СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ 4
ВВЕДЕНИЕ 5
1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 7
Межклеточная коммуникация 7
Пути межклеточной коммуникации в растительных тканях 7
Симпластная межклеточная коммуникация. Плазмодесмы 8
Сравнение механизмов межклеточной коммуникации 10
Метод 12
Методы исследования на основе микроскопии 12
ЯМР с импульсным градиентом магнитного поля 13
Парамагнитный допинг 21
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ 28
2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 28
Метод 28
Параметры измерений 28
Воздействия 28
Материалы 29
Исследуемые объекты 29
3 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 30
Вклад симпластного переноса в суммарный транспорт воды 30
Время релаксации системы 31
Влияние окислительного стресса на суммарный транспорт воды 32
Влияние ингибитора синтеза каллозы на корни 33
Влияние контрастных веществ разного типа на симпласт 34
«Физиологический коридор» водной проводимости на фоне Gd-DTPA 36
ВЫВОДЫ 38
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ 39
Межклеточная коммуникация является необходимым условием для развития многоклеточных организмов. В данной работе симпластная межклеточная коммуникация исследована на примере плазмодесм (ПД) в корнях высших растений. В животных клетках механизм переноса намного сложнее, однако и там есть аналог плазмодесм – туннельные нанотрубки (ТНТ). Помимо очевидных структурных сходств, сравнение ТНТ и ПД также обнаруживает значительные функциональные похожести, схожие процессы формирования и аналогичную ответную реакцию во время заражения вирусными инфекциями. Несмотря на значительный прогресс, достигнутый в выявлении компонентов ПД, по-прежнему в значительной степени неизвестны их структурные и функциональные особенности [1], механизмы регулирования (одним из которых является синтез каллозы) и ответная реакция на окислительный стресс в целом.. Таким образом, В какой-то мере прогресс был ограничен преимущественным использованием простых технологий, в отличие от более сложных способов, которые необходимы для ответа на оставшиеся вопросы. Одним из современных подходов является применение ЯМР с импульсным градиентом магнитного поля. Данный метод позволяет количественно оценивать водный перенос, не оказывая при этом губительного воздействия на живые биологические системы.
Целью работы являлось: разработка и апробация метода для количественного определения физиологического диапазона изменений водной проводимости симпластной системы (плазмодесм) в интактных растениях на основе метода ЯМР-диффузометрии.
Для достижения указанной цели были поставлены следующие задачи:
1. Разработка метода для количественного определения водной проводимости симпластной системы (плазмодесм) в интактных растениях на основе метода ЯМР-диффузометрии с контрастными веществами.
2. Сравнение влияния комплексона и комплексообразователя парамагнитных контрастных препаратов на симпластный межклеточный перенос воды в корнях проростков кукурузы методом ЯМР-диффузометрии.
3. Определение верхней границы водной проницаемости симпластного пути в корнях интактных растений кукурузы, используя ингибитор синтеза каллозы
– DDG (2-деокси-д-глюкоза).
4. Исследование блокирующего действия индуктора активных форм кислорода на водную проницаемость симпластного пути на примере – Cu-a (смесь CuCl2 и аскорбиновой кислоты).
1) Впервые был разработан и апробирован метод для количественного определения водной проводимости симпластной системы (плазмодесм) в интактных растениях на основе метода ЯМР-диффузометрии с GdDTPA.
2) Методом ЯМР-диффузометрии наибольшая интенсивность симпластного переноса воды в корнях проростков кукурузы детектируется на фоне циклического Gd-содержащего парамагнитного комплекса. Распределение исследованных парамагнитных контрастных препаратов по межклеточному пространству корня кукурузы происходит в течение часа.
3) Была определена верхняя граница водной проницаемости симпластного пути в корнях интактных растений кукурузы, используя ингибитор синтеза каллозы – DDG. Было выяснено, что в контрольных образцах при оптимальных условиях выращивания коэффициент самодиффузии ближе к верхней границе «физиологического диапазона» изменений водной проводимости симпластной системы.
4) Было установлено, что действие индуктора активных форм кислорода – Cu- a приводит к почти полному блокированию симпласного переноса, при этом так же блокируется суммарный водный транспорт (в том числе трансмембранный перенос).
1) Sokolowska,K. Symplasmic transport in vascular plants [Text] / K.Sokolowska, P.Sowinski // New York: Springer Science+Business Media – 2013. – P.245-257.
2) Zambryski, P. Quick guide: plasmodesmata [Text] / P. Zambryski // Current Biology. – 2008. – Vol.18, №8. – P.324-325.
3) Steudle, E. Water uptake by roots: effect of water deficit [Text] / E. Steudle // Journal of Experimental Botany – 2000. – Vol.51. – P. 1531-1542.
4) Radford,J. E. Callose deposition at plasmodesmata [Text] / J. E. Radford, M. Vesk, R. L. Overall // Protoplasma. – 1998. – Vol.201. – P.33.
5) Benedetti, E.L. Electron microscopic observations on negatively stained plasma membranes isolated from rat liver [Text] / E.L. Benedetti, P. Emmelot // Journal of Cell Biology. – 1965. – Vol.26. – P.299–305.
6) Robertson, J.D. Occurrence of a subunit pattern in unit membranesof club endings in mauthner cell synapses in gold fish brains [Text] / J.D.Robertson // Journal of Cell Biology. – 1963. – Vol.19. – P.201–221.
7) Lucas, W.J. RNA as a long-distance information macromolecule in plants [Text] / W.J.Lucas, B.C.Yoo, F.Kragler // Nature Reviews Molecular Cell Biology. – 2001. – Vol.2. – P.849–857.
8) Abounit,S. Wiring through tunneling nanotubes – from electrical signals to organelle transfer [Text] / S.Abounit, C.Zurzolo // Journal of Cell Science .– 2012.
– Vol.125. – P.1089–1098.
9) Gurke, S. The art of cellular communication:tunneling nanotubes bridge the divide [Text] / S.Gurke, J.F.VBarroso, H.H. Gerdes // Histochemistry and Cell Biology. – 2008. – Vol.129. – P.539–550.
10) Rustom, A. Hen or Egg? Some Thoughts on Tunneling Nanotubes [Text] / A.Rustom // Natural Genetic Engineering and Natural Genome Editing. – 2009. – Vol.1178. – P.133.
11) Oparka, K.J. Simple, but not branched, plasmodesmata allow the nonspecific trafficking of proteins in developing tobacco leaves [Text] / K.J.Oparka, A.G. Roberts, P. Boevink // Cell. – 1999. – Vol.97. – P.743–754.
12) Rustom, A. Nanotubular high ways for intercellular organelle transport [Text] / A.Rustom, R. Saffrich, I. Markovic // Science. – 2004. – Vol.303. – P.1007–1010.
13) Koyanagi, M. Cell-to-cell connection of endothelial progenitor cells with cardiac myocytes by nanotubes: A novel mechanism for cell fate changes? [Text] / M.Koyanagi, R.P. Brandes, J. Haendeler // Circulation Research. – 2005. – Vol.96.– P.1039–1041.
14) Kasteel, D.T. The movement proteins of cowpea mosaic virus and cauliflower mosaic virus induce tubular structures in plant and insect cells [Text] / D.T. Kasteel // Journal of General Virology. – 1996. – Vol.77. – P.2857–2864.
15) Pouwels, J. Studies on the origin and structure of tubules made by the movement protein of cowpea mosaic virus [Text] / J.Pouwels, C.J.Tack, P.N.Span, A.J.Olthaar, C.G.Sweep, F.C.Huvers, J.A.Lutterman, A.R.Hermus // Journal of General Virology. – 2004. – Vol.85. – P.3787– 3796.
16) Oparka, K. .Imaging plasmodesmata [Text] / B.Karen, K.Oparka // Protoplasma. – 2010.– Vol.248. – P.9–25.
17) Van As, H. Intact plant MRI for the study of cell water relations, membrane permeability, cell-to-cell and long-distance water transport [Text] / / H. Van As // Journal of Experimental Botany/. 2007. Vol.58. P.743756.
18) H. Маклаков, А. И. Самодиффузия в растворах и расплавах полимеров [Текст] / А.И. Маклаков, В. Д. Скирда, Н. Ф. Фаткуллин; под ред. Ю. И. Соловьева. – Казань: Издательство Казанского Университета. – 1987. – 224 с.
19) Савинков, А.В. Методические указания к лабораторным работам по курсу ядерный магнитный резонанс: учебн. метод.пособие для студентов специализации физика полимеров Института физики [Текст] / А.В. Савинков, Б.И. Гизатуллин – Казань: КФУ, – 2013. – 60 с.
20) Callaghan, P.T. Spatial coherence phenomena arising from translational spin motion in gradient spinecho experiments [Text] / P.T. Callaghan, S.L. Codd, J.D. Seymour // Concepts in Magnetic Resonance. – Vol.11. – 1999. – P.181–202.
21) Regan, D.G. Mean residence time of molecules diffusing in a cell bounded by a semi-permeable membrane: Monte Carlo simulations and an expression relating membrane transition probability to permeability [Text] / D.G. Regan, P.W.Kuchel
// European Biophysical Journal – 2000. – Vol.29. – P.221–227.
22) Van As, H. Advances in Photosynthesis and Respiration: Biophysical Techniques in Photosynthesis: Magnetic Resonance Imaging of Plants: Water Balance and Water Transport in Relation to Photosynthetic Activity [Text] / H. Van As, C.W. Windt // Springer. – 2007. – Vol.26. – P. 55-75.
23) Sen, P.N. Time-dependent diffusion coefficient as a probe of geometry [Text] / P.N.Sen // Concepts in Magnetic Resonance. – 2004. – Vol.23. – P.1–21.
24) Sibgatullin, T.A. Quantitative permeability imaging of plant tissues [Text] / T.A.Sibgatullin, F.J.Vergeldt, E.Gerkema, Van As H. // European Biophysical Journal. – 2010. – Vol.39. – P. 699-710.
25) Valiullin, R.R. Time dependent self-diffusion coefficient of molecules in porous media [Text] / R.R. Valiullin, V.D. Skirda // Journal of Chemical Physics – 2001.
– Vol.114. – P. 452-458.
26) Belton, P.S. NMR and compartmentation in biological tissues [Text] / P.S.Belton, R.G.Ratcliffe // Progress in Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy – 1985. – Vol.17. – P.241–279.
27) Snaar, J.E.M. Probing water compartment and membrane permeability in plant cells by proton NMR relaxation measurements [Text] / J.E.M. Snaar, H.Van As // Biophysical Journal. – 1992. – Vol.63. – P.1654–1658
28) Van Dusschoten, D. Extracting diffusion constants from echo-time-dependent PFG NMR data using relaxation-time information [Text] / D. Van Dusschoten,
P.A. de Jager, H. Van As // Journal of Magnetic Resonance – 1995. – Vol.116. – P.22-28.
29) Weinmann, H.J. Characteristics of gadolinium-DTPA complex: a potential NMR contrast agent [Text] /H.J. Weinmann, R.C.Brasch, W.R.Press, G.E.Wesbey // American Journal of Roentgenology. – 1984. – Vol.142. – P.619–624
30) Morcos, S.K. Extracellular gadolinium contrast agents: Differences in stability [Text] / S. Morcos // European Journal of Radiology – 2008 – P.175–179
31) Morcos, S.K. Nephrogenic systemic fibrosis following the administration of extracellular gadolinium based contrast agents: is the stability of the contrast agent molecule an important factor in the pathogenesis of this condition? [Text] / S.K Morcos // The British Journal of Radiology – 2007. – Vol.80. – P.73–76.
32) Idee, J-M. Clinical and biological consequences of transmetallation induced by contrast agents for magnetic resonance imaging: a review [Text] / J-M. Idee, M. Port, I Raynal, C.Corot // Fundamental and Clinical Pharmacology – 2006. – Vol.20. – P.563–576.
33) Geenen, R.W.F. Non-tissue specific extra cellular MR contrast media [Text] /
R.W.F. Geenen, G.P. Krestin // Heidelberg: Springer Verlag – Vol.006. – P. 107 – 114.
34) Di Gregorio, E. On the Fate of MRI Gd-Based Contrast Agents in Cells. Evidence for Extensive Degradation of Linear Complexes upon Endosomal Internalization [Text] / E. Di Gregorio, E. Gianolio, R. Stefania, G. Barutello, G. Digilio, S. Aime
// Analytical chemistry – 2013. – Vol.85. – P.5627–5631.
35) Demidchik, V. Arabidopsis root K+ efflux conductance activated by hydroxyl radicals: single-channel properties, genetic basis and involvement in stress-induced cell death [Text] /V. Demidchik, T.A.Cuin, D. Svistunenko, S.J.Smith, A.J. Miller, S.Shabala, A.Sokolik, V.Yurin // Journal of Cell Science.–2010.–Vol.123.– P.1468-1479.