Введение 3
Глава 1. Обзор литературы 5
1.1 Полигидроксиалканоаты и его особенности. 5
1.2. Характеристика поли(З-гидроксибутирата) 6
1.3 Молекулярно-массовое распределение полимера 9
1.5 Cupriavidus eutrophus B-10646, как продуцент ПГА 13
Глава 2. Материалы и методы 14
2.1 Бактериальный штамм, среда и условия роста 14
2.2. Культивирование и измерение параметров процесса
2.3. Измерение содержания полимера. 15
2.4. Измерение молекулярной массы. 15
Заключение 24
Список использованной литературы
Полигидроксиалканоаты (ПГА) - новый класс биоматериалов, обладающих комплексом полезных свойств - термопластичностью, биосовместимостью с животными тканями, антиоксидантностью, биодеградируемостью, что делает перспективным их использование в различных сферах деятельности человека, а именно, в медицине, фармакологии, электронной промышленности и т.д. Наиболее ценным в ПГА является возможность синтеза биополимеров различного состава, т.е. управление их свойствами (температура плавления и разложения, удлинение при разрыве, прочность на разрыв и т.д.). В настоящее время выявление связи между условиями роста бактерий, штаммовой спецификой, химической структурой и молекулярной массой полимера является актуальной задачей. Молекулярная масса полимера - это один из важных показателей, так как она влияет на физико-механические характеристики полимера, от чего в свою очередь зависит возможность переработки полимера в различные изделия. Несмотря на то, что проводились и проводятся многочисленные биохимические и биотехнологические исследования биосинтеза ПГА, очень мало работ по изучению возможности регулирования степени полимеризуемости полимера. Публикаций, посвященных анализу этой проблемы, крайне мало. В настоящее время полагают, что величина молекулярной массы зависит от видовых характеристик штамма, условий культивирования, в частности, углеродного субстрата, времени и температуры культивирования, соотношения C/N в среде, а также условий экстракции.
При дефиците азота в клетках бактерий начинается синтез полимера. Для применения ПГА в различных областях необходимо решить проблему регулирования молекулярной массы полимера, так как степень полимеризации влияет на его физические характеристики.
Целью нашей работы было изучение влияния условий культивирования на рост бактерий Cupriavidus eutrophus B-10646 и синтез полимера.
Перед нами стояли следующие задачи, а именно:
1) Исследовать влияние различных концентраций NH4Cl на рост клеток Cupriavidus eutrophus B-10646 и синтез полимера.
2) Определить молекулярную массу полимера в ходе роста культуры
Исследовано накопление биомассы и полимера у бактерий C. eutrophus B-10646 при культивировании на фруктозе и олеиновой кислоте при концентрации NH4Cl в среде 1.0, 1.5 и 2.0 г/л. Максимальный урожай биомассы при росте бактерий, как на фруктозе, так и на олеиновой кислоте получен в присутствии NH4Cl в концентрации 2.0 г/л и составил соответственно 10.5 и 9.9 г/л. Содержание полимера в конце культивирования, независимо от типа используемого субстрата и концентрации хлорида аммония, составляло 80-90% от веса сухой биомассы. Установлено, что в ходе культивирования, когда субстратом была фруктоза, среднечисловая и средневесовая молекулярная масса полимера снижалась соответственно с 900-1400 и 1600-2100 до 300-340 и 770-900 кДа на фоне увеличения полидисперсности с 1.66-1.94 до 2.42-2.6. При культивировании бактерий на олеиновой кислоте среднечисловая и средневесовая молекулярные массы полимера на 48 и 72 ч практически не отличались и составляли 150-300 и 650-800 кДа. Для полимера, полученного на олеиновой кислоте, характерна более высокая полидисперсность (3.3-4.6)
1. Перт С. Дж. Основы культивирования микроорганизмов и клеток//М.: Мир.,1978.-331 с. 7. Работнова И.Л. Хемостатное культивирование и ингибирование роста микроорганизмов//М.: Наука,-1979.-207 с.
2. Бонарцева, Г .А. Новые полимерные системы для контролируемого высвобождения дипиридамола и индометацина /Бонарцева Г.А., Махина Т.К., Мышкина В.Л. и др. // Прикладная биохимия и микробиология. 2006 -Т. 42 -С. 710-715.
3. Kunasundari B., Sudesh K. Isolation and recovery of microbial
polyhydroxyalkanoates //Express Polym. Lett. - 2011. - T. 5. - №. 7. - С. 620¬634. Nikodinovic-Runic J. et al. Carbon-rich wastes as feedstocks for
biodegradable polymer (polyhydroxyalkanoate) production using bacteria //Adv Appl Microbiol. - 2013. - T. 84. - С. 139-200.
4. Akiyama M., Tsuge T., Doi Y. Environmental life cycle comparison of polyhydroxyalkanoates produced from renewable carbon resources by bacterial fermentation //Polymer Degradation and Stability. - 2003. - T. 80. - №. 1. - C. 183-194.
5. Steinbuchel A. et al. Considerations on the structure and biochemistry of bacterial polyhydroxyalkanoic acid inclusions //Canadian journal of microbiology.
- 1995. - T. 41. - №. 13. - C. 94-105.
6. Volova T. G. et al. Cell growth and accumulation of polyhydroxyalkanoates from CO 2 and H 2 of a hydrogen-oxidizing bacterium, Cupriavidus eutrophus B- 10646 //Bioresource technology. - 2013. - T. 146. - C. 215-222.
7. Madison L. L., Huisman G. W. Metabolic engineering of poly (3- hydroxyalkanoates): from DNA to plastic //Microbiology and molecular biology reviews. - 1999. - T. 63. - №. 1. - C. 21-53.
8. Волова Т.Г., Шишацкая Е.И. (2012) Штамм бактерий ВКПМ B-10646 - продуцент полигидроксиалканоатов и способ их получения. Патент РФ № 2439143.
9. Бонарцева Г.А., Мышкина В.Л., Николаева Д.А., Ребров А.В., Герасин В.А., Махина
Т.К. Биодеградация поли-в-оксибутирата в модельных условиях почвенного сообщества: влияние условий среды на скорость процесса и физико-механические характеристики полимера// Микробиология. 2002. т. 71, № 2, стр. 258-263.
10. Тагер А. А. Физико-химия полимеров/Тагер А.А. - Москва: Издательство «Химия». - 1968.-c.500.
11.Suzuki, T., Yamane, T., Shimizu, S. 1986. Mass production of poly- p- hydroxybutyric acid by fed batch culture with controlled carbon/ nitrogen feeding. Appl. Microbiol. Biotechnol. 24: 37 с.374.
12.Sung HY, Young JY (1995). Effect of pH on the Mw of Poly-3hydroxybutyric Acid Produced by Alcaligenes sp.. Biotechnol. Lett., 17: c.389-394.
13. Suzuki T, Deguchi H, Yamane T, Shimizu S, Gekko K (1988). Control of Mw of poly-3-hydroxybutyric acid produced in fet-batch culture of Protomonas extorquens. Appl. Microbiol. Biotechnol., 27.c. 487-491.
14. Daniel M, Choi JH, Kim JH, Lebeault JM (1992). Effect of nutrient deficiency on accumulation and relative Mw of poly-3-hydroxybutyric acid by methylotrophic bacterium, Pseudomonas 135. Appl. Microbiol. Biotechnol., 37: 702-706.
15. Shimizu H, Tamura S, Shioya S, Suga K (1993). Kinetic study of poly-D(-)-3- hydroxybutyric acid (PHB) production and its Mw distribution control in a fed- batch culture of Alcaligenes eutrophus. J. Ferment. Bioeng., 76: 465-469.
16. Hahn SK, Chang YK, Lee SY (1995). Recovery and Characterization of Poly(3-Hydroxybutyric Acid) Synthesized in Alcaligenes eutrophus and Recombinant Escherichia coli. Appl. Environ. Microbiol., 61: 3439.
17. Sung HY, Young JY (1995). Effect of pH on the Mw of Poly-3hydroxybutyric Acid Produced by Alcaligenes sp.. Biotechnol. Lett., 17: c.368-373.
18. Akiyama M., Tsuge T., Doi Y. Environmental life cycle comparison of polyhydroxyalkanoates produced from renewable carbon resources by bacterial fermentation //Polymer Degradation and Stability. - 2003. - T. 80. - №. 1. - C. 183-194.
19. Волова, Т.Г. Биоразрушаемые полимеры: синтез, свойства,применение / Т.Г. Волова, Е.И. Шишацкая. - Красноярск: Красноярский писатель, 2011. - 400 с.
20. Rehm B. H. A., Steinbuchel A. Polyhydroxyalkanoate (PHA) synthases: the key enzymes of PHA synthesis //Biopolymers online. - 2002.Godoy F. et al. Sphingopyxischilensis sp. nov., a chlorophenol-degrading bacterium that accumulates polyhydroxyalkanoate, and transfer of Sphingomonas alaskensis to Sphingopyxis alaskensis comb. nov //International journal of systematic and evolutionary microbiology. - 2003. - Т. 53. - №. 2. - С. 473-477.
21 Agus, J., Kahar, P., Abe, H., Doi, Y. &Tsuge, T. Molecular weight characterization of poly[(R)-3-hydroxybutyrate] synthesized by genetically engineered strains of Escherichia coli. Polym. Degrad. Stab. 91,-2006-c. 1138¬1146.
22. 0 Shi, F., Gross, R. A. &Rutherford, D. R. Microbial polyester synthesis: effects of poly (ethylene glycol) on product composition, repeat unit sequence, and end group structure. Macromolecules 29.- 1996-c. 10-17.
23. Sanguanchaipaiwong, V., Gabelish, C. L., Hook, J., Scholz, C. & Foster, L. J.
R. Biosynthesis of natural-synthetic hybrid copolymers polyhydroxyoctanoate-diethylene glycol. Biomacromolecules 5-2004-c. 643-649.
24. Arikawa, H., Sato, S., Fujiki, T. & Matsumoto, K. A study on the relation between poly (3-hydroxybutyrate) depolymerases or oligomer hydrolases and molecular weight of polyhydroxyalkanoates accumulating in Cupriavidus necator H16. J. Biotechnol. 227-2016- c.94-102.
25. Ushimaru, K., Watanabe, Y., Hiroe, A. & Tsuge, T. A single-nucleotide substitution in phasin gene leads to enhanced accumulation of polyhydroxyalkanoate (PHA) in Escherichia coli harboring Aeromonas caviae PHA biosynthetic operon. J. Gen. Appl. Microbiol. 61-2015- c.63-66.
26. Hiroe, A., Ushimaru, K. & Tsuge, T. Characterization of polyhydroxyalkanoate (PHA) synthase derived from Delftia acidovorans DS-17 and the influence of PHA production in Escherichia coli. J. Biosci. Bioeng. 115-2013-c. 633 -638.
27. Hiroe, A., Shiraishi, M., Mizuno, K. & Tsuge, T. Behavior of different polyhydroxyalkanoate synthases in response to the ethanol level in Escherichia coli cultures. Polym. J. 47-2015-c. 767-770.
28. Peoples O. P., Sinskey A. J. Poly-beta-hydroxybutyrate (PHB) biosynthesis in Alcaligenes eutrophus H16. Identification and characterization of the PHB polymerase gene (phbC) //Journal of Biological Chemistry. - 1989. - T. 264. - №. 26. - C. 15298-15303.
29. Noda I., Green P. R., Satkowski M. M., and Schechtman L. A. Preparation and properties of a novel class of polyhydroxyalkanoate copolymers / Biomacromol. /2005. V. 6. - c. 580-586.
30. Laycock, B. The chemomechanical properties of microbial polyhydroxyalkanoate / B. Laycock, P. Halley, S. Pratt et al. // Prog. Polym. Sci. - 2013. - Vol. 38. - c. 536-583- 2007. - Vol. 82. - c. 233-247.
31. Poirier, Y. Medium-Chain-Length Polyhydroxyalkanoate / Y. Poirier,
S.M. Brumbley // In: Plastics from bacteria: Natural functions and applications / G.Q. Chen, A. Steinbuchel, editors. - Berlin, Heidelberg: Springer-Verlag, 2010. - c. 187-211.
32. Волова T. Г., Шишацкая E. И. Штамм бактерий Cupriavidus eutrophus ВКПМ B-10646 — продуцент полигидроксиалканоатов и способ их получения. - 2012- П. РФ № 2439143
33. Жила, Волова, Калачева - Характеристика культуры Cupriavidus eutrophus В-10646, синтезирующей полигидроксиалканоаты при росте на сахарах и липидных субстратах / Журнал Сибирского федерального университета. Биология. Journal of Siberian Federal University/ Biology .— 2014 .— №2 .— C. 63-75