Тип работы:
Предмет:
Язык работы:


ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ДИПЕПТИДА ь-ИЗОЛЕЙЦИЛ-ь-АЛАНИН С ПАРООБРАЗНЫМИ СОЕДИНЕНИЯМИ ПО ДАННЫМ СЕНСОРНОГО И ТЕРМИЧЕСКОГО АНАЛИЗОВ, И АТОМНО-СИЛОВОЙ МИКРОСКОПИИ

Работа №51669

Тип работы

Бакалаврская работа

Предмет

физика

Объем работы57
Год сдачи2017
Стоимость5345 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
81
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


ВВЕДЕНИЕ 4
ГЛАВА 1. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР 5
1.1 Олигопептиды 5
1.2 Взаимодействия, обеспечивающие самосборку пептидов 5
1.3 Самосборка олигопептидов в наноструктуры 9
1.4 Факторы, влияющие на самосборку 11
1.4.1 Тип, количество и последовательность аминокислотных остатков, входящих в
состав пептида 11
1.4.2 Тип растворителя 13
1.4.3 Концентрация олигопептидов в растворе и температура 15
1.4.4 Тип подложки, на которой происходит формирование пленок и влажности
воздуха 17
1.4.5 Влияние степени гидратации на морфологию пленки олигопептида и его
сорбционные свойства 17
1.5 Способы получения наноструктур на основе олигопептидов 18
1.5.1 Метод замены растворителя 18
1.5.2 Метод насыщения парообразным растворителем 20
1.5.3 Метод осаждения из паровой фазы 22
1.5.4 Термическая обработка 23
1.6 Свойства наноструктур, полученных на основе олигопептидов 24
1.7 Применение наноструктур на основе олигопептидов 29
ГЛАВА 2. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ 34
2.1. Объект исследования 34
2.2. Пьезоэлектрические кварцевые микровесы 34
2.3 Совмещённый ТГ/ДСК/МС анализ 35
2.4. Атомно-силовая микроскопия 36
2.5. Порошковая дифрактометрия 36
ГЛАВА 3. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ 36
3.1 Рецепторные свойства олигопептидов по отношению к органическим
соединениям по данным сенсорного анализа 36
3.2 Термический анализ 39
3.3 Данные рентгеновской порошковой дифрактометрии 43
3.4 Морфология тонких пленок олигопептидов по данным АСМ 44
3.5 Заключение 50
Список литературы:

В настоящее время активно ведется поиск веществ, способных к самоорганизации с образованием упорядоченных структур, которые могут быть использованы для распознавания и хранения газов, разделения энантиомеров и биологически активных соединений, при разработке новых нетоксичных и биосовместимых материалов для решения проблем медицины, био- и нанотехнологии. Перспективными объектами для решения этих задач считаются короткоцепные олигопептиды. В зависимости от состава и последовательности аминокислотных остатков в их молекулах могут быть получены разнообразные наноструктуры и кристаллы.
Наличие различных и многочисленных межмолекулярных взаимодействий в молекулярных кристаллах и наноструктурах на основе олигопептидов позволяет им сохранять свою особую упаковку после удаления молекул растворителя. В тоже время, такие материалы относятся к так называемым «мягким материалам», которые способны изменять свою упаковку под действием различных факторов, что также может быть использовано для формирования органических наноструктур с заданной топологией. С другой стороны, эта особенность может существенно усложнить зависимость типа «структура-свойство» для процессов связывания субстратов.
В связи с этим, целью настоящей работы было изучение рецепторных свойств наноразмерных пленок дипептида ^изолейцил-^аланин по отношению к ряду парообразных органических соединений, а также процессов самоорганизации дипептида индуцируемых сорбцией различных парообразных соединений. Задачами работы было изучение особенностей соотношения типа «структура-свойство» для процессов связывания парообразных органических соединений пленками дипептида, полученными из различных растворителей, а также изучение термической стабильности дипептида и продуктов его насыщения парообразными соединениями.


Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!


В ходе работы установлено, что сорбционные свойства тонкой пленки дипептида ^изолейцил-^аланин зависят от способа ее приготовления. Плёнка дипептида, полученная из раствора в метаноле, проявляет селективность к изученным хлорорганическим соединениям по сравнению со спиртами и нитрометаном. Плёнка дипептида, полученная из раствора в гексафторизопропаноле, обладает высокой сорбционной ёмкостью к метанолу (почти в 3 раза больше соответствующего значения, полученного для плёнки дипептида из раствора в метаноле).
Обнаружено, что с ростом размеров молекул сорбатов сорбционная емкость L- изолейцил-^аланина уменьшается как в ряду изученных спиртов, так и хлорорганических соединений.
Установлено, что ^изолейцил-^аланин обладает термической стабильностью до температуры 208 °C. При дальнейшем нагревании в фазе дипептида протекает химическая реакция с выделением воды. При температурах выше 248 °C наблюдается плавление продукта реакции, сопровождающееся его испарением.
Обнаружено, что ^изолейцил-^аланин в состоянии порошка не образует стабильные при комнатной температуре клатраты с изученными органическими соединениями, за исключением гексафторизопропанола, что может быть связано с малым диаметром и высокой спиральностью каналов в кристаллической фазе дипептида.
Установлено, что ^изолейцил-^аланин образует аморфные плёнки, при нанесении его на поверхность пирографита из растворов в метаноле и гексафторизопропаноле. В последнем случае возможно образование зародышей кристаллов на поверхности пленки. При насыщении аморфной пленки парами воды или метанола происходит ее кристаллизация с образованием кристаллов, форма и размер которых существенно зависят от времени насыщения и ее толщины.



1. Глик, Б. Молекулярная биотехнология. Принципы и применение / Б. Глик, Д. Пастернак // М.: Мир. - 2002. - 589 с.
2. Hamley, I.W. Nanotechnology with Soft Materials / I.W. Hamley // Angew. Chem. Int. Ed. - 2003. - V.42. - P.1692-1712
3. Ефимова, И.Г. Образование наноостровков на поверхности тонких пленок дипептидов под действием паров органических соединений / И.Г. Ефимова, М.А. Зиганшин, В.В. Горбачук, Д.В. Солдатов, С.А. Зиганшина, А.П. Чукланов, А.А. Бухараев // Физикохимия поверхности и защита материалов. - 2009. - T.45,N5. - С.474-477.
4. Зиганшин, М.А. Влияние подложки и влажности воздуха на морфологию пленок дипептида Е-лейцилШ-лейцин / М.А. Зиганшин, А.А. Бикмухаметова, А.В. Герасимов, В.В. Горбачук, С.А. Зиганшина, А.А. Бухараев // Физикохимия поверхности и защита материалов. - 2014. - Т.50. № 1. - С.53-58.
5. Adler-Abramovich, L. The physical properties of supramolecular peptide assemblies: from building block association to technological applications / L. Adler-Abramovich, E. Gazit // Chem. Soc. Rev. - 2014. - V.43,N20. - P. 6873-7238.
6. Yan, X. Self-assembly and application of diphenylalanine-based nanostructures / X. Yan, P. Zhu, J. Li // Chem. Soc. Rev. - 2010. - V.39. - P.1861-2336.
7. Soldatov, D.V. Dipeptides as microporous materials / D.V. Soldatov, I.L. Moudrakovski, J.A. Ripmeester // Angew. Chem. Int. Ed. - 2004. - V.43. - P.6308-6311.
8. Do, T.D. Diphenylalanine Self Assembly: Novel Ion Mobility Methods Showing the Essential Role of Water / T.D. Do, M.T. Bowers // Am. Chem. Soc. - 2015. - V.87. - P.4245-4252.
9. Gorbitz, C.H. Microporous organic materials from hydrophobic dipeptides / C.H. Gorbitz // Chem. Eur. J. - 2007. - V.13. - P.1022-1031.
10. Toksoz, S. Self-assembled one-dimensional soft nanostructures / S. Toksoz, H. Acar, M. O. Guler // Soft Matter - 2010 - P.5839-5849.
11. Israelachvili,J. N. Intermolecular and Surface Forces /J. N. Israelachvili //Academic Press, San Diego, 3rd edn, 2011, pp. 151-167.
12. Zhu, P. Solvent-induced structural transition of self-assembled dipeptide: From organogels to microcrystals/ P. Zhu, X. Yan, Y. Su, Y. Yang and J. Li// Chem. - Eur. J., 2010, 16, 3176-3183.
13. Yuan, C. Multiscale simulations for understanding of evolution and mechanism of hierarchical peptide self-assembly / C. Yuan, S. Li, Q. Zou, X. Yan // Phys. Chem. Chem. Phys., 2017, DOI: 10.1039/C7CP01923H.
14. Tsonchev, S.Phase diagram for assembly of biologically-active peptide amphiphiles/
S. Tsonchev,K. L. Niece, G. C. Schatz, M. A. Ratner and S. I. Stupp, //J. Phys. Chem. B, 2008, 112, 441-447.
15. Kabiri, M. Application of isothermal titration calorimetry for characterizing thermodynamic parameters of biomolecular interactions: Peptide self-assembly and protein adsorption case studies/ M. Kabiri,L. D. Unsworth// Biomacromolecules, 2014, 15, 3463-3473.
16. Richardson, J.J. Technology-driven layer-by-layer assembly of nanofilms/ J.J. Richardson, M. Bjo"rnmalm and F. Caruso // Science, 2015, 348, 411.
17. Tahara, K. Supramolecular surface-confined architectures created by self-assembly of triangular phenylene-ethynylenemacrocycles via van der Waals interaction/ K. Tahara, S. Lei, J. Adisoejoso, S. De Feyter and Y. Tobe// Chem. Commun., 2010, 46, 8507-8525.
18. Reches, М. Casting metal nanowires within discrete self-assembled peptide nanotubes / М. Reches, E. Gazit // Science, 2003, 300, 625-627.
19. Reches, M. Self-assembly of peptide nanotubes and amyloid-like structures by charged-termini-capped diphenylalanine peptide analogues/ M.Reches, E. Gazit// Isr. J. Chem., 2005, 45, 363-371.
20. Jeon, J. Molecular insights into diphenylalanine nanotube assembly: All-atom simulations of oligomerization/ J. Jeon, C. E. Mills and M. S. Shell// J. Phys. Chem. B, 2013, 117, 3935-3943.
21. Zelzer, M. Next-generation peptide nanomaterials: molecular networks, interfaces and supramolecular functionality/ M. Zelzer, V. U. Rein //Chem. Soc. Rev., 2010, 39, 3351-3357
22. Sakurai, M. A. New approach to molecular self-assembly through formation of dipeptide-based unique architectures by artificial supersaturation / M. Sakurai, P. Koley, M. Aono // J. Am. Chem. Soc. - 2014 - V.50 - P.12556-12559.
23. Lee, K.S. A self-assembled nanotube for the direct aldol reaction in water / K.S. Lee,
J. R. Parquette // Chem. Commun. - 2015. - V.51. - P.15653-15656.
24. Zhao, X. Molecular self-assembly and applications of designer peptide amphiphiles / X. Zhao, F. Pan, H. Xu, M.Yaseen, H. Shan,C. A. E. Hauser, S. Zhang, J. R. Lu // Chem. Soc. Rev. - 2010. - V.39. - P.3480-3498.
25. Hernik, A. Amyloidogenic Properties of Short a^L^Glutamic Acid Oligomers / A. Hernik, W. Pulawski, B. Fedorczyk, D. Tymecka, A.Misicka, S. Filipek, W. Dzwolak // Langmuir. - 2015. - V.31. - P.10500-10507.
26. Joshi, K.B. Sequence shuffle controls morphological consequences in a self¬assembling tetrapeptide / K.B. Joshi, S. Verma // J. Pept. Sci. - 2008. - V.14. - P.118-126.
27. Wang, J. Trace Solvent as a Predominant Factor to Tune Dipeptide Self-Assembly /
J. Wang, K. Liu, L. Yan, A. Wang, S. Bai and X. Yan // ACS Nano, 2016, 10, 2138-2143.
28. Erdogan, H. Morphological Versatility in the Self-Assembly of Val-Ala and Ala-Val Dipeptides / H. Erdogan, H.; E. Babur, M. Yilmaz, E.Candas, M. Gordesel, Y. Dede, E. E. Oren, G. B. Demirel, M.K. Ozturk, M. S. Yavuz, G. Demirel // Langmuir. - 2015. - V.31. - P.7337-7335.
29. Wang, H. Aligning 3D nanofibrous networks from self-assembled phenylalanine nanofibers / H. Wang, X. Wang,Y. C. Chenb, B. Li. // J. Am. Chem. Soc. - 2015. - V.5. - P. 8022-8027.
30. Lamm, M.S. Laminated Morphology of Nontwisting Beta-Sheet Fibrils Constructed Via Peptide Self-Assembly / M.S. Lamm, K. Rajagopal, J.P. Schneider, D.J. Pochan // J. Am. Chem. Soc. - 2005. - V.127, 16692-16700.
31. Yan, X. Reversible transitions between peptide nanotubes and vesicle-like structures including theoretical modeling studies / X. Yan, Y. Cui, Q. He, K. Wang, J. Li, W. Mu, B. Wang, Z. Ou-yang // Chem. Eur. J. - 2008. - V.14. - P.5974-5980.
32. Зиганшин, М.А. Влияние подложки на морфологию пленок дипептида Е-валил-L- аланиндо и после взаимодействия с парамипиридина / М.А. Зиганшин, И.Г. Ефимова, А.А. Бикмухаметова, В.В. Горбачук, С.А. Зиганшина, А.П. Чукланов, А.А. Бухараев // Физико химия поверхности и защита материалов. - 2013. - T.49 - C.258-263.
33. Niu, L. Using the bending beam model to estimate the elasticity of diphenylalanine nanotubes / L. Niu, X.Chen, S. Allen, S. J. B. Tendler // Langmuir. - 2007. - V.23. - P.7443-7446.
34. Зиганшин, М.А. Влияние гидратациинаморфологию тонкой пленки и
рецепторные свойства трипептида Б-лейцил-L- лейцил-L- лейцин / М.А. Зиганшин, А.В. Герасимов, А.А. Бикмухаметова, И.Г. Ефимова, В.В. Горбачук, С.А. Зиганшина, А.А. Бухараев // Бутлеровские сообщения. - 2012. - T.32, №12 - C.155-160.
35. Levin, А. Ostwalds rule of stages governs structural transitions and morphology of dipeptide supramolecular polymers / А .Levin, T. O. Mason, L. Adler-Abramovich, A. K. Buell, G. Meisl, C. Galvagnion, Y. Bram, S. A. Stratford, C. M. Dobson, T. P. J. Knowles and E. Gazit// Nat. Commun. - 2014. - 5. - Р. 5219.
36. I. W. Hamley, Peptide nanotubes/ Hamley I. W. //Angew. Chem., Int. Ed., 2014, 53, 6866-6881.
37. Ryu, J. Solid-phase growth of nanostructures from amorphous peptide thin film: Effect of water activity and temperature/ J. Ryu, C. B. Park// Chem. Mater., 2008, 20, 4284-4290.
38. Ryu, J. High-temperature self-assembly of peptides into vertically well-aligned nanowires by aniline vapor / J. Ryu, C.B. Park // Adv. Mater. - 2008. - V.20. - P.3754¬3758.
39. Adler-Abramovich, L. Self-assembled arrays of peptide nanotubes by vapour deposition / L. Adler-Abramovich, D. Aronov, P. Beker, M. Yevnin, S. Stempler, L. Buzhansky, G. Rosenman and E. Gazit// Nat. Nanotechnol., 2009, 4, 849-854.
40. Reches, M. Controlled patterning of aligned self-assembled peptide nanotubes/ M. Reches, E. Gazit// Nat. Nanotechnol., 2006, 1, 195-200.
41. Vasudev, M. C. Vertically aligned peptide nanostructures using plasma-enhanced chemical vapor deposition / M. C. Vasudev, H. Koerner, K. M. Singh, B. P. Partlow, D. L. Kaplan, E. Gazit, T. J. Bunning and R. R. Naik // Biomacromolecules, 2014, 15, 533-540.
42. Handelman, A. Structural and optical properties of short peptides: Nanotubes-to- nanofibers phase transformation/ A. Handelman, A. Natan and G. Rosenman// J. Pept. Sci.,2014, 20, 487-493.
43. Wang, Y. Rational Design of Chiral Nanostructures from Self-Assembly of a Ferrocene-Modified Dipeptide / Y. Wang, W. Qi, R. Huang, X. Yang, M. Wang, R. Su and Z. He // J. Am. Chem. Soc., 2015, 137, 7869-7880.
44. Lee, J. S. Self-assembling of semiconducting photoluminescent peptide nanowires in the vapor phase / J.S. Lee, I. Yoon, J. Kim, H. Ihee, B. Kim, C. B. Park // Angew. Chem.Int. Ed - 2011. - V.50. - P.1164 - 1167.
45. Afonso, R. A surface thermodynamics approach to modelling single-file adsorption in ultramicroporous materials/ R. Afonso, L. Gales, A. Mendes// Microporous and Mesoporous Materials 225 (2016) 543-551.
46. Afonso, R. Hydrophobic dipeptide crystals: a promising Ag-free class of ultramicroporous materials showing argon/oxygen adsorption selectivity/ R. Afonso,A. Mendes, L. Gales// Phys.Chem.Chem.Phys., 2014, 16, 19386.
47. Myers, A. L. Thermodynamics of Adsorption in Porous Materials / A. L. Myers // AIChE Journal - 2002 - PA 19104.
48. Comotti, A. Methane, carbon dioxide and hydrogen storage in nanoporous dipeptide- based materials / A. Comotti, S. Bracco, G. Distefano, P. Sozzani // Chem. Commun. - 2009. - P.284-286.
49. Adler-Abramovich, L. Thermal and Chemical Stability of Diphenylalanine Peptide Nanotubes: Implications for Nanotechnological Applications/ L. Adler-Abramovich, M. Reches, V. L. Sedman, S. Allen, S. J. B. Tendler и Ehud Gazit// Langmuir 2006, 22, 1313 - 1320.
50. Sedman, V.L. Direct observation of the release of phenylalanine from diphenylalanine nanotubes / V.L. Sedman, L. Adler-Abramovich, S. Allen, E. Gazit, S.J. B. Tendler // J. Am. Chem. Soc. - 2006. - V.128. - P.6903-6908.
51. Mata, A. Bone regeneration mediated by biomimetic mineralization of a nanofiber matrix / A. Mata, Y. Geng, K.J. Henrikson, C. Aparicio, S.R. Stock , R.L. Satcher, S.I. Stupp // Biomaterials. - 2010. - V.31. - P.6004-6012.
52. Rajiv Dahiya, Synthetic and biological studies on a cyclopolypeptide of plant origin /Akhilesh Kumar// J Zhejiang UnivSci B 2008 9(5):391-400.
53. Ryu, J. Synthesis of diphenylalanine/cobalt oxide hybrid nanowires and their application to energy storage / J. Ryu, S.-W. Kim, K. Kang, C.B. Park // Acs Nano. - 2010. - V.4, N1. - P.159-164.
54. Yakimova, L.S. Molecular recognition of organic vapors by adamantylcalix[4]arene in QCM sensor using partial binding reversibility / L.S. Yakimova, M.A. Ziganshin, V.A. Sidorov, V.V. Kovalev, E.A. Shokova, V.A. Tafeenko, V.V. Gorbatchuk // J. Phys. Chem.B. - 2008. - V.112. - P.15569-15575.
55. Sauerbrey, G.Z. Use of quartz vibration for weighing thin films on a microbalance /
G. Z. Sauerbrey // J. Physik. - 1959. - V.155. - P.206-212.
56. M.A. Ziganshin, A.V. Gerasimov, S.A. Ziganshina, N.S. Gubina, G.R. Abdullina, A.E. Klimovitskii, V.V. Gorbatchuk, A.A. Bukharaev. Thermally induced diphenylalanine cyclization in solid phase // J. Therm. Anal. Calorim. - 2016. - V.125, Issue 2. - P.905-912.
57. Soldatov, D.V. Micropores in crystalline dipeptides as seen from the crystal structure, He pycnometry, and 129Xe NMR spectroscopy [Text] / D.V. Soldatov, I.L. Moudrakovski, E.V. Grachev, J.A. Ripmeester // J. Am. Chem. Soc. - 2006. - V.128, N20. - P.6737-6744.


Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.




©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ