ИССЛЕДОВАНИЕ ЛИНЕЙНОГО ДОДЕКАПЕПТИДА (FIBRINOGEN-BINDING INGIBITOR PEPTIDE) МЕТОДАМИ ДВУМЕРНОЙ КОРРЕЛЯЦИОННОЙ СПЕКТРОСКОПИИ

ВВЕДЕНИЕ 3
1 Теоретическая часть 4
1.1 Теория ЯМР 4
1.1.1 Векторная модель 4
1.1.2 Квантовомеханическое описание 5
1.2 Импульсный метод ЯМР 9
1.3 Параметры спектров ЯМР 12
1.3.1 Химический сдвиг 12
1.3.2 Косвенное спин-спиновос взаимодействие 14
1.3.3 Интегральная интенсивность 16
1.4 Двумерная спектроскопия 17
1.4.1 Эксперимент 2D COSY 18
1.4.2 TOCSY ЯМР эксперимент 20
1.5 Объект исследования 21
2 ПРАКТИЧЕСКАЯ ЧАСТЬ 24
2.1 Материалы, методы и объекты исследования 24
2.2 Анализ 'Н ЯМР спектра 25
2.3 Соотнесение сигналов в спектре методами двумерной спектроскопии 27
ЗАКЛЮЧЕНИЕ 45
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ:
Купить

Интегрины это класс молекул, которые являются посредниками при взаимодействии между клетками живых организмов, участвуя в этом процессе путем связывания с конкретными макромолекулярными белковыми лигандами. Каждая субъединица интегрина состоит из большого внеклеточного образования, трансмембранной спирали и короткого цитоплазматического хвоста и комплементарных субъединиц (домен а-субъединицы связывается с доменом Р-субъединицы и т д).
Основной интегрин allbp3 тромбоцитов управляет первичным гемостазом, позволяя формировать агрегаты тромбоцитов в местах повреждения сосудов. Агрегация тромбоцитов происходит, когда растворимый фибриноген связывается с головной частью молекулы allbp3. Поскольку константа диссоциации (Kd) для комплекса фибриногена с активным allbp3 ~ 100 нМ в 100 раз ниже, чем для свободного фибриногена в плазме, то тромбоциты активируются в плазменной среде, головная часть allbp3 немедленно связывается с фибриногеном. Соответственно, аПЬрЗ жестко регулирует связывание фибриногена для предотвращения спонтанного образования внутрисосудистых агрегатов тромбоцитов.
Связывание в растворе фибриногена с головной частью аПЬрЗ осуществляется исключительно AGDV-содержащей последовательностью, расположенной на С-концс цепи фибриногена у. Однако сайт связывания пептидов, соответствующих последовательностям Arg-Gly-Asp (RGD), расположенных в двух местах в цепи фибриногена Аа, перекрывается с сайтом связывания для последовательности у-цепи, и RGD-содержащие пептиды являются мощными ингибиторами связывание фибриногена с ccllbp в растворе. [I]
Поэтому в качестве объекта исследования был выбран додекапептид (пептид, образованный цепочкой из 12 аминокислот), соответствующий С-концу у цепи фибриногена.
Главной задачей было соотнесение сигналов на одномерном 'Н ЯМР спектра, двумерном 2D TOCSY и составление таблицы химических сдвигов для каждой аминокислоты.

Купить