Список сокращений 7
Введение 8
Глава 1. Общая характеристика липаз и фосфолипаз 10
1.1 Липазы 10
1.2 Фосфолипазы 15
1.3 Структурные особенности и каталитический механизм липаз 25
1.4 Структурные особенности и каталитический механизм фосфолипаз .... 30
1.5 . Источник липаз и фосфолипаз 34
1.5.1 Животные источники 34
1.5.2 Растительные источники 34
1.5.3 Микробные источники 35
1.5.4 Рекомбинантные липазы и фосфолипазы 36
1.6. Промышленное применение липаз и фосфолипаз 39
1.6.1 Практическое применение липаз 39
1.6.2 Применение фосфолипаз в промышленности 41
Глава 2 Материалы и методы 44
2.1 Материалы 44
2.1.1 Бактериальные штаммы и плазмиды 44
2.1.2 Нуклеотидные последовательности 44
2.1.3 Ферменты и буферы 45
2.1.4 Питательные среды и антибиотики 45
2.1.5 Реактивы 46
2.1.6 Буферы и растворы 47
2.2 Методы 49
Молекулярно-генетические методы, используемые для получения рекомбинантных белков 49
2.2.1 Полимеразная цепная реакция (ПЦР) 49
2.2.2 Гидролиз ДНК 49
2.2.3 Аналитический электрофорез в агарозном гели 49...
Липазы и фосфолипазы являются ферментами класса гидролаз, которые расщепляют гидрофобные эфирные связи триацилглицеринов и фосфолипидов, соответственно [1]. Субстратом для липаз может выступать широкий спектр жирорастворимых соединений (алифатические, алициклические, бициклические и ароматические сложные эфиры, тиоэфиры, активированные амины) [2]. Специфическим субстратом для всех фосфолипаз является фосфатидилхолин. Однако они могут действовать также на фосфатидилэтаноламин (PE), фосфатидилинозитол (PI), сфингомиелин, лизофосфатидилхолин (LPC), лизофасфатидилинозитол (LPI) в некоторых организмах и тканях [3].
Липолитические ферменты широко представлены в живой природе (животных, растений, дрожжей, грибов и бактерий) [1]. У высших эукариот липазы, как правило, локализованы внутри определенных органелл (например, лизосомы), однако их можно найти во внеклеточном пространстве, они также играют роль в метаболизме, абсорбции и переносе липидов. У низших эукариот и бактерий липазы могут быть как внутриклеточными, так и секретируемыми (обеспечивают деградацию липидных субстратов, присутствующие в окружающей среде). В некоторых патогенных организмах (Candida albicans, Staphylococcus и Pseudomonas species, Helicobacter pylori) они могут даже действовать как факторы вирулентности [4]. Группа ферментов фосфолипаз имеет важное физиологическое значение. У эукариот, фосфолипазы участвуют в некоторых стадиях липидного обмена, таких как переваривания жиров, восстановления метаболизма липопротеинов и т.д. Фосфолипазы также инициируют сигнальный каскад трансдукции в ответ на активацию рецепторов клеточной поверхности и действуют в качестве липидных вторичных посредников [3, 5]. В микроорганизмах фосфолипазы также как и липазы играют определенную роль как фактор вирулентности. Разрушение фосфолипазами патогенных бактерий, грибов фосфолипидов и последующее изменение компонентов клеточных мембран приводит к повреждению клеток, зачастую это является механизмом вирулентности [6].
Разнообразие в происхождении, клеточной локализации и функциях отражается в удивительной степени биохимической изменчивости, поскольку липазы и фосфолипазы из разных организмов или даже их изоферменты, произведенные одним и тем же организмом, могут сильно различаться по молекулярной массе, рН и температурным оптимумам, посттрансляционным модификациям, субстрату и специфичностью реакции. Это имеет большое значение для биотехнологии как потенциального источника биокатализаторов, обладающих широким спектром оптимумов и особенностей, которые могут адаптироваться к различным условиям процесса. Таким образом, липазы и фосфолипазы представляют собой перспективную группу биокатализаторов, которые уже широко используются в различных промышленных применениях, таких как производство биодизеля, продуктов питания, биологически активных добавок, моющих средств, косметики, также принимают участие в гидратации масел, и в бумажной промышленности. Методы рационального дизайна а так же случайный мутагенез могут способствовать улучшению свойств липаз и фосфолипаз и способствовать более широкому использованию этих ферментов в хозяйственной деятельности [1].
Цель данной работы: разработка рекомбинантного вектора для экспрессии гибридной липазы в Kluyveromyces lactis .
Для выполнения поставленной цели были сформулированы следующие задачи:
1. Провести дизайн гена кодирующего гибридную липазу;
2. Подобрать экспрессинную систему и вектора;
3. Провести клонирование гибридного гена липазы в составе сконструированного вектора;
4. Провести анализ синтеза рекомбинантного белка.
1. Проведен дизайн гена кодирующего гибридную липазу. За основ взяты последовательности кодирующие каталитические домены липазы Thermomyces lanuginosus и фосфолипазы Fusarium oxysporum.
2. В ходе работы проведен подбор экспрессионного вектора pKLAC2, обеспечивающий синтез гибридной липазы в системе K.lactis;
3. Разработана рекомбинантная плазмида содержащая ген гибридной липазы под контролем «сильного» промотора LAC4. Структура плазмиды подтверждена секвенированием.
4. Для шести клонов K.lactis содержащих рекомбинантную встройку, при помощи Вестерн-блот анализа подтвержден синтез гибридной липазы.
1. Borrelli G. M., Trono D. Recombinant lipases and phospholipases and their use as biocatalysts for industrial applications // International journal of molecular sciences. 2015. Т. 16. №. 9. С. 20774 - 20840.
2. Polaina J., MacCabe A. P. Industrial enzymes. // Dortrecht : Springer. 2007. С. 531 - 547.
3. Потушинская Е. В. Разработка технологии обезволашивания кожевенного сырья с использованием иммобилизованных ферментных препаратов // дис., кан. тех. наук: 05.19.05. 2012.
4. Casas-Godoy L., Duquesne S., Bordes F., Sandoval G., Marty A. Lipases: an overview //Lipases and Phospholipases: Methods and Protocols. 2012. С. 3 - 30.
5. Bridges, J. P., Ikegami, M., Brilli, L. L., Chen, X., Mason, R. J., Shannon, J. MLPCAT1 regulates surfactant phospholipid synthesis and is required for transitioning to air breathing in mice //The Journal of clinical investigation. 2010. Т. 120, №. 5. С. 1736-1748.
6. Крахмалева Т. М., Манеева Э. Ш., Халитова Э. Ш. Ферментные
препараты в пищевой промышленности //Университетский комплекс как региональный центр образования, науки и культуры: материалы
Всероссийской науч.-практ. конф./Оренбург. гос. ун-т.-Оренбург. 2014. С. 1233-1238.
7. Barriuso J. Vaquero, M. E., Prieto, A., & Martinez, M. J. Structural traits and catalytic versatility of the lipases from the Candida rugosa-like family: A review //Biotechnology advances. 2016. Т. 34. №. 5. С. 874 - 885.
8. Aoki J. Inoue, A., Makide, K., Saiki, N., Arai, H. Structure and function of extracellular phospholipase A1 belonging to the pancreatic lipase gene family //Biochimie. 2007. Т. 89. №. 2. С. 197 - 204.
9. Saelee P., Wongkham S., Puapairoj A., Khuntikeo N., Petmitr S., Chariyalertsak S., Karalak, A. Novel PNLIPRP3 and DOCK8 gene expression and prognostic implications of DNA loss on chromosome 10q25. 3 in hepatocellular carcinoma // Asian Pac J Cancer Prev. 2009. Т. 10. №. 3. С. 501 - 506.
10. Lafontan M., Langin D. Lipolysis and lipid mobilization in human adipose tissue //Progress in lipid research. 2009. Т. 48. №. 5. С. 275 - 297.
11. Lombardo D. Silvy, F., Crenon, I., Martinez, E., Collignon, A., Beraud, E., Mas, E.l. Pancreatic adenocarcinoma, chronic pancreatitis, and MODY-8 diabetes: is bile salt-dependent lipase (or carboxyl ester lipase) at the crossroads of pancreatic pathologies? //Oncotarget. 2018. Т. 9. №. 15. С. 12513 - 12533 .
12. Barros M., Fleuri L. F., Macedo G. A. Seed lipases: sources, applications and properties-a review //Brazilian Journal of Chemical Engineering. 2010. Т. 27. №. 1. С. 15- 29.
13. Mounguengui R. W. M. Brunschwig C., Barea B., Villeneuve P., Blin J. Are plant lipases a promising alternative to catalyze transesterification for biodiesel production? //Progress in Energy and Combustion Science. 2013. Т. 39. №. 5. С. 441 - 456.
14. Linka N., Weber A. P. M. Intracellular metabolite transporters in plants //Molecular plant. 2010. Т. 3. №. 1. С. 21 - 53.
15. Contesini F. J. Lopes, D. B., Macedo, G. A., da Graga Nascimento, M., de Oliveira Carvalho, P. Aspergillus sp. lipase: potential biocatalyst for industrial use //Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic. 2010. Т. 67. №. 3-4. С. 163 - 171.
16. Gupta R., Gupta N., Rathi P. Bacterial lipases: an overview of production, purification and biochemical properties //Applied microbiology and biotechnology. 2004. Т. 64. №. 6. С. 763- 781...