Явление ядерного магнитного резонанса (ЯМР), открытое в 1945 г. Ф. Блохом и Э. Парселлом легло в создание нового вида спектроскопии, являющегося сегодня одним из самых информативных методов исследования структуры и динамических превращений молекул, межмолекулярных взаимодействий, механизмов химических реакций и количественного анализа веществ [1].
ЯМР является эффективным методом исследования структуры молекул. Это вызвано многими причинами, но главная из них в том, что метод ЯМР позволяет устанавливать взаимосвязи между ядрами. Высокая информативность, определяемая большим диапазоном химических сдвигов и интенсивностей сигналов, имеет по существу общий характер для остальных спектральных методов. В этом отношении ЯМР не имеет больших преимуществ [2]. Его особая ценность обусловлена тонкой структурой спектра, возникающей за счет взаимодействия между ядрами, а также различными другими взаимодействиями, такими, как ядерный эффект Оверхаузера (яэО), который позволяет определять межпротонные расстояния между магнитными ядрами, отстоящими друг от друга на расстоянии до 5 А. [3].
Существует большой арсенал ЯМР методов для каждого случая. Разработка новых методик проведения экспериментов и обработки данных постоянно расширяла круг решаемых с применением ЯМР задач и позволяла исследовать все более сложные объекты. Это способствовало успешному применению ЯМР для исследования структуры молекул и их функций в организме на уровне клеток и органов. В настоящее время современные методы спектроскопии ядерного магнитного резонанса достигли столь высокого уровня, что позволили вплотную приблизиться к детальному 3 изучению биофизических процессов в медицине и биологии [4]. Также ЯМР является мощным инструментом для детального изучения биофизических свойств медицинских объектов, например статинов, которые были исследованы в моей работе.
Статины — это препараты, способные блокировать работу фермента (HGM-CoA) в печени, который является необходимым для производства холестерина. Хотя холестерин необходим для нормального функционирования клетки и организма, очень высокий уровень холестерина липопротеинов низкой плотности может привести к атеросклерозу, состоянию, при котором образуются холестерин содержащие бляшки в артериях и блокируют поток крови. Снижая уровень холестерина липопротеинов низкой плотности в крови, статины снижают риск возникновения сердечнососудистых заболеваний [5,6].
Ранее группой Mason и соавторами высказывалось предположение, что [7]. Однако, исследования этой группы проводились методом рентгеновского дифракционного анализа, соответственно, для твердотельных образцов, и поэтому их результаты не могут быть достоверно применены к организму человека, где все процессы происходят в жидкой среде - растворах. Одной из наиболее эффективных методик ЯМР для исследования пространственного строения молекул и молекулярных комплексов в растворе является спектроскопия 2D NOESY. Недиагональные кросс пики в таком двумерном спектре соответствуют ядерным эффектам Оверхаузера, возникающим между близко расположенными ядрами (< 50 нм) или ядрам, находящимся в химическом обмене. Однако, непосредственное исследование структуры клеточных мембран с помощью метода ЯМР затруднено, поскольку время протонной релаксации для фосфолипидных агрегатов оказывается слишком мало в шкале ЯМР химических сдвигов (<10-6c), что приводит к сильному уширению линий в спектрах и затрудняет их анализ. В связи с этим в данной работе взаимодействие статинов с поверхностью клеточной мембраны исследовалось на модельных мембранах, в качестве 4
которых были выбраны мицеллы додецилфосфохолина (ДФХ) [8-13]. В отличие от фосфолипидов, которые формируют бислои и мультислои в водных растворах, молекулы додецилфосфохолина в растворах способны формировать мицеллы - относительно небольшие агрегаты сферической формы, распределенные по всему раствору [14]. Наличие у ДФХ полярной гидрофильной головной группы и гидрофобного «хвоста» по аналогии с фосфолипидными молекулами делает ДФХ подходящей модельной системой для изучения взаимодействия различных составляющих клеточных мембран, в том числе холестерина, с фосфолипидными мембранами [15].
Целью работы являлось исследование взаимодействия и комплексообразования флувастатина с мицеллами додецилфосфохолина (ДФХ), использованными в качестве модели биологической мембраны, а также описание комплекса флувастатин — мицеллы ДФХ в растворе современными методами спектроскопии ядерного магнитного резонанса. Задачами дипломной работы являются:
• освоение техники проведения ЯМР экспериментов,
• подтверждение химической структуры флувастатина на основании 1H, 2D 1Н-1Н COSY, 1H-13C HMBC, 1H-13C HSQC ЯМР экспериментов,
• изучение пространственной структуры флувастатина в растворе на основании спектров 2D NOESY,
• исследование взаимодействия и комплексообразования флувастатина с моделью биологической мембраны на основе мицелл ДФХ,
• расчет межъядерных расстояний между флувастатином и ДФХ на основании спектров NOESY с различными временами смешивания.
Работа выполнена на оборудовании ФЦКП ФХИ Казанского Федерального университета (спектрометр ЯМР Bruker Avance II 500).
• На основании 1H и 1Н-1Н 2D COSY, 1H-13C HSQC и HMBC ЯМР экспериментов установлено, что химическая структура исследуемого соединения соответствует флувастатину. С помощью 2D NOESY экспериментов установлены особенности пространственной структуры флувастатина в растворе D2O, а также в присутствии мицелл додецилфосфохолина, использованных в качестве модели биологической мембраны.
• Установлено, что флувастатин образует комплекс с моделью биологической мембраны путем проникновения циклической части молекулы в поверхность мицелл ДФХ и рассчитаны средние межъядерные расстояния между протонами флувастатина и додецилфосфохолина.
1. Гюнтер, Х. Введение в курс спектроскопии ЯМР [Текст] / Х. Гюнтер. - М.: Мир, 1984. - 478 с.
2. Дероум, Э. Современные методы ЯМР для химических исследований [Текст] / Э. Дероум. — М.: Мир, 1992. - 403 с.
3. Blokhin, D. NOE Effect of Sodium Dodecyl Sulfate in Monomeric and Micellar Systems by NMR Spectroscopy [Text] / D. Blokhin, E.A. Filippova, V.V. Klochkov // Applied Magnetic Resonance. - 2014. - V. 15. - P. 715-721.
4. Галиуллина, Л.Ф. Исследование структуры компонентов атеросклеротической бляшки методами магнитного резонанса: Дис. ... канд. физ.-мат. наук: 01.04.07 физика конденсированного состояния - дата защиты 26.12.13. - Казань, 2013. . - 135 с.
5. Информационный ресурс о холестерине [Электронный ресурс] / http://holesterin.info(дата обращения: 26.11.2015)
6. Галиуллина, Л.Ф. Прямое наблюдение образования комплекса: холестерин - модель биологической мембраны методами ЯМР спектроскопии [Текст] / Л.Ф. Галиуллина, Д.С. Блохин, А.В. Аганов, В.В. Клочков // Клеточная трансплантология и тканевая инженерия. - 2012. - Т. VII, №3. - C. 41-48.
7. Mason, R.P. Intermolecular differences of 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme a reductase inhibitors contribute to distinct pharmacologic and pleiotropic actions [Text] / R.P. Mason, M.F. Walter, Ch.A. Day, R.F. Jacob // the American journal of cardiology - 2005. - V. 96. - Р. 11-23.
8. Callion L., Lequin O., Khemtemourian L. Evaluation of membrane models and their composition for islet amyloid polypeptide-membrane aggregation [Text] / L. Callion, O. Lequin, L. Khemtemourian // Biochim. Biophys. Acta - 2013. - V. 1828. - P. 2091-2098.
9. Henry G.D. Methods to study membrane protein structure in solution [Text] / G.D. Henry, B.D. Sykes // Methods Enzymol. - 1994. - V. 239. - P. 515¬44
535. 10. Galiullina, L.F. Investigation of cholesterol+model of biological membrane complex by NMR spectroscopy / L.F. Galiullina, D.S. Blokhin, A.V. Aganov, V.V. Klochkov // MRSej. - 2012. - V. 14. - P. 12204-12210.
11. Novotna, P. structural effect of bilirubin and model membranes by vibrational circular dichroism [Text] /. P. Novotna, I. Goncharova, M. Urbanova //. Biochim. Biophys. Acta. - 2014. - V. 1838. - P. 831-841.
12. Usachev, K.S. Solution structures of Altzheimers amyloid A013-23 peptide: NMR studies in solution and in SDS [Text] / K.S. Usachev, A.V. Filippov, E.A Filippova., O.N. Antzutkin, V.V. Klochkov // J. Mol. Struct. - 2013. - V. 1049. - P. 436-440.
13. Galiullina, L.F. Structure of pravastatin and its complex with sodium dodecyl sulfate micelles studied by NMR spectroscopy [Text] / L.F. Galiullina, I.Z. Rakhmatullin, E.A. Klochkova, A.V. Aganov, V.V. Klochkov // Magnetic resonance in chemistry. - 2015. - V. 53(2). - P.110-114.
14. Wang, G. Solution structure of the N-terminal amphitropic domain of Escherichia coli glucose-specific enzyme IIA in membrane-mimetic micelles. [Text] / G. Wang, P. Keifer, A. Peterkofsky // Protein Science. - 2003. - V 12. - P. 1087-1096.
15. Латфуллин, И.А. Плейотропность статинов. Имеются ли возможности объяснения феномена? [TeKCT] / И.А. Латфуллин, Л.Ф. Галиуллина, И.З. Рахматуллин, В.В. Клочков, А.В. Аганов// Рациональная фармакотерапия в кардиологии 2015 т 11 - с 634-637.
16. Bernhard, Blumich. Essential NMR for Scientists and Engineers [Text] / Bl. Bernhard. - Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2005. - P. 5-16.
17. Пименов, Г.Г. Краткий курс по ядерному магнитному резонансу [Гекст] / Пименов Г.Г., Гизатуллин Б.И. - М.: Казань: КГУ, 2008, 55с.
18. Jeener, J. Investigation of exchange processes by two-dimensional NMR spectroscopy [Text] / J. Jeener, B.H. Meier, P. Bachmann, R.R. Ernst // The Journal of Chemical Physics. - 1979. - V. 71. - P.4546-4553
19. Википедия свободная энциклопедия [Электронный ресурс] / ййр8://ги^1к1реб1а.огд^1к1/Двухмериая ядериая магиитиорезонансная спектроскопия(дата обращения 26.11.2015)
20. Parella, T. Pulsed field gradients: a new tool for routine NMR [Text] / T. Parella // Magn. Reson. Chem. - 1998. - p. 467-495.
21. Keeler, J. Understanding NMR spectroscopy [Text] / J. Keeler. - Cambridge.: Wiley, 2005. - 459 c.
22. Ресурсный центр. Санкт-Петербургский государственный университет, РЦ МРМИ 2012-2016. [Электронный ресурс]. М., 2015 URL: http ://cmr. spbu. ru/methods/hsqc/
23. Atta-ur-Rahman. One and Two dimensional NMR spectroscopy [Text] / Atta-ur-Rahman. - Elsevier, 1989. - 654 p.
24. Rule, G.S. Fundamentals of Protein NMR Spectroscopy [Text] / G.S. Rule, T.K. Hitchens. - Dordrecht: Springer, 2006. - 530 p.
25. Гадиев, T. А. Двумерная спектроскопия ЯМР NOESY в изучении пространственной структуры мономерных и димерных производных каликс[4]аренов в растворах [Текст] : Дис. ... канд. физ.- мат. наук: 01.04.07 физика конденсированного состояния - дата защиты 26.12.13. - Казань, 2007. - 123 с.
26. Усачев, К.С. Пространственное строение амилоидогенных Ар пептидов и их комплексов с модельными мембранами в растворах методами спектроскопии ЯМР: Дис. ... канд. физ.-мат. наук: 01.04.07 физика конденсированного состояния - дата защиты 26.12.13. - Казань, 2013. . - 137 с.
27. Manzo, G. Characterization of sodium dodecylsulphate and dodecylphosphocholine mixed micelles through NMR and dynamic light scattering / G. Manzo, M. Carboni, A.C. Rinaldi, M. Casu., M.A. Scorciapino - Magn. Reson. Chem., 51 (2013), pp. 176-183.
28. Deborah, A. The use of dodecylphosphocholine micelles in solution NMP / A.K. Deborah, R.T. Michael, R.W. Charles, L. Ching-Yuan - Journal of magnetic resonance. - 1995. - V. 109. - P. 60-65.