🔍 Поиск готовых работ

🔍 Поиск работ

СОМАТИЧЕСКИЙ МОЗАИЦИЗМ ПРИ АТЕРОСКЛЕРОЗЕ: СТРУКТУРНЫЕ ВАРИАЦИИ В ЭКЗОМЕ

Работа №75952

Тип работы

Дипломные работы, ВКР

Предмет

медицина

Объем работы85
Год сдачи2020
Стоимость4200 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
56
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ 4
ВВЕДЕНИЕ 5
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 8
1.1. Этиология и патогенез атеросклероза: современный взгляд 8
1.2. Архитектура генома человека 11
1.2.1. Структурные вариации в геноме человека 12
1.2.2. Клиническое значение структурных вариаций 15
1.3. Атеросклероз и структурные вариации 17
1.4. Нестабильность генома и соматический мозаицизм 21
1.5. Заключение по обзору литературы 23
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 25
2.1. Объем и структура материала 25
2.2. Выделение ДНК из биологического материала 26
2.3. Проведение полноэкзомного секвенирования 28
2.4. Биоинформатическая обработка данных 28
2.5. Аннотационный анализ 30
2.6. Приоритизация генов 31
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 32
3.1. Контроль и оценка качества полноэкзомного секвенирования 32
3.2. Герминативные и соматические CNV у больных каротидным
атеросклерозом: идентификация, характеристика, генные сети 33
3.3. Приоритизация генов герминативных и соматических CNV 44
ЗАКЛЮЧЕНИЕ 53
ВЫВОДЫ 54
Список литературы 54
ПРИЛОЖЕНИЕ 1 66
ПРИЛОЖЕНИЕ 2 67
ПРИЛОЖЕНИЕ 3 70


Наиболее распространенными причинами смерти во всем мире являются инсульт и ишемическая болезнь сердца (ИБС). Они составляют более 80% среди всей смертности от сердечно-сосудистых заболеваний (ССЗ) и до четверти всех причин смерти в мире [26]. Ведущей причиной сосудистых заболеваний является атеросклероз. Установлены многие факторы риска развития атеросклероза, такие как ожирение, курение, повышенное артериальное давление, сахарный диабет и метаболический синдром [37]. Однако молекулярные механизмы развития и генетическая компонента этого патологического процесса мало изучены.
Обеспечение более комплексного понимания патогенетики атеросклероза позволит улучшить диагностику и лечение, в том числе в аспекте персонифицированной медицины. Последние представления о генетических вариантах, влияющих на риск развития атеросклероза, в значительной степени основаны на полногеномных ассоциативных исследованиях (genome-wide association studies, GWAS) с однонуклеотидными полиморфными вариантами (single nucleotide polymorphism, SNP) [4, 39, 44]. Однако помимо SNP структурная вариабельность генома представлена другими малоизученными вариантами, как вариации по числу копий участков ДНК (copy number variation, CNV), инсерции/делеции (indel) и инверсии. Размер данных структурных вариаций может варьировать от нескольких десятков нуклеотидов до нескольких миллионов. Поэтому в них могут содержаться как части генов, так и целые гены, вплоть до нескольких групп генов. Кроме того, такие генетические вариации как CNV открыты относительно недавно [48] и являются многообещающими в отношении изучения генетической компоненты при многих заболеваниях.
Ранние исследования показали связь ряда CNV с атеросклерозом и его факторами риска. В частности, CNV, содержащие ген CYP2E1- член суперсемейства ферментов цитохрома P450, которые играют важную роль в метаболизме жирных кислот - ассоциированы с гипертриглицеридемией [66]. Увеличение копий гена KIV2влияют на размер аполипопротеина A1 и концентрацию липопротеина [32]. Также установлено, что CNV, содержащие такие гены как ERLIN1, UNG, ACACB, PCDH15ассоциированы с атеросклерозом [47]. В атерогенезе значительную роль играет иммуновоспалительный ответ в сосудистой стенке. Поэтому риск развития атеросклероза увеличивается при наличии полиморфизма в генах провоспалительных цитокинов: интерлейкина 6 (IL6)[57] и рецептора к нему (IL6R)[58], фактора некроза опухоли альфа (TNFA) [92].
Геномная нестабильность и связанные с ней структурные вариации возникают из-за ошибок репликации и репарации ДНК, которые постоянно происходят в геноме. Поэтому в одном организме могут сосуществовать генетически различные популяции клеток в той или иной степени. Результатом таких постзиготических изменений в геноме является соматический мозаицизм [88].
Ранее соматический мозаицизм рассматривали как одну из причин онкологических заболеваний [6, 14, 71]. Хорошо известно, что соматические мутации в геноме клетки, затрагивающие онкогены или гены-онкосупрессоры, способствуют онкотрансформации. В настоящее время соматические мутации активно рассматриваются в отношении продолжительности жизни и старения [7, 81], развитии нервно-психических заболеваний, а также ряда ССЗ и его факторов. Например, появление вариаций в генах, которые имеют повышенную экспрессию в головном мозге, могут привести к задержке умственного развития, аутизму [96], шизофрении [72], болезни Паркинсона [33, 77]. Структурные вариации также связаны с риском развития инсульта [14], ишемической болезни сердца [47], аритмий [51], ожирения [27,61] и других факторов риска развития сердечно-сосудистых заболеваний. При том, что соматический мозаицизм является распространенным феноменом и найден во многих тканях, его связь с атеросклерозом неясна.
Подавляющее большинство мутаций, имеющих клиническую значимость, локализуется в экзонах - это участки генов, которые кодируют часть зрелой РНК, транскрибированной с этого гена после сплайсинга. В процессе жизнедеятельности экзомы клеток одного организма накапливают разный спектр структурных вариаций. Поэтому для изучения изменений, связанных с конкретным заболеванием, необходим анализ структурных вариаций в разных тканях [88]. В целях поиска соматического мозаицизма необходимо сравнительное исследование экзома клеток биоптатов стенок сосудов и лейкоцитов периферической крови.
Таким образом, актуальным является изучение структурной вариабельности экзома отдельных типов тканей, вовлеченных в атеросклеротический процесс в контексте соматического мозаицизма.
Цель исследования. Оценить спектр и частоту структурных вариаций в контексте соматического мозаицизма в экзоме клеток лейкоцитов периферической крови и клеток атеросклеротических бляшек у больных каротидным атеросклерозом.
Задачи исследования:
1. Оценить спектр герминативных и соматических структурных вариаций у
больных с каротидным атеросклерозом методом полноэкзомного секвенирования.
2. Провести сравнительный анализ герминативных и соматических
структурных вариаций с базой данных Database of Genomic Variants.
3. Выполнить аннотационный анализ герминативных и соматических CNV, гены которых потенциально обладают вкладом в развитие атеросклероза.
4. Провести приоритизацию генов в герминативных и соматических CNV, кандидатных в отношении атеросклеротического процесса.


Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!
ДИПЛОМНЫЕ МАГИСТЕРСКИЕ ДИССЕРТАЦИИ
КУРСОВЫЕ СТАТЬИ ВКР

В настоящей дипломной работе проведено исследование по определению спектра структурных вариаций при атеросклерозе. Выявлены 35 герминативных и 56 соматических CNV разных по размеру и локализации. Среди всех выявленных CNV 32% встречаются более чем у одного пациента. Кроме того, в ходе исследования были выявлены 4 новые CNV, не представленные ранее в базе данных по геномным вариациям DGV. Подтверждено, что гены, содержащиеся в найденных CNV, участвуют в биологических процессах, связанных с воспалением и метаболизмом липидов.
В результате отобраны 6 генов (ADGRE3, GBP3, KIR2DL3, SIGLEC5, ACOT1, GSTT1),которые содержались в CNV, обнаруженных в данном исследовании. Приоритизированные гены и их белковые продукты представлены в биологических процессах, вовлечённых в атерогенез или патологии, связанные с поражением органов сердечно-сосудистой системы. Данное исследование позволяет рассматривать их в качестве кандидатов для дальнейшего изучения в отношении влияния на манифестацию атеросклероза и тяжести его течения.
Перспективным является исследование полученных результатов для каждого из гена с использованием расширенных выборок образцов и альтернативных методов анализа (множественной лигазно-зависимой амплификации зондов, ПЦР в режиме реального времени или цифровая ПЦР). Валидационное исследование позволит убедиться, что данные CNV являются потенциальными маркёрами или звеньями атерогенеза.



1. Сергиенко И. В. Атеросклероз и дислипидемии: современные аспекты патогенеза, диагностики и лечения / И. В. Сергиенко, А. А. Аншлес, В. В. Кухарчук. - Москва: ООО «ПатиСС», 2017. - 140 с.
2. Слепцов А. А. Структурная вариабельность генома лейкоцитов и клеток артерий при атеросклерозе у человека / А. А. Слепцов, М. С. Назаренко, В. П. Пузырев // Российский кардиологический журнал. - 2017. - Т. 10. - № 150. - С. 140-146.
3. Соматический мозаицизм и структурная вариабельность гена GBP3 при атеросклерозе / А. А. Слепцов, М. С. Назаренко, А. В. Зайцева [и др.] // Атеросклероз. - 2019. - Т. 4. - С. 46-51.
4. A comprehensive 1000 Genomes-based genome-wide association meta-analysis of coronary artery disease / M. Nikpay, A. Goel, H. Won [и др.] // Nature Genetics. - 2015. - Т. 47. - № 10. - С. 1121-1130.
5. Age-related clonal hematopoiesis associated with adverse outcomes / S. Jaiswal, P. Fontanillas, J. Flannick, [и др.] // New England Journal of Medicine. - 2014. - Т. 371. - № 26. - С. 2488-2498.
6. Alfred G. Knudson JR. Mutation and Cancer: Statistical Study of Retinoblastoma / JR. Alfred G. Knudson // 37th Joint Propulsion Conference and Exhibit. - 1971. - Т. 68. - № 4. - С. 820-823.
7. Analysis of somatic mutations identifies signs of selection during in vitro aging of primary dermal fibroblasts / N. Narisu, R. Rothwell, P. Vrtacnik [и др.] // Aging Cell. - 2019. - Т. 18. - № 6. - С. 1-12.
8. Angiogenesis in the atherosclerotic plaque / C. Camare, M. Pucelle, Anne Negre- Salvayre, R. Salvayrea // Redox Biology. - 2017. - Т. 12. - № 1. - С. 18-34.
9. Association of glutathione S-transferase T1 and M1 gene polymorphisms with ischemic stroke risk in the Chinese Han population / R. Wang, Y. Wang, J. Wang, K. Yang // Neural Regeneration Research. - 2012. - Т. 7. - № 18. - С. 1420-1427.
10. Atherosclerosis - Do we know enough already to prevent it? / C. A. Narasimhulu, I. Fernandez-Ruiz, K. Selvarajan [и др.] // Current Opinion in Pharmacology. - 2016. - Т. 27. - № 4. - С. 92-102.
11. Atherosclerosis: familial hypercholesterolemia and atherosclerosis in cloned minipigs created by DNA transposition of a human PCSK9 gain-of-function mutant /
R. H. Al-Mashhadi, C. B. Sorensen, P. M. Kraghi [и др.] // Science Translational Medicine. - 2013. - Т. 2. - № 5.
12. Back M. Regulation of atherosclerotic plaque inflammation / M. Back, C. Weber, E. Lutgens // Journal of Internal Medicine. - 2015. - Т. 278. - № 5. - С. 462-482.
13. Benditt E.P. Evidence for a monoclonal origin of human atherosclerotic plaques and some implications / E.P. Benditt // Circulation. - 1974. - Т. 50. - № 4. - С. 650-652.
14. B. Vogelstein. Cancer Genome Landscapes / B. Vogelstein, N. Papadopoulos, V. E. Velculescu // Science. - 1986. - Т. 233. - № 4770. - С. 1246.
15. Bodea G.O. Retrotransposon-induced mosaicism in the neural genome / G. O. Bodea, E. G. Z. McKelvey, G. J. Faulkner // Royal Society Open Science. - 2018. - Т.
8. - № 7.
16. Cardiomyocyte specific expression of Acyl-coA thioesterase 1 attenuates sepsis induced cardiac dysfunction and mortality / C. Xia, R. Dong, C. Chen [и др.] // Biochemical and Biophysical Research Communications. - 2015. - Т. 468. - № 4. - С. 533-540.
17. Cardiovascular Risk in Patients with Prehypertension and the Metabolic Syndrome / S. Kachur, R. Morera, A. D. Schutter, C. J. Lavie // Current Hypertension Reports. - 2018. - Т. 20. - № 2.
18. Cigarette Smoking and Cardiovascular Events: Role of Inflammation and Subclinical Atherosclerosis / J.W. McEvoy, M. J. Blaha, A. P. DeFilippis [и др.] // Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. - 2016. - Т. 35. - № 3. - С. 700-709.
19. Circulating miR-21 and eNOS in subclinical atherosclerosis in patients with hypertension / M. Cengiz, S. Yavuzer, B. K. Avci // Clinical and Experimental Hypertension. - 2015. - Т. 37. - № 8. - С. 643-649.
20. Clonal hematopoiesis and blood-cancer risk inferred from blood DNA sequence / G. Genovese, A. K. Kahler, R. E. Handsaker [и др.] // New England Journal of Medicine. - 2014. - Т. 371. - № 26. - С. 2477-2487.
21. Clonal Hematopoiesis and risk of atherosclerotic cardiovascular disease / S. Jaiswal, P. Natarajan, A. J. Silver [и др.] // New England Journal of Medicine. - 2017.
- Т. 377. - № 2. - С. 111-121.
22. Clonal hematopoiesis, with and without candidate driver mutations, is common in the elderly / F. Zink, S. N. Stacey, G. L. Norddahl [и др.] // Blood. - 2017. - Т. 130.
- № 6. - С. 742-752.
23. Colaianni V. Copy number variations and stroke / V. Colaianni, R. Mazzei, S. Cavallaro // Neurological Sciences. - 2016. - Т. 37. - № 12. - С. 1895-1904.
24. Combined GSTM1 AND GSTT1 null genotypes are strong risk factors for atherogenesis in a Serbian population / I. Grubisa, P. Otasevic, N. Vucinic [и др.] // Genetics and Molecular Biology. - 2018. - Т. 41. - № 1. - С. 35-40.
25. Comparison of HLA Antigen Spectrum in Atherosclerosis of Various Localization / Yu. P. Kovalev, N. Ya. Dzeranova, L. D. Serova [и др.] // Cor et Vasa.
- 1990. - Т. 32. - № 2. - С. 118-125.
26. Contributions of risk factors and medical care to cardiovascular mortality trends / M. Ezzati, Z. Obermeyer, I. Tzoulaki [и др.] // Nature Reviews Cardiology. - 2015.
- Т. 12. - № 9. - С. 508-530.
27. Copy number of pancreatic polypeptide receptor gene NPY4R correlates with body mass index and waist circumference / K. Shebanits, J. C. Andersson-Assarsson, I. Larsson [и др.] // PLoS ONE. - 2018. - Т. 13. - № 4. - С. 1-12.
28. Copy number variation in glutathione S-transferases M1 and T1 and ischemic vascular disease four studies and meta-analyses / M. S. Norskov, R. Frikke-Schmidt,
S. Loft [и др.] // Circulation: Cardiovascular Genetics. - 2011. - Т. 4. - № 4. - С. 418-428.
29. Copy Number Variation in Human Health, Disease, and Evolution / F. Zhang, W. Gu, M. E. Hurles [и др.] // Physiology & behavior. - 2017. - Т. 176. - № 1. - С. 139-148.
30. Copy-number variations in hepatoblastoma associate with unique clinical features / J. Wu, C. Lee, H. Chen [и др.] // Hepatology International. - 2013. - Т. 7. - № 1. - С. 208-214.
31. Deactivating Fatty Acids: Acyl-CoA Thioesterase-Mediated Control of Lipid Metabolism / V. Tillander, S. E. H. Alexson, D. E. Cohen [и др.] // Trends in Endocrinology & Metabolism. - 2018. - Т. 28. - № 7. - С. 473-484.
32. Deep coverage whole genome sequences and plasma lipoprotein(a) in individuals of European and African ancestries / S. M. Zekavat, S. Ruotsalainen, R. E. Handsaker [и др.] // Nature Communications. - 2018. - Т. 9. - № 1. - С. 1-14.
33. Domingo A. Genetics of Parkinson disease. Т. 147 / A. Domingo, C. Klein. - 1. - Elsevier B.V., 2018. - 211-227 с.
34. Early Somatic mosaicism is a rare cause of long-QT syndrome / J. R. Priest, C. Gawad, K. M. Kahlig [и др.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2016. - Т. 113. - № 41. - С. 11555-11560.
35. Elkon R. Characterization of noncoding regulatory DNA in the human genome / R. Elkon, R. Agami // Nature Biotechnology. - 2017. - Т. 35. - № 8. - С. 732-746.
36. Endothelial nitric oxide synthase gene intron 4 variable number tandem repeat polymorphism in 0-thalassemia major: Relation to cardiovascular complications / A. A. G. Tantawy, A. A. M. Adly, E. A. Ismail, S. H. Aly // Blood Coagulation and Fibrinolysis. - 2015. - Т. 26. - № 4. - С. 419-425.
37. Epidemiology of Atherosclerosis and the Potential to Reduce the Global Burden of Atherothrombotic Disease / W. Herrington, B. Lacey, P.l Sherliker [и др.] // Circulation Research. - 2016. - Т. 118. - № 4. - С. 535-546.
38. Ewing A. Breaking point: The genesis and impact of structural variation in tumours / A. Ewing, C. Semple // F1000Research. - 2018. - Т. 7. - С. 1-10.
39. Exome Sequencing Identifies Genetic Variants Associated with Circulating Lipid Levels in Mexican Americans: The Insulin Resistance Atherosclerosis Family Study (IRASFS) / C. Gao, K. Tabb, L. M. Dimitrov [и др.] // Scientific Reports. - 2018. - Т. 8. - № 1. - С. 1-9.
40. Forsberg L. A. Mosaicism in health and disease-clones picking up speed / L. A. Forsberg, D. Gisselsson, J. P. Dumanski // Nature Reviews Genetics. - 2017. - Т. 18. - № 2. - С. 128-142.
41. Gaillard H. Replication stress and cancer / H. Gaillard, T. Garcia-Muse, A. Aguilera // Nature Reviews Cancer. - 2015. - Т. 15. - № 5. - С. 276-280.
42. Genetic copy number variants in myocardial infarction patients with hyperlipidemia / W. Shia,T. Ku, Y. Tsao [и др.] // BMC Genomics. - 2011. - Т. 12. - № 3.
43. Genetics of coronary artery disease in the light of genome-wide association studies / H. Schunkert, M. Scheidt, T. Kessler [и др.] // Clinical Research in Cardiology. - 2018. - Т. 107. - № 2. - С. 2-9.
44. Genome-wide association analysis identifies novel blood pressure loci and offers biological insights into cardiovascular risk / H. R. Warren, E. Evangelou, C. P. Cabrera [и др.] // Nature Genetics. - 2017. - Т. 49. - № 3. - С. 403-415.
45. Genome-wide association analysis of Over 1 Million People Identifies 535 New Loci Associated With Blood Pressure Traits / E. Evangelou, H. R. Warren, D. Mosen- Ansorena [и др.] // Nature Genetics. - 2018. - Т. 50. - № 10. - С. 1412-1425.
46. Genomic factors (toll-like receptors genes) in development of atherosclerosis and its clinical manifestations / I. I. Zhidkova, A. V. Ponasenko, M. V. Khutornaya [и др.] // Medical Immunology (Russia). - 2017. - Т. 19. - № 3. - С. 241-254.
47. Genomic structural variations for cardiovascular and metabolic comorbidity / M. S. Nazarenko, A. A. Sleptcov, I. N. Lebedev [и др.] // Scientific Reports. - 2017. - Т. 7. - № 1. - С. 1-9.
48. Global variation in copy number in the human genome / R. Redon, S. Ishikawa,
K. R. Fitch [и др.] // Nature. - 2006. - Т. 444. - № 7118. - С. 444-454.
49. Haraksingh R. R. Impacts of variation in the human genome on gene regulation / R. R. Haraksingh, M. P. Snyder // Journal of Molecular Biology. - 2013. - Т. 425. - № 21. - С. 3970-3977.
50. Hayes M. Computational Analysis of Structural Variation in Cancer Genomes / M. Hayes // Methods in Molecular Biology. - 2019. - Т. 1878. - № Cml. - С. 65-83.
51. High frequency of activated natural killer and natural killer T-cells in patients with new onset of type 2 diabetes mellitus / H. Guo, B. Xu, L. Gao [и др.] // Experimental Biology and Medicine. - 2012. - Т. 237. - № 5. - С. 556-562.
52. Hypercholesterolemia Induces a Mast Cell-CD4 + T Cell Interaction in Atherosclerosis / E. Kritikou, T. Heijden, M. Swart [и др.] // The Journal of Immunology. - 2019. - Т. 202. - № 5. - С. 1531-1539.
53. Identification of novel nt-MGAM inhibitors for potential treatment of type 2 diabetes: Virtual screening, atom based 3D-QSAR model, docking analysis and ADME study / A. Laoud, F. Ferkous, L. Maccari [и др.] // Computational Biology and Chemistry. - 2018. - Т. 72. - С. 122-135.
54. IDOL N342S variant, atherosclerosis progression and cardiovascular disorders in the italian general population / A. Dhyani, G. Tibolla, A. Baragetti [и др.] // PLoS ONE. - 2015. - Т. 10. - № 4. - С. 1-12.
55. Initial sequencing and analysis of the human genome / E. S. Lander, L. M. Linton, B. Birren [и др.] // Nature. - 2001. - Т. 409. - № 2. - С. 860-921
56. Interferon-induced guanylate-binding proteins: Guardians of host defense in health and disease / K. Tretina, E. Park, A. Maminska, J. D. MacMicking // Journal of Experimental Medicine. - 2019. - Т. 216. - № 3. - С. 482-500.
57. Interleukin-6 gene polymorphism, chronic stress and atherosclerosis. / N. Chumaeva, M. Hintsanen, L. Pulkki-Raback [и др.] // Journal of Psychosomatic Research. - 2014. - Т. 76. - № 4. - С. 333-338.
58. Interleukin-6 receptor Asp358Ala gene polymorphism is associated with plasma C-reactive protein levels and severity of aortic valve stenosis / E. Wypasek, D. P. Potaczek, M. Lamplmayr [и др.] // Clinical Chemistry and Laboratory Medicine. - 2014. - Т. 52. - № 7. - С. 1049-1056.
59. Liu S.L. Association between KIR gene polymorphisms and type 1 diabetes mellitus (T1DM) susceptibility / S. L. Liu, A. J. Zheng, L. Ding // Medicine (United States). - 2017. - Т. 96. - № 52.
60. Loss of heterozygosity: What is it good for? / G. L. Ryland, M. A. Doyle, D. Goode [и др.] // BMC Medical Genomics. - 2015. - Т. 8. - № 1. - С. 1-12.
61. Low Salivary Amylase Gene (AMY1) Copy Number Is Associated with Obesity and Gut Prevotella Abundance in Mexican Children and Adults / P. Leon-Mimila, H. Villamil-Ramirez, B. E. Lopez-Contreras [и др.] // Nutrients. - 2018. - Т. 10. - № 11.
- С. 1-12.
62. MacConaill L. E. Clinical implications of the cancer genome / L. E. MacConaill,
L. A. Garraway // Journal of Clinical Oncology. - 2010. - Т. 28. - № 35. - С. 5219-5228.
63. Arlt M. F. Replication Stress and Mechanisms of CNV Formation / M. F. Arlt,
T. E. Wilson, T. W. Glover // Current Opinion in Genetics & Development. - 2012. - Т. 22. - № 3. - С. 204-210.
64. Measurement of absolute copy number variation reveals association with essential hypertension / F. Z. Marques, P. R. Prestes, L. B. Pinheiro [и др.] // BMC Medical Genomics. - 2014. - Т. 7. - № 1. - С. 1-8.
65. Meta-analysis of genome-wide association studies from the CHARGE consortium identifies common variants associated with carotid intima media thickness and plaque / J. C. Bis, M. Kavousi, N. Franceschini [и др.] // Nature Genetics. - 2011.
- Т. 43. - № 10. - С. 940-948.
66. Microduplication of 10q26.3 in a Chinese hypertriglyceridemia patient / J.J. Li, Y. Chen, L. Fan [и др.] // Molecular and Cellular Probes. - 2018. - Т. 37. - № 11. - С. 28-31.
67. Mobile element insertion detection in 89,874 clinical exomes / R. I. Torene, K. Galens, S. Liu [и др.] // Genetics in Medicine. - 2020. - № 22. - С. 974-978.
68. Molecular analysis of the GSTT1 gene polymorphism in patients with clinical manifestation of atherosclerosis / J. V. M. Martins, D. A. Rodrigues, K. S. F. Silva [и др.] // Genetics and Molecular Research. - 2017. - Т. 16. - № 3.
69. New biomarkers for atherothrombosis in antiphospholipid syndrome: Genomics and epigenetics approaches / C. Lopez-Pedrera, N. Barbarroja, A. M. Patino-Trives [и др.] // Frontiers in Immunology. - 2019. - Т. 10. - № 3. - С. 1-16.
70. New insights into the role of inflammation in the pathogenesis of atherosclerosis / M. Wu, C. Li, M. Hou, P. Chu [и др.] // International Journal of Molecular Sciences.
- 2017. - Т. 18. - № 10.
71. Nowell P. The clonal evolution of Tulor Cell Populations / P. Nowell // Science.
- 1976. - Т. 194. - № 4260.
72. Owen M. J. Schizophrenia and the neurodevelopmental continuum:evidence from genomics / M. J. Owen, M. C. O’Donovan // World Psychiatry. - 2017. - Т. 16.
- № 3. - С. 227-235.
73. Park I. Functional diversity of macrophages in vascular biology and disease / I. Park, C. Kassiteridi, C. Monaco // Vascular Pharmacology. - 2017. - Т. 99. - № October. - С. 13-22.
74. Pathology of human coronary and carotid artery atherosclerosis and vascular calcification in diabetes mellitus / K. Yahagi, F. D. Kolodgie, C. Lutter [и др.] // Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. - 2017. - Т. 37. - № 2. - С. 191-204.
75. Prevalence of cardiovascular disease in type 2 diabetes: A systematic literature review of scientific evidence from across the world in 2007-2017 / T. R. Einarson, A. Acs, C. Ludwig, U. H. Panton [и др.] // Cardiovascular Diabetology. - 2018. - Т. 17.
- № 1. - С. 1-19.
76. Protective Effects of Acyl-coA Thioesterase 1 on Diabetic Heart via PPARa/PGC1a Signaling / S. Yang, C. Chen, H. Wang [и др.] // PLoS ONE. - 2012.
- Т. 7. - № 11.
77. Rare chromosomal deletions and duplications in attention-deficit hyperactivity disorder: A genome-wide analysis / N. M. Williams, I. Zaharieva, A. Martin [и др.] // The Lancet. - 2010. - Т. 376. - № 9750. - С. 1401-1408.
78. Razmara E. Whole-exome sequencing identifies R1279X of MYH6 gene to be associated with congenital heart disease / E. Razmara, M. Garshasbi // BMC Cardiovascular Disorders. - 2018. - Т. 18. - № 1. - С. 1-7.
79. Relationship of a Body Shape Index and Body Roundness Index with carotid atherosclerosis in arterial hypertension / G. Geraci, M. Zammuto, R. Gaetania [и др.] // Nutrition, Metabolism and Cardiovascular Diseases. - 2019. - Т. 29. - № 8. - С. 822-829.
80. Resveratrol ameliorates low shear stress-induced oxidative stress by suppressing ERK/eNOS-Thr495 in endothelial cells / Z. Wang, J. Zhang, B. Li [и др.] // Molecular Medicine Reports. - 2014. - Т. 10. - № 4. - С. 1964-1972.
81. Risques R. A. Aging and the rise of somatic cancer-associated mutations in normal tissues / R. A. Risques, S. R. Kennedy // PLoS Genetics. - 2018. - Т. 14. - № 1. - С. 1-12.
82. Robust identification of mosaic variants in congenital heart disease / K. B. Manheimer, F. Richter, L. J. Edelmann [и др.] // Human Genetics. - 2019. - Т. 137. - № 2. - С. 183-193.
83. Salzberg S. L. Open questions: How many genes do we have? / S. L. Salzberg // BMC Biology. - 2018. - Т. 16. - № 1. - С. 10-12.
84. Sex differences in vascular physiology and pathophysiology: Estrogen and androgen signaling in health and disease / A. C. Boese, S. C. Kim, K. Yin [и др.] // American Journal of Physiology - Heart and Circulatory Physiology. - 2017. - Т. 313. - № 3. - С. H524-H545.
85. Siglec-5 is a novel marker of critical limb ischemia in patients with diabetes / J. Li, X. Yang, X. Wang [и др.] // Scientific Reports. - 2017. - Т. 7. - № 1. - С. 1-9.
86. Single-neuron sequencing analysis of l1 retrotransposition and somatic mutation in the human brain / G. D. Evrony, X. Cai, E. Lee [и др.] // Cell. - 2012. - Т. 151. - № 3. - С. 483-496.
87. Six novel susceptibility loci for coronary artery disease and cerebral infarction identified by longitudinal exome-wide association studies in a Japanese population / Y. Yasukochi, J. Sakuma, I. Takeuchi [и др.] // Biomedical Reports. - 2018. - Т. 9. - № 2. - С. 123-134.
88. Somatic mosaicism for copy-neutral loss of heterozygosity and DNA copy number variations in the human genome / O. Zilina, M. Koltsina, R. Raid [и др.] // BMC Genomics. - 2015. - Т. 16. - № 1. - С. 1-10.
89. Spielmann M. Structural variation in the 3D genome / M. Spielmann, D. G. Lupianez, S. Mundlos // Nature Reviews Genetics. - 2018. - Т. 19. - № 7. - С. 453¬467.
90. Systemic inflammatory response and atherosclerosis: The paradigm of chronic inflammatory rheumatic diseases / A. Arida, A. D. Protogerou, G. D. Kitas, P. P. Sfikakis // International Journal of Molecular Sciences. - 2018. - Т. 19. - № 7. - С. 1-27.
91. Takumi T. CNV biology in neurodevelopmental disorders / T. Takumi, K. Tamada // Current Opinion in Neurobiology. - 2018. - Т. 48. - С. 183-192.
92. TNFA-308 (rs1800629) polymorphism is associated with a higher risk of cardiovascular disease in patients with rheumatoid arthritis / L. Rodriguez-Rodriguez, C. Gonzalez-Juanatey, R.Palomino-Morales [и др.] // Atherosclerosis. - 2011. - Т. 216. - № 1. - С. 125-130.
93. Transcriptional profiling of foam cells reveals induction of guanylate-binding proteins following western diet acceleration of atherosclerosis in the absence of global changes in inflammation / Y. Goo, S. Son, V. K. Yechoor, A. Paul [и др.] // Journal of the American Heart Association. - 2016. - Т. 5. - № 4.
94. Transcriptome-Wide Association Study (TWAS) Identifies Novel Candidate Susceptibility Genes for Pancreatic Cancer / J. Zhong [и др.] // JNCI: Journal of the National Cancer Institute. - 2020. - Т. 4.
95. Tubio J. M. C. Somatic structural variation and cancer / J. M. C. Tubio // Briefings in Functional Genomics. - 2015. - Т. 14. - № 5. - С. 339-351.
96. Vatsa N. UBE3A and its link with autism / N. Vatsa, N. R. Jana // Frontiers in Molecular Neuroscience. - 2018. - Т. 11. - № 12. - С. 1-8.
97. Vijg J. Genome Instability and Aging / J. Vijg, Y. Suh // Annual Review of Physiology. - 2013. - Т. 75. - № 1. - С. 645-668.
98. Weckselblatt B. Human Structural Variation: Mechanisms of Chromosome Rearrangements / B. Weckselblatt, M. K. Rudd // Trends in Genetics. - 2015. - Т. 31. - № 10. - С. 587-599.
99. ZDHHC11 and ZDHHC11B are critical novel components of the oncogenic MYC-miR-150-MYB network in Burkitt lymphoma / A. Dzikiewicz-Krawczyk, K. Kok, I. Slezak-Prochazka [и др.] // Leukemia. - 2017. - Т. 31. - № 6. - С. 1470-1473.


Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.




©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ
.