Введение 4
1. Обзор литературы 7
1.1. Характеристика полигидроксиалканоатов 7
1.2. Потенциальные источники углерода для синтеза ПГА 9
1.3. Синтез мономера 4ГБ 11
1.4. Влияние условий культивирования на синтез сополимеров поли(3ГБ/4ГБ) 14
1.5. Биохимические пути синтеза ПГА 17
2. Материалы и методы 21
2.1. Объект исследования 21
2.2. Культивирование бактерий и методы измерения параметров
культивирования 21
2.2.2. Контроль химических параметров процесса культивирования бактерий
2.2.3. Определение содержания и состава полимера 25
2.3. Статистическая обработка данных 27
3. Результаты и обсуждения исследования 28
3.1. Определения констант насыщения и ингибирования для глюкозы и
масляной кислоты 28
3.2. Определение наиболее активно действующего прекурсора 30
3.3. Выращивание бактерий CupriaviduseutrophusB10646 на среде,
содержащей в качестве субстрата масляную кислоту 33
3.4. Выращивание бактерий Cupriavidus eutrophus B10646 на среде,
содержащей в качестве субстрата глюкозу 34
3.5. Выращивание бактерий Cupriavidus eutrophus B10646 на разных
концентрациях 4-броммасляной кислоты 35
3.6. Дробные добавки 4-броммасляной кислоты 36
3.7. Свойства сополимеров 3-и 4-гидроксимаслянной кислоты 37
Выводы 40
Литература
За последние десятки лет загрязнение окружающей среды синтетическими полимерами является одной из важнейших проблем современного мира, вопрос о том, как решить эту проблему давно волнует человечество. Все дело в том, что применение синтетических полимеров приносит дисбаланс в углеродный цикл, так как уровень потребления углеродосодержащих ресурсов намного превосходит уровень их восполнения.
Полигидроксиалканоаты (ПГА) - термопластические полиэфиры, синтезируемые различными бактериями в качестве внутриклеточного запасного материала в условиях лимитирования роста питательными элементами (например, азотом, фосфором) и при избыточном содержании источника углерода [34]. ПГА в настоящее время становятся реальными кандидатами на роль материалов XXI века, с ними связаны большие надежды, так как помимо термопластичности аналогично полипропилену и полиэтилену, эти биопластики обладают пьезоэлектрическим эффектом и характеризуются высокой биосовместимостью.
Особо перспективными ПГА являются сополимеры, имеющие низкую кристалличность и обладающие свойствами эластомеров. Это короткоцепочечные сополимеры 3- и 4-гидроксибутирата, а также сополимеры, содержащие, помимо коротко-, среднецепочечные мономеры, например 3- гидроксигексаноат (3ГГ) [40].
На сегодняшний день работ, посвященных синтезу поли(3ГБ/4ГБ), достаточно много, однако результаты, приводимые авторами, в некоторой степени можно считать противоречивыми, главным образом из-за использования разными авторами различных штаммов микроорганизмов, разных ростовых субстратов и условий культивирования. Так же синтез сополимерных ПГА является сложной биотехнологической задачей, так как для их получения в состав среды, как правило, необходимо внесение дополнительных источников углерода в качестве субстратов-предшественников целевых мономеров, которые в подавляющем большинстве ингибируют рост продуцентов. Это негативно сказывается на общей продуктивности процесса биосинтеза по биомассе клеток и общих выходах сополимеров [5]. А значит, возникает необходимость в поиске новых прекурсоров, которые бы не ингибировали рост бактерий и давали более высокое содержание мономера 4ГБ в сополимере.
Наиболее ценным свойством является возможность синтеза биополимеров различного состава с различными свойствами. Существенное внимание многими авторами уделяется бактериямCupriaviduseutrophusвсвязи со способностью этих бактерий аккумулировать ПГА с высокими выходами на различных субстратах, в том числе различного состава (гомогенный полигидроксибутират, более технологичные сополимеры гидроксибутирата с гидроксигексаноатом (поли(3ГБ/3ГГ)), сополимеры 3- и 4-гидроксимасляной кислоты (поли(3ГБ/4ГБ)).В зависимости от содержания фракции 4- гидроксибутирата в сополимере П[3ГБ/4ГБ], полимер может быть как высококристалличным так и эластичным. Сополимеры с высоким содержанием 4ГБ являются термопластичными эластомерами, удлинение при разрыве данных сополимеров имеет более высокие значения по сравнению с большинством общеизвестных пластиков, к примеру, полипропилен и полиэтилен, а предел прочности на разрыв лежит в тех же пределах, что и у этих полимеров. Недавно было показано, что сополимеры с высоким содержанием 4ГБ обладают высокими механическими свойствами и перспективны для применения в медицине, в том числе биоразрушаемых материалов и эндопротезов [7,39].
Цель работы: определение влияния режима углеродного питания на продукцию сополимера 3ГБ/4ГБ, при которых содержание мономера 4ГБ в сополимере будет максимальным с использованием различных прекурсоров и изучение физико-химических свойства сополимеров 3- и 4-гидроксимасляной кислоты.
Задачи:
- Определение влияния субстратов-предшественников (прекурсоров) на синтез мономера 4ГБ и выбор наиболее активного влияющих субстратов- предшественников на выход биомассы, содержание полимера, и процентное содержание мономера 4ГБ в полимере.
- Определение параметров обеспечивающих продуктивный синтез сополимера 3ГБ/4ГБ.
- Изучение физико-химических свойств в зависимости от соотношения мономеров.
1. Исследован рост и выход полимера у бактерий Сирпог)Дикеи горкик В10646 на глюкозе и масляной кислоте в сочетании с тремя прекурсорами:,4-бутандиол, 1,6-гександиол и 4-броммасляная кислота. 4-броммасляная кислота дает показатель процентного содержания мономера 4ГБ в 2-2,5 раза выше, чем 1,4-бутандиол и 1,6-гександиол, тогда как выход биомассы и содержание ПГА примерно равны. Максимальные выходы биомассы 6 г/л и сополимера (до 95 % от веса сухой биомассы) получены в условиях роста бактерий на среде с масляной кислотой и 4-броммасляной кислотой в качестве субстрата-предшественника.
2. Рассчитаны оптимальные коцентрации масляной кислоты (2 г/л) и 4- броммасляной кислоты (2 г/л) для продуктивного синтеза сополимера 3ГБ/4ГБ, было рассчитано, что максимальное содержание 4ГБ 12,7 мол.% достигается на 48 час после добавки прекурсора. А также был организован и исследован дробный режим подачи 4-броммасляной кислоты в культуру. Установлено, что в таком режиме при трехкратной подачи прекурсора в концентрации 2 г/л возможно увеличение содержания 4ГБ до 15,3 мол.%.
3. Установлено, что режимом углеродного питания, заключающегося в варьировании соотношения в среде прекурсор/основной субстрат и режима дозирования 4-броммасляной кислоты в культуру, можно обеспечить условия для синтеза штаммом Cupriavidus eutrophusВ10646 сополимера [поли(3ГБ/4ГБ)] с различным содержанием 4ГБ от2.9 до 15.3 мол.%, которое влияет на физико-химические свойства в сополимере, а так же было показано, что молекулярно-массовые характеристики не зависят от соотношения мономеров,полидисперсность имела зависимость от 2,8 до 3,9 от содержания 4ГБ,а величина значение Мв находятся в широких пределах от 547 - 759 кДа. Включение 4ГБ до 15.3 мол.%. приводит к снижению степени кристалличности (до 42%), не влияя на температуру плавления.
1. Volova, T.G, Zhila, N.O.,Kalacheva, G.S.,BrighamC. J., AnthonyJ. Sinskey, A.J.,Effects of intracellular poly(3-hydroxybutyrate) reserves on physiological-biochemical properties and growth ofRalstoniaeutropha// Research in Microbiology . - 2013. - Pp. 164-171
2. Hui-Ling Chai, Rahayu Ahmad, A. R. M. Yahya, M. I. A. Majid, Microbial synthesis of poly(3-hydroxybutyrate-co-4- hydroxybutyrate) copolymer by Cupriavidus sp. USMAA2-4 through a two step cultivation process. - 2009.
3. AmirulAl Ashraf, S. N. Syairah, Ahmad R. M. Yahya, M. N. M. Azizan, M. I. A. Majid, Synthesis of biodegradable polyesters by Gram negative bacterium isolated from Malaysian environment. - 2008.
4. Volova, T.G., Kiselev, E.G., Shishatskaya, I.S., Zhila, N.O., Boyandin,
A. N., Syrvacheva, D.A., Vinogradova, O.N., Peterson, I. V., Cell growth and accumulation of polyhydroxyalkanoates from CO2 and H2 of a hydrogen-oxidizing bacterium, Cupriaviduseutrophus B-10646- 2010.
5. CavalheiroJoao M.B.T., Rodrigo S. Raposo, M. Catarina M.D., de Almeida, M. Teresa Cesario, Chantal Sevrin, Christian Grandfils, M.M.R. da Fonseca, Effect of cultivation parameters on the production of poly(3- hydroxybutyrate-co-4-hydroxybutyrate) and poly(3-hydroxybutyrate-4- hydroxybutyrate-3-hydroxyvalerate) by Cupriavidusnecator using waste glycerol. - 2012.
6. Zhila, N.O., Volova, T.G, Nikolaeva, E.D.,Syrvacheva, D.A., Microbial synthesis and characterization of poly (3-Hydroxybutyrate-co- 4-Hydroxybutyrate) copolymer. - 2011.
7. Muzaiyanah, A. R.,Amirul, A. A., Studies on the microbial synthesis and characterization of polyhydroxyalkanoatesсontaining 4-Hydroxyvalerate using y- valerolactone. -2013.
8. Amirur, A. A., Ahmad R. M. Yahya, K. Sudesh, M. N. M. Azizan, M. I. A. Majid, Isolation of poly(3-hydroxybutyrate-co-4-hydroxybutyrate) producer from Malaysian environment using c-butyrolactone as carbon source. - 2009.
9. Fahima, T. M., Azira, A. A., Nursolehah Y. Norhayati, M. I. A. Majid,Amirul, A. A, Biosynthesis of poly(3-hydroxybutyrate-co-3- hydroxyvalerate-co-4-hydroxybutyrate) terpolymer by Cupriavidus sp. USMAA2- 4 through two-step cultivation process. - 2011.
10. ChanprateepSuchada, Yoshio Katakura, Characterization of new isolated Ralstoniaeutropha strain A-04 and kinetic study of biodegradable copolyesterpoly(3-hydroxybutyrate-co-4-hydroxybutyrate) production. - 2008.
11. ChanprateepSuchada, KetsuneeBuasri, AumtigaMuangwong, PhonpisitUtiswannakul, Biosynthesis and biocompatibility of biodegradable poly(3-hydroxybutyrate-co-4-hydroxybutyrate). - 2010.
12. Fukui Toshiaki, Suzuki Mamie, TakeharuTsuge, Satoshi Nakamura, Microbial synthesis of Poly((R)-3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxypropionate) from unrelated carbon sources by engineered Cupriavidusnecator. -2009.
13. Hsieh Wen-Chuan, Yuki Wada, Chih-Pong Chang, Fermentation, biodegradation and tensile strength of poly(3-hydroxybutyrateco-4- hydroxybutyrate) synthesized by Delftiaacidovorans. - 2009.
14. KimJinSeol, Lee Bong Hee, KimBeom Soo, Production of poly(3- hydroxybutyrate-co-4-hydroxybutyrate) by Ralstoniaeutropha. -2005.
15. LauNyok-Sean, Kumar Sudesh, Revelation of the ability of Burkholderia sp. USM(JCM 15050) PHA synthase to polymerize 4- hydroxybutyrate monomer. -2012.
16. Lee Wing-Hin, AzizanMohd N.M, Sudesh Kumar, Effects of culture conditions on the composition of poly(3-hydroxybutyrate-co-4-hydroxybutyrate) synthesized by Comamonasacidovorans. - 2004.
17. Li Zheng-Jun, Shi Zhen-Yu, Production of poly(3-hydroxybutyrate-co-4 hydroxybutyrate)from unrelated carbon sources by metabolically engineered Escherichia coli. - 2010.
18. Martin David P., Williams Simon F., Medical applications of poly-4- hydroxybutyrate: a strong flexible absorbable biomaterial. - 2003.
19. Masood F, Chen P, Yasin T, Hasan F, Ahmad B, Hameed A. Synthesis of poly-(3-hydroxybutyrate-co-12 mol % 3-hydroxyvalerate) by Bacillus cereus FB11: its characterization and application as a drug carrier // J Mater Sci Mater Med. - 2013. - 24(8). - Pp. 1927-1937.
20. MengDe-Chuan, Shi Zhen-Yu, Production and characterization of poly(3-hydroxypropionate-co hydroxybutyrate) with fully controllable structures by recombinant Escherichia coli containing anengineered pathway. - 2012.
21. Vigneswari S. Vijaya, M. I. A. Majid, K. Sudesh, C. S. Sipaut, M. N. M. Azizan, A. A. Amirul Enhanced production of poly(3-hydroxybutyrate-co-4- hydroxybutyrate) copolymer with manipulated variables and its properties. - 2009.
22. Волова, Т.Г. Регуляция синтеза микробного полиоксибутирата параметрами среды / Т.Г. Волова, Г.С. Калачева, Я.В. Федорова // В сб.:
Микробная биоконверсия. Рига. -1990. - С. 119-129.
23. Жила, Н.О., Волова, Т.Г., Калачева, Т.Г. Характеристика культуры Cupriaviduseu1rophusB-10646синтезирующей полигидроксиалканоаты при росте на сахарах и липидных субстратах. - 2014.
24. Волова, Т.Г. Получение и исследование физико-химических свойств микробных полиоксиалканоатов / Т.Г. Волова, С.Г. Луковенко,А.Д. Васильев // Биотехнология. - 1992. - № 1. - С. 19-22.
25. Волова, Т.Г., Миронов, П.В., Васильев, А.Д. Синтез и исследование многокомпонентных полигидроксиалканоатов. - 2006.
26. Волова, Т.Г.,Шишацкая, Е.И., Жила, Н.О., Киселев, Е.Г., Миронов, П.В., Васильев, А.Д.,Петерсон, И.В.,Сински, Э.Д.Фундаментальные основы производства и применения биодеградируемых полигидроксиалканоатов. -
2012.
27. Киселев, Е.Г., Шишацкий, О.Н., Сински, Э.Дж. Технико-технологические основы производства разрушаемых полигидроксиалканоатов. - 2012 г.
28. Киселев, Е.Г., Демиденко, А.В. Сравнительное исследование методов экстракции полигидроксиалканоатов из биомассы бактерий. - 2014 г.
29. Мышкина, В.Л., Иванов, Е.А., Николаева, Д.А., Махина, Т.К., Биосинтез сополимера поли-3-гидрокскибутирата-3-гидроксивалерата штаммом Azotobacterchroococcum7E.- 2009.
30. Шишацкая, Е.И., Волова, Т.Г. Штамм бактерий СupriaviduseutrophusВ10646 - продуцент полигидроксиалканоатов и способ их получения. - 2012.
31. Шишацкая, Е.И., Волова, Т.Г. Полигидроксиалканоаты как матрикс в клеточных технологиях. - 2010. - С. 55-56
32. Волова, Т.Г. Влияние условий роста на накопление полиоксибутирата водородными бактериями / Т.Г. Волова, Г.С. Калачева, В.М. Константинова, А.П. Пузырь // Прикладная биохимия и микробиология. - 1992. - Т. 28. - С. 221-222.
33. Волова, Т.Г. Биотехнология / Т.Г. Волова. - Красноярск.: СО РАН. - 2002. - 267 с.
34. Волова, Т.Г. Влияние лимитирования роста на накопление полиоксибутирата у водородокисляющих бактерий / Т.Г., Волова,Я.В., Федорова, Г.С., Калачева // В кн.: Материалы Всес. конф. Лимитирование и ингибирование роста микроорганизмов. - 1989. - С. 16-24.
35. Волова, Т.Г. Современные проблемы и методы биотехнологии [Электронный ресурс]: учеб.-метод. пособие для самостоят. работы [для студентов программы подг. 020400.68 «Биология»] / Сиб. федерал. ун-т ; сост.: Т. Г. Волова, Е. И. Шишацкая. - Красноярск : СФУ. - 2013. - 73 c.
36. Kim I.S., Beaudette L.A., Cassydy M.B., Lee H., Trevors J.T. Alterations in fatty acid composition and fluidity of cell membranes affect the accumulation of PCB congener 2,2',5,5'-tetrachlorbiphenyl by Ralstoniaeutropha H850 // J. Chem. Technol. Biotechnol. - 2002. - 77. - Pp. 793-799.
37. M. Koller, A. Salerno, A. Muhr, A. Reiterer, G. Braunegg. Polyhydroxyalkanoates: biodegradable polymers and plastics from renewable resources // Mater. Technol.- 2012. -Pp. 23-30.
38. Martin, D. Medical applications of poly-4- hydroxybutyrate: a strong flexible absorbable biomaterial / D. Martin, S. Williams // Biochem. Eng. J., 2003.
39. Васнев, В. А. Биоразлагаемые полимеры. Высокомолекулярные соединения / В. А. Васнев. - Сер. Б. М., 1997. Т. 39. № 12. С. 2073 - 2086.
40. Doi Y., Abe H. Structural effects on biodegradation of aliphatic polyesters// Macromol. Symp. 1997. -V. 118. - P. 725-731.
41. Doi Y., Kanesawa Y., Tanahashi N. et al. Biodegradation of microbial poly(hydroxyalkanoates) // Makromol. Chem. Rapid. Commun. 1989. - V.10. -P. 227-230.
42. Doi Y., Segawa A., Kawaguchi Y. et al. Cyclic nature of poly(3- hydroxyalkanoate) metabolism in Alcaligeneseutrophus II FEMS Microbiol. Lett. 1990. - V. 67. - P. 165-170.
43. 21. Doi Y., Kanesawa Y., Kawaguchi Y. et al. Hydrolytic degradation of microbial polyesters in the marine environment // Polym. Degrad. Stub. 1992a. -V.36.-P.173-177.
44. Doi Y., Kawaguchi Y., Nakamura S. et al. Synthesis and degradation of polyhydroxyalkanoates //FEMS Microbiol.Rev. 1992b. - V. 1-3. - P. 103-108.
45. Doi Y., Mukai K., Kasuya K. et al. Biodegradation of biosynthetic and chemosyntcheticpolyhydroxyalkanoates.// In: Y.Doi and K. Fukuda K. (Eds). Biodegradable plastics and polymers. Elsevier, Amsterdam. 1994. - P. 39-51.
46. Bourne, R.B. Fractures of the patella after total knee replacement// OrthopClin North Am. -1999.-V. 2.-P.287-291.
47. Brandl H., Gross R., Lenz R. et al. Plastics from bacteria and for
bacteria: poly(-y0-hydroxyalkanoates) as natural, biocompatible, and
biodegradable polyesters // Adv. Biochem. Eng.Biotechnol. 1990. - V. 41. - P. 77¬93.
48. Е. И. Степановских, Ю. Н. Макурин, Л. Н. Маскаева, И. М. Морозова Определение параметров кинетических уравнений: учебное пособие /. Екатеринбург: УГТУ - УПИ, 2008. 73 с.
49. Kessler, B.,Witholt, B. Factors involved in the regulatory network ofpolyhydroxyalkanoatemetabolism // Biotechnol., 2001. - V. 86. - P. 97-104.
50. Timm, A., Steinbuchel, A. Formation of polyesters consisting of medium-chain-length 3-hydroxyalkanoic acids from gluconate by Pseudomonas aeruginosa and other fluorescent pseudomonads // Appl. Environ. Microbiol., 1990. - V. 56. - P. 3360-3367.
51. Rahayu, A. Production of copolymer poly(3-hydroxybutyrate-co-4- hydroxybutyrate) through a one-step cultivation process / A. Rahayu, Z. Zaleha, A.
R. M. Yahaya, M. I. A. Majid, A. A. Amirul // J. Ind. Microbiol. Biotechnol., 2008 - V. 24. - P. 2403 - 2409.
52. Волова Т.Г., Калачёва Г.С. // Микробиология. 2005. Т. 74. № 1. С. 63-69.
53. M. Koller, A. Salerno, A. Muhr, A. Reiterer, G. Braunegg. Polyhydroxyalkanoates: biodegradable polymers and plastics from renewable resources. Mater. Technol., 46 , 2012, pp. 23-30.
54. De Koning, G.J.M. Biosynthesis of poly-(R)-3-hydroxyalkanoate: an emulsion polymerization / G.J.M. De Koning, I.A. Maxwell // Environ Polym. Degrad., 1993. - V. 1. - P. 223-226.
55. Kunioka, M. Production of biodegradable copolyesters of 3- hydroxybutyrate and 4-hydroxybutyrate by Alcaligenes eutrophus / M. Kunioka, Y. Kawaguchi, Y. Doi // Apll. Microbiol. Biotechnol., 1989a. - V. 30. - P. 569-573.
56. T. M. Fahima Azira. Biosynthesis of Poly(3-hydroxybutyrate-co-3- hydroxyvalerate-co-4-hydroxybutyrate) terpolymer by Cupriavidus sp. USMAA2- 4 through two-step cultivation process // 2011
57. Song, J. Y. Characteristics of poly(3-hydroxybutyrate-co-4- hydroxybutyrate) production by Ralstonia eutropha NCIMB 11599 and ATCC 17699 / J. Y. Song, B. S. Kim // Biotechnol. AndBiopro. Eng., 2005. - V. 10. - P. 603 - 606.