Аннотация 2
Перечень условных обозначений 4
Введение 5
1 Обзор литературы 7
1.1 Вирус гепатита С 7
1.2 Генетическое разнообразие вируса гепатита С 9
1.3 Жизненный цикл вируса гепатита С 11
1.4 Иммунный ответ на заражение ВГС 13
1.4.1 Вирус гепатита С и аутофагия 14
1.4.2 Механизмы развития хронической инфекции ВГС 15
1.5 Фиброз печени при вирусном гепатите 16
1.5.1 Морфологическая характеристика фиброза печени 16
1.5.2 Механизмы фиброгенеза 17
1.6 Гены белков систем репарации ДНК 19
1.6.1 TP53BP1 21
1.6.2 ATM 22
1.6.3 Комплекс белков MRN 23
1.6.3.1 MRE11A 24
1.6.3.2 NBS1 24
1.6.4 MLH1 и PMS2 25
2 Материалы и методы 28
2.1 Материалы 28
2.2 Методы 28
2.2.1 Полимеразная цепная реакция 28
2.2.2 Рестрикционный анализ 31
2.2.3 Гель-электрофорез 31
2.2.4 ПЦР в реальном времени 32
2.2.5 Статистическая обработка результатов 33
Список использованных источников и литературы 34
Вирусный гепатит C представляет собой инфекционное заболевание, вызывающее воспаление печени, развивающееся в результате инфицирования вирусом гепатита С (ВГС). По оценкам ВОЗ, в 2019 г. от гепатита С умерли приблизительно 290 000 человек, главным образом в результате цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы. По имеющимся оценкам, хроническим гепатитом C страдают 3,2 миллиона детей и подростков. В Европе от таких осложнений ХВГС ежегодно умирает 170 000 человек. Всего в мире хроническим гепатитом С страдают примерно 58 миллионов человек, при этом ежегодно происходит около 1,5 миллионов новых случаев инфицирования. Это определяет актуальность изучения данной патологии, в том числе и ее генетической основы, а также - прогрессирования фиброза печени, который предшествует развитию цирроза и гепатоцеллюлярной карциномы [Всемирная организация здравоохранения, 2019].
Важно отметить, что эпидемиологические исследования показали, что большинство пациентов не знают о своем положительном статусе антител к ВГС. В отчете Института национальной медицинской академии сказано, что до 75 % пациентов с ХВГС остаются не выявленными. Центры по контролю и профилактике заболеваний в США подсчитали, что лица, родившиеся в 1945-1965 гг., составляют примерно 27 % населения Соединенных Штатов, на них приходится 75 % всех инфекций ВГС и 73 % смертности, связанной с ВГС [Lavanchy, 2011; Sebastiani et al., 2014].
В зависимости от длительности заболевания выделяют острый гепатит С и хронический. Острый гепатит С - ранняя стадия заболевания, длительность которой составляет не более 6 месяцев. У 15-45 % инфицированных в течение шести месяцев после заражения достигается спонтанное излечение. У остальных 55-85 % развивается хроническая инфекция ВГС. При хронической инфекции ВГС риск развития цирроза печени в течение следующих 20 лет составляет от 15 % до 30 % [Всемирная организация здравоохранения, 2019].
У пациентов в острой фазе инфекции ВГС чаще всего проявляются неспецифические признаки и симптомы, которые могут развиться при других вирусных инфекциях печени, например, недомогание, утомляемость, боль в животе, умеренная гепато- и спленомегалия и артралгия. Эти симптомы обычно сохраняются от 2 до 12 недель. В хронической фазе часть больных жалуется на недомогание, тошноту, боль в животе и зуд [Czepiel et al., 2008].
Осложнения хронической инфекции ВГС включают компенсированный и
5
декомпенсированный цирроз печени, гепатоцеллюлярную карциному. Исследования показывают, что треть людей с хронической инфекцией ВГС являются «быстро прогрессирующими» (время от момента заражения до цирроза составляет менее 20 лет), у трети время от момента заражения до цирроза составляет 20-50 лет, и у трети цирроз наступает более чем через 50 лет с момента заражения. Факторами, связанными с прогрессированием заболевания, являются: пожилой возраст, мужской пол, коинфекция ВИЧ, вирусом гепатита В или обеими инфекциями, сопутствующее заболевание печени, чрезмерное употребление алкоголя [Yau et al., 2015; El-Kassas, Awad, 2022].
Продукты генов репарации ДНК участвуют в процессах формирования иммунного ответа и воспаления, что делает их многообещающими кандидатами в гены предрасположенности широкого спектра многофакторных заболеваний, в том числе инфекционных [Reduced isotype ..., 1999; Delineation of the role ..., 2004; A primary immunodeficiency ..., 2007; Human PMS2 ..., 2008]. Вместе с тем гены белков систем репарации ДНК при изучении генетической компоненты подверженности инфекционным патологиям привлекаются достаточно редко [DNA double ..., 2009; Bristol et al., 2017; The mutational landscape ..., 2018; Next generation sequencing ..., 2020; Association between ..., 2019; ].
В связи с этим, целью настоящей работы является изучение вовлеченности генов белков систем репарации ДНК в развитие хронического вирусного гепатита С.
Для достижения данной цели были поставлены следующие задачи:
1. Прогенотипировать популяционную выборку г. Томска по маркерам в генах ATM (rs189037 и rs1801516), NBN (rs709816 и rs1805800), MRE11 (rs473297), TP53BP1 (rs560191), MLH1 (rs1799977), PMS2 (rs1805321).
2. Прогенотипировать выборку пациентов с вирусным гепатитом С по
маркерам в генах ATM (rs189037 и rs1801516), NBN (rs709816 и rs1805800), MRE11 (rs473297), TP53BP1 (rs560191), MLH1 (rs1799977), PMS2
(rs1805321).
3. Оценить ассоциации изученных маркеров с вирусным гепатитом С.
4. Изучить ассоциации проанализированных полиморфных вариантов с патогенетически значимыми при вирусном гепатите С количественными признаками.
