Тип работы:
Предмет:
Язык работы:


Распределение генотипов гена фиколина (FCN2) в популяциях Красноярского края

Работа №21520

Тип работы

Бакалаврская работа

Предмет

физика

Объем работы43
Год сдачи2018
Стоимость5900 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
327
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


Реферат 2
Введение 3
1.1 Тенденции формирования здоровья популяций, проживающих в условиях крайнего севера Красноярского края 5
1.2 Популяционный состав Красноярского края 10
1.2.1 Коренные народы. Тунгусо-маньчжуры 11
1.2.2 Коренные народы. Тюрки 12
1.2.3 Коренные народы. Самодийцы 13
1.3 Лектины 15
1.3.1 Маннозосвязывающий лектин
1.3.2 Влияние MBL на течение заболеваний новорожденных 19
1.3.3 Фиколины и их влияние на течение инфекционных заболеваний 20
2 Материалы и методы 23
2.1 Группы 23
2.2 Выделение ДНК по протоколу DNAprep 24
2.3 Метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) 26
2.4 Метод рестрикционного анализа 27
2.5 Метод электрофоретической детекции 27
2.6 Статистический анализ 29
3 Результаты и обсуждение 31
3.1 Распределение частот генотипов гена фиколинау новорожденных
различных популяций Красноярского края 31
Заключение
Список используемых источников


Младенческая смертность является важной характеристикой общего состояния здоровья и уровня жизни населения страны. Показано, что генетически обусловленные особенности метаболизма и иммунных реакций у детей коренных народов Севера могут способствовать тяжелому течению распространенных инфекционных заболеваний с повышенным риском смертности в младенческом возрасте [1].
Наиболее актуальными заболеваниями для раннего возраста с высоким риском неблагоприятных исходов являются инфекции респираторного тракта и центральной нервной системы, вызванные группой инкапсулированных бактерий (Streptococcuspneumoniae, Neisseriameningitidis, Haemophilusinfluenzae) [2].
Лектин-опосредованная активация комплемента является одним из важных путей первой линии неспецифической защиты от инфекций. В настоящее время известно несколько молекул, активирующих лектиновый путь активации комплемента: фиколины и коллектины (маннозосвязывающий лектин (mannosebindinglectin, MBL), печеночный коллектин-1 (collectinliver-1) и почечный коллектин-1 (collectinkidney-1)). Фиколины структурно и функционально гомологичны MBL, обладают способностью фиксироваться к углеводным компонентам бактерий с последующей активацией комплемента. Высокие показатели младенческой смертности в коренных популяциях арктических территорий России предположительно могут быть связаны с дефектами иммунной системы, вызванными вариантами гена L-фиколина (FCN2) [1].
До настоящего времени не проведен анализ полиморфизма генов, ассоциированных с нарушением отдельных путей иммунного реагирования, не исследованы распределения частот генотипов, предрасполагающих к тяжелому течению инфекций у детей раннего возраста в Арктических регионах России [2].
Целью настоящей работы является оценка распределения генотипов гена фиколина FCN2 (в точках rs7851696 и rs17549193), в популяциях Красноярского края.
Для достижения цели были поставлены следующие задачи:
1. Выделить ДНК из сухих пятен крови от младенцев из разных популяций Красноярского края (долган - нганасане, ненцы, европейцы) с помощью метода с использованием сорбента по протоколу DIAtom™ DNA Prep.
2. Провести генотипирование аллельных вариантов гена FCN2 (в точках rs7851696 и rs17549193) используя методы: полимеразной цепной реакции, рестрикционного анализа продуктов амплификации и электрофоретической детекции в агарозном геле.
3. Провести сравнительную характеристику и выявить особенности распределения частоты генотипов гена FCN2 в популяциях Красноярского края (долган - нганасане, ненцы, европейцы).
Работа выполнена в Красноярском Федеральном государственном бюджетном научном учреждении «Федеральный исследовательский центр «Красноярский научный центр Сибирского отделения Российской академии наук» (ФГБНУ ФИЦ КНЦ СО РАН, КНЦ СО РАН) Научно-исследовательский институт медицинских проблем Севера (НИИ МПС)


Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!


Таким образом, результаты, полученные в настоящем исследовании, позволяют предположить, что арктические популяции Восточной Сибири характеризуются специфичностью генетического состава, ответственного за активность L- фиколина. Можно предположить, что популяции Арктики характеризуются генетической предрасположенностью к более высокому уровню функциональной активности L-фиколина по сравнению с европеоидной популяцией. Показано, что население ненцев имеет несколько важных особенностей по сравнению с долганами-нганасанами: более низкая распространенность аллеля T для полиморфизма rs17549193 и более высокая распространенность аллеля T для полиморфизма rs7851696. Результаты текущего показывают, что население ненцев имеет самый высокий уровень неспецифической противоинфекционной защиты по сравнению с другими популяциями Восточной Сибири. Дополнительный анализ заболеваемости инфекционными болезнями в изученных популяциях позволит выявить фенотипические характеристики населения ненцев, связанные с повышенной функциональной способностью L-фиколина как одного из важных агентов инфекции первого ряда защитного агента.


1. Смольникова, М. В. Полиморфизм гена L-фиколина (FCN2) в арктических популяциях России / М. В. Смольникова, В. Б. Епанешникова, С. Н. Зобова, С. Ю. Терещенко // НИИ медицинских проблем Севера ФИЦ КНЦ СО РАН, Красноярск, России
2. Смольникова, М. В. Этнически ассоциированные факторы риска высокого уровня младенческой смертности у детей коренного населения крайнего севера: исследование генетической предрасположенности (mbl2, fcn2) к инфекционным заболеваниям / М. В. Смольникова, В. Б. Епанешникова, С. Ю. Терещенко // Медицинская Иммунология. - Санкт - Петербург, 2017. - Т. 19, Специальный выпуск. - С. 82 -83
3. Макарова, В. И. Основные проблемы здоровья детей на Севере России /
B. И. Макарова, Л. И. Меньшикова // Экология человека. - 2003. - № 1. - С. 39¬41.
4. Зубов, Л. А. Медико-социальные проблемы детей коренного населения Ненецкого автономного округа / Л. А. Зубов, Г. Н. Дегтева, Е. Н. Сибилева. // Проблемы адаптации человека к экологическим и социальным условиям севера: Сыктывкар. - 2004. - С. 43-45.
5. Капустина, Т. А. Этнические особенности распространенности хронических заболеваний уха, горла и носа у детей северных регионов Восточной Сибири / Т. А. Капустина // Педиатрия. - 2001. - № 2. - С. 49-51.
6. Пряхин, Е. И. Медико-биологические аспекты здоровья детей на Севере / Е. И. Пряхин // Сибирское медицинское обозрение . - 2002 . - № 1 . -C. 3-7.
7. Артемова, Н. А. Состояние здоровья детей города Северодвинска - Государственного Российского Центра атомного судостроения / Н. А. Артемова, Л. И. Меньшикова, Л. А. Ошуркова // Экология человека. - 2003. - № 6. - С. 34-37.
8. Голикова, О. И. Гигиенические принципы прогнозирования состояния здоровья детского населения Крайнего Севера / О. И. Голикова // Гигиеническая наука и практика на рубеже XXI века: Материалы IX Всероссийского съезда гигиенистов и санитарных врачей. - Москва, 2001. - Т. 2. - С. 306-309.
9. Чернев, А. В. Некоторые вопросы охраны здоровья детей Кольского Севера / А. В. Чернев, С. В. Дмитриевская, И. В. Анохина // Гигиеническая наука и практика на рубеже XXI века. Материалы IX Всероссийского съезда гигиенистов и санитарных врачей. - Москва, 2001. - Т. 2. - С. 523-526.
10. Теддер, Ю. Р. Состояние здоровья и адаптация первоклассников к обучению в школе в условиях Севера / Ю. Р. Теддер, Т. С. Копосова // Экология человека. - 2000. - № 2. - С. 44-46.
11. Токарев, С. А. Основные тенденции в отношении факторов риска и здоровья подростков на Крайнем Севере / С. А. Токарев, Е. Л. Уманская, А. А. Буганов // Медицина труда и промышленная экология. - 2003. - № 9. - С. 29¬
32.
12. Ковызина, О. Л., Функциональные показатели школьников Северного города / О. Л. Ковызина, О. Н. Лепунова, С. В. Панин, В. С. Соловьев // Экология человека. - 2000. - № 2. - С. 41-43.
13. Усынина, А. А. Факторы риска перинатальной патологии. Состояние здоровья новорожденных детей в условиях Европейского Севера / А. А. Усынина, М. В. Усынин // Экология человека. - 2001. - № 1. - С. 43- 46.
14. Шарапова, О. В. Всероссийская диспансеризация: основные тенденции в состоянии здоровья детей / О. В. Шарапова, Царегородцев А. Д. // Российский вестник перинатологии и педиатрии. - 2004 - № 1. - С. 56- 60.
15. Юрьев, В. К. Социально - психологическая оценка репродуктивного здоровья школьниц Крайнего Севера / В. К. Юрьев, А. А. Наумова, В. Е. Самохвалов // Экология человека. - 2001. - № 1. - С. 53-55.
16. Кудря, Л. М. Протективная роль питания детей дошкольного возраста в условиях Европейского Севера: Автореферат. ... канд. мед .наук / Л. М. Кудря. - Архангельск, 1996. - 28 с.
17. Пряхин, Е. И. Роль ученых НИИ медицинских проблем Севера СОРАМН в решении вопросов охраны здоровья детей / Е. И. Пряхин // Там же. - 2001 . - № 2 . - С. 51-52.
18. Малявская, С. И. Распространенность метаболических факторов риска в популяции школьниц г. Архангельска / С. И. Малявская, Т. А. Торопыгина, В. Е. Триль и др. // Экология человека. - 2001. - № 4. - С. 51-53.
19. Ковалев, И. В. Загрязненность окружающей среды и здоровье населения на Российском Севере / И. В. Ковалев. - Мосва, - 1999 . - С. 86 - 126.
20. Чернев, А. В. Некоторые вопросы охраны здоровья детей Кольского Севера / А. В. Чернев, С. В. Дмитриевская, И. В. Анохина // Гигиеническая наука и практика на рубеже XXI века. Материалы IX Всероссийского съезда гигиенистов и санитарных врачей. - 2001. - Т. 2. - С. 523-526.
21. Прахин, Е. И. Медико-биологические аспекты здоровья детей на Севере / Е. И. Прахин // Сибирское медицинское обозрение. - 2002. - №1. - С. 3-7.
22. Голикова, О. И. Гигиенические принципы прогнозирования состояния здоровья детского населения Крайнего Севера / О. И. Голикова // Гигиеническая наука и практика на рубеже XXI века: Материалы IX Всероссийского съезда гигиенистов и санитарных врачей. - 2001. - Т. 2. - С. 306-309.
23. Капустина, Т. А. Этнические особенности распространенности хронических заболеваний уха, горла и носа у детей северных регионов Восточной Сибири / Т. А. Капустина // Педиатрия. - 2001. - № 2. - С. 49-51.
24. Ковызина, О. Л., Функциональные показатели школьников Северного города / О. Л. Ковызина, О. Н. Лепунова, С. В. Панин, В. С. Соловьев // Экология человека. - 2000. - № 2. - С. 41-43.
25. Официальный сайт Совета при Президенте России по реализации приоритетных национальных проектов и демографической политике . [Электронный ресурс] : Президиум совета при Президенте Российской Федерации по реализации приоритетных национальных проектов и демографической политике. - режим доступа :
http://government.ru/department/288/events/
26. Макарова, В. И. Основные проблемы здоровья детей на Севере России / В. И. Макарова, Л. И. Меньшикова // Экология человека. - 2003. - № 1. - С. 39-41
27. Проект ФЗ «Об Арктической зоне РФ» [Электронный ресурс] : Минстерство регионального развития Российско федерации - Режим доступа: http ://www.minregion.ru/documents/draft_documents/2714.html
28. Евминенко, С. А. Основные показатели здоровья матери и ребенка, деятельности службы охраны детства и родовспоможения в красноярском крае / С. А. Евминенко, В. К. Соколовская, С. В. Семенова, Л. А. Куприянова // Статистический сборник. - 2015. - С. 85.
29. Официальный портал красноярского края [Электронный ресурс] : режим доступа : http://www.krskstate.ru/
30. Этноатлас Красноярского края / гл. ред. Р. Г. Рафиков. — Изд. 2-е, переработано и дополнено. — Красноярск: Изд-во «Платина», 2008. — 224 с.
31. Медиапроект Гильдии межэтнической журналистики/ [Электронный ресурс] : «Национальный акцент» - Режим доступа: http://nazaccent.ru/nations/
32. Смольникова, М. В. Генетические дефекты иммунного реагирования при осложненной и рецидивирующей пневмококковой инфекции у детей / М. В. Смольникова, С. Ю. Терещенко // Современные проблемы науки и образования. - Пенза, 2017. - № 5. - С. 30
33. Helene Ingels. Immunodeficiency Among Children with Recurrent Invasive Pneumococcal Disease / Helene Ingels, Lone Schejbel, A.C. Lundstedt, Lise Jensen, Inga A. Laursen, Lars P. Ryder, Niels H.H. Heegaard, Helle Konradsen, Jens Jоrgen Christensen, Carsten Heilmann, Hanne V. Marquart. // Pediatr Infect Dis J. - 2015. - № 34(6). - Р. 644-651.
34. Романов, А.О. Иммунологические факторы патогенеза HCV - инфекции / А.О. Романов, Т.В. Беляева, Е.В. Эсауленко // Инфекционные болезни. - 2010. - Т.11. - С.554 - 574.
35. Garred, P. Dual role of mannan - binding protein in infections: another case of heterosis? / P. Garred, M. Harboe, T. Oettinger, et al. // Eur. J. Hum. Genet. - 1994. - № 21. - Р. 125- 131.
36. Lipscombe, R. J. Distinct physicochemical characteris-tics of human mannose binding protein expressed by individuals of differing genotype. / R. J. Lipscombe, M. Sumiya, J. A. Summerfield, M. W. Turner // Immunology. - 1995. - № 85. - Р. 660-667.
37. Eisen, D. P. Mannose-binding lectin deficiency and respiratory tract infection / D. P. Eisen // Australia - 2010. - Р. 3
38. Roy, S. MBL genotype and risk of invasive pneumococcal disease: a case¬control study / S. Roy, K. Knox, S. Segal, D. Griffiths, C. E. Moore, K. I. Welsh, A. Smarason, N. P. Day, W. L. McPheat, D. W. Crook, A. V. Hill // Lancet. - 2002. - № 359. - Р. 1569 - 1573.
39. Kronborg, G. Variant mannose-binding lectin alleles are not associated with susceptibility to or outcome of invasive pneumococcal infection in randomly included patients / G. Kronborg, N. Weis, H. O. Madsen, S. S. Pedersen, C. Wejse, H. Nielsen, P. Skinhоj, P. Garred // J Infect Dis. - 2002. - № 185 (10). - Р. 1517 - 1520.
40. Lundbo, L. F. Mannose-binding lectin gene, MBL2, polymorphisms are not associated with susceptibility to invasive pneumococcal disease in children / L. F. Lundbo, Z. B. Harboe, L. N. Clausen, M. V. Hollegaard, H. T. Sоrensen, D. M. Hougaard, H. B. Konradsen, M. №гцаагс1, T. Benfield // Clin Infect Dis. - 2014. - № 59(4). - Р. 66 - 71.
41. Eisen, D. P. Low serum mannose-binding lectin level increases the risk of death due to pneumococcal infection / D. P. Eisen, M. M. Dean, M. A. Boermeester, K. J. Fidler, A. C. Gordon, G. Kronborg, J. F. Kun, Y. L. Lau, A. Payeras, H. Valdimarsson, S. J. Brett, W. K. Ip, J. Mila, M. J. Peters, S. Saevarsdottir, van J. W. Till, C. J. Hinds, E. S. McBryde // Clin Infect Dis. - 2008. - № 47(4). - Р.506 -510.
42. Ali, Y. M. The lectin pathway of complement activation is a critical component of the innate immune response to pneumococcal infection / Y. M. Ali, N. J. Lynch, K. S. Haleem, T. Fujita, Y. Endo, S. Hansen, U. Holmskov, K. Takahashi, G. L. Stahl, T. Dudler, U. V. Girija, R. Wallis, A. Kadioglu, C. M. Stover, P. W. Andrew, W. J. Schwaeble // PLoS Pathog. - 2012. - №8(7).
43. Лосин, И. Е. Сердечно-сосудистые заболевания и маннозосвязывающий лектин / Р. М Шахнович, К. А. Зыков, М. Я. Руда // Кардиология. - 2014. - № 3. - С.64 - 70.
44. Esposito, S. Genetic polymorphisms and risk of recurrent wheezing in pediatric age / S. Esposito // Milan, Italy. - 2014. - P. 2.
45. Nuolivirta, К. Mannose-binding lectin gene polymorphisms in infants with bronchiolitis and post-bronchiolitis wheezing / К. Nuolivirta // Finland - 2012. - Р. 6.
46. Koponen, P. Association of MBL2 polymorphism with asthma after bronchiolitis in infancy / Р. Koponen // Finland. - 2012. - Р. 6.
47. Eisen, D. P. Mannose-binding lectin deficiency and respiratory tract infection / D. P. Eisen // Australia - 2010. - Р. 3.
48. Лосин, И. Е. Маннозо-связывающий лектин и факторы активности нейтрофильного фагоцитоза у больных с ОКС. Влияние на течение и прогноз по данным двухлетнего проспективного наблюдения: автореферат диссертация кандидат медицинских наук: 14.01.05; 14.01.05 / Лосин Илья Евгеньевич. - Москва, 2014. - С.24 - 32.
49. Kwakkel-van Erp, J. Mannose-binding lectin deficiency linked to cytomegalovirus (CMV) reactivation and survival in lung transplantation / J. Kwakkel-van Erp, A. Paantjens, van D. Kessel et al. // Clinical and Experimental Immunology. - 2011, - № 3. - P. 410-416.
50. Kilpatrick, D. C. Human L-Ficolin (Ficolin-2) and Its Clinical Significance / D. C. Kilpatrick, J. D. Chalmers // Journal of Biomedicine and Biotechnology. - 2012.
51. Hummelshoj, T. Polymorphisms in the FCN2 gene determine serum variation and function of Ficolin-2 / T. Hummelshoj, L. Munthe-Fog, H.O. Madsen, T. Fujita, M. Matsushita, P. Garred // Hum Mol Genet. - 2005. - № 14. - P. 1651¬1658.
52. Cedzynski, M. Extremes of L-ficolin concentration in children with recurrent infections are associated with single nucleotide polymorphisms in the FCN2 gene / M. Cedzynski, L. Nuytinck, A. P. Atkinson, St Swierzko A., K. Zeman, J. Szemraj, A. Szala, M. L. Turner, D. C. Kilpatrick // Clin. Exp. Immunol. - 2007. - № 150. - P. 99-104.
53. Mishra, A. Association of Ficolin-2 Serum Levels and FCN2 Genetic Variants with Indian Visceral Leishmania / A. Mishra, J. S. Antony, P. Sundaravadivel, H. V. Tong, C. G. Meyer, R. D. Jalli, T. P. Velavan, K. Thangaraj // l'ToSOum- 2015.
54. Mishra, A. Association of Ficolin-2 Serum Levels and FCN2 Genetic Variants with Indian Visceral Leishmaniasis / A. Mishra, J. S. Antony, P. Sundaravadivel et al. // PLoS One. - 2015. - Vol. 10. - № 5. - P.129 - 138.
55. Munthe-Fog, L. The impact of FCN2 polymorphisms and haplotypes on the Ficolin-2 serum levels / L. Munthe-Fog, T. Hummelshoj, B. E. Hansen et al. // Scand J Immunol. - 2007. - Vol. 65. - № 4. - P. 383-392.
56. Herpers, B. L. Coding and non-coding polymorphisms in the lectin pathway activator L - ficolin gene in 188 Dutch blood bank donors / B. L. Herpers, M. M. Immink, B. A. De Jong et al. // Mol Immunol. - 2006. - Vol. 43. - № 7. - P. 851-855.
57. Ruskamp, J. M. Polymorphisms in the mannan-binding lectin gene are not associated with questionnaire-reported respiratory tract infections in children / J. M. Ruskamp, M. O. Hoekstra, D. S. Postma et al. // J Infect Dis. - 2008. - Vol. 198.- № 11. - P. 1707-1713.
58. Cedzynski, M. Extremes of L-ficolin concentration in children with recurrent infections are associated with single nucleotide polymorphisms in the FCN2 gene / M. Cedzynski, L. Nuytinck, A. P. Atkinson et al. // Clin Exp Immunol. - 2007.- Vol. 150. - № 1. - P. 99-104.


Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.




©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ