Тип работы:
Предмет:
Язык работы:


СИГНАЛЬНАЯ СИСТЕМА, УПРАВЛЯЮЩАЯ КОНУСОМ РОСТА АКСОНОВ ПРИ ВОЗДЕЙСТВИИ ЭЛЕКТРИЧЕСКИМ ПОЛЕМ

Работа №37344

Тип работы

Дипломные работы, ВКР

Предмет

физика

Объем работы64
Год сдачи2019
Стоимость4900 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
181
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


Введение 8
1. Обзор литературы 10
1.1 Актиновые филаменты в конусах роста 10
1.2 Микротрубочки в конусах роста 11
1.3 Межклеточные сигналы 12
1.3.1 Фосфорилирование 12
1.3.2 Ионы кальция и клеточные сигналы 13
1.3.3 Кальмодулин 16
1.4 NO-cGMP, контролирующий направление конуса роста при
помощи модуляуции цитозольного кальция 18
1.5 Переключатель CaMKII/CaN, контролирующий направление
кальций зависимого конуса роста 21
1.6 Роль белков Homer1 и EPAC 24
1.7 МАРК протеинкиназы 24
1.8 Фосфорилирование CRN2 с помощью CK2 24
1.9 Роль PDE в управлении конусом роста аксона 25
1.10 Влияние белка VASP и гельзолина 25
1.11 Взаимосвязь cAMP и cGMP в управлении конусом роста . . . 26
1.12 Различия между аденилатциклазами 28
1.13 Влияние электрического поля 29
1.13.1 Способы воздействия внеклеточного ЭП на нейрон . . 30
1.13.2 Роль нейротрофинов в направлении конуса роста при
воздействии электрическим полем 31
1.13.3 Роль ГТФаз в направлении конуса роста при
воздействии электрическим полем 34
1.13.4 Изменение концентрации Ca2+ каналов при
воздействии электрическим полем 36
1.13.5 Применение электрического поля в медицине 37
2. Математическая модель 40
2.1 Моделирование 40
2.2 Схематическое пояснение образования областей
деполяризации и гиперполяризации 41
2.3 Схема сигнальной системы, управляющей конусом роста
аксона 43
2.4 Описание динамики кальция в микровыростах конуса роста
аксона нервной клетки 46
2.5 Моделирование динамики кальция в отростке аксона
нервной клетки 47
2.5.1 Ток активного транспорта 47
2.5.2 Ток пассивного транспорта 48
2.5.3 Численное решение дифференциального уравнения . . 51
3. Анализ математической модели 54
Заключение 56
Список литературы 57


Конус роста аксона - утолщение неправильной формы, которое прокладывает путь через окружающую ткать и находится на конце развивающегося аксона нервной клетки. Он заполнен мелкими, иногда соединёнными друг с другом, мембранными пузырьками неправильной формы, также митохондриями, микротрубочками и нейрофиламентами. Непосредственно под складчатыми участками мембраны и в шипиках на конусе роста находится плотная масса перепутанных актиновых филаментов. Конус роста удлиняется и сокращается за счет широких пластинок, называемых ламеллиподиями, и тонких, остроконечных выпячиваний, называемых филоподиями. Филопо- дии достигают размеров в несколько десятков микрометров и могут удлиняться и сокращаться, как бы ощупывая субстрат во всех направлениях. Они адгезируют к определенному субстрату и тянут конус роста в этом направлении.
Актин играет ключевую роль в подвижности конуса роста. Как ламел- липодии, так и филоподии богаты филаментным актином и веществами, ингибирующими полимеризацию актина. Выпячивание и ретракция ламелли- подий и филоподий, а также движение вперед самого конуса роста управляется двумя процессами: (1) полимеризацией и разборкой актиновых филаментов и (2) зависимой от миозина транслокацией актиновых филаментов прочь от ведущего края конуса роста.
Оба процесса используют энергию гидролиза АТФ и могут управляться белками, связывающими актин. Кальций, протеинкиназы и другие внутриклеточные вторичные посредники управляют активностью связывающих актин белков.
Итак, рост аксона, его движение вдоль клеток определяется различными ростовыми и ингибирующими факторами, которые синтезируются клетками и встраиваются в их мембраны, но каким же образом регулируется направление роста аксонов? Актуальным является вопрос выявления этого механизма.
Цель данной работы: Провести модельные исследования сигнальной системы, управляющей конусом роста аксонов.
Для достижения цели были поставлены следующие задачи:
1. На основе данных, представленных в литературе, составить схему сигнальной системы, которая управляет конусом роста аксона.
2. Построить математическую модель системы, описывающей динамику кальция в микровыростах конуса роста аксона - филоподиях.
3. Используя построенную модель, провести анализ нашей сигнальной системы.


Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!


Направление развития конуса роста аксона определяется сигнальной системой, работа которой, несмотря на все проведенные исследования, до сих пор остается не до конца выясненной.
В целом считается, что физические и химические факторы во внеклеточной среде играют важную роль в определении направления роста нейритов. Одним из видов физических факторов, определяющих направление конуса роста аксонов, является наличие в ткани слабых внеклеточных электрических полей. Причем исследования показывают, что рост нейритов в экспериментах был направлен преимущественно к катоду внеклеточного электрического поля. Мы попытались объяснить результаты экспериментов на основе анализа внутриклеточных процессов.
Когда происходит развитие конуса роста аксонов, прежде всего, формируются филоподии (Ф) - тонкие выросты диаметром примерно 0.1 мкм и длиной до 10 мкм и более. Нами был проведен анализ динамики кальция в таком микровыросте конуса роста аксона нервной клетки при помощи математической модели и были сделаны выводы об автономности Ф относительно ламеллиподий и друг друга. Из свойства автономности следует, что изменение концентрации стационарного кальция при изменении трансмембранной разности потенциалов будет происходить независимо у каждой Ф. Изменение концентрации стационарного кальция у Ф, находящихся со стороны анода, никак не повлияет на изменение концентрации стационарного кальция у Ф со стороны катода. Следовательно, автономность в контексте кальциевой сигнализации позволяет рассматривать каждый микровырост отдельно от конуса роста аксона в целом.
Таким образом, мы предполагаем, что механизм управления конусом роста аксонов с помощью электрического поля обусловлен тем, что в Ф, направленных в сторону катода, происходит увеличение концентрации стационарного кальция, которое индуцирует активацию сигнальной системы, представленной в виде схемы в данной работе, приводящей к сборке, а со стороны анода при уменьшении концентрации кальция - к разборке цитоскелета.


1. Gallo, G. Regulation of Growth Cone Actin Filaments by Guidance Cues [Text] / G. Gallo, P. Letourneau, С. Paul // Journal of Neurobiology. — 2004. — Vol. 58, No. 1. — P. 92-102.
2. Gordon-Weeks, P. Microtubules and Growth Cone Function [Text] / P. Gordon-Weeks, R. Phillip // Journal of Neurobiology. — 2004. — Vol. 58, No. 1. — Р. 70-83.
3. Arena, S. Genetic analysis of the kinome and phosphatome in cancer [Text] / S. Arena, S. Benvenuti, A. Bardelli // Cellular and Molecular Life Sciences. — 2005. —Vol. 62, No. 18. — P. 2092-2099.
4. Berridge, M. Inositol trisphosphate and calcium signalling [Text] / M. Berridge // Nature. —1993. —Vol. 361, No. 6410. — P. 315-325.
5. Berridge, M. Calcium signalling remodelling and disease [Text] / M. Berridge // Biochemical Society Transactions. — 2012. —Vol. 40, No. 2. — P. 297-309.
6. Fernandes, I. Calcium-induced calmodulin conformational change. Electrochemical evaluation [Text] / I. Fernandes, A. Oliveira-Brett // Bioelectrochemistry. —2017. —Vol. 113. — P. 69-78.
7. Wagenen, S. Regulation of Neuronal Growth Cone Filopodia by Nitric Oxide [Text] / S. Wagenen, V. Rehder // Journal of Neurobiology. —1999.—Vol.39. —No.2.— P.168- 185.
8. Wagenen, S. Regulation of Neuronal Growth Cone Filopodia by Nitric Oxide Depends on Soluble Guanylyl Cyclase [Text] / S. Wagenen, V. Rehder //
Journal of Neurobiology. —2001. —Vol.46. —No.3.— P.206- 219.
9. Zhong, L. Nitric Oxide Regulates Neuronal Activity via Calcium Activated Potassium Channels Cyclase [Text] / L. Zhong, S. Estes, L. Artinian, V. Rehder // PLOS ONE. —2013. —Vol.8. —No.11.
10. Tojima, T. The Nitric Oxide-cGMP Pathway Controls the Directional Polarity of Growth Cone Guidance via Modulating Cytosolic Ca2+ Signals [Text]/ T. Tojima, R. Itofusa, H. Kamiguchi // Journal of Neuroscience. — 2009. — Vol. 29, No. 24. — P. 7886-7897.
11. Welshhans, K. Nitric oxide regulates growth cone filopodial dynamics via ryanodine receptor-mediated calcium release [Text] / K. Welshhans, V. Rehder // European Journal of Neuroscience. — 2007. — Vol. 26, No. 6. — P. 15371547.
12. Wen, Z. A CaMKII/calcineurin switch controls the direction of Ca 2+- dependent growth cone guidance [Text]/ Z. Wen, C. Guirland, G. Ming, J. Zheng // Neuron. — 2004. — Vol. 43, No. 6. — P. 835-846.
13. Sutherland, D. The interdependent roles of Ca2+ and cAMP in axon guidance [Text] / D. Sutherland, G. Goodhill // Developmental Biology. —2013. —Vol. 75. —No. 4.— P. 402-410.
14. Valeyev, N. Multiple calcium binding sites make calmodulin multifunctional [Text] / N. Valeyev, P. Heslop-Harrison, I. Postlethwaite, N. Kotov, D. Bates// Molecular BioSystems. —2008. —Vol. 4. —No. 1.— P. 1-100.
15. Masada, N. Distinct Mechanisms of Regulation by Ca2+/Calmodulin of Type 1 and 8 Adenylyl Cyclases Support Their Different Physiological Roles [Text] /
N. Masada, A. Ciruela, D. MacDougall, D. Cooper // THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. —2009. —Vol. 284. —No. 7.— P. 4451-4463.
16. Pi, H. CaMKII control of spine size and synaptic strength: Role of phosphorylation states and nonenzymatic action [Text] / H. Pi, N. Otmakhov, F. Gaamouch , D. Lemelin, P. Koninck, J. Lisman // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. —2010. —Vol. 107. — No. 32.— P. 14437-14442.
17. Gasperini, R. Homer regulates calcium signalling in growth cone turning [Text] / R. Gasperini, D. Choi-Lundberg, M. Thompson, C. Mitchell, L. Foa // Neural Development. —2009. —Vol. 4. —No. 29.— P. 1-18.
18. Forbes, E. Calcium and cAMP Levels Interact to Determine Attraction versus Repulsion in Axon Guidance [Text] / E. Forbes, A. Thompson, J. Yuan, and G. Goodhill // Neuron. —2012. —Vol. 74.— P. 490-503.
19. Kostenko, S. PKA-induced F-actin rearrangement requires phosphorylation of Hsp27 by the MAPKAP kinase MK5 [Text] / S. Kostenko, M. Johannessen, U. Moens // Cellular Signalling. — 2009. — Vol. 21, No. 5. — P. 712-718.
20. Xavier, C. Phosphorylation of CRN2 by CK2 regulates F-actin and Arp2/3 interaction and inhibits cell migration [Text] / C. Xavier, R. Rastetter, M. Blomacher, M. Stumpf, M. Himmel, R. Morgan, M. Fernandez, C. Wang, A. Osman, Y. Miyata, R. Gjerset, L. Eichinger, A. Hofmann, S. Linder, A. Noegel, C. Clemen // Scientific Reports. — 2012. — Vol. 2.
21. McQuown, S. Phosphodiesterase 1b (PDE1B) Regulates Spatial and Contextual Memory in Hippocampus [Text] / S. McQuown, S. Xia, K. Baumgartel, R. Barido, G. Anderson, B. Dyck, R. Scott, M. Peters // Frontiers in Molecular Neuroscience.—2019. —Vol. 12. —No. 21.
22. Яковлев, А.В. Учебное пособие. Аденилатциклазная и гуанилатциклазная системы внутриклеточных вторичных посредников. / Яковлев А.В., Яковлева О.В., Ситдикова Г.Ф. - Казань: Изд-во КГУ, 2009.
23. Benz, P. Differential VASP phosphorylation controls remodeling of the actin cytoskeleton [Text] / P. Benz, Peter M. Benz, С. Blume, S. Seifert, S. Wilhelm,
J. Waschke, K. Schuh, F. Gertler, T. Munzel, T. Renne // Journal of Cell Science. —2009. —Vol. 122. — P. 3954-3965.
24. Yin, H. Ca2+ Control of Actin Filament Lengt [Text] / H. Yin, J. Hartwig, K. MaruyamaS, T. Stossel // THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. —1981. —Vol. 256. —No. 18.— P. 9693-9697.
25. Averaimo, S. Intermingled cAMP, cGMP and calcium spatiotemporal dynamics in developing neuronal circuits [Text] / S. Averaimo, X. Nicol // Frontiers in Cellular Neuroscience. —2012. —Vol. 8. — P. 376.
26. Nicol, X. Routes to cAMP: Shaping neuronal connectivity with distinct adenylate cyclases [Text] / X. Nicol, P. Gaspar // European Journal of Neuroscience. —2014. —Vol. 39, No. 11, . — P. 1742-1751.
27. Wang, H. The role of Ca2+-stimulated adenylyl cyclases in bidirectional synaptic plasticity and brain function [Text] / H. Wang, M. Zhang // Reviews in the neurosciences. —2012. —Vol. 23, No. 1. — P. 67-78.
28. Azavedo, E. Radiological evidence of response to electrochemical treatment of breast cancer [Text] / E. Azavedo, G. Svane, B. Nordenstrom // Clinical Radiology. —1991. —Vol. 43. —No. 2.— P. 84-87.
29. Gentzkow, G. Electrical Stimulation to Heal Dermal Wounds [Text] / G. Gentzkow // The Journal of Dermatologic Surgery and Oncology. —1993. — Vol. 19. —No. 8.— P. 753-758.
30. Astrom, M. Relationship between Neural Activation and Electric Field Distribution during Deep Brain Stimulation [Text] / M. Astrom, E. Diczfalusy, H. Martens, K. Wardell // IEEE Transactions on Biomedical Engineering. —
2015. —Vol. 62, No. 2. — P. 664-672.
31. Patel, N. Orientation of neurite growth by extracellular electric fields [Text] /
N. Patel, M. Poo // The Journal of neuroscience. —1982. —Vol. 2, No. 4. — P. 483-496.
32. Maisonpierre, P. Human and rat brain-derived neurotrophic factor and neurotrophin-3: Gene structures, distributions, and chromosomal localizations [Text] / P. Maisonpierre, M. Le Beau, R. Espinosa, N. Ip, L. Belluscio, S. de la Monte, S. Squinto, M. Furth, G. Yancopoulos // Genomics. —1991. —Vol. 10. —No.3.— P. 558-568.
33. Erskine, L. Growth cone neurotransmitter receptor activation modulates electric field-guided nerve growth [Text] / L. Erskine, C. McCaig // Developmental Biology. —1995. —Vol. 171. —No. 2.— P. 330-339.
34. McCaig, C. Rajnicek A.M., Song B. Has electrical growth cone guidance found its potential? [Text]/ C. McCaig, A. Rajnicek B. Song // TRENDS in Neurosciences. —2002. —Vol. 25, No. 7.
35. McCaig, C. Neurotrophins enhance electric field-directed growth cone guidance and directed nerve branching [Text] / C. McCaig, L. Sangster, R. Stewart // Developmental Dynamics. —2000. —Vol. 217. —No. 3.— P. 299308.
36. McCaig, C. Nerve growth and nerve guidance in a physiological electric field. In Nerve Growth and Nerve Guidance [Text] / C. McCaig, L. Erskine // Portland Press. —1996. — P. 151-170.
37. Erskine, L. Growth Cone Neurotransmitter Receptor Activation Modulates Electric Field-Guided Nerve Growth [Text] / L. Erskine, C. McCaig // Developmental Biology. —1995. —Vol. 171. —No. 2.— P. 330-339.
38. Stewart, R. Calcium-Channel Subtypes and Intracellular Calcium Stores Modulate Electric Field-Stimulated and Field-Oriented Nerve Growth [Text] / R. Stewart, C. McCaig, L. Erskine // Developmental Biology. —1995. —Vol. 171. —No. 2.— P. 340-351.
39. Rajnicek, A. The Direction of Neurite Growth in a Weak DC Electric Field Depends on the Substratum: Contributions of Adhesivity and Net Surface Charge [Text] / A. Rajnicek, K. Robinson, C. McCaig // DEVELOPMENTAL BIOLOGY. —1998. —Vol.203.— P.412- 423.
40. Gasperini, R. How does Calcium interact with the Cytoskeleton to Regulate Growth Cone Motility during Axon Pathfinding? [Text] / R. Gasperini, M. Pavez, A. Thompson, C. Mitchell, H. Hardy, K. Young, G. Chilton, L. Foa // Molecular and Cellular Neuroscience. —2017. —Vol.84.— P.29-35.
41. Rajnicek, A. Temporally and spatially coordinated roles for Rho, Rac, Cdc42 and their effectors in growth cone guidance by a physiological electric field [Text] / A. Rajnicek, L. Foubister and C. McCaig // Journal of Cell Science. — 2006. — Vol. 119, No. 9.— P. 1723-1735.
42. Cougoule, С. Dissociation of Recruitment and Activation of the Small G- protein Rac during FcY Receptor-mediated Phagocytosis [Text] / С. Cougoule, А. Dart, J. Lim, E. Caron // THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. —2006. —Vol.281. —No.13.— P. 8756-8764.
43. Hall, A. Ras-Related GTPases and the Cytoskeleton [Text] / A. Hall // Molecular Biology of the Cell. —1992. —Vol.3.— P. 475-479.
44. McCaig, C. On the Mechanism of Nerve Galvanotropism [Text]/ C.
McCaig // Journal of Neuroscience. —1989. —Vol.93.— P. 723-730.


Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.



Подобные работы


©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ