Аннотация
ВВЕДЕНИЕ 3
1 Литературный обзор 5
1.1 Рак яичников 5
1.2 Опухолевое микроокружение 9
1.2.1 Эндотелиальные клетки 10
1.2.2 Опухолеассоциированные фибробласты 11
1.2.3 Клетки иммунной системы 12
1.2.4 Опухолеассоциированные макрофаги 13
1.2.5 Моноциты и опухолевая прогрессия 14
1.3 Химиотерапия на основе препаратов платинового ряда 16
1.3.1 Координационная химия комплексов платины (II) 16
1.3.2 Цисплатин, карбоплатин, оксалиплатин: строение, физико-химические свойства,
механизм активации 17
2 Материалы и методы 21
2.1 Материалы 21
2.2 Методы 21
2.2.1 Клеточная сортировка 21
2.2.2 Выделение РНК 22
2.2.3 Подготовка кДНК библиотек 24
2.2.4 Секвенирование следующего поколения 26
2.2.5 Биоинформатическая обработка данных секвенирования 27
3 Результаты и их обсуждение 30
3.1 Сравнение моноцитов больных РЯ и здоровых доноров 30
3.2 Транскриптомный ландшафт моноцитов 42
3.3 Сравнение транскриптомного профиля моноцитов больных раком яичников, получавших и не получавших химиотерапию на основе препаратов платинового ряда . 58
ЗАКЛЮЧЕНИЕ 64
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ 65
Рак яичников (РЯ) занимает седьмое место по заболеваемости и шестое место по смертности от онкологических заболеваний в мире среди женского населения [1]. Высокие показатели летальности обусловлены тем, что в большинстве случаев заболевание диагностируется на поздних стадия. Стандартом лечения поздних стадий РЯ является первичная циторедуктивная операция, при условии достижения полной циторедукции. Иначе применяют неоадъювантную химиотерапию (НАХТ) на основе препаратов платинового ряда с последующей промежуточной циторедуктивной операцией. Однако, несмотря на циторедуктивный эффект НАХТ, больные РЯ впоследствии развивают рецидив. Одним из ключевых факторов, влияющих на прогрессию рака яичников, является опухолевое микроокружение (ОМ), в котором иммунная система играет важную, а в ряде случаев определяющую роль. Установлено, что инфильтрация опухоли иммунными клетками, в том числе моноцитами и макрофагами, оказывает значительное влияние на развитие и прогрессию заболевания [2]. Особый интерес представляет изучение опухолеассоциированных макрофагов (ОАМ), плотность которых в опухолевой ткани коррелирует с более агрессивным клиническим течением заболевания, снижением общей выживаемости и развитием резистентности к противоопухолевой терапии, включая препараты платины [2,3].
Важным фактором, определяющим поведение ОАМ в опухолевом очаге, является состояние моноцитов крови, которые инфильтрируют в опухоль и являются главным пластическим ресурсом ОАМ. Транскриптомный профиль моноцитов при онкологических заболеваниях существенно отличается от такового у здоровых доноров [4]. Показано, что моноциты онкологических больных с поздними стадиями заболевания в значительной степени стимулируют опухолевый рост, по сравнению с моноцитами больных с ранними стадиями заболевания [5]. Таргетинг моноцитов, как основных предшественников ОАМ в опухолевом микроокружении, остается привлекательной стратегией для увеличения эффективности текущих схем НАХТ и улучшения показателей выживаемости больных РЯ на поздних стадиях.
В настоящей работе впервые методом тотального РНК-секвенирования проведен интегративный транскриптомный анализ моноцитов периферической крови у больных РЯ после НАХТ и без такового. Впервые охарактеризованы молекулярные особенности транскриптомного профиля моноцитов после проведения НАХТ на основе препаратов платины. Выявлены характерные транскриптомные сигнатуры и сигнальные пути, отражающие системные изменения в моноцитах периферической крови под воздействием химиотерапии. Результаты позволят расширить знания о роли моноцитов в формировании ответа опухоли на химиотерапию и открывает новые возможности для поиска прогностических маркеров и создания иммунотерапевтических подходов при лечении РЯ.
Целью данной работы является: путём биоинформатического анализа данных РНК секвенирования выявить ключевые особенности транскриптомного профиля моноцитов у больных раком яичников, леченных и не леченных неоадъювантной химиотерапией на основе препаратов платинового ряда.
Целью данной работы является: путём биоинформатического анализа данных РНК секвенирования выявить ключевые особенности транскриптомного профиля моноцитов у больных раком яичников, леченных и не леченных неоадъювантной химиотерапией на основе препаратов платинового ряда.
Для достижения поставленной целей были поставлены следующие задачи:
1. Определить особенности транскриптомного профиля моноцитов больных раком яичников в отличие от здоровых доноров.
2. Выявить характерные отличия в транскриптомном ландшафте моноцитов больных раком яичников в сравнении с моноцитами больных колоректальным раком, раком молочной железы, раком головы и шеи, раком простаты и здоровых доноров.
3. Охарактеризовать влияние препаратов платинового ряда на транскриптомный профиль моноцитов больных раком яичников.
Данная работа проводилась на базе Лаборатории трансляционной клеточной и молекулярной биомедицины НИ ТГУ
