Введение 4
1 Обзор литературы 5
1.1 Полигидроксиалканоаты: структура и свойства 5
1.2 Получение биополимера 7
1.3 Выделение продуктов биотехнологического синтеза 10
1.4 Молекулярно - массовые характеристики полимера 16
1.5 Оптимизация первого этапа процесса экстракции: кинетика и
моделирование 17
2 Методы исследования 19
2.1 Исследуемые микроорганизмы 19
2.2 Условия роста бактерий Cupriavidus eutrophus В10646 19
2.3 Определение сухой биомассы клеток 22
2.4 Выбор факторов для плана оптимизации 22
2.5 Методика проведения математической обработки процессов
экстракции ПГА 23
2.6 Методы выделения продуктов биотехнологического синтеза. 28
2.7 Метод спиртовой экстракции 28
2.8 Исследование содержания и состава ПГА 30
2.9 Определение молекулярной массы ПГА 30
Выводы 56
Список литературы 58
Полигидроксиалканоаты (ПГА) представляют собой перспективные сложные полиэфиры, полученные бактериями путем аэробной ферментации с использованием разных источников углерода. Эти биополимеры полностью биодеградируются в аэробных и анаэробных условиях, а также обладают эластомерными и термопластичными свойствами. Однако, несмотря на усилия, поставленные к разработке рентабельных ферментативных систем, стоимость производства ПГА по-прежнему остается существенно высокой, препятствуя использованию этих биополимеров в качестве товара [1].
Из ПГА возможно получение гибких пленок различной толщины, в том числе полупроницаемых мембран, нитей, нетканых материалов, различных полых форм (бутыли, контейнеры, коробки и пр.), а также гелей и клеев. Совокупность свойств, характерных для ПГА, делает их перспективными для применения в различных сферах - медицине, фармакологии, пищевой и косметической промышленности, сельском и коммунальном хозяйстве, радио-электронике и других сферах. Масштабы применения ПГА в настоящее время сдерживаются достаточно высокой стоимостью. Расходы на извлечение ПГА из общей стоимости производственного процесса может составлять более чем 50 % стоимости конечного продукта [2, 3]. Существуют различные методы извлечения ПГА. Эти методы включают использование растворите¬лей, химическое вываривание, ферментативное вываривание, механическая экстракция с гомогенизацией с высоким давлением и ультразвуком, используют комбинацию этих методов. При крупномасштабном производстве, сбор и очистка биополимера от остатков биомассы представляют собой решающую стадию, определяющую практическую применимость технологии. Однако возрастающие требования к охране окружающей среды, с одной стороны, и имеющиеся перспективы снижения стоимости биополимеров за счет повышения эффективности производства, с другой, делают ПГА одним из перспективных материалов.
В связи с высокой значимостью процесса экстракции в общей технологической схеме получения ПГА проводились исследования, целью которых является повышение эффективности экстракции за счет определения влияния факторов на процесс извлечения продуктов биотехнологического синтеза.
Проведен биосинтез бактерий Cupriavidus eutrophus B10646, в ходе которого получен образец биомассы с концентрацией клеток в культуре около 64 г/л. Содержание ПГА, накопленного в ходе биосинтеза составило около 70 % от а.с.м.
Исследовано влияние параметров обработки биомассы С. eutrophusВ- 10646 этанолом на выход и физико-химические свойства ПГА.
Предложены математические модели, описывающие влияние параметров процесса этапа спиртовой экстракции на выход ПГА, экстрактивных веществ, молекулярную массу и чистоту биополимера. Получены модели, показывающие возможное управление этим процессом.
С помощью программ статистической установлены зависимости, дающие представление о количественном влиянии каждого фактора на выход экстрактивных веществ, величину молекулярной массы и чистоту полимера в процессе экстракции:
- установлено, что на выход экстрактивных веществ наибольшее влияние оказывает температура экспозиции;
- для получения максимальных значений величины молекулярной массы необходимо длительное время экстракции и минимальное соотношение растворителя к биомассе, два других параметра являются незначимыми;
- модель, описывающая зависимость для чистоты ПГА показывает, что получение биополимера с высокой чистотой необходима комбинация двух факторов, оказывающих наибольшее влияние: времени экстракции и концентрации этанола.
Получены оптимальные значения технологических параметров проведения процесса экстракции биополимера в клетке: температура процесса экстракции Х1 = 60 С; продолжительность процесса экстракции Х2 = 30 мин; концентрация растворителя Х3 = 96 %; соотношение растворитель:биомасса Х4 = 4:1.
1. Николаева Д. А. Биосинтез поли-3-гидроксибутирата разной молекулярной массы культурой Azotobacter chroococcumи его биодеградации [Электронный ресурс] : автореф. дис. ... канд. биол. наук : 03.00.04 / Николаева Дария Александровна. - Москва, 2004 - 27 с. - Режим доступа: http://www.biopolymers.ru/publications/ref_2004_01 .pdf.
2. Киселев Е.Г. Сравнительное исследование методов экстракции ПГА из биомассы бактерий / Е.Г. Киселев, А.В. Демиденко // Журнал Сибирского федерального университета. Биология.- Т. 7, № 2. - 2014.- С. 148-160.
3. Volova T. G. Cell growth and accumulation of polyhydroxyalkanoates from CO2 and H2 of a hydrogen-oxidizing bacterium, Cupriaviduseutrophus B- 10646 / T. G. Volova, E. G. Kiselev, E. I. Shishatskaya, Natalia O. Zhila, A. N. Boyandin, Daria A. Syrvacheva, O. N. Vinogradova, G. S. Kalacheva, A. D. Vasiliev, I. V. Peterson // Bioresource Technology 146 - 2013.-Р. 215-222.
4. Salmiati Recovery of Polyhydroxyalkanoates (PHAs) from Mixed Micro¬
bial Cultures by Simple Digestion and Saponification [Электронный ресурс] / Salmiati, Z. Ujang, M.R. Salim, G. Olsson // Proceedings of the 3rd International Water Association(IWA)-ASPIR, 2009. Режим доступа:
https://www.researchgate.net/publication/237489392
5. Lemoigne M. Produits de deshydrationet de polymerisation de l'acidee- oxybutyric // Bull. Soc. Chim. Biol. -№ 8 - 1926. - Р. 770-782.
6. Kunasundari B. Isolation and recovery of microbial polyhydroxyalkanoates / B. Kunasundari, K. Sudesh // eXPRESS Polymer Letters. - 2011. - Vol.5. - №7. - P.620-634.
7. Nuti M.P. Influence of phenylacetic acid on poly-e-hydroxybutyrate (PHB) polymerization and cell elongation in Azotobacter chroococcum Beij / M.P. Nuti, M. Bertoldi, A.A. Lepidi // Can. J. Microbiol.- Vol. 18. - 1972. - P. 1257¬1261.
8. Scott G. Degradable Polymers: Principles and applications [Элек-тронный ресурс] / G. Scott, D. Gilead - 1995. - Р. 271. Режим доступа: https://librarycatalog.bilkent.edu.tr/client/tr_TR/default/search/detailnonmodal?qu=Polymers.&d=ent%3A%2F%2FSD_ILS%2F0%2FSD_ILS%3A1311175~ILS~0&ps=300
9. Bugnicourt E. Polyhydroxyalkanoate (PHA): Review of synthesis, char-acteristics, processing and potential applications in packaging. / E. Bugnicourt, P. Cinelli, A. Lazzeri, V. Alvarez // Polymer Letters - Vol.8, № 11- 2014.-Р. 791¬808.
10 Potter M. Regulation of phasin expression and polyhydroxyalkanoate (PHA) granule formation in Ralstonia eutropha H16 / M. Potter, M.H. Madkour,
F. Mayer et al. // Microbiol. Sgm. - 2002. -Vol. 148. - P. 2413-2426.
11Ballard D.G.H. Formation of polymers of Д-hydroxybutyric acid in bacte-rial cells and a comparison of the morphology of growth with the formation of pol-yethylene in the solid state / D.G.H. Ballard, P.A. Holmes, P.J.Senior. [n: Recent advances in mechanistic and synthetic aspects of polymerization / M. Fontanille,
A. Guyot, editors. - Bandol: NATO Asi Science Series C, 1987. - P. 293-314.
12 Rehm B.H.A. Polyhydroxyalkanoate (PHA) synthases: key enzymes of PHA biosynthesis / B.H.A. Rehm, A. Steinbuchel // In: Biopolymers online / A. Steinbuchel, Y. Doi, editors. - Weinheim: Wiley-VCH, 2005. - P. 173-215.
13 Chen et al. Production of fatty acids in Ralstonia eutropha H16 by engi-neering в-oxidation and carbon storage. [Электронный ресурс]/ Chen JS, Colon
B, Dusel B, Ziesack M, Way JC, Torella JP // PeerJ 3:e1468, 2015. Режим досту¬па : DOI 10.7717/peerj.1468
14 Kessler, B. Synthesis, recovery and possible application of medium-chainlength polyhydroxyalkanoates: a short overview / B. Kessler, B. Witholt // Macromol. Symp. - 1998. - Vol. 130. - P. 245-260.
15 Tanaka K. Production of poly(D-3-hydroxybutyrate) from CO2, H2, and O2 by high cell density autotrophic cultivation of Alcaligenes eutrophus[Элек-тронный ресурс] /K.Tanaka, A. Ishizaki, T. Kanamaru, T. Kawano // Режим доступа :https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/bit.260450312
16 Gumel, M. Biosynthesis and characterization of polyhydroxyalkanoates copolymers produced by Pseudomonas putida Bet001 isolated from palm oil mill effluent / M. Gumel, M.S.M. Annuar, Th. Heidelberg // PloS One. - 2012. - Vol. 7. - P. 1-8.
17 Thakor, N.S. Production of poly (в-hydroxybutyrate) by Comamonas testosteroni during growth on naphthalene / N.S. Thakor, M.A. Patel, U.B. Trivedi et al. // World J. Microbiol. Biotechnol. - 2003. - Vol. 19. - P. 185-189.
18 Budde, C.F. Production of poly(3-hydroxybutyrate-co-3- hydroxyhexanoate) from plant oil by engineered Ralstonia eutropha stranes /
C. F.Budde, S.L. Riedel, L.B. Willis et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2011. - Vol. 77. - P. 2847-2854.
19 Lee, S.H. Production of poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyhexanoate) by high-celldensity cultivation of Aeromonas hydrophila / S.H. Lee, D.H. Oh,
W.S. Ahn et al. // Biotechnol. Bioeng. - 2000. - Vol. 67. - P. 240-244.
20 Asrar, J. Biosynthesis and properties of poly(3-hydroxybutyrate-co-3- hydroxyhexanoate) polymers / J. Asrar, H.E. Valentin, P.A. Berger et al. // Biomacromol. - 2002. -Vol. 3. - P. 1006-1012.
21 Brandl, H. Pseudomonas oleovorans as a source of poly(betahydroxyalkanoates) for potential applications as biodegradable polyesters / H. Brandl, R.A. Gross, R.W. Lenz et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 1988. - Vol. 54. - P. 1977-1982.
22 Vandamme, P., Coenye, T., 2004. Taxonomy of the genus Cupriavidus: a tale of lost and found. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 54, 2285-2289
23 Kunasundari B. Isolation and recovery of microbial polyhydroxyalkanoates / B. Kunasundari, K. Sudesh // eXPRESS Polymer Letters. - 2011. - Vol.5. - №7. P.620-634
24 Anis S. N. S. Increased recovery and improved purity of PHA from re-combinant Cupriavidus necator / Siti Nor Syairah Anis, Nurhezreen Md Iqbal, Sudesh Kumar &Amirul Al-Ashraf // Bioengineered. - 2013. - №4(2). - P. 115¬118.
25 Jacquel N. Isolation and purification of bacterial poly(3- hydroxyalkanoates) / N. Jacquel, C-W. Lo, Y-H. Wei, H-S. Wu, S. S. Wang // Bio-chemical Engineering Journal. - 2008. - № 39. - P. 15-27.
26 Fiorese M. L. Recovery of polyhydroxybutyrate (PHB) from Cupriavidus necator biomass by solvent extraction with 1,2-propylene carbonate / M. L. Fiorese, F. Freitas, J. Pais, A. M. Ramos, G. M. F. de Aragao, M.A.M. Reis // En¬gineering in Life Sciences. - 2009. - № . Р. 454-461.
27 Wampfler B., Ramsauer T., Rezzonico S., Hischier R., Kohling R., Thony-Meyer L., Zinn M.: Isolation and purification of medium chain length poly(3-hydroxyalkanoates) (mcl-PHA) for medical applications using nonchlorinated solvents. Biomacromolecules, 11, 2716- 2723 (2010). DOI: 10.1021/bm1007663
28 Mohamed H. PHA Recovery from Biomass [Электронный ресурс] / Mohamed H. Madkour, Daniel Heinrich, Mansour A. Alghamdi, Ibraheem I. Shabbaj, Alexander Steinbuchel //Biomacromolecules 14- Р. 25-30. - 2013.
29 Khan F. A. Separation of polyhydroxyalkanoates-producing bacterial strains using PHA synthase gene and their evaluation for PHA deposition / A. B. 46 Khan, M. I. Khattak, O. M. Tarar, F. Habib, K. Jamil, A. Yasmin, S. Parvez // Brazilian Archives of Biology and Technology. - 2013. - Vol.4, №56. - Р. 645-652.
30 Сырвачева Д. А. Микробиологический синтез и характеристика полигидроксиалканоатов, содержащих мономеры среднецепочечного 3- гидроксигексаноата : дис. ... канд. биол. наук : 03.02.03 / Сырвачева Дарья Анатольевна. - Красноярск, 2016. - 138 с
31 Jacquel N. Isolation and purification of bacterial poly(3- hydroxyalkanoates) / Chi-Wei Lo, Yu-Hong Wei, Ho-Shing Wu, Shaw S. Wang // Biochemical Engineering Journal -Vol.39- Р. 15-27.-2008.
32 Yang Y.H. Polyhydroxyalkanoates (PHAs) //Biotechnology letters. - 2011 - Т. 33 - №. 5 - С. 937-942.
33 Киселев Е. Г. Технико-технологические основы биосинтеза резервных полигидроксиалканоатов водородными бактериями : автореф. дис. ... канд. биол. наук : 03.01.06 / Киселев Евгений Геннадьевич. - Красноярск,
2012. - 20 с.
34 Ramsay J.A. Recovery of poly-3-hydroxyalkanoic acid granules by a surfactant-hypochlorite treatment / J.A. Ramsay, E. Berger, B.A. Ramsay, C. Chavarie //Biotechnology Techniques - Vol. 4 -Р. 221-226.- 2009.
35 A statistical approach for optimization of polyhydroxybutyrate produc¬tion by marine Bacillus subtilis MSBN17 [Электронный ресурс] / G. Sathiyanarayanan, G. Saibaba, G. Seghal Kiran, Joseph Selvin // Режим доступа : http://www. sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813013002237
36 Feasibility study of an alkaline-based chemical treatment for the purifica-tion of polyhydroxybutyrate produced by a mixed enriched culture / Y. Jiang, G. Mikova, R. Kleerebezem, L. AM van der Wielen, M. C Cuellar //AMB Express-Р. 55-59.- 2015.
37 Choi J. Efficient and economical recovery of poly(3-hydroxybutyrate) from recombinant Escherichia coliby simple digestion with chemicals / Jong-il Choi, Sang Yup Lee. - Vol. 62, №. 5. Р. 546-553. - 2009.
38 Quines L. K. Metodos de extragao de poli-hidroxialcanoatos a partir de biomassabacteriana / L. K. M. Quines, M. Schmidt, K. Zanfonato, W. Schmidell, M. F. Glaucia // Aragao - Р.1207-1218. - 2015.
39 Kapritchkoff F. M. Enzymatic recovery and purification of polyhydroxybutyrate produced by Ralstonia eutropha / F.M. Kapritchkoff, P.A.Viott, R.C.P. Alli, M. Zuccolo, J.G.C Pradella, A.E. Maiorano, E. A. Miranda, A. Bonomi // Journal of biotechnology. - 2006. - Vol. 122, №. 4. - P. 453-462
40 Neves A. Use of enzymes in extraction of polyhydroxyalkanoates pro-duced by Cupriavidus necator/ A. Neves, J. Muller // Biotechnology Progress-Р. 58-63. -2012.
41 Koller M. Strategies for recovery and purification of poly[(R)-3- hydroxyalkanoates] (PHA) biopolyesters from surrounding biomass / Martin Koller, Horst Niebelschutz, Gerhart Braunegg // Engineering in Life Sciences. -
2013. - № 13. - P. 549-562.
42Laycock, B. The chemomechanical properties of microbial polyhydroxyalkanoate / B. Laycock, P. Halley, S. Pratt et al. // Prog. Polym. Sci. -2013.- Vol. 38. - P. 536-583.
43Jian J. Metabolic engineering for microbial production of polyhydroxyalkanoates consisting of high 3-hydroxyhexanoate content by recom-binant Aeromonas hydrophila/ J. Jian, Z.J. Li, H.M. Ye et al. // Bioresour. Technol. - 2010. - Vol. 101. - P. 6096-6102.
44 Wong, Y.M. Biosynthesis and characterization of polyhydroxyalkanoate containing high 3-hydroxyhexanoate monomer fraction from crude palm kernel oil by recombinant Cupriavidus necator/ Y.M. Wong, C.J. Brigham, C. Rha et al. // Bioresour. Technol. - 2012. - Vol. 121. - P. 320-327.
45 Wanga Q. Optimization of polysaccharides extraction from seeds of
Pharbitisniland its anti-oxidant activity [Электронный ресурс] / Q. Wanga, Y. Suna, B. Yanga, Z. Wanga, Y. Liua, Qi Caoa, X. Sunb, H. Kuanga // Carbohydrate Polymers. - № 102. - Р. 460 - 466. - 2014. Режим доступа:
http://www. sciencedirect. com/science/article/pii/S0144861713012083.
46 Xiong Z. Efficient extraction of intracellular reduced glutathione from fermentation broth of Saccharomyces cerevisiae by ethanol / Z. Xiong, M. Guo, Y. Guo, J. Chu, Y. Zhuang, S. Zhang // Bioresource Technology. - № 100. - Р. 1011-1014. -2009.
47 Таблицы планов эксперимента. Для факторных и полиномиальных моделей. Справочное издание Бродский В.З., Бродский Л.И., Голикова Т.И., Никитина Е.П., Панченко Л.А. - Под ред. В.В. Налимова. - М.: Металлургия, 1982. - 753 с.
48 Wilde E. Untersuchungen uber Wachstum und Speicherst off synthese von Hydrogenomonas eutropha/ E. Wilde // Arch. Mikrobiol. - 1962. - Vol. 43. - P. 109-137.
49 Reinecke F. Ralstonia eutropha strain H16 as model organism for PHA metabolism and for biotechnological production of technically interesting biopol-ymers /F. Reinecke, A. Steinbuchel // J. Mol. Microbiol. Biotechnol. - 2009. - Vol. 16. - P. 91-108.
50 Volodina E. Engineering the heterotrophic carbon sources utilization range of Ralstonia eutropha H16 for applications in biotechnology / E. Volodina, M. Raberg, A. Steinbuchel // Critical Rev. Biotechnol. - 2015. - P. 1-14. DOI:10.3109/07388551.2015.1079698
51 Определитель бактерий Берджи: в 2-х т. / Дж. Хоулт, Н. Криг, П. Снит, С. Уилльямс; пер. с англ.; под ред. Г.А. Заварзина. - 9-е изд., перераб. и доп. - М.: Мир, 1997. - 2 т.
52 Волова Т.Г. Получение и исследование микробных гетерополимерных полиоксиалканоатов / Т.Г. Волова, О.Г. Беляева, Г.С. Калачева [и др.] // ДАН. - 1996. - Т. 347. - С. 256-258
53 Волова Т.Г. Полиоксиалканоаты (ПОА) - биоразрушаемые полимеры для медицины / Т.Г. Волова, В.И. Севастьянов, Е.И. Шишацкая. - Новосибирск: СО РАН, 2003. - 330 c.
54 Гавриленко А.К. Планирование и обработка эксперимента в пакете Statgraphics /Гавриленко А.К. - Екатеринбург: УрГУПС, 2012. - 30 с.
55 Braunegg, G. A rapid gas chromatographic method for the determination of poly-^-hydroxybutyric acid in microbial biomass / G. Braunegg, B. Sonnleitner, R.M. Lafferty // Eur. J. Appl. Microbiol. Biotechnol. - 1978. - Vol. 6. - P. 29-37.
56 Brandl H. Pseudomonas oleovorans as a source of poly(betahydroxyalkanoates) for potential applications as biodegradable polyesters / H. Brandl, R.A. Gross, R.W. Lenz et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 1988. - Vol. 54. - P. 1977-1982.
57 Prasad M.P. Рroduction and isolation of polyhydroxyalkanoates from Pseudomonas sp. using waste cooking oil as a sole carbon source / Prasad M.P. and Rekha Sethi //International Journal of Advanced Biotechnology and Research. - Vol 4. - Issue 4. - 2013. - Р.527-532.
58 Mitra Mohammadi. Recovery and purification of intracellular polyhydroxyalkanoates from recombinant Cupriavidus necator using water and ethanol / Mitra Mohammadi, Mohd Ali Hassan, Lai-Yee Phang, Hidayah Ariffin, Yoshihito Shirai, Yoshito Ando // BiotechnolLett. - 2012. - Р.253-259.