📄Работа №143230
Тема: Скрытое разнообразие темноспоровых миксомицетов (Myxomycetes) горных тропических лесов заповедника Фиаоак-Фиаден (северный Вьетнам)
Характеристики работы
Тип работы
Дипломные работы, ВКР
Предмет
Биология
Объем:
94 листов
Год:
2022
Просмотров:
140
4800
руб.
🛒 Купить работу
Не подходит эта работа?
Закажите новую по вашим требованиям
Узнать цену на написание
Закажите новую по вашим требованиям
Представленный материал является образцом учебного исследования, примером структуры и содержания учебного исследования по заявленной теме. Размещён исключительно в информационных и ознакомительных целях.
Workspay.ru оказывает информационные услуги по сбору, обработке и структурированию материалов в соответствии с требованиями заказчика.
Размещение материала не означает публикацию произведения впервые и не предполагает передачу исключительных авторских прав третьим лицам.
Материал не предназначен для дословной сдачи в образовательные организации и требует самостоятельной переработки с соблюдением законодательства Российской Федерации об авторском праве и принципов академической добросовестности.
Авторские права на исходные материалы принадлежат их законным правообладателям. В случае возникновения вопросов, связанных с размещённым материалом, просим направить обращение через форму обратной связи.
Настоящий учебно-методический информационный материал размещён в ознакомительных и исследовательских целях и представляет собой пример учебного исследования. Не является готовым научным трудом и требует самостоятельной переработки.
📋 Содержание
Введение 3
Обзор литературы 5
1.1 Морфология и жизненный цикл миксомицетов 5
1.2 Систематика миксомицетов 12
1.3 Экология миксомицетов 14
1.4 Подходы к исследованию 19
1.5 Скрытое разнообразие миксомицетов 21
Материалы и методы 24
2.1 Характеристика района исследования 24
2.2 Описание типов растительности 25
2.3 Сбор и обработка материала традиционными методами 29
2.4 Темноспоровые миксомицеты, выявленные традиционными методами 30
2.5 Секвенирование по Сэнгеру 33
2.6 Получение и обработка метагеномных данных 34
Результаты и обсуждение 38
4.1 Итоги метагеномного анализа 38
4.2 Аннотация и филогенетическое положение zOTU 39
4.3 Сравнение двух подходов к исследованию 43
4.4 Бета-разнообразие 45
Выводы 49
Благодарности 50
Список литературы 51
Приложение 1 60
Приложение 2 61
Приложение 3 62
Приложение 4 63
Приложение 5 64
Обзор литературы 5
1.1 Морфология и жизненный цикл миксомицетов 5
1.2 Систематика миксомицетов 12
1.3 Экология миксомицетов 14
1.4 Подходы к исследованию 19
1.5 Скрытое разнообразие миксомицетов 21
Материалы и методы 24
2.1 Характеристика района исследования 24
2.2 Описание типов растительности 25
2.3 Сбор и обработка материала традиционными методами 29
2.4 Темноспоровые миксомицеты, выявленные традиционными методами 30
2.5 Секвенирование по Сэнгеру 33
2.6 Получение и обработка метагеномных данных 34
Результаты и обсуждение 38
4.1 Итоги метагеномного анализа 38
4.2 Аннотация и филогенетическое положение zOTU 39
4.3 Сравнение двух подходов к исследованию 43
4.4 Бета-разнообразие 45
Выводы 49
Благодарности 50
Список литературы 51
Приложение 1 60
Приложение 2 61
Приложение 3 62
Приложение 4 63
Приложение 5 64
📖 Аннотация
Работа посвящена комплексному изучению скрытого разнообразия темноспоровых миксомицетов в горных тропических лесах заповедника Фиаоак-Фиаден на севере Вьетнама. Актуальность исследования обусловлена трудностями выявления полного биоразнообразия организмов со скрытыми стадиями жизненного цикла, что особенно значимо для малоизученных тропических регионов, где традиционные методы могут недооценивать реальное видовое богатство. Методология включала комбинацию классических подходов — маршрутный сбор плодовых тел и метод влажных камер — с современным метагеномным анализом почвенных проб, направленным на выявление операционных таксономических единиц (zOTU). В результате на исследованной территории было выявлено 49 видов темноспоровых миксомицетов, причем метагеномный анализ позволил обнаружить 273 zOTU, относящиеся преимущественно к порядку Physarales. Шесть видов были обнаружены обоими методами, а один вид, Physarum didermoides, является новым как для заповедника, так и для Вьетнама в целом. Статистически значимых различий в составе сообществ между разными типами растительности выявлено не было. Практическая значимость работы заключается в том, что полученные данные и примененная методика вносят вклад в формирование референсных баз генетических последовательностей миксомицетов и могут быть использованы специалистами-микологами и протозоологами для мониторинга биоразнообразия и филогенетических исследований в Юго-Восточной Азии.
📖 Введение
Вопросы изучения биоразнообразия особенно сложно решать в отношении организмов, чей жизненный цикл преимущественно включает стадии, скрытые от прямого наблюдения в природе. К ним относятся грибы и протисты [Mueller, 2004], многие из которых не имеют явного прикладного значения: не являются ни патогенами, ни организмами-биоиндикаторами и не дают сиюминутной выгоды человеку. Тем не менее эти группы давно привлекают внимание исследователей, поскольку служат отличными модельными объектами для решения вопросов фундаментальной науки, включая проблемы биогеографии, экологии, цитологии, физиологии и филогении эукариотических организмов [Martin, Alexopoulos, 1969; Stephenson et al., 1993].
Примером таких объектов являются миксомицеты или настоящие плазмодиальные слизевики (Myxomycetes = Myxogastrea). Данная группа грибоподобных амеб уже достаточно долго приковывает внимание ученых по всему миру [Ing, Stephenson, 2017]. Возможность сбора без дополнительной оптики, легкость гербаризации плодовых тел и поддержания их коллекций [Wrigley De Basanta & Estrada-Torres, 2017], разнообразие стадий уникального жизненного цикла — все это позволило выявить многие аспекты их физиологии и экологии еще до эры молекулярно-генетических исследований, наступившей значительно позже в сравнении с другими группами грибоподобных организмов [Fiore-Donno et al., 2005; Fiore-Donno et al., 2013]. За последние десятилетия систематика миксомицетов была не раз пересмотрена в соответствии с принципами молекулярной филогении, но этот процесс еще далек от завершения [Leontyev et al., 2019]. Комбинирование стандартных методик, таких как маршрутный метод сбора и постановка влажных камер [Новожилов, 1993], с новыми подходами позволяет наиболее полно описывать биоразнообразие миксомицетов в природе и выявлять новые таксоны.
Возможность применения современных протоколов изучения метагенома почв с наложением его на референсные последовательности сильно расширяет представления о биогеографии, экологии и скрытом разнообразии миксомицетов [Dahl et al., 2018; Gao et al., 2019; Shchepin et al., 2019].
Выбранная для проведения работы территория - национальный парк Фиаоак- Фиаден, расположенный на северо-востоке Вьетнама [Tran 2014; Nguyen, 2017]. В настоящее время для заповедника существует несколько работ, среди которых представлены описания новых и эндемичных видов [Do Van, Wei & Wen, 2017; Pham et al., 2019; Son et al., 2021; Tu et al., 2016], включая и миксомицетов [Fedorova, Novozhilov & Gmoshinskiy, 2020; Novozhilov et al., 2022].
Цель данной работы: изучить скрытое разнообразие темноспоровых миксомицетов, встречающихся в горных тропических лесах на территории национального парка Фиаоак- Фиаден, расположенного на севере Вьетнама.
Задачи исследования:
1. Провести метагеномный анализ ДНК, выделенной из образцов почвы.
2. Сравнить результаты, полученные традиционными методами (полевые сборы и постановка влажных камер) и с использованием метагеномного анализа.
3. Проанализировать таксономическую структуру темноспоровых миксомицетов.
4. Оценить альфа- и бета-разнообразие темноспоровых миксомицетов.
Примером таких объектов являются миксомицеты или настоящие плазмодиальные слизевики (Myxomycetes = Myxogastrea). Данная группа грибоподобных амеб уже достаточно долго приковывает внимание ученых по всему миру [Ing, Stephenson, 2017]. Возможность сбора без дополнительной оптики, легкость гербаризации плодовых тел и поддержания их коллекций [Wrigley De Basanta & Estrada-Torres, 2017], разнообразие стадий уникального жизненного цикла — все это позволило выявить многие аспекты их физиологии и экологии еще до эры молекулярно-генетических исследований, наступившей значительно позже в сравнении с другими группами грибоподобных организмов [Fiore-Donno et al., 2005; Fiore-Donno et al., 2013]. За последние десятилетия систематика миксомицетов была не раз пересмотрена в соответствии с принципами молекулярной филогении, но этот процесс еще далек от завершения [Leontyev et al., 2019]. Комбинирование стандартных методик, таких как маршрутный метод сбора и постановка влажных камер [Новожилов, 1993], с новыми подходами позволяет наиболее полно описывать биоразнообразие миксомицетов в природе и выявлять новые таксоны.
Возможность применения современных протоколов изучения метагенома почв с наложением его на референсные последовательности сильно расширяет представления о биогеографии, экологии и скрытом разнообразии миксомицетов [Dahl et al., 2018; Gao et al., 2019; Shchepin et al., 2019].
Выбранная для проведения работы территория - национальный парк Фиаоак- Фиаден, расположенный на северо-востоке Вьетнама [Tran 2014; Nguyen, 2017]. В настоящее время для заповедника существует несколько работ, среди которых представлены описания новых и эндемичных видов [Do Van, Wei & Wen, 2017; Pham et al., 2019; Son et al., 2021; Tu et al., 2016], включая и миксомицетов [Fedorova, Novozhilov & Gmoshinskiy, 2020; Novozhilov et al., 2022].
Цель данной работы: изучить скрытое разнообразие темноспоровых миксомицетов, встречающихся в горных тропических лесах на территории национального парка Фиаоак- Фиаден, расположенного на севере Вьетнама.
Задачи исследования:
1. Провести метагеномный анализ ДНК, выделенной из образцов почвы.
2. Сравнить результаты, полученные традиционными методами (полевые сборы и постановка влажных камер) и с использованием метагеномного анализа.
3. Проанализировать таксономическую структуру темноспоровых миксомицетов.
4. Оценить альфа- и бета-разнообразие темноспоровых миксомицетов.
✅ Заключение
1. Метагеномный анализ выявил присутствие 273 zOTU, характеризующихся сходством с референсными последовательностями не менее 70% и обилием не менее 10 последовательностей.
2. В результате комбинирования традиционных методов и метагеномного анализа на исследованной территории было выявлено 49 видов темноспоровых миксомицетов, причем 6 их них было выявлено обоими методами. Обнаружен один новый вид для исследованной территории, являющийся новым видом и для Вьетнама (Physarum didermoides).
3. Полученные zOTU были отнесены к пор. Echinosteliales (0,7% от общего числа), Trichiales (1,8%), Stemonitidales (6,2%) и Physarales (91,2%).
4. Для трех типов растительности было выявлено всего 2 общих zOTU, однако статистически значимые различия между типами растительности не были показаны.
2. В результате комбинирования традиционных методов и метагеномного анализа на исследованной территории было выявлено 49 видов темноспоровых миксомицетов, причем 6 их них было выявлено обоими методами. Обнаружен один новый вид для исследованной территории, являющийся новым видом и для Вьетнама (Physarum didermoides).
3. Полученные zOTU были отнесены к пор. Echinosteliales (0,7% от общего числа), Trichiales (1,8%), Stemonitidales (6,2%) и Physarales (91,2%).
4. Для трех типов растительности было выявлено всего 2 общих zOTU, однако статистически значимые различия между типами растительности не были показаны.
ИЛИ
Поиск аналога
📕 Список литературы
🖼 Скриншоты
🛒 Оформить заказ
⚡ Работу высылаем в течении 5 минут после оплаты.