📄Работа №197773

Тема: Поиск генов ферментов, участвующих в биодеградации фракций нефти (аренов и алканов) и органических загрязнителей (нитрофенол, полихлорбифенил) в штаммах консорциума микроорганизмов «Абориген»

📝
Тип работы Магистерская диссертация
📚
Предмет биология
📄
Объем: 65 листов
📅
Год: 2023
👁️
Просмотров: 32
4995 руб.
🛒 Купить работу
Не подходит эта работа?
Закажите новую по вашим требованиям
Узнать цену на написание
ℹ️ Настоящий учебно-методический информационный материал размещён в ознакомительных и исследовательских целях и представляет собой пример учебного исследования. Не является готовым научным трудом и требует самостоятельной переработки.
📋 Содержание 📖 Введение ✅ Заключение 📕 Литература 🔍 Похожие 🛒 Купить

📋 Содержание

ВВЕДЕНИЕ 5
1 Обзор литературы 7
1.1 Источники загрязнений почв и водоёмов 7
1.1.1 Нефть: основные фракции и их состав 7
1.1.2 Нефть как органический загрязнитель 8
1.1.3 Органические загрязнители почв и водоемов, сопутствующие
деятельности человека 9
1.2 Использование потенциала микроорганизмов для очистки почв и водоёмов ....
10
1.2.1 Деградация алканов микроорганизмами 12
1.2.2 Деградация нафтенов микроорганизмами 15
1.2.3 Деградация аренов микроорганизмами 17
1.2.4 Деградация ПАУ микроорганизмами 23
1.2.5 Деградация фенантрена и антрацена микроорганизмами 26
1.2.6 Деградация бензпирена микроорганизмами 27
1.3 Гены ферментов, участвующих в деградации различных соединений нефти ....
28
1.3.1 Гены ферментов, участвующих в деградации алканов 29
1.3.2 Гены ферментов, участвующих в деградации моноароматических
соединений 32
1.3.3 Гены ферментов, участвующих в деградации ПАУ 35
1.4 Применение штаммов микроорганизмов для ремедиации почвы 37
2 Материалы и методы 39
2.1 Получение образцов плазмидной ДНК 39
2.2 Получение образцов хромосомной ДНК 39
2.3 Выделение образцов хромосомной ДНК из геля 39
2.4 ПЦР-анализ штаммов на наличие генов биодеградации углеводородов
нефти 40
2.5 Электрофорез образцов ДНК 40
3 Результаты и их обсуждение 41
3.1 Получение чистых фракций штаммов 41
3.2 Поиск ферментов для анализа деградации фракций нефти 42
3.3 Поиск генов ферментов, участвующих в деградации органических
загрязнителей в штаммах консорциума «Абориген» 46
ВЫВОДЫ 52
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ 53

📖 Введение

Экологический ущерб от загрязнения почв углеводородами весьма велик - от снижения качества и продуктивности почв до вывода земель из сельскохозяйственного оборота. Создаётся опасность загрязнения подземных и поверхностных вод в результате попадания нефтепродуктов в водоносные горизонты, реки и водоёмы. Нефть и продукты ее переработки, многие из которых чрезвычайно токсичны, канцерогенны и персистентны, то есть разрушаются крайне медленно, в частности, в Сибири с ее холодным климатом. Известно, что биодеградация нефти и нефтепродуктов в почве происходит при активном участии почвенных микроорганизмов, способных использовать соединения нефти в качестве источника энергии. Тем не менее, когда концентрация загрязнителя в почве относительно высока, как происходит при разливах, естественной микрофлоре необходимо время для адаптации к ксенобиотику. Ауторемедиация нефтезагрязненных почв может длиться до 30 лет, в северных регионах период декструкции составляет 50 и более лет, а токсические свойства нефти исчезают через 10-12 лет после рекультивационных работ [Неустроев, 2015]. Чтобы ускорить время биоремедиации и/или улучшить её качество, т.е. достигнуть более низких значений остаточной концентрации загрязнителя применяют различные методы биоремедиации, в том числе микробные препараты содержащие как отдельные штаммы нефтедеструкторов, так и целые консорциумы, выделенные из естественной среды. Одним из таких препаратов является «Абориген» производства «ООО Дарвин» содержащий штаммы микроорганизмов, выделенных из природных естественных ландшафтов с застарелыми разливами на нефтяных месторождениях Ханты-Мансийского и Ямало-Ненецкого автономного округа. На базе Национального Исследовательского Томского Государственного университета и научно-производственной лаборатории компании Дарвин проведены лабораторные исследования, подтвердившие высокую эффективность биопрепарата. Однако пока неизвестно какие именно ферменты и кодирующие их гены ответственны за эту способность в штаммах консорциума «Абориген». Выделение генов, ассоциированы^ с деградацией различных соединений нефти и других органических загрязнителей может помочь в улучшении состава микробного препарата путем получения одного или двух многофункциональных генноинженерных штаммов с множественной активностью.
Целью данной магистерской диссертации является поиск генов ферментов, участвующих в биодеградации фракций нефти (аренов и алканов) и органических загрязнителей (нитрофенол, полихлорбифенил) в штаммах консорциума микроорганизмов «Абориген».
Для выполнения поставленной цели были выделены следующие задачи:
1. Наработка клеточной массы штаммов Pseudomonas sp. 2Н, Bacillus subtiles B10, Acinetobacter calcoaceticus B1318 консорциума «Абориген», ответственных за биодеградацию нефти для получения чистой хромосомной и плазмидной ДНК.
2. Выделение чистой хромосомной и плазмидной ДНК из штаммов конорциума «Абориген».
3. На основе литературных данных подбор оптимальных праймеров для поиска генов ферментов, участвующих в деградации аренов и алканов, а также органических загрязнителей.
4. Анализ наличия нуклеотидной последовательности ферментов участвующих в деградации аренов и алканов CatA, NahH, AlkBв хромосомной и плазмидной ДНК, выделенных из штаммов консорциума «Абориген» Pseudomonas sp. 2Н, Bacillus subtiles B10, Acinetobacter calcoaceticus B1318.
5. Анализ наличия нуклеотидной последовательности ферментов участвующих в биодеградации органических загрязнителей NpcB, BphA4в хромосомной и плазмидной ДНК, из штаммов консорциума «Абориген» Pseudomonas sp. 2Н, Bacillus subtiles B10, Acinetobacter calcoaceticus B1318.

Возникли сложности?

Нужна качественная помощь преподавателя?

👨‍🎓 Помощь в написании
🎓 Дипломные 📘 Магистерские 📙 Диссертации 📗 Курсовые 📝 Статьи 📄 ВКР

✅ Заключение

1. В результате культивирования штаммов биодеградации углеводородов на селективной среде и последующих методов выделения ДНК и очистки с помощью гель- электрофореза получены чистые фракции хромосомной и плазмидной ДНК штаммов Pseudomonas sp. 2Н, Bacillus subtiles B10, Acinetobacter calcoaceticus B1318 консорциума «Абориген».
2. Методом ПЦР выявлены гены ферментов, участвующих в деградации нефти (аренов и алканов) у штаммов 2Н, B10, B1318 консорциума «Абориген». Ген деградации алифатических углеводородов (AlkB)обнаружен в хромосомной ДНК всех исследуемых штаммов. В плазмидной ДНК штаммов B10, 2H и В1318 AlkBне выявлен. Ген деградации ароматических соединений по орто-механизму расщепления кольца (катехол-1,2- диоксигеназа) обнаружен как в плазмидной, так и в хромосомной ДНК всех трёх штаммов. Ген деградации ароматических соединений по мета-механизму расщепления кольца (катехол-2,3-диоксигеназа) обнаружен в штаммах В1318 и В10, только в хромосомной ДНК.
3. Выявлены гены ферментов, участвующих в деградации органических загрязнителей в штаммах 2Н, B10, B1318 консорциума «Абориген» . Во всех исследуемых штаммах обнаружен ген окисления п-нитрофенола. Ген бифенил-2,3-диоксигеназы (BphA4)по результатам ПЦР найден в хромосомной ДНК штаммов B10 и 2H и плазмидной ДНК штаммов B1318 и В10.

Нужна своя уникальная работа?
Срочная разработка под ваши требования
Рассчитать стоимость
ИЛИ
Поиск аналога

📕 Список литературы

1. Auger R. L. Effect of nonionic surfactant addition on bacterial metabolism of naphthalene: Assessment of toxicity and overflow metabolism potential/ R. L.Auger, A. M.Jacobson, M. M.Domach //Journal of hazardous materials. - 1995. - Т. 43. - №. 3. - С. 263¬272.
2. Baboshin M. Conversion of polycyclic aromatic hydrocarbons by Sphingomonas sp. VKM B-2434. / M. Baboshin, V. Akimov, B. Baskunov, T.L. Born, S.U. Khan, L. Golovleva // Biodegradation - 2008 - V.4 - p.567-576.
3. Balashova N.V. Purification and characterization of a salicylate hydroxylase involved in 1-hydroxy-2-naphthoic acid hydroxylation from the naphthalene and phenanthrene-degrading bacterial strain Pseudomonas putida BS202-P1/ N.V. Balashova, A. Stolz, H.J. Knackmuss, I.A. Kosheleva, A.V. Naumov, A.M. Boronin // Biodegradation. - 2001 - V.3 - p.179-188.
4. Baptist J.N. Hydrocarbon oxidation by a bacterial enzyme system. I. Products of octane oxidation. / J.N.Baptist, R.K.Gholston, M. J.Coon // Biochim Biophys Acta. - 1963 - V.69-p.40-47.
5. Barbe V. Unique features revealed by the genome sequence of Acinetobacter sp. ADP1, a versatile and naturally transformation competent bacterium / V. Barbe, D. Vallenet, N. Fonknechten, A. Kreimeyer, S. Oztas, L. Labarre, S. Cruveiller, C. Robert, S. Duprat, P. Wincker, L.N. Ornston, J. Weissenbach, P. Marliere, G.N. Cohen, C.Mddigue // Nucleic Acids Res. - 2004 - V19-p.5766-5779.
6. Bidja Abena M.T. Microbial diversity changes and enrichment of potential petroleum hydrocarbon degraders in crude oil-, diesel-, and gasoline-contaminated soil / M.T. Bidja Abena, G. Chen, Z. Chen, X. Zheng , S. Li , T. Li, W. Zhong. // Biotech. - 2020 -V.2- p.42.
7. Cao B. Biodegradation of aromatic compounds: current status and opportunities for biomolecular approaches/ B. Cao, K. Nagarajan, K.C. Loh // Appl Microbiol Biotechnol. - 2009 - V.85 - p.207-228.
8. Cdbron A. Real-Time PCR quantification of PAH-ring hydroxylating dioxygenase (PAH-RHDalpha) genes from Gram positive and Gram negative bacteria in soil and sediment samples/ A. Cdbron, M.P. Norini, T. Beguiristain, C.Leyval // J Microbiol Methods. - 2008 - V.73 - p.148-59.
9. Cheng Q. Genetic analysis of a gene cluster for cyclohexanol oxidation in Acinetobacter sp. Strain SE19 by in vitro transposition / Q. Cheng, S.M.Thomas, K. Kostichka,
J.R. Valentine, V. Nagarajan // J Bacteriol. - 2000. - V.182.-p.4744-4751.
10. Copley SD. Evolution of a metabolic pathway for degradation of a toxic xenobiotic: the patchwork approach / S.D. Copley // Trends Biochem Sci. - 2000 - V.25-p.261- 265.
11. Dean-Ross D. Metabolism of anthracene by a Rhodococcus species / D.Dean- Ross, J.D. Moody, J.P. Freeman, D.R. Doerge, C.E. Cerniglia // FEMS Microbiol Lett. - 2001 - V.204-p.205-211.
12. Dennis J. J. Complete sequence and genetic organization of pDTG1, the 83 kilobase naphthalene degradation plasmid from Pseudomonas putida strain NCIB 9816-4/ J.
J. Dennis, G. J. Zylstra //Journal of molecular biology. - 2004. - V. 341. - №. 3. - С. 753-768.
13. Denome S.A. Metabolism of dibenzothiophene and naphthalene in Pseudomonas strains: complete DNA sequence of an upper naphthalene catabolic pathway/ S.A. Denome, D.C. Stanley, E.S. Olson, K.D. Young // J Bacteriol. - 1993 -V.175-p.6890-6901.
14. Ecker S. et al. Catabolism of 2, 6-dinitrophenol by Alcaligenes eutrophus JMP 134 and JMP 222 //Archives of microbiology. - 1992. - V. 158. - p. 149-154.
15. Feng, L. Genome and proteome of long-chain alkane degrading Geobacillus thermodenitrificans NG80-2 isolated from a deep-subsurface oil reservoir / L. Feng, W.Wang, J. Cheng, Y. Ren, G. Zhao, C. Gao et al. // Proc Natl Acad Sci USA - 2007 - V.104 - p.5602¬5607.
16. Fuenmayor S.L. A gene cluster encoding steps in conversion of naphthalene to gentisate in Pseudomonas sp. strain U2/ S.L. Fuenmayor, M. Wild, A.L. Boyes, P.A. Williams - J Bacteriol. - 1998 - V180-p.2522-2530.
17. Funhoff E.G. CYP153A6, a soluble P450 oxygenase catalyzing terminal-alkane- hydroxylation / E.G. Funhoff, U. Bauer, I. Garcia-Rubio, B. Witholt, J.B, van Beilen // J Bacteriol - 2006 - V.188 - p.5220-5227.
18. Furukawa K. Cloning of a gene cluster encoding biphenyl and chlorobiphenyl degradation in Pseudomonas pseudoalcaligenes/ K. Furukawa, T. Miyazaki // J Bacteriol. - 1986 - V.166-p.392-398.
19. Furukawa K. Microbial degradation of polychlorinated biphenyls: biochemical and molecular features/ K. Furukawa, H. Fujihara // J Biosci Bioeng. - 2008 - V.105-p.433-449.
20. George, K. W. Bacterial Strategies for Growth on Aromatic Compounds / George,
K. W // Advances in Applied Microbiology - 2011 - V. 74 - p.1-33.
21. Gianfreda L. Laccases: a useful group of oxidoreductive enzymes/ L.Gianfreda, F.Xu, J. M. Bollag //Bioremediation journal. - 1999. - V. 3. - №. 1. - p. 1-26.
22. Gibson D.T. Formation of (+)-cis-2,3-dihydroxy-1-methylcyclohexa-4,6-diene from toluene by Pseudomonas putida / D.T. Gibson, M. Hensley, H.Yoshioka, T.J. Mabry// Biochemistry - 1970 - V.9-p.1626-1630.
23. Gibson, D.T. Microbial Degradation of Aromatic Hydrocarbons / D.T. Gibson, and V.Subramanian // Marcel Dekker - 1984 - New York - p.181-252.
24. Goyal A.K. Genetics of naphthalene and phenanthrene degradation by Comamonas testosterone/ A.K. Goyal, G.J. Zylstra // J Ind Microbiol Biotechnol - 1997 - V.19- p.401-407.
25. Goyal A.K. Molecular cloning of novel genes for polycyclic aromatic hydrocarbon degradation from Comamonas testosteroni GZ39. / A.K. Goyal, G.J. Zylstra //Appl Environ Microbiol. - 1996 - V.62-p.230-236.
26. Groenewegen P.E. Novel degradative pathway of 4-nitrobenzoate in Comamonas acidovorans NBA-10 / P.E.Groenewegen, P. Breeuwer, J.M. van Helvoort, A.A. Langenhoff, F.P. de Vries, J.A. de Bont // J Gen Microbiol. - 1992 - V.138-p.1599-1605.
27. Habe H. Genetics of polycyclic aromatic hydrocarbon metabolism in diverse aerobic bacteria / H.Habe, T.Omori //Bioscience, biotechnology, and biochemistry. - 2003. - V. 67. - №. 2. - p. 225-243.
28. Haigler B. E. Degradation of 1, 2-dichlorobenzene by a Pseudomonas sp./ B.E. Haigler, S. F. Nishino, J. C. Spain //Applied and Environmental Microbiology. - 1988. - V. 54. - №. 2. - p. 294-301.
29. Hara A. Cloning and functional analysis of AlkB genes in Alcanivorax borkumensis SK2/ A.Hara, S.H.Baik, K.Syutsubo, N.Misawa, T.H.Smits, J.B. van Beilen, S.Harayama //Environ Microbiol. - 2004 - V.3-p.191-197.
30. Harayama S. Characterization of five genes in the upper-pathway operon of TOL plasmid pWW0 from Pseudomonasputida and identification of the gene products/ S.Harayama, M. Rekik, M. Wubbolts, K. Rose, R.A. Leppik, K.N. Timmis // J Bacteriol. - 1989 - V.171- p.5048-5055.
31. Harwood, C. S. The P-ketoadipate pathway and the biology of self-identity / C. S. Harwood, R. E. Parales // Annual Review of Microbiology - 1996 - V.50 - p.553-590.
32. Hirose J. Biphenyl/PCB Degrading bph Genes of Ten Bacterial Strains Isolated from Biphenyl-Contaminated Soil in Kitakyushu, Japan: Comparative and Dynamic Features as Integrative Conjugative Elements (ICEs)/ J. Hirose, H. Fujihara, T. Watanabe, N. Kimura, H. Suenaga, T. Futagami, M. Goto, A. Suyama, K.Furukawa // Genes - 2019 - V.10 - p. 404.
33. Jakoncic J. The catalytic pocket of the ring-hydroxylating dioxygenase from Sphingomonas CHY-1/ J. Jakoncic, Y. Jouanneau, C. Meyer, V. Stojanoff // Biochem Biophys Res Commun. - 2007 - V.352-p.861-866.
34. Jouanneau Y. Purification and characterization of a three-component salicylate 1- hydroxylase from Sphingomonas sp. strain CHY-1 / Y. Jouanneau, J. Micoud, C. Meyer // Appl Environ Microbiol. - 2007 - V.73-p.7515-7521.
35. Kim S.I. Proteome analysis of Pseudomonas sp. K82 biodegradation pathways/ S.I. Kim, J.Y. Kim, S.-H. Yun, J.H. Kim, S.-H. Leem, C.-H. Lee// Proteomics - 2004 - V4 - p.3610-3621.
36. Kim Y.H. Analysis of aromatic catabolic pathways in Pseudomonas putida KT 2440 using a combined proteomic approach: 2-DE/MS and cleavable isotope-coded affinity tag analysis / Y.H. Kim, K .Cho, S.H. Yun, J.Y. Kim, K.H. Kwon, J.S. Yoo, S.I. Kim // Proteomics - 2006 - V.6-p.1301-1318.
37. Kitagawa W. A novel p-nitrophenol degradation gene cluster from a gram¬positive bacterium, Rhodococcus opacus SAO101/ W. Kitagawa, N. Kimura, Y. Kamagata// J Bacteriol - 2004 - V.186-p.4894-4902.
38. Kiyohara H. Cloning and characterization of a chromosomal gene cluster, pah, that encodes the upper pathway for phenanthrene and naphthalene utilization by Pseudomonas putida OUS82/ H. Kiyohara, S.Torigoe, N. Kaida, T. Asaki, T. Iida, H. Hayashi, N.Takizawa // J Bacteriol. - 1994 - V.176-p.2439-2443.
39. Laczi K. New Frontiers of Anaerobic Hydrocarbon Biodegradation in the Multi- Omics Era/ K.Laczi, A. Erdeind Kis, A. Szilagyi, N. Bounedjoum, A. Bodor, G.E. Vincze, T. Kovacs, G. Rakhely, K. Perei// Front. Microbiol. - 2020 - V16.-p.590-595.
40. Lenke H. Initial hydrogenation during catabolism of picric acid by Rhodococcus erythropolis HL 24-2 / H.Lenke, H. J. Knackmuss //Applied and Environmental Microbiology. - 1992. - V. 58. - №. 9. - p. 2933-2937.
41. Li, L. Crystal structure of long-chain alkane monooxygenase (LadA) in complex with coenzyme FMN: unveiling the long-chain alkane hydroxylase/ L.Li, X. Liu, W. Yang, F. Xu, W. Wang, L. Feng et al.// J Mol Biol - 2008 - V.376 - p.453-465.
42. Lily M.K. Degradation of Benzo [a] Pyrene by a novel strain Bacillus subtilis BMT4i (MTCC 9447)/ M.K. Lily, A. Bahuguna, K. Dangwal, V.Garg // Braz J Microbiol. - 2009- V.40-p.884-892.
43. Lloyd-Jones, G. Analysis of catabolic genes for naphthalene and phenanthrene degradation in contaminated New Zealand soils/ G.Lloyd-Jones, A. D.Laurie, D. W.Hunter, & R. Fraser// FEMS Microbiology Ecology - 1999 - V.29 - p.69-79.
44. Lu, X. Biodegradation of naphthalene by enriched marine denitrifying bacteria/
X. Lu , T.Zhang, H. H. P. Fang, K. M.Leung, & G.Zhang, // International Biodeterioration & Biodegradation - 2011 - V.65 - p.204-211.
45. Maeng, J.H. Diversity of dioxygenases that catalyze the first step of oxidation of long-chain n-alkanes in Acinetobacter sp. strain M-1 / J.H Maeng, Y. Sakai , T. Ishige, Y.Tani and N. Kato // FEMS Microbiol Lett - 1996 - V. 141 - p.177-182.
46. Marchant R. The degradation of n-hexadecane in soil by thermophilic geobacilli / R. Marchant, F.H. Sharkey, I.M. Banat, T.J. Rahman, A. Perfumo //FEMS Microbiol Ecol. - 2006 - V.56-p.44-54.
47. McKew B. A. Determining the identity and roles of oil-metabolizing marine bacteria from the Thames estuary / B. A. McKew; F.Coulon; A. M.Osborn; K.N. Timmis; T. J. McGenity// UK. Environ Microbiol. - 2007 - V.9-p.165-176.
48. Moody J.D. Degradation of phenanthrene and anthracene by cell suspensions of Mycobacterium sp. strain PYR-1. / J.D. Moody, J.P. Freeman, D.R. Doerge, C.E. Cerniglia //Appl Environ Microbiol. - 2001 - V.67-p.1476-1483.
49. Nakai C. Cloning, DNA sequencing, and amino acid sequencing of catechol 1,2- dioxygenases (pyrocatechase) from Pseudomonas putida mt-2 and Pseudomonas arvilla C-1/ C. Nakai, H. Uyeyama, H. Kagamiyama, T. Nakazawa, S. Inouye, F. Kishi, A. Nakazawa, M. Nozaki //Arch Biochem Biophys. - 1995 - V.321-p.353-362.
50. Nie Y. Diverse alkane hydroxylase genes in microorganisms and environments/
Y. Nie, C.Q. Chi, H. Fang, J.L. Liang, S.L. Lu, G.L. Lai, Y.Q. Tang, X.L. Wu //Sci Rep. - 2014 - V.15-p.4968.
51. Nie Y. Two novel alkane hydroxylase-rubredoxin fusion genes isolated from a Dietzia bacterium and the functions of fused rubredoxin domains in long-chain n-alkane degradation/ Y. Nie, J. Liang, H. Fang, Y.Q. Tang, X.L. Wu //Appl Environ Microbiol - 2011 - V.77-p.7279-7288.
52. Ohtsubo Y. Conjugal transfer of polychlorinated biphenyl/biphenyl degradation genes in Acidovorax sp. strain KKS102, which are located on an integrative and conjugative element/ Y. Ohtsubo, Y. Ishibashi, H. Naganawa, S. Hirokawa, S. Atobe, Y. Nagata, M.Tsuda //J Bacteriol. - 2012 - V.192-p.4237-4248.
53. Olsen R.H. A novel toluene-3-monooxygenase pathway cloned from Pseudomonas pickettii PKO1/ R.H. Olsen, J.J.Kukor, B. Kaphammer //Bacteriol. - 1994 - V.176-p.3749-3756.
54. Ostrem Loss E.M. Bioremediation and microbial metabolism of benzo(a)pyrene /Ostrem Loss E.M. and Yu J.-H. // Molecular Microbiology - 2018 - V.109 - p.433-444.
55. Parales R.E. Aspartate 205 in the catalytic domain of naphthalene dioxygenase is essential for activity / R.E. Parales, J.V. Parales, D.T. Gibson // J Bacteriol. - 1999 - V.182- p.1831-1837.
56. Phale P.S. Metabolic Diversity in Bacterial Degradation of Aromatic Compounds/ P.S. Phale, A. Basu, P.D. Majhi, J. Deveryshetty, C. Vamsee-Krishna, R. Shrivastava // OMICS: A Journal of Integrative Biology - 2007 - V.11 - p.252-279.
57. Procopio L. Transcriptional profiling of genes involved in n-hexadecane compounds assimilation in the hydrocarbon degrading Dietzia cinnamea P4 strain/ L. Procopio, M. de Cassia Pereira e Silva, J.D. van Elsas, L. Seldin // Braz J Microbiol. - 2013 - V.44-p.633- 641.
58. R.Boopathy Trinitrotoluene (TNT) as a sole nitrogen source for a sulfate-reducing bacterium Desulfovibrio sp.(B strain) isolated from an anaerobic digester / R.Boopathy, C. F. Kulpa //Current microbiology. - 1992. - V. 25. - p. 235-241.
59. Ramos J.L. Regulatory circuits controlling transcription of TOL plasmid operon encoding meta-cleavage pathway for degradation of alkylbenzoates by Pseudomonas / J.L. Ramos, N. Mermod, K.N.Timmis //Mol Microbiol. - 1987 - V.3 - p.293-300.
60. Ratajczak A. Alkane hydroxylase from Acinetobacter sp. strain ADP1 is encoded by alkM and belongs to a new family of bacterial integral-membrane hydrocarbon hydroxylases/ A. Ratajczak, W. Geissdorfer, W.Hillen // Appl Environ Microbiol. - 1998 - V.64 - p.1175¬1179.
61. Raymond D. G. M. Microbial metabolism and cometabolism of nitrophenols / D. G. M.Raymond, M. Alexander//Pesticide Biochemistry and Physiology. - 1971. - V. 1. - №. 2. - p. 123-130.
62. Reineke W. Development of hybrid strains for the mineralization of chloroaromatics by patchwork assembly/ W. Reineke //Annu Rev Microbiol. - 1998 - V.52 -p. 287-331.
63. Rentz, J. A. Benzo [a] pyrene degradation by Sphingomonas yanoikuyae JAR02/ J. A. Rentz, P. J.Alvarez & J. L.Schnoor, // Environmental pollution - 2009 - 151(3), 669-677.
64. Rojo F. Degradation of alkanes by bacteria // Environ Microbiol. - 2009 - V.11- p.2477-2490.
65. Ronchel M.C. Retrotransfer of DNA in the rhizosphere/ M.C. Ronchel, M.A. Ramos-Diaz, J.L. Ramos // Environ Microbiol. - 2000 - V.3-p.319-323.
66. Ronson C.W. Symbiosis islands/ C.W. Ronson, M.F. Hynes, J.P. Ramsay, and J.T. Sullivan // Brenner's Encyclopedia of Genetics (2nd edition) - 2013 - Elsevier publishers - pp 598-600.
67. Saito A. A novel phenanthrene dioxygenase from Nocardioides sp. strain KP7: expression in Escherichia coli / A.Saito, T.Iwabuchi, S. Harayama //Journal of Bacteriology. - 2000. - V. 182. - №. 8. - p. 2134-2141.
68. Sakshi. A comprehensive review of metabolic and genomic aspects of PAH- degradation/ Sakshi, A.K. Haritash, // Arch Microbiol - 2022 - V.202 - p.2033-2058.
69. Salamanca, D. Novel cyclohexane monooxygenase from Acidovorax sp. CHX100/ D. Salamanca, R. Karande, A. Schmid, et al. // Appl Microbiol Biotechnol - 2015 - V.99 - p.6889-6897.
70. Seo J.S. Bacterial degradation of aromatic compounds / J.S. Seo, Y.S.Keum, Q.X. Li // Int J Environ Res Public Health. - 2009 - V.6-p.278-309.
71. Shaw J.P. Purification and characterisation of TOL plasmid-encoded benzyl alcohol dehydrogenase and benzaldehyde dehydrogenase of Pseudomonas putida/ J.P.Shaw, S.Harayama // Eur J Biochem. - 1990 - V.191-p.705-714.
72. Shields M.S. Novel pathway of toluene catabolism in the trichloroethylene-degrading bacterium g4 / M.S. Shields, S.O. Montgomery, P.J. Chapman, S.M. Cuskey, P.H. Pritchard // Appl Environ Microbiol. - 1989 - V.55-p.1624-1629.
73. Shields M.S. TOM, a new aromatic degradative plasmid from Burkholderia (Pseudomonas) cepacia G4/ M.S. Shields, M.J. Reagin, R.R.Gerger, R.Campbell, C. Somerville//Appl Environ Microbiol. - 1995 - V.61-p.1352-1356.
74. Shimizu S. Characterization of the 450-kb linear plasmid in a polychlorinated biphenyl degrader, Rhodococcus sp. strain RHA1/ S. Shimizu, H. Kobayashi, E. Masai, M.Fukuda //Appl Environ Microbiol. - 2001 - V.67-2021-2028.
75. Shrivastava R. Purification and characterization of benzyl alcohol-and benzaldehyde-dehydrogenase from Pseudomonas putida CSV86 / R. Shrivastava, A. Basu, P. S. Phale //Archives of microbiology. - 2011. - V. 193. - p. 553-563.
76. Shrivastava, R. Biodegradation of Mono-aromatic Compounds by Bacteria / R. Shrivastava, P.S. Phale // Microorganisms in Environmental Management - 2012 - V.55 - p.97-105.
77. Simon M.J. Sequences of genes encoding naphthalene dioxygenase in Pseudomonas putida strains G7 and NCIB 9816-4/ M.J. Simon, T.D. Osslund, R. Saunders, B.D. Ensley, S. Suggs, A. Harcourt, W.C. Suen, D.L. Cruden, D.T. Gibson, G.J. Zylstra // Gene. - 1993 - V.127 - p.31-37.
78. Simon MJ. Sequences of genes encoding naphthalene dioxygenase in Pseudomonas putida strains G7 and NCIB 9816-4 / M.J. Simon, T.D. Osslund, R.Saunders, B.D. Ensley, S.Suggs, A.Harcourt, W.C. Suen, D.L. Cruden, D.T. Gibson, G.J. Zylstra // Gene - 1993 - V.127 - p.31-37.
79. Smith C.B. Alkane hydroxylase gene (AlkB) phylotype composition and diversity in northern Gulf of Mexico bacterioplankton/ C.B. Smith, B.B. Tolar, J.T. Hollibaugh, G.M. King // Front Microbiol. - 2013 - V.12 - p.370.
80. Smith M.R. The biodegradation of aromatic hydrocarbons by bacteria //Biodegradation. - 1990 - V.2 - p.191-206.
81. Smits, T. H. M. Functional analysis of alkane hydroxylases from Gram-negative and Gram-positive bacteria / T. H. M.Smits, S. B.Balada, B.Witholt, and J. B. van Beilen // J. Bacteriol. - 2002 - V.184 - p.1733-1742.
82. Solyanikova I.P. Dioxygenases of Chlorobiphenyl-Degrading Species Rhodococcus wratislaviensis G10 and Chlorophenol-Degrading Species Rhodococcus opacus 1CP Induced in Benzoate-Grown Cells and Genes Potentially Involved in These Processes/ I.P. Solyanikova, O.V. Borzova, E.V. Emelyanova, E.S. Shumkova, N.V. Prisyazhnaya, E.G. Plotnikova, L.A. Golovleva // Biochemistry (Mosc) - 2016 -V.81 - p.986-998
83. Sota M. Genomic and functional analysis of the IncP-9 naphthalene-catabolic plasmid NAH7 and its transposon Tn4655 suggests catabolic gene spread by a tyrosine recombinase/ M. Sota, H. Yano, A. Ono, R. Miyazaki, H. Ishii, H. Genka, EM. Top, M.Tsuda // J Bacteriol. - 2006 - p.188 - p.4057-4067.
84. Sowada, J. Degradation of benzo [a] pyrene by bacterial isolates from human skin/ J.Sowada, A.Schmalenberger, I.Ebner, A.Luch, T.Tralau // FEMS microbiology ecology - 2014 - V.88 - p.129-139.
85. Stach J. E. M. Enrichment versus biofilm culture: a functional and phylogenetic comparison of polycyclic aromatic hydrocarbon-degrading microbial communities/ J. E. M.Stach, R. G. Burns //Environmental Microbiology. - 2002. - V. 4. - №. 3 - p.12-17.
86. Steffen K.T. Degradation of benzo[a]pyrene by the litter-decomposing basidiomycete Stropharia coronilla: role of manganese peroxidase/ K.T. Steffen, A. Hatakka, M.Hofrichter //Appl Environ Microbiol. - 2003 - V.69 - p.3957-3964.
87. Subashchandrabose S. R. Biodegradation of high-molecular weight PAHs by Rhodococcus wratislaviensis strain 9: Overexpression of amidohydrolase induced by pyrene and BaP/ S. R. Subashchandrabose, K. Venkateswarlu, R. Naidu, M. Megharaj// Science of The Total Environment - V. 651 - p. 813-821.
88. Tancsics A. Sequence analysis of 16S rRNA, gyrB and catA genes and DNA- DNA hybridization reveal that Rhodococcus jialingiae is a later synonym of Rhodococcus qingshengii /A. Tancsics, T. Benedek, M. Farkas, // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. - 2014. - V.64 - p.298-301.
89. Tani, A. Gene structures and regulation of the alkane hydroxylase complex in Acinetobacter sp. strain M-1 / T. Ishige , Y. Sakai and N. Kato // J Bacteriol - 2001 - V.183 - p.1819-1823.
90. Temitayo O. Olowomofe. Degradation of poly aromatic fractions of crude oil and detection of catabolic genes in hydrocarbon-degrading bacteria isolated from Agbabu bitumen sediments in Ondo State / Temitayo O. Olowomofe, J. O. Oluyege, B.I. Aderiye, O. A. Oluwole // AIMS Microbiol. - 2019. - V.5. - p.308-323.
91. Throne-Holst M. Identification of novel genes involved in long-chain n-alkane degradation by Acinetobacter sp. strain DSM 17874 / M. Throne-Holst, A. Wentzel, T.E. Ellingsen, H.K. Kotlar, and S.B. Zotchev // Appl Environ Microbiol - 2007 - V.73- p.3327¬3332.
92. Top E.M. Catabolic mobile genetic elements and their potential use in bioaugmentation of polluted soils and waters/ E.M. Top, D. Springael, N.Boon // FEMS Microbiol Ecol. - 2002 - V.42. - p.199-208.
93. Toussaint A. The biphenyl- and 4-chlorobiphenyl-catabolic transposon Tn4371, a member of a new family of genomic islands related to IncP and Ti plasmids/ A. Toussaint, C. Merlin, S. Monchy, M.A. Benotmane, R. Leplae, M. Mergeay, D. Springael// Appl Environ Microbiol. - 2003 - V.69 - p.4837-4845.

🛒 Оформить заказ

⚡ Работу высылаем в течении 5 минут после оплаты.

🔍 ПОХОЖИЕ РАБОТЫ ПО ТЕМЕ

ПОИСК ГЕНОВ ФЕРМЕНТОВ. УЧАСТВУЮЩИХ В МЕТАБОЛИЗМЕ РАЗЛИЧНЫХ ФРАКЦИЙ НЕФТИ И В ЧАСТНОСТИ НАФТАЛИНА У ШТАММОВ КОНСОРЦИУМА «АБОРИГЕН» Дипломные работы, ВКР биология 2023 г. 4700 руб. ПОИСК НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ГЕНОВ ФЕРМЕНТОВ, УЧАСТВУЮЩИХ В БИОДЕГРАДАЦИИ РАЗЛИЧНЫХ ФРАКЦИЙ НЕФТИ В ПЛАЗМИДНОЙ ДНК ШТАММОВ КОНСОРЦИУМА МИКРООРГАНИЗМОВ «АБОРИГЕН» Магистерская диссертация биология 2025 г. 4960 руб. СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ СТРУКТУРЫ НАСЛЕДСТВЕННОЙ КОМПОНЕНТЫ ПОДВЕРЖЕННОСТИ К БРОНХИАЛЬНОЙ АСТМЕ И ТУБЕРКУЛЕЗУ ПО ГЕНАМ ФЕРМЕНТОВ МЕТАБОЛИЗМА КСЕНОБИОТИКОВ Диссертация биология 2005 г. 500 руб. СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ СТРУКТУРЫ НАСЛЕДСТВЕННОЙ КОМПОНЕНТЫ ПОДВЕРЖЕННОСТИ К БРОНХИАЛЬНОЙ АСТМЕ И ТУБЕРКУЛЕЗУ ПО ГЕНАМ ФЕРМЕНТОВ МЕТАБОЛИЗМА КСЕНОБИОТИКОВ Диссертации (РГБ) медицина 2005 г. 700 руб. Ассоциация полиморфизма генов ферментов антиоксидантной системы с риском развития сердечной недостаточности Дипломные работы, ВКР медицина 2022 г. 4210 руб. ВЛИЯНИЕ ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНОВ ЭНЕРГЕТИЧЕСКОГО ОБМЕНА И АНГИОГЕНЕЗА У ЖЕНЩИН НА РАЗВИТИЕ ПЛОДА Бакалаврская работа биология 2020 г. 3850 руб. Методика геномной оценки резистентности раковых клеток к лекарственной терапии Дипломные работы, ВКР медицина 2018 г. 4600 руб. МОДИФИКАЦИЯ ГЕНОМА РАСТЕНИЙ МЕТОДОМ CRISPR/Cas С ЦЕЛЬЮ ПОЛУЧЕНИЯ СОРТОВ С ВЫСОКИМ СОДЕРЖАНИЕМ АНТОЦИАНОВ Дипломные работы, ВКР биология 2019 г. 4900 руб. Исследование полиморфизма гена nifA у клубеньковых бактерий Дипломные работы, ВКР биология 2018 г. 4470 руб. АЛЛЕЛЬНЫЕ ВАРИАНТЫ ГЕНОВ-КАНДИДАТОВ ПОДВЕРЖЕННОСТИ ТУБЕРКУЛЕЗУ У РУССКОГО НАСЕЛЕНИЯ ЗАПАДНОЙ СИБИРИ Диссертация биология 2005 г. 500 руб.

📎 МАГИСТЕРСКАЯ ДИССЕРТАЦИЯ ПО ПРЕДМЕТУ «БИОЛОГИЯ»

Найдено работ: 357

ТАКСОНОМИЧЕСКАЯ РЕВИЗИЯ ПАУКОВ-ВОЛКОВ ГРУППЫ ВИДОВ ALBOSTRIATA (РОД ALOPECOSA SIMON. 1885) И РОДА MUSTELICOSA ROEWER. 1960 (ARANEAE, LYCOSIDAE) Магистерская диссертация биология 2025 г. 4860 руб. ВЛИЯНИЕ ИШЕМИЧЕСКОГО ИНСУЛЬТА НА ДЛИНУ ТЕЛОМЕР В МОЛОДЫХ И ЗРЕЛЫХ НЕЙРОНАХ У МЫШЕЙ Магистерская диссертация биология 2021 г. 4955 руб. ЭФФЕКТИВНОСТЬ НАГЛЯДНЫХ И ПРАКТИЧЕСКИХ МЕТОДОВ ОБУЧЕНИЯ БИОЛОГИИ В СТАРШИХ КЛАССАХ Магистерская диссертация биология 2021 г. 4970 руб. ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ОПУХОЛЕВЫХ КЛЕТОК РАЗЛИЧНЫХ КЛОНОВ IN VITRO и IN SITU ПРИ РАКЕ МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ Магистерская диссертация биология 2020 г. 4975 руб. Формирование экологической культуры у школьников с учетом национально-культурных особенностей в Республике Тува Магистерская диссертация биология 2019 г. 4840 руб. ИЗУЧЕНИЕ ФИЗИОЛОГИИ НОВЫХ ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ РОДА THERMODESULFOVIBRIO ИЗ ГЛУБИННЫХ ВОДОНОСНЫХ ГОРИЗОНТОВ Магистерская диссертация биология 2022 г. 4885 руб. СОЗДАНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИ МОДИФИЦИРОВАННОЙ КЛЕТОЧНОЙ ЛИНИИ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ РОЛИ ГЕНА МУС В МЕТАСТАЗИРОВАНИИ Магистерская диссертация биология 2023 г. 4865 руб. ГИСТОЛОГИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ОРГАНОВ-МИШЕНЕЙ КРЫС В ПОЗДНЕМ ОНТОГЕНЕЗЕ ПОД ВОЗДЕЙСТВИЕМ КЛЕТОЧНОЙ ТЕРАПИИ Магистерская диссертация биология 2022 г. 4800 руб. ПОИСК НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ГЕНОВ ФЕРМЕНТОВ, УЧАСТВУЮЩИХ В БИОДЕГРАДАЦИИ РАЗЛИЧНЫХ ФРАКЦИЙ НЕФТИ В ПЛАЗМИДНОЙ ДНК ШТАММОВ КОНСОРЦИУМА МИКРООРГАНИЗМОВ «АБОРИГЕН» Магистерская диссертация биология 2025 г. 4960 руб. ИЗУЧЕНИЕ ЛИПОЛИТИЧЕСКИХ МИКРООРГАНИЗМОВ. ПЕРСПЕКТИВНЫХ ДЛЯ ДЕСТРУКЦИИ ОТХОДОВ ЖИВОТНОВОДСТВА Магистерская диссертация биология 2025 г. 4940 руб. РОЛЬ МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗЫ МЕЖКЛЕТОЧНОГО МАТРИКСА ADAMTS1 В ФОРМИРОВАНИИ ИНДИВИДУАЛЬНОЙ РАДИОЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ Магистерская диссертация биология 2021 г. 4845 руб. ВЫДЕЛЕНИЕ И ИЗУЧЕНИЕ УГЛЕВОДОРОДОКИСЛЯЮЩИХ МИКРООРГАНИЗМОВ ДЛЯ РАЗРАБОТКИ БИОПРЕПАРАТОВ Магистерская диссертация биология 2021 г. 4800 руб. ЭВОЛЮЦИЯ ГЕНЕТИЧЕСКОГО ЛАНДШАФТА ОПУХОЛИ МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ ПОД ДЕЙСТВИЕМ РАЗЛИЧНЫХ СХЕМ НЕОАДЪЮВАНТНОЙ ХИМИОТЕРАПИИ Магистерская диссертация биология 2024 г. 4750 руб. ЭКОЛОГИЧЕСКИЕ ТРОПЫ И ИХ РОЛЬ В ЭКОЛОГИЧЕСКОМ ОБРАЗОВАНИИ И ВОСПИТАНИИ ШКОЛЬНИКОВ: ОПЫТ РАЗРАБОТКИ И РЕАЛИЗАЦИЯ Магистерская диссертация биология 2018 г. 4650 руб. СРАВНЕНИЕ СПОРОВО-ПЫЛЬЦЕВЫХ СПЕКТРОВ ЛЕСНОЙ, ЛЕСОСТЕПНОЙ И СТЕПНОЙ ЗОН ЗАПАДНОЙ СИБИРИ Магистерская диссертация биология 2018 г. 4750 руб.
📋 Содержание 📖 Введение ✅ Заключение 📕 Литература 🔍 Похожие 🛒 Купить ⬆️

Оценка стоимости

Это краткая форма заказа. После ее заполнения вы перейдете на полную форму заказа работы

Каталог работ (208326)

Поиск работ


©2026 Cервис помощи студентам в выполнении работ
.