Тип работы:
Предмет:
Язык работы:


Моделирование и оптимизация 3-мерных МРТ последовательностей для количественного определения объемов различных структур головного мозга

Работа №56754

Тип работы

Дипломные работы, ВКР

Предмет

физика

Объем работы43
Год сдачи2017
Стоимость4760 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
62
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


Введение 3
1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 6
1.1. Основные принципы магнитного резонанса 6
1.2. Поведение намагниченности в импульсном эксперименте 6
1.3. Уравнение Блоха 8
1.4. Релаксационные процессы 10
1.5. Импульсные последовательности 11
1.5.1. Спад свободной индукции 12
1.5.2. Спин-эхо томография 13
1.5.3. Последовательность MP-RAGE 14
1.5.4. Многослойная томография 16
1.6. Характеристики изображения 17
1.7. Градиенты магнитного поля 18
1.7.1. Томография по сигналам градиентного эха 20
1.8. К-пространство 21
1.8.1. По неполному набору данных Фурье-изображение 21
1.8.2. Трехмерная Фурье-томография 22
1.9. Преобразование сигнала 22
1.10. Контраст изображения 23
1.11. Отношение сигнал/шум. Усреднение сигнала 24
1.12. Т1- и Т2- взвешенные изображения 25
1.13. Функция точечного распределения (Point Spread Function) 26
1.14. Воксельная Морфометрия (VBM) 27
2. Практическая часть 30
3. Выводы 39
4. Список литературы 40
5. Приложение


В 1945 году под руководством Феликса Блоха и Эдварда Парселла две независимых группы американских физиков впервые наблюдали явление ЯМР в твердых телах [1]. Хотелось бы отметить, что в 1943 году выдающийся российский физик Е.К. Завойский, также наблюдал данное явление, но по ряду причин не смог опубликовать данные. Ричард Эрнст, Нобелевский лауреат по химии в 1991 году “За вклад в развитие методологии спектроскопии ЯМР”, является создателем современной импульсной
методики ЯМР.
В настоящее время мы смело можем сказать, что все открытия, сделанные в данной области, принесли большую пользу в медицине. Магнитно Резонансная томография (МРТ) - это вид диагностики, которое позволяет исследовать внутренние органы живого организма. Опытные врачи, на основе полученных результатов, могут вынести диагноз и назначить лечение.
На сегодняшний день производители клинических томографов стараются решить ряд проблем, такие как улучшение качества изображения, сокращение времени сканирования, безопасность при проведении исследования.
МР изображения могут быть получены с помощью различных импульсных последовательностей, и характеризуется в первую очередь - отношением SNR (сигнал-шум), CNR (контраст-шум) и отсутствием артефактов. Параметры импульсных последовательностей влияют на интенсивность регистрируемого сигнала. Разность интенсивностей между двумя пикселами или вокселами соответствует контрастности между двумя этими элементами. Чем больше контрастность, тем больше различаются два элемента. Если контрастность равна нулю, то два элемента не различаются. Импульсная последовательность - это совокупность РЧ импульсов, которые возбуждают спиновую систему, а их пространственную локализацию определяют с помощью градиентов. Физик Эрвин Хан в 1950 году первым наблюдал “эхо-сигнал” свободной индукции, а последовательность получила название спин-эхо [3]. Вслед за ним изобрели более совершенные последовательности, такие как последовательности Карра - Перселла, Мейбума - Гилла и др.
Для того чтобы исследовать ткани мозга, создаются последовательности, которые обеспечивает высокий контраст ткани, а также полный охват мозга в короткое время сканирования. Пример такой последовательности может быть последовательность MP-RAGE (Magnetization - Prepared Rapid Gradient¬Echo) [4]. В данной последовательности был введен предварительный намагничивающий инверсионный импульс, для получения максимального контраста между серым веществом (GM), белым веществом (WM) и спинномозговой жидкостью (CSF).
При проектировании импульсных последовательностей немаловажную роль играют времена релаксации. Релаксация - это процесс возвращение намагниченности в исходное положение. Она подразделяется на продольную Т2 (спин-решеточная релаксация) и поперечную Т1 (спин-спиновая
релаксация).
Точное измерение времен релаксации Т1, важно для оптимизации Т1- взвешенного МР изображения. Более того, измерение Т1 может быть полезным для тканевых характеристик, также как для фундаментального понимания механизмов релаксации. В частности, быстрое вычисление Т1 полезно в клинических МР приложениях, требующих получение отображения Т1 за очень короткое время (несколько минут) [5].
Быстрые и точные методы определения времен продольной и поперечной релаксации на основе характеристики Т1 и Т2 могут обеспечить быстрое распознавание ткани, сегментаций и их классификаций. Абсолютное определение Т1 и Т2 клинически полезны в таких областях, как
динамическое исследование контрастного вещества [6] и при определении степени тяжести болезни Паркинсона [7].
В быстрых последовательностях часто ради сокращения времени измерения происходит потеря сигнала от мелких объектов, что ведет к краевым неточностям [8]. Данное явление связано с уширением функции распределения точки (англ. - Point Spread Function).
Целью данной дипломной работы является: моделирование 3-мерной МРТ последовательности MP-RAGE, широко используемой для воксельной морфометрии, исследование того, как ее параметры влияют на результаты воксельной морфометрии, и оптимизация параметров этой последовательности для количественного определения объемов структур головного мозга.

Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!


Путем моделирования последовательности MP-RAGE были подобраны оптимальные параметры импульсной последовательности, для получения максимального контраста между серым веществом (GM), белым веществом (WM) и спинномозговой жидкостью(СЗЕ). Предложенные нами параметры визуализации дают наименьшую ошибку в определении объемов структур головного мозга, по сравнению с параметрами рекомендованными Siemens и ADNI [21].
Анализ ошибок в определении объемов структур головного мозга показал, что изменение контраста и потеря четкости изображения, в наибольшей мере сказывается на распознавании структур на границе серого вещества и спинномозговой жидкости.



1. Марусина, М.Я. Современные виды томографии [Текст] / М.Я.Марусина, А.О.Казначеева - СПб: СПбГУ ИТМО, 2006. - 132с.
2. Мэнсфилд П., Быстрая магнитно-резонансная томография (перевод на русский) / П. Мэнсфилд - Успехи физических наук.-2005.-Уо1.175, No.10.-P.1044-1-52.
3. Фаррар, Т. Импульсная и Фурье-спектроскопия ЯМР [Текст] / Т. Фаррар, Э. Беккер. - М.: Мир, 1973.-164 с.
4. Wang J, He L, Zheng H, Lu Z-L, Optimizing the Magnetization-Prepared Rapid Gradient-Echo (MP-RAGE) Sequence / J. Wang. L. He, H.Zheng, Z.- L.Lul. - 2014. - Vol7. - P-1-16.
5. Nkongchu K, Santyr G (2005) An improved 3-D Look-Locker imaging method for T(1) parameter estimation.[Text] / K. Nkongchu, G. Santyr. - Magn. Reson. Imajing 23: 801-807.
6. Pitkamen A. Severity of hippocampal atrophy correlates with the prolongation of MRI T2 relaxation time in temporal lope epilepsy but not in Alzheimer’s disease[Text] / A. Pitkamen, M. Laakso, R. Kalviamen, K. Partanen, P. Vainio, M. Lehtovitra, P. Riekkinen, H. Soininen. - Neurology 1996; 172-1730.
7. Vymazal J. T1 and T2 in the brain of healthy subjects, patients with Parkinson’s disease, and patients with multiple system atrophy: relation to iron content [Text] / J. Vymazal, A. Righini, RA Brooks, M Canesi, C. Mariani, M. Leonardi, G. Pezzoli. - Radiology 1999; 211:489-495.
8. Nkongchu K, Santyr G. Phase-encoding strategies for optimal spatial resolution and T1 accuracy in 3D Look-Locker imaging [Text] / K. Nkongchu, G. Santyr. - Magn Reson Imaging. 2007 Oct; 25(8): 1203-14.
9. Ильясов К.А. Принципы получения изображений в магнитно -
резонансной томографии [Текст] / К.А. Ильясов, учебно-методическое пособие для студентов-бакалавров специальностей “Медицинская физика”, “Биотехнические системы и технологии” и магистров по специальностям “Физика магнитных явлений” и ’’Медицинская физика”. Казань, издательство КФУ, 2014. - 30 с.
10. Аганов А.В., Введение в медицинскую ядерную магнитно-резонансную томографию [Текст] / А.В. Аганов, Учебное пособие для бакалавров и магистров. Казань, издательство КФУ, 2012. - 60 с.
11. Ринк, П.А. Магнитный Резонанс в Медицине [Текст] / П.А. Ринк. - Издание третье. Пер. с англ. - Oxford, Backwell scientific publications. - 1995. - 247 c.
12. Джозеф П. Хорнак. Основы МРТ [Текст] / Хорнак Д.П., перевод с английского Гиппа И.Н. - Изд. “Центр визуализирующих методов, Технологический институт Рочестера”, 2003.
13. Douglas N. Greve, Martinos, “An Absolute Beginner’s Guide to Surface- and Voxel-based Morphometric Analysis,” Center for Biomedical Imaging, Massachusetts General Hospital Harvard Medical School.
14. Andrea Mechelli. Voxel-based morphometry of the human brain: Methods and applications [Text] / M. Andrea, Price J. Cathy, Friston J. Karl, and A. John. - Current Medical Imaging Reviews, 1(2): 105-113, 2005.
15. Миргазова, А.А. Оптимизация МРТ измерений для сегментации
тканей головного мозга и количественного анализа их объемов [Текст]/ А.А. Миргазова, С.Н. Нарзикулов, С.И. Сабирова, К.А. Ильясов // Международный симпозиум «Магнитный резонанс от
фундаментальных исследований к практическим приложениям>>. Сборник тезисов, Казань, 21-23 апреля 2016. - С.193.
16. Л.А. Мироновский. Введение в MATLAB [Текст] / Мироновский Л.А., Петрова К.Ю. Учебное пособие, СПбГУАП. СПб., 2005 г. - С.122.
17. Yuan Le. Improved T1, Contrast Concentration, and Pharmacokinetic Parameter Quantification in the Presence of Fat with Two-Point Dixon for Dynamic Contrast-Enhanced Magnetic Resonance Imaging [Text] / L. Yuan, D. Brian, A. Fatih, K. Karen, L. Chen. - Magn. Reson.Med. 75: 1677-1684 (2016).
18. Noth U., Improved visibility of brain tumors in synthetic MP-RAGE anatomies with pureT1 weighting [Text] / U. Noth, E. Hattingen, J. Bahr, J. Tichy, R. Deichmann - NMR Biomed, 2015 Jul, 28(7): 818-30.
19. Kecskemeti S., MPnRAGE: A technique to simultaneously acquire hundreds of differently contrasted MPRAGE images with applications to quantitative T1 mapping [Text] / S. Kecskemeti, A. Samsonov, SA. Hurley, DC. Dean, A. Field, AL. Alexander - Magn.Reson.Med. 2016 Mart, 75(3):1040-53.
20. Saranathan M., Optimization of white-matterr-nulled magnetization prepared rapid gradient echo (MP-RAGE) imaging [Text] / M. Saranathan, T. Tourdias, E. Bayram, P. Ghanouni, BK. Rutt - Magn.Reson.Med. 2015 May, 73(5):1786-94.
21. C.R. Jack. The Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI): MRI methods [Text] M.A. Bernstein, N.C. Fox//. Magn.Reson.Imaging 2008 V- 27:P 685-691.


Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.




©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ