📄Работа №217591

Тема: Определение липофильности ингибиторов PI3K

📝
Тип работы Бакалаврская работа
📚
Предмет Химия
📄
Объем: 51 листов
📅
Год: 2021
👁️
Просмотров: 1
Не подходит эта работа?
Закажите новую по вашим требованиям
Узнать цену на написание
ℹ️ Настоящий учебно-методический информационный материал размещён в ознакомительных и исследовательских целях и представляет собой пример учебного исследования. Не является готовым научным трудом и требует самостоятельной переработки.

📋 Содержание

Аннотация
Введение 6
1 Литературный обзор 8
1.1 Понятие липофильности 8
1.2 Правила Липинского в дизайне ингибиторов киназ 9
1.3 Влияние липофильности на ADMET характеристики 18
1.4 Методы определения липо фильности 21
1.4.1 Метод «встряхивания» 21
1.4.2 Метод титрования 23
1.4.3 Хроматографические методы 23
2 Обсуждение результатов 30
3 Экспериментальная часть 39
3.1 Реагенты и оборудование 39
3.2 Объекты исследования 39
3.3 Методика проведения эксперимента 41
3.4 Определение значения фактора удерживания 41
Заключение 43
Список используемой литературы 45

📖 Аннотация

В данной бакалаврской работе проведено исследование, направленное на определение липофильности ряда перспективных ингибиторов фосфоинозитид-3-киназы (PI3K) с использованием метода обращенно-фазовой высокоэффективной жидкостной хроматографии (ОФ-ВЭЖХ). Актуальность исследования обусловлена ключевой ролью PI3K в сигнальных путях онкогенеза, что делает её важной мишенью для разработки новых противоопухолевых препаратов, а липофильность является критическим параметром, влияющим на фармакокинетику и биодоступность потенциальных лекарственных средств. В ходе работы была установлена высоколинейная корреляция (R=0.989) между логарифмом коэффициента распределения в системе октанол-вода (logP) и хроматографическим параметром удерживания (logk₀) для набора референсных соединений, что подтвердило валидность применяемого хроматографического подхода. На основе полученного калибровочного уравнения экспериментально определены значения липофильности для серии новых производных 5-цианопиримидина, рассматриваемых в качестве пероральных ингибиторов киназ. Результаты работы демонстрируют принципиальную возможность применения правил Липинского, включая критерий липофильности (logP), для рационального дизайна ингибиторов киназ, что согласуется с выводами таких исследователей, как Parang K. et al., изучавших механизм-ориентированный дизайн ингибиторов протеинкиназ, Schroder M. et al., анализировавших основы селективности, и Thakur A. et al., разрабатывавших ингибиторы PI3K. Научная значимость работы заключается в оптимизации методики скрининга липофильности, а практическая – в предоставлении количественных данных для отбора наиболее перспективных соединений-кандидатов на дальнейшие доклинические исследования в рамках разработки новых противораковых препаратов.

📖 Введение

Открытие лекарств - важный шаг в разработке новых лекарственных препаратов. Обычная процедура начинается с рассмотрения большого количества новых потенциальных молекул, которые тестируют против биохимических мишеней и выбирают те, которые проявляют значительную активность и могут рассматриваться как кандидаты для дальнейшей разработки.
Протеинкиназы составляют одно из крупнейших семейств белков в геноме человека, состоящее более чем из 500 представителей [1]. Их строго контролируемая каталитическая активность играет решающую роль в регуляции передачи сигналов в клетках. Передача сигнала через протеинкиназные каскады играет ключевую роль в процессах жизнедеятельности как здоровых клеток, так и раковых. Изменение функций киназ из-за мутаций или сверхэкспрессия часто приводит к развитию широкого спектра заболеваний. Поэтому в настоящее время многие исследователи нацелены на разработку программ синтеза ингибиторов киназ [2].
Например, большим противораковым потенциалом обладают ингибиторы фосфоинозитид-3-киназы (PI3K) [3-6]. Эти низкомолекулярные соединения вмешиваются в ключевой для развития раковой опухоли путь, который помогает злокачественным клеткам выживать и пролиферировать. За последнее время было предпринято много попыток создания эффективного и безопасного ингибитора PI3K. На фармацевтическом рынке на данный момент присутствуют три представителя этого класса: Иделалисиб, Копанлисиб и Алпелисиб. Поэтому в настоящее время стратегическим направлением в терапии рака стала разработка ингибиторов киназ, в частности PI3K.
При молекулярном докинге изучаемых молекул основным правилом для выбора «молекулы-хита» является соответствие правилу Липинского 6
(правило пяти). Если молекула полностью соответствует указанному выше правилу, то, почти со стопроцентной вероятностью, такое соединение будет выступать в роли эффективного лекарства.
Цель работы: определение экспериментальных значений
липофильности впервые синтезированных ингибиторов PI3K киназ в структурном ряду производных 5-цианопиримидина.
Задачи работы:
- Ознакомиться с правилами Липинского и их физико-химическим обоснованием.
- Установить применимость правил в дизайне ингибиторов киназ.
- В ходе ряда экспериментов определить факторы удерживания соединений, взятых в качестве стандарта.
- Вывести основное уравнения для расчета липофильности изучаемых производных 5-цианопиримидинов и рассчитать ее значения.

Возникли сложности?

Нужна качественная помощь преподавателя?

👨‍🎓 Помощь в написании

✅ Заключение

В ходе данной бакалаврской работы была достигнута цель, а также выполнены поставленные задачи. По проделанной исследовательской работе можно сделать следующие выводы:
1. Осуществлена литературная проработка по заданной теме, в ходе которой определены эффективные методы экспериментального определения значений липофильности. Показано, что наряду с классическим методом определения гидрофобности в системе н-октанол - вода, все большее распространение принимают методы ВЭЖХ в режиме обращенно-фазового варианта. Показатель липофильности (гидрофобности) один из ключевых параметров в правилах Липинского. Установлена принципиальная возможность использования правил Липинского в дизайне ингибиторов киназ. Проанализированы основные обзоры в этом направлении.
2. В ходе лабораторных экспериментов определены факторы
удерживания для 6 веществ, взятых за стандарты. Для данных соединений известны значения коэффициента гидрофобности. Набор соединений отражает различные типы межмолекулярных взаимодействий.
Коэффициенты гидрофобности данных веществ прокоррелированы с фактором удерживания в ОФ ВЭЖХ. По полученным результатам выведено уравнение, связывающее между собой величины logk0 и logPo/w, с коэффициентом корреляции 0,989.
3. В условиях ВЭЖХ исследованы производные 5-цианопиримидинов. Данные соединения являются перспективными в качестве ингибиторов киназ с ожидаемым перроральным способом введения. Для такого способа введения, а также для проверки правила 5 Липинского, параметр липофильности является одним из ключевых. По результатам хроматографического эксперимента, по полученному в работе уравнению рассчитаны коэффициенты гидрофобности log P для 5-цианопиримидинов.
4. Наименьшее значение липофильности было получено для
соединения PHD-168, наибольшее - для PHD-174. Данные значения хорошо согласуются с природой заместителей при основном скафольде
цианопиримидинов, а именно с их объемом, поляризуемостью и
гидрофобностью. В целом, все изученные в работе соединения
соответствуют правилам Липинского, за исключением значения гидрофобности для PHD-174 (4-(4-(1Н-пирроло[2,3-Ь]пиридин-3-ил)-5,6-
дигидропиридин-1 (2Н)-ил)-2-морфолино-6-(пиридин-3 -ил)-5-ционопирими- дина), которое занимает пограничное значение. Следовательно, исследованные 5-цианопиримидины могут быть рекомендованы для
дальнейшего исследования их в качестве ингибиторов киназ.

Нужна своя уникальная работа?
Срочная разработка под ваши требования
Рассчитать стоимость
ИЛИ

📕 Список литературы

1. Parang, K. Mechanism-based design of a protein kinase inhibitor / K. Parang, J. H. Till, A. J. Ablooglu et al. // Nature structural biology. - 2001. - Vol. 8. - P. 37-41.
2. Schro der M. DFG-1 Residue Controls Inhibitor Binding Mode and Affinity, Providing a Basis for Rational Design of Kinase Inhibitor Selectivity / M. Schroder, A. N. Bullock, O. Fedorov et al. // Journal of Medicinal Chemistry. - 2020. - Vol. 63. - №. 18. - P. 10224-10234.
3. Lawrence M. S. Discovery and saturation analysis of cancer genes across 21 tumour types / M. S. Lawrence, P. Stojanov, C. H. Mermel et al. // Nature. - 2014. - Vol. 505. - №. 7484. - P. 495-501.
4. Thakur A. Design, synthesis, and biological evaluation of quinazolin-4- one-based hydroxamic acids as dual PI3K/HDAC inhibitors / A. Thakur, G. J. Tawa, M. J. Henderson et al. // Journal of medicinal chemistry. - 2020. - Vol. 63. - №. 8. - P. 4256-4292.
5. Yu Y. Design, synthesis, and biological evaluation of imidazo[1, 2-a] pyridine derivatives as novel PI3K/mTOR dual inhibitors / Y. Yu, Y. Han, F. Zhang et al. // Journal of medicinal chemistry. - 2020. - Vol. 63. - №. 6. - P. 3028-3046.
6. Zhang M. PI3K inhibitors: review and new strategies / M. Zhang, H. Jang, R. Nussinov // Chemical Science. - 2020. - Vol. 11. - №. 23. - P. 5855-5865.
7. Waring M. J. Lipophilicity in drug discovery // Expert opin drug discov. - 2010. - Vol. 5. - P. 235-248.
8. Gaudette L. E. Relationship between the lipid solubility of drugs and their oxidation by liver microsomes / L. E. Gaudette, B. B. Brodie // Biochemical pharmacology. - 1959. - Vol. 2. - №. 2. - P. 89-96.
9. Leo A. Partition coefficients and their uses / A. Leo, C. Hansch, D. Elkins // Chemical reviews. - 1971. - Vol. 71. - №. 6. - P. 525-616.
10. Arnott J. A., Planey S. L. The influence of lipophilicity in drug discovery and design // Expert opinion on drug discovery. - 2012. - Vol. 7. - №. 10. - P. 863-875.
11. Tsopelas F. Lipophilicity and biomimetic properties to support drug discovery / F. Tsopelas, C. Giaginis, A. Tsantili-Kakoulidou //Expert opinion on drug discovery. - 2017. - Vol. 12. - №. 9. - P. 885-896.
12. Lipinski C. A. Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings / C. A. Lipinski, F. Lombardo, B. W. Dominy et al. // Adv. Drug Deliv. Rev. - 2001. - Vol. 46, № 3. - P. 3-26.
13. Tsopelas F. Lipophilicity and biomimetic properties to support drug discovery / F. Tsopelas, C. Giaginis, A. Tsantili-Kakoulidou // Expert opinion on drug discovery. - 2017. - Vol. 12. - №. 9. - P. 885-896.
14. Merour J. Y. The azaindole framework in the design of kinase inhibitors / J. Y. Merour, F. Buron, K. Ple et al. // Molecules. - 2014. - Vol. 19. - №. 12. - P. 19935-19979.
15. Carles F. PKIDB: A curated, annotated and updated database of protein kinase inhibitors in clinical trials / F. Carles, S. Bourg, C. Meyer et al. // Molecules. - 2018. - Vol. 23. - №. 4. - P. 908...61

🖼 Скриншоты

🛒 Оформить заказ

Работу высылаем в течении 5 минут после оплаты.
Предоставляемые услуги, в том числе данные, файлы и прочие материалы, подготовленные в результате оказания услуги, помогают разобраться в теме и собрать нужную информацию, но не заменяют готовое решение.
Укажите ник или номер. После оформления заказа откройте бота @workspayservice_bot для подтверждения. Это нужно для отправки вам уведомлений.

©2026 Cервис помощи студентам в выполнении работ