Молекулярный дизайн - это метод создания новых химических соединений с заданными свойствами с привлечением компьютерных, теоретических и экспериментальных практик. Одной из сфер пользования данного метода является медицинская химия. Создание лекарств основывается на имеющихся сведениях о механизме действия химических веществ и/или эмпирического соотношения «структура - свойство» [1].
Одним из важных критериев при создании лекарственных средств в медицинской химии является оценка биологической активности соединения. В фармакологии биологическая активность описывает положительное или отрицательное воздействие лекарственного средства на организм [2].
Производные 5-цианопиримидинов очень важны в медицинской химии, т.к. являются лекарственными веществами, например производные 4- амино-5-цианопиримидина обладают снижающим внутриглазное давление свойствами и могут найти применение при лечении глазной гипертензии и глаукомы [3], также пиримидин-5-карбонитрилы являются противоопухлевыми соединениями, а именно ингибиторами pEGFR, pAKT, pERK1/2 [4]. Поэтому разработка новых биологически активных производных 5-цианопиримидина очень важна в настоящее время.
Цель работы: анализ современных методов синтеза биологически активных производных 5-цианопиримидина.
Задачи работы:
• Проанализировать научную литературу о различных способах
получения биологически активных производных 5-цианопиримидина за последние 15 лет;
• Обобщить полученные результаты и дать им критическую оценку;
• Выявить основные подходы к молекулярному дизайну производных 5-цианопиримидина и основные активности, которыми могут обладать данные соединения.
В ходе исследования было установлено, что природное происхождение класса пиримидинов объясняет широкий спектр их использования и высокую биологическую активность их производных. Были рассмотрены два наиболее приоритетных способа получения 5-цианопиримидинов: трехкомпонентный одностадийный и многостадийный синтезы. Также был проведен анализ различных способов синтеза биологически активных производных пиримидин-5-карбонитрилов, которые проявляли следующие виды активности: противоопухолевая, противовоспалительная, противосудорожная, антимикробная, антидиабетическая, антитрипаносомная и антиплазмоидальная.
Широкий спектр высокой биологической активности, простой синтез, не требующий больших затрат и низкая токсичность позволяют говорить о 5- цианопиримиданах как о перспективных скаффолдах, на основе которых будут разрабатываться новые лекарственные средства. В заключение стоит отметить, что основным приоритетом в данной области медицинской химии является совершенствование уже полученных соединений, а также разработка новых производных пиримидин-5-карбонитрилов в качестве препаратов от актуальных на данный момент заболеваний.
1. Schneider, G. Molecular design: concepts and applications / G. Schneider, K.H. Baringhaus // Wiley-VCH: Weinheim, 2008.
2. Etymology: Gk, bios, life; L, activus, with energy. Mosby's Medical Dictionary. 8th edition. 2009.
3. 4-amino-5-cyanopyrimidine derivatives / Kato M., Sato N., Okada M. et al. // Patent Japan № WO/2005/105778, 2005.
4. Бунев А.С. Структурно-ориентированный дизайн
противоопухолевых соединений на основе 5-цианопиримидина / А.С. Бунев, Д.А. Хоченков, Ю.А. Хоченкова, Е.В. Степанова // Материалы IV всероссийской конференции по молекулярной онкологии (Москва, 17-19 декабря 2018 г.). - Москва, 2018. - №5. - С. 79-80.
5. Борисова, Н. С. Исследование взаимодействия янтарной и фумаровой кислот с урацилом и его производными / Н. С. Борисова, Г. И. Ишмуратова, О. И. Валиева, И. М. Борисов, Ю. С. Зимин, А. Г. Мустафин // Вестник Башкирского университета. - 2012. - №17(4). - С. 1687-1690.
6. Осипов, А.О. Фармакологическая активность производных пиримидина / П.П. Пурыгин, А.В. Дубищев, А.А. Осипова // Вестник СамГУ — Естественнонаучная серия. - 2011. - № 8(89). - С. 167-172.
7. Гимадиева, А. Р. Синтез и биологическая активность производных пиримидина / А. Р. Гимадиева, Ю. Н. Чернышенко, А. Г. Мустафин, И. Б. Абдрахманов // Башкирский химический журнал. - 2007. - №14(3). - С. 5-21.
8. Cocco, M.T. Synthesis and antitumor evaluation of 6-thioxo-, 6-oxo- and 2,4-dioxopyrimidine derivatives / M.T. Cocco, C. Congiu, V. Onnis, R. Piras // Farmaco. - 2001. - Vol. 56. - P. 741-748.
9. Synthesis and biological evaluation of pyrimidine nucleoside monophosphate prodrugs targeted against infuenza virus / S. Meneghesso, E. Vanderlinden, A. Stevaert et al. // Antivir Res. -2012. - Vol. 94. - P. 35-43.
10. Ashour H.M. Synthesis and biological evaluation of thieno [2',3':4,5]pyrimido[1,2-^][1,2,4]triazines and thieno[2,3-d] [1,2,4]triazolo[1,5- a]pyrimidines as anti-infammatory and analgesic agents / H.M. Ashour,
O. G. Shaaban, O.H. Rizk, I.M. El-Ashmawy // Eur. J. Med. Chem. - 2013. - Vol. 62. - P. 341-351.
11. Synthesis, cytotoxicity, antimicrobial and anti-biofilm activities of novel pyrazolo[3,4-b] pyridine and pyrimidine functionalized 1,2,3-triazole derivatives /
P. Nagender, G.M. Reddy, R.N. Kumar et al. // Bioorg. Med. Chem. Lett. - 2014. - Vol. 24. - P. 2905-2908.
12. Synthesis, structure-activity relationship and biological evaluation of 2,4,5-trisubstituted pyrimidine CDK inhibitors as potential anti-tumour agents / H. Shao, S. Shi, D.W. Foley D.W. et al. // Eur. J. Med. Chem. - 2013. - Vol. 70. - P. 447-455.
13. Synthesis and biological evaluation of pyrimidine nucleoside monophosphate prodrugs targeted against infuenza virus / S. Meneghesso, E. Vanderlinden, A. Stevaert et al. // Antivir. Res. - 2012. - Vol. 94. - P. 35-43.
14. Synthesis and antiviral activity of 2,4-diamino-5-cyano-6-[2- (phosphonomethoxy) ethoxy]pyrimidine and related compounds / D. Hockov, A. Holy, M. Masojidkov et al. // Bioorg. Med. Chem. - 2004. - Vol.12. - P. 3197¬3202.
15. Gondkar, A.S. Synthesis, characterization and in vitro anti-inflammatory activity of some substituted 1,2,3,4-tetrahydropyrimidine derivatives / A.S. Gondkar, V.K. Deshmukh, S.R. Chaudhari // Drug. Invent. Today. - 2013. - Vol. 5. - P. 175-181.
16. Biological potential of pyrimidine derivatives in a new era / J. Rani, S. Kumar, M. Saini et al. // Res. Chem. Intermed. - 2016. - Vol. 42. - P. 6777¬6804.
17. Bhalgat, C.M. Novel pyrimidine and its triazole fused derivatives: synthesis and investigation of antioxidant and anti-inflammatory activity / C.M. Bhalgat, M.I. Ali, B. Ramesh, G. Ramu / Arab. J. Chem. - 2014. - Vol. 7. - P. 986-993.
18. Design, synthesis and vasorelaxant evaluation of novel coumarin-pyrimidine hybrids / K.M. Amin, F.M. Awadalla, A.M Eissa et al. // Bioorg. Med. Chem. - 2011. - Vol. 19. - P. 6087-6097.
19. Bararjanian, M. A Novel and Efficient One-Pot Synthesis of 2- Aminopyrimidinones and Their Self-Assembly / M. Bararjanian, S. Balalaie, F. Rominger, S. Barouti / Helv. Chim. Acta. - 2010. - Vol. 93. - P. 777-784.
20. A Facile and Efficient Synthesis of 1,6-Dihydro-6-oxo-pyrimidine Derivatives under Solvent-Free Conditions/. L. Liu, S. Yin, S. Xia et al. // Chin. J. Org. Chem. - 2012. - Vol. 32. - P. 612-615.
21. An efficient one-pot multi component synthesis of pyrimidine derivatives in aqueous media / A. Bhatewara, S. R. Jetti, T. Kadre et al. // Arch. Appl. Sci. Res. - 2012. - Vol. 4. - P. 1274-1278.
22. Microwave assisted synthesis and biological evaluation of dihydropyrimidin one derivatives as anti-inflammatory, antibacterial and antifungal agents/ A. Bhatewara, S.R. Jetti, T. Kadre et al. // Int. J. Med. Chem. - 2013. - P. 1-5.
23. Deshmukh, M.B. A novel and efficient one step synthesis of 2-amino-5- cyano-6-hydroxy-4-aryl pyrimidines and their anti-bacterial activity/
M.B. Deshmukh, S.M. Salunkhe, D.R. Patil, P.V. Anbhule // Eur. J. Med. Chem. - 2009. - Vol. 44. - P. 2651-2654.
24. Other strategies to the targets using three-component reaction with aldehydes, B-ketonitriles, and substituted guanidines lack the efficient supply of the desired substituted guanidines / C. Val, A. Crespo, V. Yaziji et al. // ACS Comb. Sci. - 2013. - Vol. 15. - P. 370-378.
25. Efficient and Facile Synthesis of 2,4-Diamino-6-arylpyrimidine-5- carbonitrile Under Solvent-Free Conditions / L. Rong, H. Han, L. Gao et al. // Synth. Commun. - 2010. - Vol. 40. - P. 504-509.
26. A novel and environmental friendly, one-step synthesis of 2,6- Diamino- 4-phenyl pyrimidine-5-carbonitrile using potassium carbonate in water /
M. B. Deshmukh, P.V. Anbhule, S.D. Jadhav et al. // Indian. J. Chem. - 2008. - Vol. 47B. - P. 792-795.
27. Richardsona, J. Improved Substrate Scope in the Potassium Hexacyanoferrate (II) based Cyanation for the Synthesis of Benzonitriles and their Heterocyclic / J. Richardsona, S.P. Mutton // Analogs. J. Org. Chem. - 2018. - Vol. 83. № 9. - P. 4922-4931.
28. State-of-the-Art Cyanation of Aryl Bromides: A Novel and Versatile Copper Catalyst System Inspired by Nature / T. Schareina, A. Zapf, W. Magerlein et al. // Chemistry. - 2007. - Vol. 13. №21. - P. 6249-6254.
29. Copper(II)-Mediated [11C]Cyanation of Arylboronic Acids and Arylstannanes / K.J. Makaravage, X. Shao, A.F. Brooks et al. // Org. Lett. - 2018.
- Vol. 20. №6. - P. 1530-1533.
30. Azath, I.A.Per-6-amino-b-cyclodextrin/CuI catalysed cyanation of aryl halides with K4[Fe(CN)6]. / I.A. Azath, P. Suresh, K. Pitchumani // New. J. Chem.
- 2012. - Vol. 36. - P. 2334-2339.
31. Zhang, X. General and Mild Nickel-Catalyzed Cyanation of Aryl/Heteroaryl Chlorides with Zn(CN)2: Key Roles of DMAP / X. Zhang, A. Xia, H. Chen, Y. Liu // Org. Lett. - 2017. - Vol. 19. №8. - P. 2118-2121.
32. Chen, R. Transcription inhibition by flavopiridol: mechanism of chronic lymphocytic leukemia cell death / R. Chen, M.J. Keating, V. Gandhi, W. Plunkett // Blood. - 2005. - Vol. 106. - P. 2513-2519.
33. Senthilkumar, N. Synthesis of a new series of pyrimidine derivatives: exploration of anti-proliferative activity on EAT cells and molecular docking /
N. Senthilkumar, D.Y. Ravichandran, K.M. Kumar, S. Ramaiah // Res. Chem. Int.
- 2016. - Vol. 42. №2. - P. 1295-1313.
34. 5-Cyanopyrimidine Derivatives as a Novel Class of Potent, Selective, and Orally Active Inhibitors of p38r MAP Kinase / S.T. Wrobleski, J. Lin, A. Gulzar et al. // J. Med. Chem. - 2005. - Vol. 48. - P. 6261-6270.
35. Pyrimidine compounds for the treatment of inflammation. 2005. WO 2005/040133 A1.
36. A new generation of adenosine receptor antagonists: From di- to trisubstituted aminopyrimidines / J.P.D. Veldhoven, L.C.W. Chang, J. K. Frijtag Drabbe Kunzel et al. // Bio. Med. Chem. - 2008. - Vol. 16. - P. 2741-2752.
37. Huang, Z.L. Roles of adenosine and its receptors in sleep-wake regulation / Z.L. Huang, Z. Zhang, W.M. Qu // Int. rev. neurobiol. - 2014. - Vol. 119. - P. 349-371.
38. The discovery of potent, orally bioavailable pyrimidine-5-carbonitrile-6- alkyl CXCR2 receptor antagonists / D.W. Porter, M. Bradley, Z. Brown et al. // Bio. Med.Chem. Let. - 2014. - Vol. 24. - P. 3285-3290.
39. Synthesis and anticonvulsant activity of some newer dihydro- pyrimidine-5-carbonitrile derivatives: Part II. / M.R. Ali, G. Verma, M. Shaquiquzzaman et al. // J. Tai. Un. Med. Sci. - 2015. - Vol. 10. №4. - P. 437¬443.
40. Pyrimidine-5-carbonitriles - part III: synthesis and antimicrobial activity of novel 6-(2-substituted propyl)-2,4-disubstituted pyrimidine-5-carbonitrile /
O.A. Al-Deeb, A.A. Al-Turkistani, E.S. Al-Abdullah et al. // Heterocycl. Commun. - 2013. - Vol. 19. №6. - P. 411-419.
41. El-Agrody, A.M. A. Synthesis and Antimicrobial Activity of Thioxopyrimidines and Related Derivatives / A.M. El-Agrody, F.M. Ali, F.A. Eid, M.A. El-Nassag / Phosf. Sulf. Sil. Rel. Elem. - 2006. - Vol. 181. №4. - P. 839-864.
42. Spectroscopic investigation (FT-IR and FT-Raman), vibrational assignments, HOMO-LUMO, NBO, MEP analysis and molecular docking study of 2-[(4-chlorobenzyl)sulfanyl]-4-(2-methylpropyl)-6-(phenylsulfanyl)-pyrimidine- 5-carbonitrile, a potential chemotherapeutic agent / N. Z. Alzoman, Y. Sheena Mary, C.Y. Panicker et al. // Spectr. Act. Part A: Mol. and Bio. Spectr. - 2015. - Vol. 139. - P. 413-424.
43. Synthesis, antitrypanosomal activity and molecular docking studies of pyrimidine derivatives / S.J. Melo, Z.S. Monte, A.C.S. Santos et al. // Med. Chem. Res. - 2018. - Vol. 27. - P. 2512-2522.
44. Synthesis antiplasmodial activity and mechanistic studies of pyrimidine- 5-carbonitrile and quinoline hybrids / H. Kaur, J. Balzarini, C. Kock et al. // Eur. J. Med. Chem. - 2015. - Vol. 101. - P. 52-62.