Изучение влияния бактерий Methylobacterium extorquens, Bacillus
megaterium, Bacillus subtilis и их метаболитов на патогены
сельскохозяйственных растений
ВВЕДЕНИЕ 5
ГЛАВА 1. АНАЛИТИЧЕСКИЙ ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 8
1.1. Биопрепараты как перспективный способ защиты
сельскохозяйственных растений от фитопатогенных микроорганизмов 8
1.2. Описание фитопатогенных микроорганизмов сельскохозяйственных
культур 8
1.2.1. Фузариоз 8
1.2.2. Альтернариоз 9
1.2.3. Фомоз 10
1.2.4. Церкоспороз 10
1.2.5. Серая гниль 11
1.3. Микроорганизмы, используемые для создания биопрепаратов 11
1.4. Фотосимбиотические аэробные метилобактерии 13
1.4.1. Штамм M. Extorquens 14
1.5. Грамположительные бактерии рода Bacillus 15
1.5.1. Штамм B. megaterim 15
1.5.2. Штамм B. subtilis 16
1.6. Оптимизация состава питательной среды 18
1.6.1. Источники углерода 19
1.6.2. Источники азота 19
1.6.3. Источники минерального питания 20
1.6.4. Факторы роста 21
1.6.5. Математический метод планирования эксперимента 22
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ 24
2.1. Объект исследования 24
2.2. Условия культивирования 25
2.2.1. Штамм M. extorquens 25
2.2.2. Штамм B. subtilis и B.megaterium 26
2.3. Питательные среды 26
2.3.1. Реактивы и компоненты питательных сред 26
2.3.2. Состав питательных сред 29
2.4. Методы исследования штаммов M. Extorquens, B. Megatetium, B.
Subtilis и бактериального препарата на их основе 31
2.4.1. Определение количества биомассы в культуральной жидкости
методом определения сухих веществ 31
2.4.2. Определение КОЕ/мл с помощью камеры Горяева 31
2.4.3. Определение КОЕ/мл методом последовательных разведений 32
2.4.4. Методика приготовления физиологического раствора 32
2.4.5. Методика приготовления суспензии исследуемых штаммов M.
extorquens, B. Megatetium, B. Subtilis и препарата на их основе с различными концентрациями 32
2.5. Изучение влияния биологической активности исследуемых штаммов
и бактериального препарата на рост фитопатогенных грибов 33
2.5.1. Метод радиального роста 33
2.5.2. Модифицированный метод бумажных дисков 34
2.5.3. Метод оценки противогрибной активности на модельном объекте 35
2.6. Статистическая обработка результатов эксперимента 35
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ 38
3.1. Результаты исследования противогрибной активности штамма
Bacillus subtilis 38
3.2. Результаты исследования противогрибной активности штамма
Bacillus megaterium 46
3.3. Результаты исследования противогрибной активности штамма
Methylobacterium extorquens 56
3.4. Результаты исследования противогрибной активности
бактериального препарата 61
3.4.1. Метод радиального роста 61
3.4.2. Модифицированный метод бумажных дисков 70
3.5 Результаты исследования противогрибной активности 76
ВЫВОДЫ 79
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ 80
На сегодняшний день одной из основных проблем сельскохозяйственного хозяйства становится защита растений от фитопатогенных микроорганизмов. Заражение сельскохозяйственных культур становится причиной потери урожая, которые в некоторых случаях могут доходить до 100 %, тем самым снижая количественные и качественные показатели растениеводческой продукции. Не смотря на значительные успехи, достигнутые в данном направлении, проблема создания не только эффективных, но и безопасных средств защиты растений по-прежнему остается чрезвычайно актуальной.
Среди существующий современных способов защиты растений ведущее место принадлежит химическим методам, особенно в системах интенсивных технологий возделывания сельскохозяйственных культур. Однако, не смотря на свою экономическую и биологическую эффективность, данный метод имеет ряд существенных недостатков, приводящих к снижению его эффективности и экономической целесообразности, а именно: накопление токсичных веществ, входящих в состав фунгицидов, в сельскохозяйственной продукции, что представляет значительную угрозу для здоровья человека и животных, прогрессирующая устойчивость патогенных организмов к химическим веществам, и как следствие - необходимость в увеличении доз и количества обработок фунгицидными препаратами, не специфичность действия и нарушение экологического равновесия в почве, что приводит к загрязнению окружающей нас среды, а также высокая стоимость фунгицидов. И несмотря на постоянное появление на рынке новых средств и методов химической защиты растений от опасных болезней, общая ситуация не только принципиально не меняется, но и можно выделить негативные тенденции.
Исходя из вышесказанного, стоит отметить, что все более актуальными становятся биологические способы защиты растений. Так, очевидным их преимуществом перед химическими методами становится их биологическая безопасность по отношению к окружающей среде и экономичность, так как биологические препарата не вызывают резистентности у фитопатогенных микроорганизмов, а значит значительно снижается количество обработок. Помимо прочего стоит отметить высокую эффективность и избирательность действия по отношению к широкому спектру патогенных микроорганизмов, короткий срок ожидания действия и полную безопасность продукции растениеводства, полученную после обработки биологическими препаратами.
Следовательно, биологические средства защиты являются наиболее экологические приемлемым и ресурсосберегающим приемом, способным защитить растения от широкого спектра вредителей и болезней, повысить продуктивность и урожайность сельскохозяйственной продукции без существенных финансовых затрат и невосполнимых природных ресурсов.
Цель работы: Исследование влияния штаммов бактерий M. extorquens,
B. megaterium, B. subtilis на фитопатогены сельскохозяйственных растений, создание биопрепарата на их основе с устойчивой антагонистической активностью по отношению к широкому кругу фитопатогенов.
Для достижения указанной цели были поставлены следующие задачи:
1. Исследовать влияние штаммов бактерий M. extorquens, B. megaterium, B. subtilis на фитопатогенные микроорганизмы F. solani, F. oxysporum, A. solani, A. alternata, C. beticola, B. cinerea.
2. Исследовать синергетическое действия бактериального препарата на основе штаммов бактерий M. extorquens, B. megaterium, B. subtilis на на фитопатогенные микроорганизмы F. solani, F. oxysporum, A. solani, A. alternata, C. beticola, B. cinerea.
3. Подобрать концентрацию бактериального препарата, при которой проявляется наибольшая активность по отношению к заявленным фитопатогенным микроорганизмам.
4. Провести исследование эффективности комбинации бактериального препарата на модельном объекте.
В результате проделанной работы:
1. Экспериментально установили, что штаммы Bacillus subtilis, Bacillus megaterium обладают антагонистической активностью в отношении фитопатогенных грибов F.oxysporum, A.solani, A.alternata, P. exigua, C. beticola, B.cinerea.
2. Штамм Methylobacterium extorquens проявил высокую противогрибную активность по отношению к фитопатогенным грибам - F.oxysporum, P.exigua и B.cinerea. Однако бактериальный штамм не оказал существенного влияния на ингибирование роста фитопатогенных грибов C. beticola, A. solani и A.alternata.
3. В ходе проведенных экспериментов было выявлено, что целесообразно использование комбинаций бактериальных культур, так как действие отдельных компонентов - Bacillus subtilis, Bacillus megaterium и Methylobacterium extorquens, усиливается при их совместном использовании.
4. Была подобрана концентрация бактериального препарата - 5 г/л, при которой проявлялась максимальная противогрибная активность по отношению ко всем исследуемым фитопатогенным грибам.
5. Была доказана высокая эффективность бактериального препарата на модельном объекте (помидорах сорта тестери), в отношении универсального фитопатогенного B.cinerea.
В результате был получен бактериальный препарат с высокой антагонистической активностью по отношению к заявленным фитопатогенным микроорганизмам.
1. Агафонова Н. В. Таксономическая и функциональная характеристика аэробных метилотрофных бактерий-фитосимбионтов, 2017 - 142 с.
2. Асатурова А.М. Физиологические признаки перспективных штаммов
бактерий родов Bacillus и Pseudomonas - продуценты микробиопрепаратов. МАСЛИЧНЫЕ КУЛЬТУРЫ. Научно-технический бюллетень. Всероссийский научно-исследовательского института
масличных культур. Вып. 2 (141), 2009 - 7 с.
3. Арзамасцев А.А. Математические модели кинетики микробного синтеза: возможности использования и новые подходы к разработке// Вестн. Тамбов. ун-та. Серия: Естеств. и техн. Науки, 2000. - Т. 5 (1). - 111 с.
4. Бирюков В.В. Оптимизация периодических процессов
микробиологического синтеза / Бирюков В.В. Кантере В.М. // М: Наука, 1985 - 296 с.
5. Ефременко О.В., Зенкова В.А., Катруха Г.С. и др. Анттимикробная активность представителей вида Bacillus megaterim. Микробиология. Т.81.№2, 2012 - 196-204 с.
6. Жиглецова С.К., Дунайцев И.А., Бесаева С.Г. Возможности применения микроорганизмов для решения задач экологической и продовольственной безопасности. Агрохимия. №6, 2010. - 83-96 с.
7. Замахаева, С. А., Федоров, Д. Н., Доронина, Н. В., & Троценко, Ю.
А. Клонирование и характеристика полигидроксибутиратсинтазы из Methylobacterium extorquens AM1, 2016 - 15 с.
8. Кирик Н. Н., Пиковский М. И. Симптоматика серой гнили фасоли // Защита и карантин растений. №12, 2007 - 31 с.
9. Лухменёв В.П. Фитопатология. Учебное пособие для студентов вузов, обучающихся по специальности агрономии. Оренбург, 2012. - 299 с.
10. Маланичева И.А., Козлов Д.Г., Мумаруова И.Г., Ефременко О.В. Антимикробная активность представителей вида Bacillus megaterium. МИКРОБИОЛОГИЯ,Т.8, № 2, 2012, С. 196-204.
11. Машанов А.И, Бышко Н.А. Идентификация и характеристика патогенных грибов, поражающих клубни картофеля при хранении. // Вестник КрасГАУ. 2012. № 5. С.: 423-426.
12. Минаева О.М., Акимова Е.Е., Зюбанова Т.И., Терещенко Н.Н.
Биопрепараты для защиты растений: оценка качества и эффективности: учеб. Пособие. - Томск: Издательский Дом Томского государственного университета, 2018. - С.130.
13. Монастырский О.А. Состояние и перспективы развития биологической защиты растений в России. Защита и карантин растений. №12. 2008 -
С.41-44.
14. Муродова С.С., Давронов К.Д.Комплесные микробные препараты. Применение в сельскохозяйственной практике. BIOTECHNOLOGIA ACTA. Т.7, №6. Изд.: Институт биохимии им. А.В. Палладина НАН Украины. Украина, 2014 - С.92-101.
15. МУК 4.2.1890—04. Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам.
16. Нетрусов А. И., Котова И. Б. Микробиология. - Academia, 2006. - С. 167¬168.
17. Патогены насекомых: структурные и функциональные аспекты / под ред.
В.В. Глупова. М.: Круглый год, 2001. - С.736.
18. Пименова М. Н., Гречушкина Н. Н., Азова Л. Г. Руководство к практическим занятиям по микробиологии: Малый практикум: Учебное пособие. - МГУ, 1971.
19. Реброва И.А. Планирование эксперимента: учебное пособие. - Омск: СибАДИ, 2010. - С.105.
20. Савельева В. В. Оптимизация питательной среды для streptomyces hygroscopicus - продуцента фармацевтической субстанции рапамицина / В. В. Савельева, В. В. Джавахия, Е. В. Глаголева и др. // Международный научно-исследовательский журнал. — 2017. — № 03 (57) Часть 3. — 20 с.
21. Садунов А.В. Общая характеристика бактерий рода Bacillus. Сборник материалов международной студенческой научной конференции «Современные проблемы науки и образования»,Т.1, М, 2018 - 30 с.
22. Соколов М.С., Коломбет Л.В. Агротехногенные факторы минимизации вредоносности фузариоза колоса пшеницы // Агрохимия. № 12, 2007 - 80
с.
23. Сидорова Т.М., Асатурова А.М., Хомяк А.И. Биологически активные метаболиты Bacillus subtilis и их роль в контроле фитопатогенных микроорганизмов. Сельскохозяйственная биология. Т.53, №1, 2018 - 29 с.
24. Соколов М.С., Коломбет Л.В. Агротехногенные факторы минимизации вредоносности фузариоза колоса пшеницы // Агрохимия. № 12. 2007 - С. 63-80.
25. Стогниенко О. И., Мелькумова Е. А. Церкоспороз сахарной свеклы в Центрально-Черноземном регионе // Защита и карантин растений. №8, 2007 - 33 с.
26. Троценко Ю. А., Торгонская М. Л. Аэробные метилотрофы-
перспективные объекты современной биотехнологии, 2012- 243-279 с.
27. Хомяк А. И., Асатурова А. М., Сидорова Т. М. Технология получения биофунгицидов на основе новых бактерий рода Bacillus для защиты озимой пшеницы и других сельскохозяйственных культур от экономически значимых болезней. Мат. II науч.-практ. конф. студентов, аспирантов и молодых ученых «Современные аспекты производства и переработки сельскохозяйственной продукции». Краснодар, 2016 - 216¬224 с.
28.Чан Минь Куан, Егоров М.А., Батаева Ю.В. Ростостимулирующий эффект штамма Bacillus megaterium в вегетативном опыте. Вестник Алтайского государственного аграрного университета. Алтайский государственный университет №3 (89). Барнаул, 2012 - 46-49 с.
29. Штерншис М.В. Состояние и перспетивы использования биопрепаратов
для защиты растений в Сибири. Вестник Новосибирского государственного аграрного университета. Изд.: НГАГ. №5 (21),
Новосибирск, 2011 - 48-55 с.
30. Штерншис М.В. Тенденции развития биотехнологии микробных средств
защиты растений в России. Вестник ТГУ. Биология. - №2 (18) - 2012 -
92-100 с.
31. Aksenova E.N. Methods for processing of Measurement Results. - M.: МИФИ, 2015 - 10 с.
32. Doronina, N. V., Torgonskaya, M. L., Fedorov, D. N., & Trotsenko, Y. A. Aerobic methylobacteria as promising objects of modern biotechnology //Applied biochemistry and microbiology. - 2015. - Vol. 51. - №. 2. - P. 125¬134.
33. Farace G., Fernandez O., Jacquens L., Coutte F., Krier F., Jacques Ph., Clement Ch., Barka E.A., Jacquard C., Dorey S. Cyclic lipopeptides from Bacillus subtilis activate distinct patterns of defense responses in grapevine. Mol. Plant Pathol. - 2015 - № 16(2) - P. 147.
34. Fedorov D. N., Doronina N. V., Trotsenko Y. A. Phytosymbiosis of aerobic methylobacteria: new facts and views //Microbiology. - 2011. - Vol. 80. - №.
4. - P. 443.
35. Jacques P. Surfactin and other lipopeptides from Bacillus spp. In: Biosurfactants. Microbiology monographs /G. Soberon-Chavez (ed.). Springer, Berlin, Heidelberg - 2011, Vol. 20 - №52. - P. 169.
36. Kino K., Kotanaka Y., Arai T., Yagasaki M. A novel L-amino acid ligase from Bacillus subtilis NBRC3134, a microorganism producing peptide — antibiotic rhizocticin. Biosci. Biotech. Bioch. - 2009 - Vol. 73(4) - P. 901-907.
37. Li J., Yang Q., Zhao L., Zhang S., Wang Y., Zhao X. Purification and characterization of a novel antifungal protein from Bacillus subtilis strain B29.
J. Zhejiang Univ.-Sc. B - 2009 - Vol. 10(4) - P. 264-272.
38.Ochsner, A. M., Sonntag, F., Buchhaupt, M., Schrader, J., & Vorholt, J. A. Methylobacterium extorquens: methylotrophy and biotechnological
applications //Applied microbiology and biotechnology. - 2015. - Vol. 99,№.
2. - P. 517-534.
39. Qiu, M., Wu, C., Ren, G., Liang, X., Wang, X., Huang, J. Effect chitosan and its derivatives as antifungal and preservative agents on postharvest green asparagus.//Food Chem - 2014 - V.155, P.105-111.
40. Zhong J., Zhang X., Ren Y., Yang J., Tan H., Zhou J. Optimization of Bacillus subtilis cell growth effecting jiean-peptide production in fed batch fermentation using central composite design. Electron. J. Biotechn. - 2014 - Vol. 17 - P. 132-136.