Тип работы:
Предмет:
Язык работы:


УСТАНОВЛЕНИЕ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ СТРУКТУРЫ ФЛУВАСТАТИНА В КОМПЛЕКСЕ С МИЦЕЛЛАМИ ДОДЕЦИЛФОСФОХОЛИНА МЕТОДАМИ ЯМР СПЕКТРОСКОПИИ

Работа №82118

Тип работы

Бакалаврская работа

Предмет

физика

Объем работы50
Год сдачи2016
Стоимость4200 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
26
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


ВВЕДЕНИЕ 3
1 ТЕОРЕТИЧЕСКАЯ ЧАСТЬ 6
1.1 Физические основы спектроскопии ядерного магнитного резонанса 6
1.2 Параметры спектров ЯМР высокого разрешения 8
1.2.1 Химический сдвиг 8
1.2.2 Косвенное спин-спиновое взаимодействие 9
1.2.3 Интегральная интенсивность 10
1.3 Двумерная спектроскопия ЯМР 12
1.3.1 Эксперимент 2D COSY 14
1.3.2. HSQC ЯМР эксперимент 16
1.4 Спектроскопия ядерного эффекта Оверхаузера 19
1.4.1 Ядерный эффект Оверхаузера 19
1.4.2 Эксперимент NOESY 22
1.4.3 Экспериментальное определение межпротонных расстояний 24
2 ПРАКТИЧЕСКАЯ ЧАСТЬ 28
2.1 Материалы, методы и объекты исследования 28
2.2 Анализ 1H ЯМР спектра 29
2.2 Анализ 2D COSY спектра 30
2.3 ЯМР спектры 1Н-13С HSQC и HMBC флувастатина 33
2.4 Спектры 2D NOESY 35
3 Заключение и выводы 43
Список использованной литературы 44
Приложение А

Явление ядерного магнитного резонанса (ЯМР), открытое в 1945 г. Ф. Блохом и Э. Парселлом легло в создание нового вида спектроскопии, являющегося сегодня одним из самых информативных методов исследования структуры и динамических превращений молекул, межмолекулярных взаимодействий, механизмов химических реакций и количественного анализа веществ [1].
ЯМР является эффективным методом исследования структуры молекул. Это вызвано многими причинами, но главная из них в том, что метод ЯМР позволяет устанавливать взаимосвязи между ядрами. Высокая информативность, определяемая большим диапазоном химических сдвигов и интенсивностей сигналов, имеет по существу общий характер для остальных спектральных методов. В этом отношении ЯМР не имеет больших преимуществ [2]. Его особая ценность обусловлена тонкой структурой спектра, возникающей за счет взаимодействия между ядрами, а также различными другими взаимодействиями, такими, как ядерный эффект Оверхаузера (яэО), который позволяет определять межпротонные расстояния между магнитными ядрами, отстоящими друг от друга на расстоянии до 5 А. [3].
Существует большой арсенал ЯМР методов для каждого случая. Разработка новых методик проведения экспериментов и обработки данных постоянно расширяла круг решаемых с применением ЯМР задач и позволяла исследовать все более сложные объекты. Это способствовало успешному применению ЯМР для исследования структуры молекул и их функций в организме на уровне клеток и органов. В настоящее время современные методы спектроскопии ядерного магнитного резонанса достигли столь высокого уровня, что позволили вплотную приблизиться к детальному 3 изучению биофизических процессов в медицине и биологии [4]. Также ЯМР является мощным инструментом для детального изучения биофизических свойств медицинских объектов, например статинов, которые были исследованы в моей работе.
Статины — это препараты, способные блокировать работу фермента (HGM-CoA) в печени, который является необходимым для производства холестерина. Хотя холестерин необходим для нормального функционирования клетки и организма, очень высокий уровень холестерина липопротеинов низкой плотности может привести к атеросклерозу, состоянию, при котором образуются холестерин содержащие бляшки в артериях и блокируют поток крови. Снижая уровень холестерина липопротеинов низкой плотности в крови, статины снижают риск возникновения сердечнососудистых заболеваний [5,6].
Ранее группой Mason и соавторами высказывалось предположение, что [7]. Однако, исследования этой группы проводились методом рентгеновского дифракционного анализа, соответственно, для твердотельных образцов, и поэтому их результаты не могут быть достоверно применены к организму человека, где все процессы происходят в жидкой среде - растворах. Одной из наиболее эффективных методик ЯМР для исследования пространственного строения молекул и молекулярных комплексов в растворе является спектроскопия 2D NOESY. Недиагональные кросс пики в таком двумерном спектре соответствуют ядерным эффектам Оверхаузера, возникающим между близко расположенными ядрами (< 50 нм) или ядрам, находящимся в химическом обмене. Однако, непосредственное исследование структуры клеточных мембран с помощью метода ЯМР затруднено, поскольку время протонной релаксации для фосфолипидных агрегатов оказывается слишком мало в шкале ЯМР химических сдвигов (<10-6c), что приводит к сильному уширению линий в спектрах и затрудняет их анализ. В связи с этим в данной работе взаимодействие статинов с поверхностью клеточной мембраны исследовалось на модельных мембранах, в качестве 4
которых были выбраны мицеллы додецилфосфохолина (ДФХ) [8-13]. В отличие от фосфолипидов, которые формируют бислои и мультислои в водных растворах, молекулы додецилфосфохолина в растворах способны формировать мицеллы - относительно небольшие агрегаты сферической формы, распределенные по всему раствору [14]. Наличие у ДФХ полярной гидрофильной головной группы и гидрофобного «хвоста» по аналогии с фосфолипидными молекулами делает ДФХ подходящей модельной системой для изучения взаимодействия различных составляющих клеточных мембран, в том числе холестерина, с фосфолипидными мембранами [15].
Целью работы являлось исследование взаимодействия и комплексообразования флувастатина с мицеллами додецилфосфохолина (ДФХ), использованными в качестве модели биологической мембраны, а также описание комплекса флувастатин — мицеллы ДФХ в растворе современными методами спектроскопии ядерного магнитного резонанса. Задачами дипломной работы являются:
• освоение техники проведения ЯМР экспериментов,
• подтверждение химической структуры флувастатина на основании 1H, 2D 1Н-1Н COSY, 1H-13C HMBC, 1H-13C HSQC ЯМР экспериментов,
• изучение пространственной структуры флувастатина в растворе на основании спектров 2D NOESY,
• исследование взаимодействия и комплексообразования флувастатина с моделью биологической мембраны на основе мицелл ДФХ,
• расчет межъядерных расстояний между флувастатином и ДФХ на основании спектров NOESY с различными временами смешивания.
Работа выполнена на оборудовании ФЦКП ФХИ Казанского Федерального университета (спектрометр ЯМР Bruker Avance II 500).


Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!


• На основании 1H и 1Н-1Н 2D COSY, 1H-13C HSQC и HMBC ЯМР экспериментов установлено, что химическая структура исследуемого соединения соответствует флувастатину. С помощью 2D NOESY экспериментов установлены особенности пространственной структуры флувастатина в растворе D2O, а также в присутствии мицелл додецилфосфохолина, использованных в качестве модели биологической мембраны.
• Установлено, что флувастатин образует комплекс с моделью биологической мембраны путем проникновения циклической части молекулы в поверхность мицелл ДФХ и рассчитаны средние межъядерные расстояния между протонами флувастатина и додецилфосфохолина.



1. Гюнтер, Х. Введение в курс спектроскопии ЯМР [Текст] / Х. Гюнтер. - М.: Мир, 1984. - 478 с.
2. Дероум, Э. Современные методы ЯМР для химических исследований [Текст] / Э. Дероум. — М.: Мир, 1992. - 403 с.
3. Blokhin, D. NOE Effect of Sodium Dodecyl Sulfate in Monomeric and Micellar Systems by NMR Spectroscopy [Text] / D. Blokhin, E.A. Filippova, V.V. Klochkov // Applied Magnetic Resonance. - 2014. - V. 15. - P. 715-721.
4. Галиуллина, Л.Ф. Исследование структуры компонентов атеросклеротической бляшки методами магнитного резонанса: Дис. ... канд. физ.-мат. наук: 01.04.07 физика конденсированного состояния - дата защиты 26.12.13. - Казань, 2013. . - 135 с.
5. Информационный ресурс о холестерине [Электронный ресурс] / http://holesterin.info(дата обращения: 26.11.2015)
6. Галиуллина, Л.Ф. Прямое наблюдение образования комплекса: холестерин - модель биологической мембраны методами ЯМР спектроскопии [Текст] / Л.Ф. Галиуллина, Д.С. Блохин, А.В. Аганов, В.В. Клочков // Клеточная трансплантология и тканевая инженерия. - 2012. - Т. VII, №3. - C. 41-48.
7. Mason, R.P. Intermolecular differences of 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme a reductase inhibitors contribute to distinct pharmacologic and pleiotropic actions [Text] / R.P. Mason, M.F. Walter, Ch.A. Day, R.F. Jacob // the American journal of cardiology - 2005. - V. 96. - Р. 11-23.
8. Callion L., Lequin O., Khemtemourian L. Evaluation of membrane models and their composition for islet amyloid polypeptide-membrane aggregation [Text] / L. Callion, O. Lequin, L. Khemtemourian // Biochim. Biophys. Acta - 2013. - V. 1828. - P. 2091-2098.
9. Henry G.D. Methods to study membrane protein structure in solution [Text] / G.D. Henry, B.D. Sykes // Methods Enzymol. - 1994. - V. 239. - P. 515¬44
535. 10. Galiullina, L.F. Investigation of cholesterol+model of biological membrane complex by NMR spectroscopy / L.F. Galiullina, D.S. Blokhin, A.V. Aganov, V.V. Klochkov // MRSej. - 2012. - V. 14. - P. 12204-12210.
11. Novotna, P. structural effect of bilirubin and model membranes by vibrational circular dichroism [Text] /. P. Novotna, I. Goncharova, M. Urbanova //. Biochim. Biophys. Acta. - 2014. - V. 1838. - P. 831-841.
12. Usachev, K.S. Solution structures of Altzheimers amyloid A013-23 peptide: NMR studies in solution and in SDS [Text] / K.S. Usachev, A.V. Filippov, E.A Filippova., O.N. Antzutkin, V.V. Klochkov // J. Mol. Struct. - 2013. - V. 1049. - P. 436-440.
13. Galiullina, L.F. Structure of pravastatin and its complex with sodium dodecyl sulfate micelles studied by NMR spectroscopy [Text] / L.F. Galiullina, I.Z. Rakhmatullin, E.A. Klochkova, A.V. Aganov, V.V. Klochkov // Magnetic resonance in chemistry. - 2015. - V. 53(2). - P.110-114.
14. Wang, G. Solution structure of the N-terminal amphitropic domain of Escherichia coli glucose-specific enzyme IIA in membrane-mimetic micelles. [Text] / G. Wang, P. Keifer, A. Peterkofsky // Protein Science. - 2003. - V 12. - P. 1087-1096.
15. Латфуллин, И.А. Плейотропность статинов. Имеются ли возможности объяснения феномена? [TeKCT] / И.А. Латфуллин, Л.Ф. Галиуллина, И.З. Рахматуллин, В.В. Клочков, А.В. Аганов// Рациональная фармакотерапия в кардиологии 2015 т 11 - с 634-637.
16. Bernhard, Blumich. Essential NMR for Scientists and Engineers [Text] / Bl. Bernhard. - Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2005. - P. 5-16.
17. Пименов, Г.Г. Краткий курс по ядерному магнитному резонансу [Гекст] / Пименов Г.Г., Гизатуллин Б.И. - М.: Казань: КГУ, 2008, 55с.
18. Jeener, J. Investigation of exchange processes by two-dimensional NMR spectroscopy [Text] / J. Jeener, B.H. Meier, P. Bachmann, R.R. Ernst // The Journal of Chemical Physics. - 1979. - V. 71. - P.4546-4553
19. Википедия свободная энциклопедия [Электронный ресурс] / ййр8://ги^1к1реб1а.огд^1к1/Двухмериая ядериая магиитиорезонансная спектроскопия(дата обращения 26.11.2015)
20. Parella, T. Pulsed field gradients: a new tool for routine NMR [Text] / T. Parella // Magn. Reson. Chem. - 1998. - p. 467-495.
21. Keeler, J. Understanding NMR spectroscopy [Text] / J. Keeler. - Cambridge.: Wiley, 2005. - 459 c.
22. Ресурсный центр. Санкт-Петербургский государственный университет, РЦ МРМИ 2012-2016. [Электронный ресурс]. М., 2015 URL: http ://cmr. spbu. ru/methods/hsqc/
23. Atta-ur-Rahman. One and Two dimensional NMR spectroscopy [Text] / Atta-ur-Rahman. - Elsevier, 1989. - 654 p.
24. Rule, G.S. Fundamentals of Protein NMR Spectroscopy [Text] / G.S. Rule, T.K. Hitchens. - Dordrecht: Springer, 2006. - 530 p.
25. Гадиев, T. А. Двумерная спектроскопия ЯМР NOESY в изучении пространственной структуры мономерных и димерных производных каликс[4]аренов в растворах [Текст] : Дис. ... канд. физ.- мат. наук: 01.04.07 физика конденсированного состояния - дата защиты 26.12.13. - Казань, 2007. - 123 с.
26. Усачев, К.С. Пространственное строение амилоидогенных Ар пептидов и их комплексов с модельными мембранами в растворах методами спектроскопии ЯМР: Дис. ... канд. физ.-мат. наук: 01.04.07 физика конденсированного состояния - дата защиты 26.12.13. - Казань, 2013. . - 137 с.
27. Manzo, G. Characterization of sodium dodecylsulphate and dodecylphosphocholine mixed micelles through NMR and dynamic light scattering / G. Manzo, M. Carboni, A.C. Rinaldi, M. Casu., M.A. Scorciapino - Magn. Reson. Chem., 51 (2013), pp. 176-183.
28. Deborah, A. The use of dodecylphosphocholine micelles in solution NMP / A.K. Deborah, R.T. Michael, R.W. Charles, L. Ching-Yuan - Journal of magnetic resonance. - 1995. - V. 109. - P. 60-65.


Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.




©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ