1. Введение
2. Цель и задачи иследования
3. Обзор литературы
3.1 История изучения амёб семейства Thecamoebidae и его современное
положение в системе лобозных амёб
3.2 Родовой состав семейства Thecamoebidae
3.3 Морфология и организация клетки представителей семейства
Thecamoebidae
3.4 Экология и биоразнообразие
4. Материал и методики
5. Результаты
5.1 Описание выделенных штаммов
5.2 Молекулярные данные
6. Обсуждение
Основные полученные результаты
7. Выводы
8. Благодарности
9. Список литературы
Лобозные амёбы семейства Thecamoebidae (Amoebozoa, Discosea, Thecamoebida) широко распространены в природе и известны из самых различных местообитаний - пресноводных, морских и почвенных. Часто они присутствуют в высевах проб, содержащих отмершие части растений. Благодаря сравнительно крупным размерам большинства их представителей (40 - 150 мкм) и относительно простому культивированию в лабораторных условиях текамебиды являются удобным объектом для цитологических работ и работ в области изучения амебоидного движения. Семейство Thecamoebidae - одно из немногих (если не единственное) семейство амёб, представители которого во многих случаях могут быть определены до вида на светомикроскопическом уровне, поэтому они потенциально могут являться удобным маркером при фаунистических и экологических исследованиях.
Амёб семейства Thecamoebidae легко распознать по характерной морфологии клетки - во время движения они не образуют дискретных псевдоподий. Тело их вытягивается по направлению движения, на поверхности образуются складки; некоторые представители имеют на дорсальной стороне хорошо заметные продольные гребни (количество гребней часто является определительным признаком). В передней части тела образуется широкая зона гиалоплазмы, нередко продолжающаяся на боковые стороны клетки. Сократительная вакуоль часто одна; обычно она смещается на задний конец клетки. В гранулоплазме отчетливо видно одно (роды Thecamoeba и Stenamoeba) или два ядра (род Sappinia) с разнообразными ядрышками (для многих видов строение ядрышка интерфазной клетки является определительным признаком), форма и количество ядрышек меняется во время и после митотического деления.
Первые представители семейства Thecamoebidae известны с конца XIX века (Carter, 1856), и были объектом активного изучения во второй половине XX века. Большинство представителей семейства описаны только с использованием светомикроскопических методов. Таким образом, ультраструктура, особенности биологии и пищевой спектр многих видов остаются неизвестными и требуют отдельного изучения. По мере развития методов световой микроскопии, уточнения стали требовать и многие морфологические данные.
Особый интерес вызывают представители центрального рода Thecamoeba, на котором нами было сконцентрирована большая часть нашего внимания. Многие типовые штаммы были утрачены из коллекций, а данные по ним фрагментарны и нуждаются в пополнении и подтверждении. Последнее монографическое описание рода Thecamoeba датировано 1977 годом и содержит только светомикроскопические данные, а для всего семейства ревизия не была выполнена никогда (Page, 1977).В тоже время текамебиды очень часто присутствуют в накопительных культурах, полученных из проб природных местообитаний, из чего можно полагать, что их видовое разнообразие остается недоисследованным.
Состав семейства и его систематическое положение менялись несколько раз, но в основе системы до недавнего времени лежали только морфологические признаки амёб. Фактически к этому семейству в разных классификациях относили всех уплощенных и обладающих более-менее упругим (на вид) клеточным покровом амёб. Некоторые текамёбо-подобные амёбы (например, Pseudothecamoeba, Thecochaos) так и не были надежно помещены ни в семейство Thecamoebidae, ни в какое-либо иное семейство. После внедрения в практику молекулярных методов, состав семейства в том смысле, в котором его подразумевал Пэйдж, претерпел большие изменения: часть родов, были распределены по другим семействам, в то время как некоторые представители других семейств были напротив включены в состав текамебид. В настоящей работе мы используем семейство Thecamoebidae в том составе, в котором оно установлено в современной системе амебоидных протистов (Smirnov et al. 2011).
В ходе наших работ по изучению биоразнообразия почвенных и наземных лобозных амёб мы обнаружили, что из наземных проб, содержащих отмершие части растений и верхний слой почвы, можно выделить неожиданно большое количество видов текамёб. Нами было выделено 33 штамма текамеб, содержащие 10 уникальных видов из разных географических точек. Некоторые можно определить как известные виды (Thecamoeba aesculea, T. similis и T. quadrilineata), однако есть несколько штаммов, которые вероятно являются новыми для науки видами. Филогенетические данные показывают, что в род Thecamoeba является монофилетической группой, однако в рамках рода можно выделить как минимум две крупные ветви, которые так же коррелируют с морфологическими признаками. Подобная находка позволяет приступить к работе по переисследованию известных видов, описанию новых видов и подготовке материалов для монографического описания семейства Thecamoebidae.
• Выделение нами многочисленных штаммов амёб, входящих в состав семейства Thecamoebidae, из наземных местообитаний и обнаружение нескольких новых видов показывает, что разнообразие семейства остается существенно недоисследованным. Одним из очагов биоразнообразия амёб рода Thecamoeba являются почва, опад, растительный лом и кора деревьев.
• Семейство Thecamoebidae и входящие в его состав роды Thecamoeba, Sappinia и Stenamoeba являются монофилетическими таксонами. Среди представителей рода Thecamoeba существуют виды, схожие по морфологии локомоторной формы и ядра, но хорошо различимые по молекулярным данным.
• Род Thecamoeba имеет две хорошо различимые молекулярно и морфологически ветви амёб с различным строением ядрышка.
• Морфологическое сходство выделенных штаммов с известными видами, но их очевидное различие по молекулярным данным показывает, что некоторые морфологические виды рода Thecamoeba представляют собой группы «скрытых» видов.
