РЕФЕРАТ 4
ВВЕДЕНИЕ 5
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 6
1.1 Выделение штамма Cupriavidus eutrophus B-10646 6
1.2 Культурально-морфологические особенности штамма 6
1.3 Липиды грамотрицательных бактерий и их локализация в клетке 8
1.4 Жирные кислоты 10
1.5 Основные характеристики ПГА 12
1.6 Молекулярно-массовые показатели полимера 14
1.7 Потенциальные источники углерода для синтеза ПГА 15
1.8 Синтез ПГА 16
ГЛАВА 2. Материалы и методы 18
2.1 Объект исследования 18
2.2 Культивирование 18
2.3 Измерение параметров процесса 19
2.4 Получение липидного экстракта из Cupriavidus eutrophus B-10646 20
2.5 Приготовление метиловых эфиров жирных кислот для анализа 21
2.6 ГЖ-МС хроматография метиловых эфиров жирных кислот
экстрагируемых и прочносвязанных липидов 21
2.7 Определение качественного и количественного состава полимера
методом газо-жидкостной хроматографией с МС-детектором 22
2.8 Анализ молекулярно - массового состава полимера 23
2.9 Статистическая обработка данных 23
ЗАКЛЮЧЕНИЕ 24
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ 25
Наиболее перспективными продуцентами для биотехнологического производства биоразрушаемых пластиков являются водородокисляющие бактерии Cupriavidus eutrophus B-10646 (ранее Hydrogenomonas, Alcaligenes, Ralstonia, Wautersia),группа грам-отрицательных факультативных хемолитотрофных аэробных бактерий, способных накапливать полимер до 80 - 90 % на сухое вещество. Прежде всего, перспективность водородокисляющих бактерий определяется их высоким органотрофным потенциалом.
Синтез полигидроксиалканоатов (ПГА) у бактерий может быть связан с метаболизмом липидов, особенно, если в качестве субстратов используются или длинноцепочечные жирные кислоты, или растительные масла.
Бактерии Ralstonia eutrophaотносятся к наиболее изученным организмам в отношении синтеза ПГА, однако данные по составу липидов и жирных кислот весьма ограничены, несмотря на то, что липидный профиль интенсивно используется в хемотаксономии бактерий, а анализ состава жирных кислот является общепризнанным быстрым методом идентификации видов.
Жирные кислоты бактерий являются составляющими компонентами клеточных мембран, которые в первую очередь контактируют и реагируют на все изменения в окружающей среде, поддерживая взаимосвязь между структурой и функцией мембраны, сохраняя оптимальную степень текучести липидных компонентов.
Недавно было показано, что при использовании в качестве субстрата олеиновой кислоты для культивирования C. eutrophus B-10646, происходят значительные изменения в спектре жирных кислот липидов цитоплазматической мембраны. Поэтому изучение влияния различных ростовых субстратов на состав липидов этих бактерий в условиях оптимального роста и накопления ПГА представляется актуальной задачей.
Таким образом был проведен и освоен процесс культивирования бактерии C. eutrophus B-10646 в периодической культуре, исследованы урожай, выходы ПГА, общий жирнокислотный состав липидов. По результатам проведенных исследований были сформулированы следующие выводы:
1. Урожай биомассы и содержание полимера при росте на фруктозе, олеиновой кислоте и смеси фруктозы и олеиновой кислоты с добавлением валерата или пропионата калия были сопоставимы и составляли соответственно 9,3-10,2 г/л и 80-90 % от веса сухой биомассы;
2. Добавление валерата и пропионата калия привело к синтезу сополимера П(3ГБ-со-3ГВ) с включением 3ГВ соответственно 21.2-26.4 мол.% и 14.3-19.5 мол.%;
3. Средневесовая и среднечисловая молекулярная масса П(3ГБ), синтезируемого бактериями при росте на фруктозе, олеиновой кислоте и их смеси составляла соответственно 813 и 274, 775 и 220, 639 и 149 кДа. Средневесовая молекулярная масса сополимеров П(3ГБ-со-3ГВ), полученного на разных субстратах, была сопоставимой с П(3ГБ), однако полидисперсность полимера была более высокой;
4. Содержание внутриклеточных липидов не зависело от используемого субстрата и составляло около 2% от веса сухой биомассы. Жирнокислотный состав внутриклеточных липидов существенно изменялся в зависимости от используемых субстратов. Основные изменения происходили в присутствии в среде с олеиновой кислотой, повышая ее долю в липидах цитоплазматической мембраны до 50% и выше, но не зависели от пропионата и валерата калия.
1. Заварзин Г. А. Водородные бактерии и карбоксидобактерии./ М.: Наука/ 1978, С. 204
2. Андреев Л.В.,Склифас А.Н. О хемотаксономических аспектах липидного обмена бактерий. /В сб. Биохимия и биофизика микроорганизмов. /Межвузовский сб., серия биол., / - Горький - 1977, №5. - С. 3-9
3. Васюренко З.П. Циклопропановые жирные кислоты микроорганизмов/ Успехи современной биологии/1980, в т. 90, №2. - С. 179-192
4. Воронова Е.А. Паничев А.В. Сопоставление спектров жирных кислот бактерий семейства Vibrionaceaeс помощью метода численного анализа./Биохимия и биофизика микроорганизмов./ - Горький - 1983, №II - С.62-68, 107
5. Заварзин Г. А., Жилина Т.Н. Миксобактерии в культурах водородных бактерий /Микробиология/ 1971, том 40 - С. 407-412
6. Акимова Т.Г. Хаскин В.В. /ЮНИТИ-ДАНА/ - 2007. -495с.
7. Калачева Г.С., Трубачев И.Н. Липиды водородных бактерий // В сб.: Хемосинтез в непрерывной культуре. /- Новосибирск/- Наука, 1978. С. 89-96
8. Алимов Е.К. Аствацатурьян А. Т. Биосинтез и окисление жирных кислот нормального строения с нечетным числом атомов С, разветвленных и циклопропановых./Успехи современной биологии/1973, в т. 76, № I (4). - С.34-53
9. Кеслер Т.Г., Вебер М.И., Войтович Я. В. Потребности водородных бактерий на различных источниках азота.//В кн. Непрерывная культура водродокисляющих бактерий как средство биосинтеза белка. //¬Красноярск//- 1974, С. 28-45
10.О'Лири. Липиды микроорганизмов./Молекулярная микробиология./ Мир/- 1977, С.201-239
11. Рубан Е.А. Фосфолипиды и фосфолипазы микроорганизмов. /Успехи микробиологии/-1980, №15-041-67
12. Тагер А. А. Физико-химия полимеров/Тагер А.А. - Москва: Издательство «Химия». - 1968.-500С.
13. Пинчук Л.М., Соколова К.Я. О значении профилей жирных кислот в таксономии энтеробактерий. /Биохимия и биофизика микроорганизмов/ - Горький/-1983, №П, С.53-58
14. Barridge J.K. Shively J.M. Phospholipids of the Thiobacillus./J. Bacteriol.// - 1968, v. 95. P. 2182-2185
15. Gray, G. U. The cyclopropane acids of Salmonella typhimurim./ G. U. Gray.- Biochem. Biophys. Acta, 1969
16.Olyver, I. D. Extrectable lipids of gramnegative marine bacterial: phospholipid composition / I. D. Olyver, R. R. Colwell // International journal of systematic and evolutionary microbiology. - J. Bacteriol., 1973.- V. 23, - P. 442-458
17. Boe B., Gjerde J. The fatty acid patterns in the classification of some representatives of the families Enterobacteriaceace and Vibriaceae./J.Gen.Microbiol./ - 1980, v.116, №1. P.41-49
18. Buyer J.S. Identification of bacteria from single colonies by fatty acid analysis /J. Microb. Meth./ - 2002. V. 48. P. 259-265
19. Calcott P.H., Petty S. Phenotypic variability of lipids of Escherichia coli grow in chemostat culture./PEMS Microbiol. Lett./ - 1980. V.7, № 1, P.23-27
20. Cronan, J.E. Ir. and Rock, C.O. Biosynthesis of membrane lipids. /In Esherichia coli and Salmonella: cellular and molecular biology 2nd ed.,/American Society for Microbiology /- 1996. P. 612-636
21. Dennis D., McCoy M., Stangl A., Valentin H.E., Wu Z. Formation of poly(3- hydroxybutyrate-co-3-hydroxyhexanoate) by PHA synthase from Ralstonia eutropha /J. Biotechnol./ 1998. V. 64. P. 177-186.
22. Embley, T. M. Fatty acid, isopropenoid guinone and polar lipid composition in the classification of Renibacterium selmoninerum / T.M. Embley, N. Goodfellow, B. Austin // J. Appl. Bacteriol.,1983. - V.55, - P. 31-37.
23. Doi Y., Tamaki A., Kunioka M., Soga K. Production of copolyesters of 3- hydroxybutyrate and 3-hydroxyvalerate by Alcaligenes eutrophus from butyric and pentanoic acids / Appl. Microbiol. Biotechnol. /1998. V. 28. P. 330-334.
24. Thiele O.W. The lipids of hydrogen oxidizing bacteria: occurrence of cis- 9,10-methylen hexadecanoic acid in Hydrogenomonas H-16 /Experientia/-1971. V. 27. N 15. P. 1268-1269.
25. Thiele O.W., Dreysel J., Hermenn D. The free lipids of two different strains of hydrogenoxidizing bacteria in relation to their growth phases / Eur. J. Biochem. / - 1972. V. 29. P. 224-236.
26. Thiele O.W., Thiele C. Lipid patterns of various hydrogen oxidizing bacterial species /Biochem. Sys. Ecol/ -1977. V.5. P. 1-6.
27. Galbraith L., Jonsson M.H., Rudhe L. C., Wilkinson S.G. Lipids and fatty acids of Burkholeria and Ralstonia species / FEMS Microbiol. Lett./- 1999. V. 173. P. 359-364.
28. Kalacheva G. S. and Volova T. G. Fatty Acid Composition of Wautersia eutropha Lipids under Conditions of Active Polyhydroxyalkanoates Synthesis /Microbiology./ - 2007. V. 76. No.5. P. 535-540.
29. Grogan D. W., Cronan J.E. Cyclopropane ring formation in membrane lipids of bacteria / Microbiol. Mol. Biol. Rev. /-1977. V. 61. P. 429-441.
30. Lennars W.J. lipid metabolism in the bacteria./Acad.Press/-1967. P175-225
31. Lee S.Y., Choi L., Han K. and Song J.Y. Removal of endotoxin during purification of poly(3-hydroxybutyrate) from gram-negative bacteria / Appl. Environ. Microbiol./- 1999. V.65. P. 2762-2764.
32. Noda I., Green P. R., Satkowski M. M., and Schechtman L. A. Preparation and properties of a novel class of polyhydroxyalkanoate copolymers / Biomacromol. /2005. V. 6. P. 580-586.
33. Rick, P.D. Lipopolysaccharide biosynthesis. In Esherichia coli and Salmonella: cellular and molecular biology ed. Neidhardt, F.C., Ingraham, J.L., Low, K.B., Magasanic, B., Schaechter, M. and Umbarger, H.E. Washington DC: /American Society for Microbiology/- 1987. Vol. 1. P. 648-538.
34. Riedel S.L., Lu J., Stahl U/, Brigham C.J. Lipid and fatty acid metabolism in Ralstonia eutropha: relevance for the biotechnological production of value-added products /Appl. Microbiol. Biotechnol./- 2014. V.98. P.1469-1483
35.Steinbuchel, A. Perspectives for biotechnological production and utilization of biopolymers: metabolic engineering of polyhydroxyalkanoate biosinthesis pathways as a successful example. / A. Steinbuchel.- Biosci./-2001. V. 64. P. 177¬186