Тип работы:
Предмет:
Язык работы:


Биологическая активность пептидного фрагмента C3f C3-компонента системы комплемента

Работа №135566

Тип работы

Бакалаврская работа

Предмет

биология

Объем работы51
Год сдачи2019
Стоимость4270 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
11
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ 4
ВВЕДЕНИЕ 5
ГЛАВА 1. Обзор литературы 6
1.1. Система комплемента 6
1.1.1. История изучения системы комплемента 7
1.1.2. Пути активации системы комплемента 8
1.1.3. Регуляция работы системы комплемента 11
1.1.3.1 Естественные регуляторы системы комплемента 11
1.1.3.2. Природные и искусственные ингибиторы системы комплемента 14
1.1.4. Другие биологические функции комплемента 15
1.1.4.1. Участие компонентов комплемента в реакциях местного воспаления 15
1.1.4.2. Прямая антимикробная активность компонентов системы комплемента 16
1.2. Антимикробные пептиды 16
1.2.1. История открытия антимикробных пептидов 17
1.2.2. Классификация антимикробных пептидов и их структурные свойства 17
1.2.2.1. Классификация по организму-хозяину 17
1.2.2.2. Классификация по механизму синтеза. 18
1.2.2.3. Классификация по структурным свойствам 19
1.2.2.4. Классификация по трёхмерной структуре 20
1.2.2.5. Классификация на основе молекулярных мишеней антимикробного пептида 21
1.2.2.6. Классификация на основе паттернов ковалентного связывания 21
1.2.2.7. Классификация по функции пептида 22
1.2.3. Механизм действия антимикробных пептидов 22
ГЛАВА 2. Материалы и методы 25
2.1. Синтез C3f 25
2.1.1. Конденсация аминокислот на полимерном носителе 25
2.1.2. Отщепление пептида от полимерного носителя 29
2.2. Очистка C3f методом обращено-фазовой высокоэффективной жидкостной хроматографии (ОФ ВЭЖХ) 29
2.3. Анализ полученных фракций 30
2.3.1. Обращено-фазовая высокоэффективная жидкостная хроматография (ОФ ВЭЖХ) 30
2.3.2. Измерение концентрации C3f 30
2.3.3. Масс-спектрометрия 31
2.4. Анализ антимикробной активности пептида методом радиальной диффузии 31
ГЛАВА 3. Результаты 33
3.1. Получение пептида C3f 33
3.1.1. Твердофазный синтез 33
3.1.2. Очистка C3f методом высокоэффективной жидкостной хроматографии 33
3.2. Исследование антимикробной активности C3f 36
ГЛАВА 4. Обсуждение 42
ВЫВОДЫ 44
БЛАГОДАРНОСТИ 45
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 46


Развитие резистентности микроорганизмов к используемым в терапевтических целях антибиотическим веществам является серьёзной проблемой при лечении инфекционных заболеваний бактериальной и грибковой природы[67]. Одним из вариантов решения данной проблемы является поиск веществ, имеющих альтернативные механизмы действия для осуществления бактерицидной функции. Наибольший интерес вызывают механизмы, реализуемые врождённым иммунитетом, а именно его гуморальным компонентом, к которому относятся антимикробные пептиды[46], система комплемента[6], липополисахарид-связывающие белки, белки острой фазы воспаления.
Антимикробные пептиды — гетерогенная группа преимущественно низкомолекулярных молекул, характеризующихся такими свойствами как катионность и амфипатичность. Существуют два основных механизма их действия. Первый основан на их деструктивном воздействии на плазматическую мембрану микроорганизма, путём образования пор, истончения мембраны или изменения её пластичности. Во втором варианте разрушения плазматической мембраны не происходит, антимикробный пептид воздействует на внутриклеточные мишени микроорганизма[74].
Другим мощным инструментом врождённого гуморального иммунитета является система комплемента, представляющая собой совокупность из 9 основных белков (C1-C9) и многочисленных продуктов активации каскада. Активация может идти по трём путям: классическому, альтернативному и лектиновому, в результате которой происходит формирование мембран-атакующего комплекса (МАК) на поверхности патогенной клетки с последующим её лизисом, или опсонизация клетки микроба с дальнейшим рецепторно-опосредованным фагоцитозом.
Центральным компонентом системы комплемента является белок C3, образующий при гидролизе свою активную форму – C3b, участвующую как в инициации сборки МАК, так и в опсонизации патогенных клеток. Помимо C3b, при гидролизе образуется компонент C3a, являющийся анафилотоксином. Дальнейший гидролиз компонента C3bприводит к образованию его инактивированной формыiC3bи компоненту C3f.
Помимо образования МАК некоторые компоненты системы комплемента имеют прямое антимикробное действие. Для C3aбыло показано, что данный пептид и его производные проявляют бактерицидные свойства и разрушают плазматическую мембрану бактерий[50].
C3f – пептид, состоящий из семнадцати аминокислотных остатков (SSKITHRIHWESASLLR),с молекулярной массой 2021,28 Да. При pH 7 молекула имеет заряд +2,2, что позволяет классифицировать C3f как катионный пептид. Показано, что компонент C3fспособен вызывать сокращения гладкомышечной ткани, то есть, обладает спазмогенным действием, как и анафилотоксинC3a[18].
На данный момент физиологическая роль компонента C3fне установлена[3].Катионные свойства этого пептида позволяют нам предполагать, что данный компонент системы комплемента, возможно, обладает прямым антимикробным действием.
Эндогенные антимикробные пептиды и белки могут быть использованы в качестве прототипов новых лекарственных препаратов, обладающих антимикробной активностью, что делает исследования в данном направлении актуальными.
Цель выпускной квалификационной работы — изучение биологической активности пептида C3f.
Для достижения цели были поставлены следующие задачи:
1. Получить компонент C3f методом твердофазного синтеза пептидов.
2. Провести очистку синтезированного пептидапосредством обратно-фазовой высокоэффективной жидкостной хроматографии (ОФ ВЭЖХ).
3. Оценить чистоту полученного пептида методом ОФ ВЭЖХ и соответствие молекулярной массе методом MALDI/TOF масс-спектрометрии.
4. Изучить антимикробную активность C3f.


Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!


1. Методом твердофазного синтеза по Fmoc/tBu-стратегии был получен C3f.После очистки методом высокоэффективной жидкостной хроматографии был получен пептидC3fс конечным выходом 19,7 %и чистотой 98,0 %.
2. Соответствие молекулярной массы синтезированного пептида массеC3f было подтверждено масс-спектрометрическим анализом. Молекулярная масса пептида составила 2022 Да.
3. Показано, что пептид C3f обладает антимикробной активностью invitroв отношении грамположительной бактерииListeriamonocytogenes(МИК около 70мкмоль/л). Также, C3fпоказал ингибирующее действие в отношении грамположительных бактерийMicrococcusluteus(МИК около 161мкмоль/л) иEnterococcusfaecium(МИК более 128 мкмоль/л).
4. Показано, что пептид C3f не активен invitroв отношении микроорганизмов:Candidaalbicans, Escherichiacoli, Bacilluscereus.



1. BaharA. [идр.]. Antimicrobial Peptides // Pharmaceuticals. 2013. № 12 (6). C. 1543–1575.
2. Bajic G. [идр.]. Complement activation, regulation, and molecular basis for complement‐related diseases // The EMBO Journal. 2015. № 22 (34). C. 2735–2757.
3. Barnum S.R. C3 // The Complement FactsBook. 2018. C. 157–170.
4. Berends E.T.M. [идр.]. Distinct localization of the complement C5b-9 complex on Gram-positive bacteria // Cellular Microbiology. 2013. № 12 (15). C. 1955–1968.
5. Bloch E.F. [идр.]. C5b-7 and C5b-8 precursors of the membrane attack complex (C5b-9) are effective killers of E. Coli J5 during serum incubation // Immunological Investigations. 1997. № 4 (26). C. 409–419.
6. Blom A.M. [идр.]. Factor H-IgG Chimeric Proteins as a Therapeutic Approach against the Gram-Positive Bacterial Pathogen Streptococcus pyogenes. // Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950). 2017. № 11 (199). C. 3828–3839.
7. Bohlson S.S. [идр.]. Complement, C1q, and C1q-Related Molecules Regulate Macrophage Polarization // Frontiers in Immunology. 2014. (5).
8. C. Chan W., White P.D. Fmoc Solid-Phase Peptide Synthesis: A Practical Approach / W. C. Chan, P.D. White, Oxford University Press, USA, 2000. 370 c.
9. Chang W.K. [идр.]. Characterization of antimicrobial peptide activity by electrochemical impedance spectroscopy // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes. 2008. № 10 (1778). C. 2430–2436.
10. Christophers E., Henseler T. Contrasting disease patterns in psoriasis and atopic dermatitis. // Archives of dermatological research. 1987. (279 Suppl). C. S48-51.
11. Coulthard L.G., Woodruff T.M. Is the complement activation product C3a a proinflammatory molecule? Re-evaluating the evidence and the myth. // Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950). 2015. № 8 (194). C. 3542–8.
12. Couvreur B. [идр.]. Variability and Action Mechanism of a Family of Anticomplement Proteins in Ixodes ricinus // PLoS ONE. 2008. № 1 (3). C. e1400.
13. Dousset B. [идр.]. Purification from Human Plasma of a Hexapeptide That Potentiates the Sulfation and Mitogenic Activities of Insulin-like Growth Factors // Biochemical and Biophysical Research Communications. 1998. № 3 (247). C. 587–591.
14. Dubos R.J. STUDIES ON A BACTERICIDAL AGENT EXTRACTED FROM A SOIL BACILLUS : II. PROTECTIVE EFFECT OF THE BACTERICIDAL AGENT AGAINST EXPERIMENTAL PNEUMOCOCCUS INFECTIONS IN MICE. // The Journal of experimental medicine. 1939. № 1 (70). C. 11–7.
15. Edelhoch H. Spectroscopic Determination of Tryptophan and Tyrosine in Proteins // Biochemistry. 1967. № 7 (6). C. 1948–1954.
16. Epps H.L. Van René Dubos: unearthing antibiotics. // The Journal of experimental medicine. 2006. № 2 (203). C. 259.
17. Frachet P. [идр.]. Role of C1q in Efferocytosis and Self-Tolerance — Links With Autoimmunity InTech, 2015.
18. Ganu V.S., Müller-Eberhard H.J., Hugli T.E. Factor C3f is a spasmogenic fragment released from C3b by factors I and H: The heptadeca-peptide C3f was synthesized and characterized // Molecular Immunology. 1989. № 10 (26). C. 939–948.
19. Gautier R. [идр.]. HELIQUEST: a web server to screen sequences with specific -helical properties // Bioinformatics. 2008. № 18 (24). C. 2101–2102.
20. GROVES M.L., PETERSON R.F., KIDDY C.A. Polymorphism in the Red Protein isolated from Milk of Individual Cows // Nature. 1965. № 5000 (207). C. 1007–1008.
21. Grubb A., MOMENI N. Autism diagnostics // 2004.
22. Guo R.-F., Ward P.A. ROLE OF C5A IN INFLAMMATORY RESPONSES // Annual Review of Immunology. 2005. № 1 (23). C. 821–852.
23. Hancock R.E. Peptide antibiotics. // Lancet (London, England). 1997. № 9049 (349). C. 418–22.
24. Hansen A. [идр.]. Intracellular toxicity of proline-rich antimicrobial peptides shuttled into mammalian cells by the cell-penetrating peptide penetratin. // Antimicrobial agents and chemotherapy. 2012. № 10 (56). C. 5194–201.
25. Hansen C.B. [идр.]. The Levels of the Lectin Pathway Serine Protease MASP-1 and Its Complex Formation with C1 Inhibitor Are Linked to the Severity of Hereditary Angioedema. // Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950). 2015. № 8 (195). C. 3596–604.
26. Hein E., Garred P. The Lectin Pathway of Complement and Biocompatibility Springer, Cham, 2015. 77–92 с.
27. HIRSCH J.G. Phagocytin: a bactericidal substance from polymorphonuclear leucocytes. // The Journal of experimental medicine. 1956. № 5 (103). C. 589–611.
28. Hofmeyer T. [идр.]. Arranged Sevenfold: Structural Insights into the C-Terminal Oligomerization Domain of Human C4b-Binding Protein // Journal of Molecular Biology. 2013. № 8 (425). C. 1302–1317.
29. Hoover D.L. [идр.]. Killing of Leishmania tropica amastigotes by factors in normal human serum. // Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950). 1984. № 2 (132). C. 893–7.
30. Hourcade D.E. [идр.]. Anti-complement activity of the Ixodes scapularis salivary protein Salp20 // Molecular Immunology. 2016. (69). C. 62–69.
31. Inal J.M. [идр.]. Complement C2 receptor inhibitor trispanning: a novel human complement inhibitory receptor. // Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950). 2005. № 1 (174). C. 356–66.
32. Jongerius I. [идр.]. Staphylococcal complement evasion by various convertase-blocking molecules. // The Journal of experimental medicine. 2007. № 10 (204). C. 2461–71.
33. Kaiser E. [идр.]. Color test for detection of free terminal amino groups in the solid-phase synthesis of peptides // Analytical Biochemistry. 1970. № 2 (34). C. 595–598.
34. Kim S.H. [идр.]. Nucleated cell killing by complement: effects of C5b-9 channel size and extracellular Ca2+ on the lytic process. // Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950). 1987. № 5 (138). C. 1530–6.
35. Kishore U. [идр.]. C1q and tumor necrosis factor superfamily: modularity and versatility // Trends in Immunology. 2004. № 10 (25). C. 551–561.
36. Kiss G., Michl H. Uber das Giftsekret der Gelbbauchunke, Bombina variegata L. // Toxicon. 1962. № 1 (1). C. 33–34.
37. Klos A. [идр.]. International Union of Basic and Clinical Pharmacology. [corrected]. LXXXVII. Complement peptide C5a, C4a, and C3a receptors. // Pharmacological reviews. 2013. № 1 (65). C. 500–43.
38. Koski C.L. [идр.]. Cytolysis of nucleated cells by complement: cell death displays multi-hit characteristics. // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 1983. № 12 (80). C. 3816–20.
39. Lambris J.D. (John D.., Morikis D. Structural biology of the complement system / J.D. (John D.. Lambris, D. Morikis, Taylor & Francis, 2005. 370 c.
40. Lee H.S. [идр.]. Mechanism of anticancer activity of buforin IIb, a histone H2A-derived peptide // Cancer Letters. 2008. № 1 (271). C. 47–55.
41. Lehrer R.I. [идр.]. Interaction of human defensins with Escherichia coli. Mechanism of bactericidal activity. // The Journal of clinical investigation. 1989. № 2 (84). C. 553–61.
42. Lehrer R.I. [и др.]. Ultrasensitive assays for endogenous antimicrobial polypeptides // Journal of Immunological Methods. 1991. № 2 (137). C. 167–173.
43. Li C.K.N. Proof of the one-hit mechanism of complement-induced lysis // Immunochemistry. 1975. № 1 (12). C. 89–92.
44. Lintner K.E. [идр.]. Early Components of the Complement Classical Activation Pathway in Human Systemic Autoimmune Diseases // Frontiers in Immunology. 2016. (7). C. 36.
45. Liszewski M.K., Atkinson J.P. Complement regulators in human disease: lessons from modern genetics // Journal of Internal Medicine. 2015. № 3 (277). C. 294–305.
46. Mahlapuu M. [идр.]. Antimicrobial Peptides: An Emerging Category of Therapeutic Agents // Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 2016. (6). C. 194.
47. Merle N.S., Church S.E., Fremeaux-Bacchi V. Complement system part I - molecular mechanisms of activation and regulation // Frontiers in Immunology. 2015. № JUN (6). C. 1–30.
48. Nauta A.J. [идр.]. The membrane attack complex of complement induces caspase activation and apoptosis // European Journal of Immunology. 2002. № 3 (32). C. 783.
49. Nauta A.J. [идр.]. Biochemical and functional characterization of the interaction between pentraxin 3 and C1q // European Journal of Immunology. 2003. № 2 (33). C. 465–473.
50. Nordahl E.A. [идр.]. Activation of the complement system generates antibacterial peptides. // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2004. № 48 (101). C. 16879–84.
51. Ourradi K. [идр.]. Development and validation of novel biomarker assays for osteoarthritis // PLOS ONE. 2017. № 7 (12). C. e0181334.
52. Paréj K. [идр.]. The control of the complement lectin pathway activation revisited: Both C1-inhibitor and antithrombin are likely physiological inhibitors, while α2-macroglobulin is not // Molecular Immunology. 2013. № 3–4 (54). C. 415–422.
53. Pasupuleti M. [идр.]. Preservation of Antimicrobial Properties of Complement Peptide C3a, from Invertebrates to Humans // Journal of Biological Chemistry. 2007. № 4 (282). C. 2520–2528.
54. Pausa M. [идр.]. Serum-resistant strains of Borrelia burgdorferi evade complement-mediated killing by expressing a CD59-like complement inhibitory molecule. // Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950). 2003. № 6 (170). C. 3214–22.
55. Ribeiro J.M. Ixodes dammini: salivary anti-complement activity. // Experimental parasitology. 1987. № 3 (64). C. 347–53.
56. Ricklin D. [идр.]. Complement component C3 - The “Swiss Army Knife” of innate immunity and host defense // Immunological Reviews. 2016. № 1 (274). C. 33–58.
57. Riley-Vargas R.C., Lanzendorf S., Atkinson J.P. Targeted and restricted complement activation on acrosome-reacted spermatozoa. // The Journal of clinical investigation. 2005. № 5 (115). C. 1241–9.
58. Rooijakkers S.H.M., Strijp J.A.G. van Bacterial complement evasion // Molecular Immunology. 2007. № 1–3 (44). C. 23–32.
59. Roumenina L.T. [идр.]. Interaction of the globular domain of human C1q with Salmonella typhimurium lipopolysaccharide // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics. 2008. № 9 (1784). C. 1271–1276.
60. Roy R.N. [идр.]. The mechanism of inhibition of protein synthesis by the proline-rich peptide oncocin // Nature Structural & Molecular Biology. 2015. № 6 (22). C. 466–469.
61. Ruiz-Herrera J. [идр.]. Molecular organization of the cell wall of Candida albicans and its relation to pathogenicity // FEMS Yeast Research. 2006. № 1 (6). C. 14–29.
62. Schuijt T.J. [идр.]. A tick mannose-binding lectin inhibitor interferes with the vertebrate complement cascade to enhance transmission of the lyme disease agent. // Cell host & microbe. 2011. № 2 (10). C. 136–46.
63. Seefeldt A.C. [идр.]. Structure of the mammalian antimicrobial peptide Bac7(1–16) bound within the exit tunnel of a bacterial ribosome // Nucleic Acids Research. 2016. № 5 (44). C. 2429–2438.
64. Skerlavaj B. [идр.]. Biological characterization of two novel cathelicidin-derived peptides and identification of structural requirements for their antimicrobial and cell lytic activities. // The Journal of biological chemistry. 1996. № 45 (271). C. 28375–81.
65. TAKEMATSU H., OHKOHCHI K., TAGAMI H. Demonstration of anaphylatoxins C3a, C4a and C5a in the scales of psoriasis and inflammatory pustular dermatoses // British Journal of Dermatology. 1986. № 1 (114). C. 1–6.
66. Tomlinson S. [идр.]. Killing of gram-negative bacteria by complement. Fractionation of cell membranes after complement C5b-9 deposition on to the surface of Salmonella minnesota Re595 // Biochemical Journal. 1989. № 2 (263). C. 505–511.
67. Ventola C.L. The antibiotic resistance crisis: part 1: causes and threats. // P & T : a peer-reviewed journal for formulary management. 2015. № 4 (40). C. 277–83.
68. Wagemakers A. [идр.]. An Ixodes ricinus Tick Salivary Lectin Pathway Inhibitor Protects Borrelia burgdorferi sensu lato from Human Complement // Vector-Borne and Zoonotic Diseases. 2016. № 4 (16). C. 223–228.
69. Wang G. Antimicrobial peptides: discovery, design and novel therapeutic strategies / G. Wang, подред. G. Wang, Wallingford: CABI, 2017.
70. Wang G., Li X., Wang Z. APD3: the antimicrobial peptide database as a tool for research and education // Nucleic Acids Research. 2016. № D1 (44). C. D1087–D1093.
71. Xiang Y. [идр.]. Comprehensive investigation of disease-specific short peptides in sera from patients with systemic sclerosis: Complement C3f-des-arginine, detected predominantly in systemic sclerosis sera, enhances proliferation of vascular endothelial cells // Arthritis & Rheumatism. 2007. № 6 (56). C. 2018–2030.
72. Yeaman M.R., Yount N.Y. Mechanisms of antimicrobial peptide action and resistance. // Pharmacological reviews. 2003. № 1 (55). C. 27–55.
73. ZEYA H.I., SPITZNAGEL J.K. ANTIBACTERIAL AND ENZYMIC BASIC PROTEINS FROM LEUKOCYTE LYSOSOMES: SEPARATION AND IDENTIFICATION. // Science (New York, N.Y.). 1963. № 3595 (142). C. 1085–7.
74. Zhang L.-J., Gallo R.L. Antimicrobial peptides. // Current biology : CB. 2016. № 1 (26). C. R14-9.
75. Козлов Л.В. [и др.]. ИСКУССТВЕННОЕ ИНГИБИРОВАНИЕ СИСТЕМЫ КОМПЛЕМЕНТА // Биоорганическая химия. 2007. № 5 (33). C. 485–510.
76. Кокряков В.Н. Очерки о врождённом иммунитете / В.Н. Кокряков, Санкт-Петербург: Наука, 2006. 261 c.
77. Умнякова Е.С. Модуляция системы комплемента антимикробными пептидами 2017.



Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.




©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ