Многие исследования в биологии сосредоточена! на активности клеток, которые в первую очередь состоят из белка. Особенности белковой структуры таких клеток могут дать точное представление о ее функциях в организме.
Структура белка может быть определена экспериментально посредством спектроскопии ядерного магнитного резонанса или рентгеновской кристаллографии. В результате таких экспериментов становятся частично или полностью известны расстояния между атомами. Следовательно, возникает задача определения структуры молекулы по полученным расстояниям.
В работах [1]-[3] эта задача решается с помощью разнообразных подходов. Среди них имеются подходы, основанные на оптимизации некоторых гладких функционалов, минимумы которых совпадают с корректной конфигурацией молекулы.
В данной работе разработан подход основанный на оптимизации негладких функционалов, а также приведен сравнительный анализ результатов работы гладкого и негладких методов.
В работе решена задача о нахождении пространственной структуры молекулы по заданным расстояниям между атомами. В процессе решения задачи были разработаны оптимальные алгоритмы минимизации гладкого и негладких функционалов, а также приведен сравнительный анализ работы этих алгоритмов.
На языке Matlab написана программная реализация всех необходимых методов.
