ВВЕДЕНИЕ 4
1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 6
1.1 Общая характеристика рода Trollius 6
1.2 Морфологическая характеристика, экология и особенности
распространения сибирских представителей р. Trollius 8
1.3 Особенности изучения ценопопуляций растений 13
1.4 Изучение генетического полиморфизма популяций редких растений .. 20
1.5 Принцип сбора материала и выделения ДНК из растительных тканей.
Методы использования ДНК в генетическом анализе 23
2 РАЙОН И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ 27
2.1 Характеристика районов исследования 27
2.2 Методика исследований 34
2.3 Методика выделения ДНК из растительных тканей с помощью
DiamondDNA 36
3 РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ 40
3.1 Фитоценотическая приуроченность изучаемых видов 40
ВЫВОДЫ 67
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ 69
ПРИЛОЖЕНИЕ А 76
ПРИЛОЖЕНИЕ Б 91
Изучение популяционной биологии и экологии видов способствует выявлению механизмов, обеспечивающих устойчивое существование видовых популяций растений в природных фитоценозах [1]. Особую актуальность эта проблема приобретает для редких и исчезающих видов растений, поскольку поможет дать объективную оценку состояния их популяций и организовать действенную охрану [2].
В настоящее время основной причиной резкого сокращения численности отдельных видов растений и животных, обеднения биоценозов, их изменения и преобразования биосферы в целом, является деятельность людей. Действие антропогенного фактора привело к трансформации природных экосистем практически во всех частях нашей планеты.
Наиболее сложной задачей является сохранение генофонда редких и находящихся под угрозой исчезновения растений и животных, однако, сохранение биологического разнообразия растений невозможно без исследования их ценотических популяций. Изучение организации популяций позволяет оценить их состояние в разных сообществах, определить способы самоподдержания и устойчивого существования вида. Знание биологии вида и структуры его популяций - это база, на основе которой возможно прогнозировать изменение популяции во времени, а также ответную реакцию растений на различное воздействие факторов окружающей среды [3].
Объектом нашего исследования являются следующие виды рода Trollius:купальница азиатская (Trollius asiaticus L.), купальница Виталия (Trollius vitalii Stepanov), купальница сибирская (Trollius sibiricus Schipcz.). Это травянистые многолетние высокодекоративные растения, относящиеся к редким и исчезающим видам. В ходе изучения литературных данных было установлено, что специальных исследований биологии, экологии видов рода Trolliusна территории Сибири не проводилось. Кроме того, ведутся споры, связанные с систематическим положением некоторых видов данного рода.
Цель работы: анализ полиморфизма популяций сибирских видов Trollius.
Задачи:
■ Изучить фитоценотическую приуроченность видов рода Trollius;
■ Оценить модификационную изменчивость признаков жарков;
■ Провести анализ сходства популяций и выявить таксономически значимые признаки;
■ Осуществить подбор праймеров для генетического анализа популяций видов рода Trollius.
1. T. asiaticusвстречается в березовых, смешанных лесах и на заболоченных лугах. Предпочитает открытые местообитания (окна древостоя, лесные опушки). Trollius vitaliiотмечен только в пределах субальпийского пояса Западного Саяна, где произрастает в пихтовых редколесьях и на субальпийских лугах. Trollius sibiricusявляется редким видом и отмечен нами только на заболоченном лугу в долине реки Паньковки (Иркутская область).
2. Наиболее благоприятные условия для роста и размножения особей Trollius asiaticusсоздаются в березовых лесах Западного Саяна, Кузнецкого Алатау, Хамар-Дабана. Снижение большинства морфометрических показателей наблюдается у растений, произрастающих в окрестностях г. Красноярска: в березняке в районе Академгородка (ТА1) и в ельниках с высокой сомкнутостью крон (ТА4, ТА7). В антропогенно- нарушенных местообитаниях наблюдается достоверное увеличение размеров вегетативных органов растений T. asiaticus,по сравнению с контролем.
3. В сравнении с особями Trollius asiaticus, T. vitaliiимеет меньшие размеры вегетативных органов, более вытянутую форму и глубокое расчленение листьев, максимальное количество чашелистиков и изогнутую форму семязачатков, имеющих оттянутый носик. Т. sibiricusхарактеризуется максимальными диаметром цветка и длиной чашелистика, короткими и относительно широкими лепестками, желтой окраской цветка.
4. Диагностическими признаками, позволяющими разделить популяции видов рода Trolliusможно назвать размеры стеблевого и прикорневого листьев, глубину рассечения средней доли листа, количество нектарников, количество зубчиков средней доли прикорневого листа, длину лепестков и чашелистиков. Такие признаки, как ширина чашелистиков и лепестков имеют диагностическое значение для внутривидового популяционного анализа.
5. Установлено, что наибольший уровень полиморфизма ДНК (43-73%) купальницы азиатской и купальницы Виталия проявляется при использовании ISSR-праймеров HB8, 844B, 17898B, HB10 и HB14.
Генетическое расстояние М. Нея между особями двух видов составляет 0,54, что свидетельствует о значительных генетических отличиях купальницы азиатской и купальницы Виталия.
1. Работнов, Т. А. Вопросы изучения состава популяций для целей фитоценологии / Т. А. Работнов. // Проблемы ботаники. - 1950. - Т. 1. - С. 465-483.
2. Лыу, Т. Н. Изменчивость морфологических признаков растений и виталитетная структура ценопопуляций видов рода Tulipa (Liliaceae) в заповеднике "Черные земли" / Т. Н. Лыу, А. С. Очирова, Н. Ц. Лиджиева. // Известия Самарского научного центра Российской академии наук. - 2016. - №5(2). - С. 314-319.
3. Басаргин, Е. А. Биоморфология некоторых длиннокорнбевищных видов растений и структура их ценопопуляций на юге Сибири: дис. ... канд био. Наук : 03.02.01 / Басаргин Евгений Александрович. - Новосибирск, 2011. - 136 c.
4. Цвелёв, Н. Н. Флора Восточной Европы / Н. Н. Цвелёв. - СПб. :СПХФА, 2001. - 670 c.
5. Байкова, К. С. Конспект флоры Азиатской России: сосудистые растения / К. С. Байкова. - Новосибирск : СО РАН, 2012. - 640 c.
6. Трулевич, Н. В. Купальницы / Н. В. Трулевич. - М. : Армада-пресс, 2001. - 32 c.
7. Акшенцев, Е.В. Пространственно-временная организация ценопопуляций купальницы европейской (Trollius europaeus L.) / Е.В. Акшенцев: Автореф. дисс. канд. биол. наук. Новосибирск. 2006. - 18 с.
8. Маевский, П. Ф. Флора средней полосы европейской части России / П. Ф. Маевский. - М. : Товарищество научных изданий КМК, 2014. - 635 c.
9. Спливинский, В. Н. Род Trollius на северо-востоке Азии / В. Н. Спливинский. // Новости систематики высших растений. - 1972. - 9. - С. 163-182.
10.3иман, С. Н. Морфология и филогения семейства лютиковых / С. Н. Зиман. - Киев : Наукова думка, 1985. - 248 c.
11. Харкевич, С. С. Сосудистые растения советского Дальнего востока / С. С. Харкевич. - СПб. : Наука, 1995. - 395 c.
12. Шишкин, Б.К. Флора Ленинградской области / Под ред. чл.-корр. АН СССР, проф. Б.К.Шишкина. - Ленинград: Ленинградского университета, 1965. - 288 с.
13. Буглова, Л.В. Риты цветения некоторых видов Trollius l. в условиях Новосибирска/ Л.В. Буглова // Вестник ИрГСХА. - 2011. - №44. - С. 35¬40.
14. Никифоров, Ю.В. Алтайские травы-целители / Ю. В. Никифоров. - Горно -Алтайск: Юч- Сюмер- Белуха, 1992. - 208 с
15. Растительные ресурсы СССР. Сем. Ranunculaceae. - Л.: Наука, 1985. - С. 82-98
16. Березкина, И. В. Библия садовых растений / И. В. Березкина, Н. В. Григорьева. - М. : Эксмо, 2012. - 256 c.
17. Плантариум [Электронный ресурс]. - Режим доступа :
http: //www.plantarium.ru/page/taxonomy/taxon/44289.html, свободный. - Загл. с экрана.
18. Тимохина, С. А. Флора Сибири / С. А. Тимохина. - Новосибирск: ВО "Наука". Сибирская издательская фирма, 1993. - 310 c.
19. Купальница азиатская [Электронный ресурс]. - Природа Кузбасса. - Режим доступа : http://prirodakem.narod.ru/flor/kup.htm
20. Анучин, Н.А. Лесная энциклопедия. / Анучин Н.А., Атрохин В.Г., Виноградов В.Н. и др. , Под ред. Ред.кол.: Анучин Н.А., Атрохин В.Г., Виноградов В.Н. и др. . - М.: Сов. энциклопедия, 1985. - 563 с
21. Выдрина, С.Н. Флора Сибири / Выдрина С.Н., Курбатский В.И., Положий А.В. , - Новосибирск: Сибирская издательская фирма ВО "Наука", 1994. - 280 с.
22. Бирюля Н. М. Медоносные, лекарственные, декоративные растения естественной флоры Сибири, Урала и Европейской части России : справочное издание : в 2 т. Т. 1 / Бирюля Н. М., Богомолов К. В.. - Рязань ; Новосибирск : Издательство ГУП РО «Рязанская областная типография», 2017. - 349 с. : ил.
23. Красная книга Ямало-Ненецкого автономного округа. Животные. Растения. Грибы. / Эктова СН, Замятин Д.О, Под ред. Эктовой С.Н., Замятиной Д.О. - Екатеринбург: Баско, 2010. - 308 с.
24. Красная книга Республики Саха (Якутия). Т. 1: Редкие и находящиеся под угрозой исчезновения виды растений и грибов. / Долинин ИН и др, - Якутск: НИПК "Сахаполиграфиздат", 2000. - 256 с.
25. Красная книга Омской области / Правительство Омской области, Омский государственный педагогический университет ; отв. ред.: Г.Н.Сидоров, В.Н.Русаков. - Омск : Изд-во ОмГПУ, 2005. - 460 стр. : ил.
26. Красная книга Ханты -Мансийского автономного округа. Животные. Растения. Грибы. / Федоровских М. А., Под ред. Федоровских М.А. - Екатеринбург: Издательский дом "Пакрус" , 2003. - 376 с.
27. Красная книга Красноярского края. Т. 2: Редкие и находящиеся под угрозой исчезновения виды дикорастущих растений и грибов / отв. ред. Н. В. Степанов; Сибирский фед. ун-т. — 2-е изд., перераб. и доп. — Красноярск, 2012. — 576 c.:
28. Степанцова, Н. В. Новые и редкие виды флоры Байкало-Ленского заповедник / Н. В. Степанцова, Е. Л. Железная. // Turczaninowia. - 2016. - №19. - С. 70-76.
29. Евдокимов, И. Ю Современное представление о системе семейства Ranunculaceae Juss/ И. Ю. Евдокимов. // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии. - 2016. - №1. - С. 117-122.
30. Акшенцев, Е. В. Сравнение поликритериального и монокритериального подходов в определении оптимума на примере купальницы европейской. (Trollius europaeus L.) / Е. В. Акшенцев. // Вестник Челябинского государственного университета. - 2005. - №1. - С. 50-52.
31. Белых, О. А. Биологически активные вещества и полезные свойства представителей семейства Ranunculaceae Juss. (обзор) / О. А. Белых. // Известия вузов. Прикладная химия и биотехнология. - 2014. - №5. - С. 25-32.
32. Буглова, Л. В. Биологические особенности семян некоторых видов Trollius L. и Paeonia L / Л. В. Буглова, О. В. Кузнецова, Я. Г. Некрашевич. // Ученые записки Забайкальского государственного университета. - 2011. - №36. - С. 151-157.
33. Antkowiak, W. Chemical composition and morphology of basal leaves of Trollius europaeus L. and T. altissimus Crantz / W. Antkowiak. и др. // Polish Journal of Environmental Studies. - 2007. - №16. - C. 475-500.
34. Буглова, Л. В. Гистохимические исследования семязачатка двух видов рода Trollius / Л. В. Буглова. // Растительный мир Азиатской России. - 2011. - 2. - С. 100-103.
35. Ru-Feng, Wang. Trollioside, a new compound from the flowers of Trollius chinensis / Wang. . Ru-Feng. и др. // Journal of Asian Natural Products Research. - 2014. - №6. - C. 139-144
36. Fang, An. Effects of orientin and vitexin from Trollius chinensis on the growth and apoptosis of esophageal cancer EC-109 cells / An. . Fang. и др. // Oncology Letters. - 2015. - 2. - C. 2627-2633.
37. Л.И.Цветкова Экология: Учебник для студентов высш. и сред. учеб. заведений, обуч. по техн. спец. и направлениям/Л.И.Цветкова, М.И.Алексеев, Ф.В.Карамзинов и др.; под общ. ред. Л.И.Цветковой. М.: АСБВ, 2012.- 550 с.
38.. Глазырина М. А. Изучение популяций растений на промышленных отвалах : [учеб. пособие] / М. А. Глазырина, Е. И. Филимонова, Н. В. Лукина, Т. С. Чибрик ; науч. ред. Т. А. Радченко ; М-во образования и науки Рос. Федерации, Урал. федер. ун-т. Екатеринбург : Изд-во Урал. ун-та, 2016. - 228 с.
39. Воронцова, Л.И., Гатцук, Л.Е., Егорова, В.Н. Ценопопуляции растений / Л.И. Воронцова, Л.Е. Гатцук, В.Н. Егорова.- М.: Наука, 1976.- 216 с.
40. Методы изучения ценопопуляций цветковых растений [Электронный ресурс]: учебно-методическое пособие для магистров биологического факультета. / Сост. А.С. Кашин, Т.А. Крицкая, Н.А. Петрова, И.В. Шилова. - Саратов, 2015. - 127 с.
41. Воронцова, Л.И., Гатцук, Л.Е., Ермакова, П.М. Жизненность особей в ценопопуляциях / О.В. Смирнова, Л.Б. Заугольнова, П.М. Ермакова // Ценопопуляции растений (основные понятия и структура).- М.: Наука, 1976.- С.44-61.
42. Braun-Blanquet, J. Plant sociology / J. Braun-Blanquet.- N.Y., L., 1932.
43. Уранов, А.А. Жизненное состояние вида в растительном сообществе / А.А. Уранов //Бюллетень МОИП, №64, вып. 3, 1960.
44. Хайлов, К. М. Иерархическая регуляция структуры и функции морских растений / К. М. Хайлов, В. П. Парчевский. - Киев : Наукова думка, 1983. - 254 c.
45. Злобин, Ю.А. Принципы и методы изучения ценотических популяций растений / Ю.А. Злобин. - Изд-во Казанск. Ун-та, 1989. - 145 с
46. Федина, К. А. Экологические и популяционно-онтогенетические исследования растений : межвузовский сборник научных трудов / К. А. Федина. - Саратов : СГПИ, 1985. - 109 c.
47. Ильина, В. Н. Исследования ценотических популяций растений (фитоценопопуляций) В Самарской области / В. Н. Ильина. // Самарская Лука: проблемы региональной и глобальной экологии. - 2010. - Т. 19, № 3. - С. 99-121.
48. Frankel, O. H. Genetic conservation: our evolutionary responsibility / O. H. Frankel. // Genetics. - 1974. - №78. - С. 53-65.
49. Селютина, И. Ю. Возможности использования ISSR-маркеров для выявления генетической дифференциации популяций редкого вида Astragalus sericeocanus (Fabaceae) / И. Ю. Селютина, Е. С. Кониченко, О. В. Дорогина. // Растительный мир Азиатской России. - 2014. - № 4(16). - С. 3-8.
50. Грушецкая, 3. Е. Использование ISSR-анализа для изучения внутри- и межвидового генетического полиморфизма различных таксонов высших растений / 3. Е. Грушецкая. и др. // Вестник БГУ. - 2013. - 3. - С. 50-56
51. Diamond, J. Evolution, consequences and future of plant and animal domestication / J. Diamond. // Nature. - 2002. - №418. - С. 700-707.
52. Крюков, А. А. Филогения видов подрода Esula рода Euphorbia (Euphorbiaceae) по результатам сравнительного анализа последовательностей района ITS1-5. 8S рДНК-ГГ82 / А. А. Крюков. и др. // Ботанический журнал. - 2010. - Т. 95. № 6. - С. 801819.
53. Носов, Н. Н. Молекулярно-филогенетическое изучение взаимоотношений между представителями рода Poa (Poaceae) / Н. Н. Носов, А. В. Родионов. // Ботанический журнал. - 2010. - Т. 93. № 12. - С. 1919 - 1936.
54. Huseyin, Uysal. Genetic diversity of cultivated flax (Linum usitatissimum L.) and its wild progenitor pale flax (Linum bienne Mill.) as revealed by ISSR markers / Uysal. . Huseyin. и др. // Genetic Resources and Crop Evolution. - 2010. - №57. - C. 1109 - 1119.
55. Костюкова, E. E. Молекулярно-генетический анализ редких видов орхидных Брянской области / E. E. Костюкова, В. В. Заякин, И. Я. Нам. // Бюллетень Брянского отделения Русского ботанического общества. - 2013. - 1. - С. 51-55.
56. Рябушкина, Н. А. Специфика выделения ДНК из растительных объектов / Н. А. Рябушкина, М. Е. Омашева, Н. Н. Галиакпаров. // Биотехнология. Теория и практика. - 2012. - 2. - С. 9-26.
57. Cheng, Y-J. An efficient protocol for genomic DNA extraction from Citrus species / Y-J. Cheng, W-W. Guo, H-L. Yi et al. // Plant Mol Biol Rep. 2003. V. 21. Р. 177a-g.
58. Остроумов, Л. А. Метод выделения растительной ДНК из растений и продуктов питания на их основе / Л. А. Остроумов. и др. // Известия Самарского научного центра Российской академии наук. - 2010. - т. 12, №4(3). - С. 722-724.
59. Карапетьян, О. Ш. Учебно-методическое пособие к проведению лабораторных работ и контроля самостоятельной работы студентов по молекулярной биологии Академии биологии и биотехнологии / О. Ш. Карапетьян, Е. М. Вечканов, И. А. Сорокина. - Ростовна-Дону : ЮФУ, 2015. - 100 .
60. Westermeier, R. Electrophoresis in practice: a guide to methods and applications of DNA and protein separations / R. Westermeier. - Weinheim : Wiley-VCH, 1997. - 331 c.
61.Sambrook, J. Gel electrophoresis of DNA / J. Sambrook, E. F. Fritsch. - New York : Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. - 300 c
62. Красноярский край. Природное и экономико-географическое районирование / Под ред. М.В.Кириллова и Ю.А.Щербакова.- Красноярск, 1962.-401 с.
63. Кириллов, М.В. География Красноярского края / М.В. Кириллов, П.Г. Матушанская. - Красноярск: кн. издво, 1964.-61с.
64. Поликарпов, Н.П. Климат и горные леса Южной Сибири / Н.П. Поликарпов, Н.М. Чибакова, Д.И. Назимова. 0 Новосибирск: Наука, 1986.-226с.
65. Тахтаджян, А. Л. Флористические области Земли / А. Л. Тахтаджян. - Л. : Наука, 1978. - 248 c.
66. Васильев, Я. Я. Геоботаническое районирование СССР / Я. Я. Васильев, Е. М. Лавренко, А. И. Лесков. - М. : Акад. наук СССР, 1947. - 152 c.
67.Черепнин, Л. М. Флора южной части Красноярского края. Т. 1 / Л. М. Черепнин. - Красноярск : КГПИ, 1957. - 96 c.
68. Рябовой, С. В. Растительность г. Красноярска / С. В. Рябовой. и др. // Современные проблемы науки и образования. - 2013. - 1.
69. Черепнин, Л. М. Растительный покров южной части Красноярского края и задачи его изучения/ Л. М. Черепнин // Учёные записки Красноярского педагогического института. - 1956. - Т. 5. - С. 3-43.
70. Куминова, А. В. Растительный покров Хакасии /А. В. Куминова. - Новосибирск: Наука, 1976. - 422 с.
71. Дулепова, Б. И. Водная растительность / Б. И. Дулепова // Растительность Сибири (Предбайкалье и Забайкалье). - Новосибирск: Наука, 1985. - С. 95-102.
72. Пешкова, Г. А. Растительность Сибири (Предбайкалье и Забайкалье)./ Г. А. Пешкова - Новосибирск: Наука, 1985. - 144 с.
73. Антипова Е. М. Классификация растительности северных лесостепей Средней Сибири / Е. М. Антипова // Ботан. исслед. в Сибири. - Красноярск, 2004. - Вып. 12. - С. 8-13.
74. Ефиц, О. А. Растительный покров Красноярского края: Учеб. пособие / О. А. Ефиц. - Красноярск : Сибирский федеральный университет, 2012.- 128 c.
75. Сахарова, Н.А. Запасы сырья и массивы важнейших лекарственных растений Кузнецкого Алатау / Н.А. Сахарова / В кн.: Растительные ресурсы Южной Сибири, их рациональной использование и охрана.- Томск: Изд-во Томск. ун-та, 1982.- С.12-20.
76. Назимова, Д.И. Черневые темнохвойные леса на юге Красноярского края и проблемы их обзорного картографирования / Д.И. Назимова, Е.Н. Пономарев, Н.В. Степанов, Е.В. Федотова // Лесоведение, 2005. - №1.-С.12-18.
77. Зятькова, Л. К. Новейшая тектоника Западного Саяна / Л. К. Зятькова. - Новосибирск : Наука. Сиб. отд-ние, 1973. - 175 c.
78. Краткая географическая энциклопедия. Том 2/ Гл.ред. Григорьев А.А. М.:Советсвкая энциклопедия - 1961, 592 с. с илл. и карт., 27 л. карт. и илл., 1 л. отд. карты
79. Байкальский заповедник [Электронный ресурс]: Байкальский государственный природный биосферный заповедник Режим доступа: http://www.baikal-zapovednik.ru/territory/baikal_reserve/landscape
80. Алексеева, Н. В. Динамика природной среды Западного Забайкалья в позднем кайнозое :По данным фауны мелких млекопитающих : дис. ... канд. географических наук: 25.00.25. Иркутск, 2003. 185 с.
81. Зоогеография [Электронный ресурс]. - Режим доступа : http://www.zoogeo365.ru/public_card/2857/klimat_hamar-dabana/, свободный. - Загл. с экрана.
82. Ярошенко, П.Д. Геоботаника / П.Д. Ярошенко.- М.-Л., 1961. - 474c.
83. Воронов, А.Г. Геоботаника / А.Г. Воронов. - М.: Высшая школа, 1973.-384с
84. Шмидт, В.М. Математические методы в ботанике / В.М Шмидт. - Л.: Изд-во ЛГУ, 1984.- 288 с.
85. Мамаев, С.А. Основные принципы методики исследования внутривидовой изменчивости древесных растений/ С. А. Мамаев // Индивидуальная и эколого-географическая изменчивость растений. Свердловск, 1975. С. 3-14.
86. DiamondDNA [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://diamond- dna.ru/, свободный. - Загл. с экрана
87. Шемберг, М.А. Береза каменная (систематика, география, изменчивость) / М.А. Шемберг. - Новосибирск: Изд-во Наука, Сиб. отд-ие, 1986. - 176 с.