Тип работы:
Предмет:
Язык работы:


Исследование особенностей альфа 7 и альфа 9 никотиновых ацетилхолиновых рецепторов методами сайт-направленного мутагенеза и флоуресцентной детекции кальция

Работа №76610

Тип работы

Бакалаврская работа

Предмет

химия

Объем работы65
Год сдачи2020
Стоимость4770 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
41
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


2. Введение 8
3. Литературный обзор 11
3.1. Никотиновые ацетилхолиновые рецепторы (нАХР) 11
3.2. Строение и функционирование нАХР 17
3.3. а7 нАХР и а9 нАХР 25
3.4. Мышечные нАХР 28
4. Заключение 32
5. Экспериментальная часть 33
5.1. Приборы и материалы 33
5.2. Точечный мутагенез нАХР 34
5.2.1. Подбор праймеров 34
5.2.2. ПЦР-амплификация 35
5.2.3. Электро форез 36
5.2.4. Экстракция плазмидной ДНК из агарозного геля 37
5.2.5. Трансформация клеток и посев на чашку Петри 37
5.2.6. ПЦР-скрининг колоний и наращивание в жидкой LB-среде 38
5.2.7. Выделение плазмидной ДНК 39
5.2.8. Секвенирование плазмидной ДНК 40
5.3. Флуоресцентная микроскопия и кальциевый имиджинг 41
5.3.1. Программное обеспечение 41
5.3.2. Флуоресцентная детекция цитоплазматического кальция 41
6. Обсуждение полученных результатов 48
7. Экономическая часть 50
7.1. Организация и планирование работ по теме 50
7.1.1. Организация работ 51
7.1.2. График проведения работ 53
7.2. Расчет стоимости проведения работ 54
7.2.1. Затраты на материалы и покупные изделия 55
7.2.2. Расчет затрат на спецоборудование 56
7.2.3. Расчет основной заработной платы персонала 56
7.2.4. Дополнительная заработная плата персонала 57
7.2.5. Страховые отчисления 57
7.2.6. Командировочные расходы 57
7.2.7. Контрагентские услуги 57
7.2.8. Накладные расходы 57
7.2.9. Прочие расходы 57
7.2.10. Полная себестоимость 58
8. Выводы 59
9. Список использованных источников

Надсемейство пентамерных лиганд-управляемых ионных каналов (пЛУИК)
представляет собой группу трансмембранных рецепторов, обеспечивающих селективный пассивный транспорт ионов через плазматическую мембрану посредством изменения конформации при связывании с молекулами лигандов. Последние можно классифицировать по типу вызываемых ими изменений активности
рецептора на: агонисты, переводящие рецептор в активное состояние; антагонисты, блокирующие его; и аллостерические модуляторы, селективно регулирующие действие других лигандов. По строению пЛУИК представляют собой белковые комплексы из пяти субъединиц, симметрично расположенных вокруг центрального ионного канала. В каждой субъединице выделяют три функциональных домена: внеклеточный, трансмембранный и цитоплазматический. Надсемейство пЛУИК включает семейство Цис-петельных рецепторов, представителями которого являются никотиновые ацетилхолиновые рецепторы (нАХР)
наряду с серотониновыми рецепторами (5-НТ3Р) и рецепторами γ-аминомасляной кислоты (ГАМКАР). Ключевой особенностью строения рецепторов данного
семейства является наличие пары цистеинов, расположенных во внеклеточном
домене и соединенных друг с другом посредством дисульфидной связи. нАХР
широко распространены по всему животному миру от нематод до человека и экспрессируются во многих областях центральной и периферической нервной системы, а также в глиальных, эпителиальных, эндотелиальных, дендритных и др.
клетках. К лигандам нАХР, как видно из названия, относят эндогенный ацетилхолин и экзогенный никотин. Вследствие широкой распространенности в организме и вовлеченности во многие физиологические процессы, нАХР являются
перспективной мишенью лекарственных средств при патологиях нервной и иммунной систем, в частности при болезни Альцгеймера, шизофрении, миастении,
эпилепсии и др. Гомопентамерные α7 нАХР представляют особый интерес, поскольку обладают уникальными свойствами: высокой проницаемостью для9
ионов кальция, высоким сродством к α-бунгаротоксину (α-BTX), относительно
низким сродством к никотину и быстрой десенситизацией. Мышечные нАХР,
наряду с α7 нАХР обладающие высоким сродством к α-BTX, играют важнейшую
роль в жизнедеятельности млекопитающих через обеспечение работы скелетной
мускулатуры. Мутации в генах субъединиц мышечного нАХР зачастую приводят к появлению редких генетических заболеваний — наследственных миастений. Наиболее интересными с точки зрения изучения фундаментальных механизмов функционирования нАХР являются миастении так называемых «медленных каналов». Этот тип наследственных миастений вызван мутациями, повышающими активность мышечного нАХР, что приводит к избыточному проникновению ионов кальция в мышечные волокна и повреждению мышечной ткани. Таким образом, исследование нАХР, проницаемых для ионов кальция и их мутантных форм является актуальной задачей, как с точки зрения фундаментальной
науки, так и для создания новых лекарственных средств.
Целью данной работы является исследование молекулярных механизмов
функционирования различных типов рецепторов, в частности с мутантными α7
и мышечными нАХР, с помощью сочетания методов сайт-направленного мутагенеза и кальциевого имиджинга.
Для достижения цели были поставлены следующие задачи:
1) получить точечный мутант α7 нАХР с двойной заменой в участке связывания с лигандами на основе двух мутантов с одиночными заменами:
L119D и F209S;
2) исследовать функциональную активность мутантов мышечного рецептора на основе мутанта, ассоциированного с наследственной миастенией
медленных каналов.

Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!


Была произведена мутация F209S в нАХР α7-го подтипа с мутацией
L119D. В процессе внесения мутации F209S произошла незапланированная дупликация участка «C»-петли, что произошло вследствие
наличия в «C»-петле повторяющихся нуклеотидных последовательностей.
2. Были обработаны данные кальциевого имиджинга мышечного нАХР
дикого типа (WT) и мутантных рецепторов при аппликации агониста
(ацетилхолина) в разных концентрациях. Исследование показало, что
при низких концентрациях ацетилхолина (10 мкМ) мутанты G173S,
L219T и L219A проявляют повышенную активность в сравнении с мышечным нАХР дикого типа (WT), а мутация L219A взаимодействует с
мутацией G173S (вызывающей миастению), что приводит к уменьшению чувствительности двойного мутанта и к низким, и к слишком высоким концентрациям ацетилхолина. Благодаря графикам падения интенсивности флуоресценции во времени было выявлено, что мутации в
положениях 173 и 219 мнАХР функционально и топологически взаимосвязаны.


1. Mariama, J., Evolution of Pentameric Ligand-Gated Ion Channels: Pro-Loop Receptors / J. Mariama, T. Antoine, H. Jerome // PLoS One - 2016. - Vol. 11, №3. - e0151934.
2. Corringer, P.J. et al. Structure and pharmacology of pentameric receptor chan¬nels: from bacteria to brain / P-J Corringer, F. Poitevin, M. S. Prevost, L. Sau- guet, M. Delarue, J-P. Changeux // Structure - 2012. Vol. 20, №6. - P. 41-56.
3. Edson, Х. А. et al. Mammalian Nicotinic Acetylcholine Receptors: From Structure to Function / X. A. Edson, F. R. P. Edna, A. Manickavasagom, W. R. Scott / / Physiol Rev - 2009. - Vol. 89, №1. - P. 73-120.
4. Sine, S.M., End-plate acetylcholine receptor: structure, mechanism, pharma¬cology, and disease /S. M. Sine // Physiol Rev - 2012. - Vol. 92, №3. - P.
1189 -1234.
5. Corradi, J. B. W., Understanding the Bases of Function and Modulation of a7 Nicotinic Receptors: Implications for Drug Discovery / J. B. W. Corradi, C. Bouzat // Mol Pharmacol - 2016. - Vol. 90, №3. - P. 288-99.
6. Paulo, J.A., Proteomic analysis of an alpha7 nicotinic acetylcholine receptor interactome / J.A. Paulo, W. J. Brucker, E. Hawrot // J Proteome Res - 2009. - Vol. 8, №4. - P. 1849-1858.
7. Jones, A.K., Proteins interacting with nicotinic acetylcholine receptors: ex¬panding functional and therapeutic horizons / A.K. Jones, S. D. Buckingham,
D. B. Sattelle // Trends Pharmacol Sci - 2010. - Vol. 31, №10. - P. 455-462.
8. King, J.R. et al. Identification and characterization of a G protein-binding clus¬ter in a7 nicotinic acetylcholine receptors / J. R. King, J. C. Nordman, S. P. Bridges, M. Lin // J Biol Chem - 2015. - Vol. 290, №33. - P. 20060-20070.
9. Bouzat, C. et al. The interface between extracellular and transmembrane do¬mains of homomeric Cys-loop receptors governs open-channel lifetime and rate of desensitization / C. Bouzat, M. Bartos, J. Corradi, S. M. Sine // J Neu- rosci - 2008. - Vol. 28, №31 - P. 7808-7819.
10. Yan, H. et al. The coupling interface and pore domain codetermine the single¬channel activity of the a7 nicotinic receptor / H. Yan, N. Pan, F. Xue, Y. Zheng, C. Li, Y. Chang, Z. Xu, H. Yang, J. Zhang / / Neuropharmacology -
2015. - Vol. 95. - P. 448-458.
11. Althoff, T. et al. X-ray structures of GluCl in apo states reveal a gating mech¬anism of Cys-loop receptors / T. Althoff, R. E. Hibbs, S. Banerjee, E. Gouaux // Nature - 2014. - Vol. 512, №7514 - P. 333-337.
12. Andersen, N. et al. Functional relationships between agonist binding sites and coupling regions of homomeric Cys-loop receptors / N. Andersen, J. Corradi, M. Bartos, S. M. Sine, C. Bouzat // J Neurosci - 2011. - Vol. 31, №10 - P. 3662-3669.
13. Guan, Z.Z. et al. Decreased protein levels of nicotinic receptor subunits in the hippocampus and temporal cortex of patients with Alzheimer’s disease / Z. Z. Guan, X. Zhang, R. Ravid, A. Nordberg // J Neurochem - 2000. - Vol. 74, №1 - P. 237-243.
14. Dineley, K.T. Nicotinic ACh receptors as therapeutic targets in CNS disorders / K. T. Dineley, A. A.Pandya, J. L. Yakel // Trends Pharmacol Sci - 2015. - Vol. 36, №2 - P. 96-108.
15. Shelukhina, I. et al. Calcium imaging with genetically encoded sensor Case12: Facile analysis of a7/a9 nAChR mutants / I. Shelukhina, E. Spirova, D. Kudryavtsev, L. Ojomoko, M. Werner, C. Methfessel, M. Hollmann, V. Tsetlin // PLoS One - 2017. - Vol. 12, №8 - e0181936.
16. Hone, A.J. a9-containing nicotinic acetylcholine receptors and the modulation of pain / A. J. Hone, D. Servent, J. M. Mcintosh // Br J Pharmacol - 2018. - Vol. 175, №11 - P. 1915-1927.
17. Nevin, S.T. et al. Are alpha9alpha10 nicotinic acetylcholine receptors a pain target for alpha-conotoxins? / S. T. Nevin, R. J. Clark, H. Klimis, M. J. Chris¬tie, D. J. Craik, D. J. Adams // Mol Pharmacol - 2007. - Vol. 72, №6 - P. 1406-1410.
18. Simard A.R., et al. Differential modulation of EAE by a9*- and 02*-nicotinic acetylcholine receptors / A. R. Simard, S. St-Pierre, A. Kousari, V. Patel, P. Whiteaker, B. J. Morley, R. J. Lukas, F-D. Shi // Immunol Cell Biol - 2013. - Vol. 91, №3 - P. 195-200.
19. Hughes, B.W. Molecular architecture of the neuromuscular junction. / B. W. Hughes, L. L. Kusner, H. J. Kaminski // Muscle Nerve - 2006. - Vol. 33, №4 - P. 445-461.
20. Wells, G.B. Structural answers and persistent questions about how nicotinic receptors work / G. B. Wells // Front Biosci - 2008. - Vol. 13 - P. 5479-510.
21. Unwin, N. Refined Structure of the Nicotinic Acetylcholine Receptor at 4 A° Resolution / N. Unwin // J Mol Biol - 2005. - Vol. 346, №4 - P. 967-89.
22. Albuquerque, E.X. et al. Mammalian Nicotinic Acetylcholine Receptors: From Structure to Function / E. X. Albuquerque, E. F. R. Pereira, M. Alkon- don, S. W. Rogers // Physiol Rev - 2009. - Vol. 9, №1 - P. 73-120.
23. Lindstrom, J.M. Nicotinic acetylcholine receptors of muscles and nerves: comparison of their structures, functional roles, and vulnerability to pathol¬ogy / J. M. Lindstrom // Ann N Y Acad Sci - 2003. - Vol. 998 - P. 41-52.
24. Karlin, A. Functional domains of the nicotinic acetylcholine receptor / A. Kar¬lin, R. N. Cox, M. Dipaola, E. Holtzman, P. N. Kao, P. Lobel, L. Wang, N. Yodh // Ann NY Acad Sci - 1986 - Vol. 463 - P. 53-69.
25. Kuryatov, A. et al. Mutation causing autosomal dominant nocturnal frontal lobe epilepsy alters Ca2+ permeability, conductance, gating of human «402 nic¬otinic acetylcholine receptors / A. Kuryatov, V. Gerzanich, M. Nelson, F. Olale, J. Lindstrom // J Neurosci - 1997 - Vol. 17, №23 - P. 9035-9047.
26. Lester, H.A. et al. Hypersensitive knockin mouse strains identify receptors and pathways for nicotine action / H. A. Lester, C. Fonck, A. R. Tapper, S. McKinney, M. I. Damaj, S. Balogh, J. Owens, J. M. Wehner, A. C. Collins, C. Labarca / / Curr Opin Drug Discov Dev - 2003 - Vol. 6, №5 - P. 633-639.
27. Bruses, J.L. et al. Membrane lipid rafts are necessary for the maintenance of the (a)7 nicotinic acetylcholine receptor in somatic spines of ciliary neurons /
J. L. Bruses, N. Chauvet, U. Rutishauser // J Neurosci - 2001 - Vol. 21 - P. 504-512.
28. Zhu, D. Lipid rafts serve as a signaling platform for nicotinic acetylcholine receptor clustering / D. Zhu, W. C. Xiong, L. Mei // J Neurosci - 2006 - Vol. 26, №18 - P. 4841-4851.
29. Shen, J-x., Yakel, J.L., Nicotinic acetylcholine receptor-mediated calcium sig¬naling in the nervous system / J-x. Shen, J. L. Yakel // Acta Pharmacol Sin - 2009 - Vol. 30, №6 - P. 673-80.
30. Papke, R.L. et al. alpha7 receptor-selective agonists and modes of alpha7 re¬ceptor activation / R. L. Papke, E. Meyer, T. Nutter, V. V. Uteshev // Eur J Pharmacol - 2000 - Vol. 393, №1-3 - P. 179-95.
31. Lendvai, B. et al. a7 nicotinic acetylcholine receptors and their role in cogni¬tion / B. Lendvai, F. Kassai, A. Szajli, Z. Nemethy // Brain Res Bull - 2013 - Vol. 93 - P. 86-96.
32. Shytle, R.D. et al. Cholinergic modulation of microglial activation by alpha 7 nicotinic receptors / R. D. Shytle, T. Mori, K. Townsend, M. Vendrame, N. Sun, J. Zeng, J. Ehrhart, A. A. Silver, P. R. Sanberg, J. Tan // J Neurochem - 2004 - Vol. 89, №2 - P. 337-343.
33. Sinkus, M.L. The human CHRNA7 and CHRFAM7A genes: A review of the genetics, regulation, and function / M. L. Sinkus, S. L. Graw, R. Freedman, R. G. Ross, S. Leonard // Neuropharmacology - Vol. 96 - P. 274-288.
34. Martelli, D. et al. The cholinergic anti-inflammatory pathway: a critical re¬view / D. Martelli, M. J. McKinley, R. M. McAllen // Auton Neurosci - 2014
- Vol. 182 - P. 65-69.
35. Jonge, W.J. The alpha7 nicotinic acetylcholine receptor as a pharmacological target for inflammation / W. J. Jonge, L. Ulloa // Br J Pharmacol - 2007 - Vol. 151, №7 - P. 915-929.
36. Baez-Pagan, C.A. Activation of the macrophage a7 nicotinic acetylcholine receptor and control of inflammation / C. A. Baez-Pagan, M. Delgado-Velez,
J. A. Lasalde-Dominicci // J Neuroimmune Pharmacol - 2015 - Vol. 10, №3
- P. 468-476.
37. Egea, J. et al. Anti-inflammatory role of microglial alpha7 nAChRs and its role in neuroprotection / J. Egea, I. Buendia, E. D. Parada, E. Navarro, R. Leon, M. G. Lopez // Biochem Pharmacol - 2015 - Vol. 97, №4 - P. 463-472.
38. Hone, A.J. a9-containing nicotinic acetylcholine receptors and the modulation of pain / A.J. Hone, D. Servent, J.M. McIntosh // Br J Pharmacol - 2018 - Vol. 175, №11 - P. 1915 - 1927.
39. Fucile, S. Ca2+ permeability of nicotinic acetylcholine receptors / S. Fucile // Cell Calcium. 2004. 35(1): p. 1-8.
40. Grassi, F. Calcium in fl ux through muscle nAChR-channels: One route, mul¬tiple roles / F. Grassi, S. Fucile // Neuroscince - 2019 - S0306-
4522(19)30251-9.
41. Entwistle, A. et al. The control of chick myoblast fusion by ion channels op¬erated by prostaglandins and acetylcholine / A. Entwistle, R. J. Zalin, S. Bevan, A. Warner // J Cell Biol - 1988 - Vol. 106 - P.1693-1702.
42. Constantin, B. Myoblast fusion requires cytosolic calcium elevation but not activation of voltage-dependent calcium channels / Constantin, B., Cognard, C., Raymond, G. // Cell Calcium - 1996 - Vol. 19 - №5 - P. 365-374.
43. Allard, B. et al. Intracellular Ca2+ changes and Ca2+-activated K+ channel ac¬tivation induced by acetylcholine at the endplate of mouse skeletal muscle fibres / B. Allard, J. C. Bernengo, O. Rougier, V. Jacquemond // J Physiol - 1996 - Vol. 494 - P. 337-349.
44. Young, K.A. Modulation of skeletal and cardiac voltage-gated sodium chan¬nels by calmodulin / K.A. Young, J.H. Caldwell // J Physiol - 2005 - Vol. 565 - P. 349-370.
45. Biswas, S. Mechanisms of a human skeletal myotonia produced by mutation in the C-terminus of NaV1.4: is Ca2+ regulation defective? / S. Biswas, D. A. DiSilvestre, P. Dong, G. F. Tomaselli // PLoS One - 2013 - 8e81063.
46. Otero-Cruz, J., D. et al. Decoding Pathogenesis of Slow-Channel Congenital Myasthenic Syndromes using Recombinant Expression and Mice Models / J.
D. Otero-Cruz, C. A. Baez-Pagan, L. Dorna-Perez, G. E. Grajales-Reyes, R. T. Ramirez-Ordonez, C. A. Luciano, C. M. Gomez, J. A. Lasalde-Dominicci // P R Health Sci J - 2010 - Vol. 29, №1 - P. 4-17.
47. Engel, A.G., Congenital myasthenic syndromes / A. G. Engel // Handb Clin Neurol - 2008 - Vol. 91 - P. 285-331.
48. National Center for Biotechnology [Электронный ресурс]. - Режим до-ступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/, свободный - (18.05.20)
49. Agilent [Электронный ресурс]. - Режим доступа: https: //www. chem. ag- ilent.com/store/primerDesignProgram.jsp, свободный - (18.05.20)
50. Zheng L, Baumann U, Reymond JL., An efficient one-step site-directed and site-saturation mutagenesis protocol. Nucleic acids research. 2004. 32(14): e115.
51. National Center for Biotechnology [Электронный ресурс]. - Режим до-
ступа:https://https.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/,свободный -
(18.05.20)
52. National Center for Biotechnology [Электронный ресурс]. - Режим до-
ступа:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi#AAB25224,свободный -
(18.05.20)


Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.




©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ