Введение 8
1. Обзор литературы 10
1.1 Актиновые филаменты в конусах роста 10
1.2 Микротрубочки в конусах роста 11
1.3 Межклеточные сигналы 12
1.3.1 Фосфорилирование 12
1.3.2 Ионы кальция и клеточные сигналы 13
1.3.3 Кальмодулин 16
1.4 NO-cGMP, контролирующий направление конуса роста при
помощи модуляуции цитозольного кальция 18
1.5 Переключатель CaMKII/CaN, контролирующий направление
кальций зависимого конуса роста 21
1.6 Роль белков Homer1 и EPAC 24
1.7 МАРК протеинкиназы 24
1.8 Фосфорилирование CRN2 с помощью CK2 24
1.9 Роль PDE в управлении конусом роста аксона 25
1.10 Влияние белка VASP и гельзолина 25
1.11 Взаимосвязь cAMP и cGMP в управлении конусом роста . . . 26
1.12 Различия между аденилатциклазами 28
1.13 Влияние электрического поля 29
1.13.1 Способы воздействия внеклеточного ЭП на нейрон . . 30
1.13.2 Роль нейротрофинов в направлении конуса роста при
воздействии электрическим полем 31
1.13.3 Роль ГТФаз в направлении конуса роста при
воздействии электрическим полем 34
1.13.4 Изменение концентрации Ca2+ каналов при
воздействии электрическим полем 36
1.13.5 Применение электрического поля в медицине 37
2. Математическая модель 40
2.1 Моделирование 40
2.2 Схематическое пояснение образования областей
деполяризации и гиперполяризации 41
2.3 Схема сигнальной системы, управляющей конусом роста
аксона 43
2.4 Описание динамики кальция в микровыростах конуса роста
аксона нервной клетки 46
2.5 Моделирование динамики кальция в отростке аксона
нервной клетки 47
2.5.1 Ток активного транспорта 47
2.5.2 Ток пассивного транспорта 48
2.5.3 Численное решение дифференциального уравнения . . 51
3. Анализ математической модели 54
Заключение 56
Список литературы 57
Конус роста аксона - утолщение неправильной формы, которое прокладывает путь через окружающую ткать и находится на конце развивающегося аксона нервной клетки. Он заполнен мелкими, иногда соединёнными друг с другом, мембранными пузырьками неправильной формы, также митохондриями, микротрубочками и нейрофиламентами. Непосредственно под складчатыми участками мембраны и в шипиках на конусе роста находится плотная масса перепутанных актиновых филаментов. Конус роста удлиняется и сокращается за счет широких пластинок, называемых ламеллиподиями, и тонких, остроконечных выпячиваний, называемых филоподиями. Филопо- дии достигают размеров в несколько десятков микрометров и могут удлиняться и сокращаться, как бы ощупывая субстрат во всех направлениях. Они адгезируют к определенному субстрату и тянут конус роста в этом направлении.
Актин играет ключевую роль в подвижности конуса роста. Как ламел- липодии, так и филоподии богаты филаментным актином и веществами, ингибирующими полимеризацию актина. Выпячивание и ретракция ламелли- подий и филоподий, а также движение вперед самого конуса роста управляется двумя процессами: (1) полимеризацией и разборкой актиновых филаментов и (2) зависимой от миозина транслокацией актиновых филаментов прочь от ведущего края конуса роста.
Оба процесса используют энергию гидролиза АТФ и могут управляться белками, связывающими актин. Кальций, протеинкиназы и другие внутриклеточные вторичные посредники управляют активностью связывающих актин белков.
Итак, рост аксона, его движение вдоль клеток определяется различными ростовыми и ингибирующими факторами, которые синтезируются клетками и встраиваются в их мембраны, но каким же образом регулируется направление роста аксонов? Актуальным является вопрос выявления этого механизма.
Цель данной работы: Провести модельные исследования сигнальной системы, управляющей конусом роста аксонов.
Для достижения цели были поставлены следующие задачи:
1. На основе данных, представленных в литературе, составить схему сигнальной системы, которая управляет конусом роста аксона.
2. Построить математическую модель системы, описывающей динамику кальция в микровыростах конуса роста аксона - филоподиях.
3. Используя построенную модель, провести анализ нашей сигнальной системы.
Направление развития конуса роста аксона определяется сигнальной системой, работа которой, несмотря на все проведенные исследования, до сих пор остается не до конца выясненной.
В целом считается, что физические и химические факторы во внеклеточной среде играют важную роль в определении направления роста нейритов. Одним из видов физических факторов, определяющих направление конуса роста аксонов, является наличие в ткани слабых внеклеточных электрических полей. Причем исследования показывают, что рост нейритов в экспериментах был направлен преимущественно к катоду внеклеточного электрического поля. Мы попытались объяснить результаты экспериментов на основе анализа внутриклеточных процессов.
Когда происходит развитие конуса роста аксонов, прежде всего, формируются филоподии (Ф) - тонкие выросты диаметром примерно 0.1 мкм и длиной до 10 мкм и более. Нами был проведен анализ динамики кальция в таком микровыросте конуса роста аксона нервной клетки при помощи математической модели и были сделаны выводы об автономности Ф относительно ламеллиподий и друг друга. Из свойства автономности следует, что изменение концентрации стационарного кальция при изменении трансмембранной разности потенциалов будет происходить независимо у каждой Ф. Изменение концентрации стационарного кальция у Ф, находящихся со стороны анода, никак не повлияет на изменение концентрации стационарного кальция у Ф со стороны катода. Следовательно, автономность в контексте кальциевой сигнализации позволяет рассматривать каждый микровырост отдельно от конуса роста аксона в целом.
Таким образом, мы предполагаем, что механизм управления конусом роста аксонов с помощью электрического поля обусловлен тем, что в Ф, направленных в сторону катода, происходит увеличение концентрации стационарного кальция, которое индуцирует активацию сигнальной системы, представленной в виде схемы в данной работе, приводящей к сборке, а со стороны анода при уменьшении концентрации кальция - к разборке цитоскелета.
1. Gallo, G. Regulation of Growth Cone Actin Filaments by Guidance Cues [Text] / G. Gallo, P. Letourneau, С. Paul // Journal of Neurobiology. — 2004. — Vol. 58, No. 1. — P. 92-102.
2. Gordon-Weeks, P. Microtubules and Growth Cone Function [Text] / P. Gordon-Weeks, R. Phillip // Journal of Neurobiology. — 2004. — Vol. 58, No. 1. — Р. 70-83.
3. Arena, S. Genetic analysis of the kinome and phosphatome in cancer [Text] / S. Arena, S. Benvenuti, A. Bardelli // Cellular and Molecular Life Sciences. — 2005. —Vol. 62, No. 18. — P. 2092-2099.
4. Berridge, M. Inositol trisphosphate and calcium signalling [Text] / M. Berridge // Nature. —1993. —Vol. 361, No. 6410. — P. 315-325.
5. Berridge, M. Calcium signalling remodelling and disease [Text] / M. Berridge // Biochemical Society Transactions. — 2012. —Vol. 40, No. 2. — P. 297-309.
6. Fernandes, I. Calcium-induced calmodulin conformational change. Electrochemical evaluation [Text] / I. Fernandes, A. Oliveira-Brett // Bioelectrochemistry. —2017. —Vol. 113. — P. 69-78.
7. Wagenen, S. Regulation of Neuronal Growth Cone Filopodia by Nitric Oxide [Text] / S. Wagenen, V. Rehder // Journal of Neurobiology. —1999.—Vol.39. —No.2.— P.168- 185.
8. Wagenen, S. Regulation of Neuronal Growth Cone Filopodia by Nitric Oxide Depends on Soluble Guanylyl Cyclase [Text] / S. Wagenen, V. Rehder //
Journal of Neurobiology. —2001. —Vol.46. —No.3.— P.206- 219.
9. Zhong, L. Nitric Oxide Regulates Neuronal Activity via Calcium Activated Potassium Channels Cyclase [Text] / L. Zhong, S. Estes, L. Artinian, V. Rehder // PLOS ONE. —2013. —Vol.8. —No.11.
10. Tojima, T. The Nitric Oxide-cGMP Pathway Controls the Directional Polarity of Growth Cone Guidance via Modulating Cytosolic Ca2+ Signals [Text]/ T. Tojima, R. Itofusa, H. Kamiguchi // Journal of Neuroscience. — 2009. — Vol. 29, No. 24. — P. 7886-7897.
11. Welshhans, K. Nitric oxide regulates growth cone filopodial dynamics via ryanodine receptor-mediated calcium release [Text] / K. Welshhans, V. Rehder // European Journal of Neuroscience. — 2007. — Vol. 26, No. 6. — P. 15371547.
12. Wen, Z. A CaMKII/calcineurin switch controls the direction of Ca 2+- dependent growth cone guidance [Text]/ Z. Wen, C. Guirland, G. Ming, J. Zheng // Neuron. — 2004. — Vol. 43, No. 6. — P. 835-846.
13. Sutherland, D. The interdependent roles of Ca2+ and cAMP in axon guidance [Text] / D. Sutherland, G. Goodhill // Developmental Biology. —2013. —Vol. 75. —No. 4.— P. 402-410.
14. Valeyev, N. Multiple calcium binding sites make calmodulin multifunctional [Text] / N. Valeyev, P. Heslop-Harrison, I. Postlethwaite, N. Kotov, D. Bates// Molecular BioSystems. —2008. —Vol. 4. —No. 1.— P. 1-100.
15. Masada, N. Distinct Mechanisms of Regulation by Ca2+/Calmodulin of Type 1 and 8 Adenylyl Cyclases Support Their Different Physiological Roles [Text] /
N. Masada, A. Ciruela, D. MacDougall, D. Cooper // THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. —2009. —Vol. 284. —No. 7.— P. 4451-4463.
16. Pi, H. CaMKII control of spine size and synaptic strength: Role of phosphorylation states and nonenzymatic action [Text] / H. Pi, N. Otmakhov, F. Gaamouch , D. Lemelin, P. Koninck, J. Lisman // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. —2010. —Vol. 107. — No. 32.— P. 14437-14442.
17. Gasperini, R. Homer regulates calcium signalling in growth cone turning [Text] / R. Gasperini, D. Choi-Lundberg, M. Thompson, C. Mitchell, L. Foa // Neural Development. —2009. —Vol. 4. —No. 29.— P. 1-18.
18. Forbes, E. Calcium and cAMP Levels Interact to Determine Attraction versus Repulsion in Axon Guidance [Text] / E. Forbes, A. Thompson, J. Yuan, and G. Goodhill // Neuron. —2012. —Vol. 74.— P. 490-503.
19. Kostenko, S. PKA-induced F-actin rearrangement requires phosphorylation of Hsp27 by the MAPKAP kinase MK5 [Text] / S. Kostenko, M. Johannessen, U. Moens // Cellular Signalling. — 2009. — Vol. 21, No. 5. — P. 712-718.
20. Xavier, C. Phosphorylation of CRN2 by CK2 regulates F-actin and Arp2/3 interaction and inhibits cell migration [Text] / C. Xavier, R. Rastetter, M. Blomacher, M. Stumpf, M. Himmel, R. Morgan, M. Fernandez, C. Wang, A. Osman, Y. Miyata, R. Gjerset, L. Eichinger, A. Hofmann, S. Linder, A. Noegel, C. Clemen // Scientific Reports. — 2012. — Vol. 2.
21. McQuown, S. Phosphodiesterase 1b (PDE1B) Regulates Spatial and Contextual Memory in Hippocampus [Text] / S. McQuown, S. Xia, K. Baumgartel, R. Barido, G. Anderson, B. Dyck, R. Scott, M. Peters // Frontiers in Molecular Neuroscience.—2019. —Vol. 12. —No. 21.
22. Яковлев, А.В. Учебное пособие. Аденилатциклазная и гуанилатциклазная системы внутриклеточных вторичных посредников. / Яковлев А.В., Яковлева О.В., Ситдикова Г.Ф. - Казань: Изд-во КГУ, 2009.
23. Benz, P. Differential VASP phosphorylation controls remodeling of the actin cytoskeleton [Text] / P. Benz, Peter M. Benz, С. Blume, S. Seifert, S. Wilhelm,
J. Waschke, K. Schuh, F. Gertler, T. Munzel, T. Renne // Journal of Cell Science. —2009. —Vol. 122. — P. 3954-3965.
24. Yin, H. Ca2+ Control of Actin Filament Lengt [Text] / H. Yin, J. Hartwig, K. MaruyamaS, T. Stossel // THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. —1981. —Vol. 256. —No. 18.— P. 9693-9697.
25. Averaimo, S. Intermingled cAMP, cGMP and calcium spatiotemporal dynamics in developing neuronal circuits [Text] / S. Averaimo, X. Nicol // Frontiers in Cellular Neuroscience. —2012. —Vol. 8. — P. 376.
26. Nicol, X. Routes to cAMP: Shaping neuronal connectivity with distinct adenylate cyclases [Text] / X. Nicol, P. Gaspar // European Journal of Neuroscience. —2014. —Vol. 39, No. 11, . — P. 1742-1751.
27. Wang, H. The role of Ca2+-stimulated adenylyl cyclases in bidirectional synaptic plasticity and brain function [Text] / H. Wang, M. Zhang // Reviews in the neurosciences. —2012. —Vol. 23, No. 1. — P. 67-78.
28. Azavedo, E. Radiological evidence of response to electrochemical treatment of breast cancer [Text] / E. Azavedo, G. Svane, B. Nordenstrom // Clinical Radiology. —1991. —Vol. 43. —No. 2.— P. 84-87.
29. Gentzkow, G. Electrical Stimulation to Heal Dermal Wounds [Text] / G. Gentzkow // The Journal of Dermatologic Surgery and Oncology. —1993. — Vol. 19. —No. 8.— P. 753-758.
30. Astrom, M. Relationship between Neural Activation and Electric Field Distribution during Deep Brain Stimulation [Text] / M. Astrom, E. Diczfalusy, H. Martens, K. Wardell // IEEE Transactions on Biomedical Engineering. —
2015. —Vol. 62, No. 2. — P. 664-672.
31. Patel, N. Orientation of neurite growth by extracellular electric fields [Text] /
N. Patel, M. Poo // The Journal of neuroscience. —1982. —Vol. 2, No. 4. — P. 483-496.
32. Maisonpierre, P. Human and rat brain-derived neurotrophic factor and neurotrophin-3: Gene structures, distributions, and chromosomal localizations [Text] / P. Maisonpierre, M. Le Beau, R. Espinosa, N. Ip, L. Belluscio, S. de la Monte, S. Squinto, M. Furth, G. Yancopoulos // Genomics. —1991. —Vol. 10. —No.3.— P. 558-568.
33. Erskine, L. Growth cone neurotransmitter receptor activation modulates electric field-guided nerve growth [Text] / L. Erskine, C. McCaig // Developmental Biology. —1995. —Vol. 171. —No. 2.— P. 330-339.
34. McCaig, C. Rajnicek A.M., Song B. Has electrical growth cone guidance found its potential? [Text]/ C. McCaig, A. Rajnicek B. Song // TRENDS in Neurosciences. —2002. —Vol. 25, No. 7.
35. McCaig, C. Neurotrophins enhance electric field-directed growth cone guidance and directed nerve branching [Text] / C. McCaig, L. Sangster, R. Stewart // Developmental Dynamics. —2000. —Vol. 217. —No. 3.— P. 299308.
36. McCaig, C. Nerve growth and nerve guidance in a physiological electric field. In Nerve Growth and Nerve Guidance [Text] / C. McCaig, L. Erskine // Portland Press. —1996. — P. 151-170.
37. Erskine, L. Growth Cone Neurotransmitter Receptor Activation Modulates Electric Field-Guided Nerve Growth [Text] / L. Erskine, C. McCaig // Developmental Biology. —1995. —Vol. 171. —No. 2.— P. 330-339.
38. Stewart, R. Calcium-Channel Subtypes and Intracellular Calcium Stores Modulate Electric Field-Stimulated and Field-Oriented Nerve Growth [Text] / R. Stewart, C. McCaig, L. Erskine // Developmental Biology. —1995. —Vol. 171. —No. 2.— P. 340-351.
39. Rajnicek, A. The Direction of Neurite Growth in a Weak DC Electric Field Depends on the Substratum: Contributions of Adhesivity and Net Surface Charge [Text] / A. Rajnicek, K. Robinson, C. McCaig // DEVELOPMENTAL BIOLOGY. —1998. —Vol.203.— P.412- 423.
40. Gasperini, R. How does Calcium interact with the Cytoskeleton to Regulate Growth Cone Motility during Axon Pathfinding? [Text] / R. Gasperini, M. Pavez, A. Thompson, C. Mitchell, H. Hardy, K. Young, G. Chilton, L. Foa // Molecular and Cellular Neuroscience. —2017. —Vol.84.— P.29-35.
41. Rajnicek, A. Temporally and spatially coordinated roles for Rho, Rac, Cdc42 and their effectors in growth cone guidance by a physiological electric field [Text] / A. Rajnicek, L. Foubister and C. McCaig // Journal of Cell Science. — 2006. — Vol. 119, No. 9.— P. 1723-1735.
42. Cougoule, С. Dissociation of Recruitment and Activation of the Small G- protein Rac during FcY Receptor-mediated Phagocytosis [Text] / С. Cougoule, А. Dart, J. Lim, E. Caron // THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. —2006. —Vol.281. —No.13.— P. 8756-8764.
43. Hall, A. Ras-Related GTPases and the Cytoskeleton [Text] / A. Hall // Molecular Biology of the Cell. —1992. —Vol.3.— P. 475-479.
44. McCaig, C. On the Mechanism of Nerve Galvanotropism [Text]/ C.
McCaig // Journal of Neuroscience. —1989. —Vol.93.— P. 723-730.