ИССЛЕДОВАНИЕ ГЕНОТИПИЧЕСКИХ ФАКТОРОВ РИСКА РЕЦИДИВИРОВАНИЯ НЕМЕЛКОКЛЕТОЧНОГО РАКА ЛЕГКОГО

СПИСОК УСЛОВНЫХ СОКРАЩЕНИЙ 3
ВВЕДЕНИЕ 4
1 ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР 6
1.1 Эпидемиология рака легкого 6
1.2 Этиология рака легкого 7
1.3 Гистологическая классификация рака легкого 9
1.4 Патогенез немелкоклеточного рака легкого 11
1.4.1 Патогенез плоскоклеточного рака легкого 11
1.4.2 Патогенез аденокарциномы легкого 14
1.5 Молекулярные маркеры рецидивирования немелкоклеточного рака
легкого 14
1.6 Связь реактивных изменений слизистой бронхов с параметрами
опухолевой прогрессии 17
2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ 19
2.1 Материал исследования 19
2.2 Методы исследования 20
2.2.1 Выделение ДНК 20
2.2.2 Измерение концентрации ДНК 22
2.2.3 Проверка качества ДНК 24
2.2.4 Подготовка ДНК-библиотек 24
2.2.5 Секвенирование 28
2.2.6 Биоинформатическая обработка 28
3 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 29
3.1 Банк ДНК образцов 29
3.2 Банк ДНК-библиотек 32
3.3 Биоинформатическая обработка данных 33
3.4 Генетические нарушения, ассоциированные с высоким риском
рецидивирования немелкоклеточного рака легкого 37
ВЫВОДЫ 40
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ 41

Купить

Рак лёгкого (РЛ) является серьезной медицинской и социальной проблемой, в развитых странах он является наиболее часто встречающейся злокачественной опухолью и является наиболее распространенной причиной смерти от онкологической патологии. Традиционно выделяют два основных гистологических типа РЛ, среди которых наиболее распространён немелкоклеточный рак легкого (НМРЛ), доля которого составляет 85%. В преобладающем большинстве случаев НМРЛ представлен такими формами как плоскоклеточный рак (ПРЛ) и аденокарцинома (АК).
Несмотря на значительные исследования в области молекулярной диагностики и современное разнообразие терапевтических подходов, применяемых при лечении немелкоклеточного рака легкого (НМРЛ), поиск эффективного лечения, предотвращающего опухолевую прогрессию, все еще остается не решенной проблемой. Даже при своевременной диагностике НМРЛ на ранней стадии заболевания, выживаемость больных остается на низком уровне ввиду высокой частоты рецидивирования и гематогенного метастазирования (Siegel R. L. et al., 2019).
Известно, что формированию НМРЛ предшествуют морфологические изменения бронхолегочного эпителия в ряду: базальноклеточная гиперплазия (БКГ) - плоскоклеточная метаплазия (ПМ) - дисплазия I-III степеней и их переходом в карциному in situ (carcinoma in situ, CIS) и далее в инвазивный рак (Kadara H. et al., 2016). Данные типы изменений могут как сочетаться друг с другом, так и встречаться в изолированном состоянии.
Коллективом Томского института онкологии были проведены исследования, позволившие обнаружить значимую ассоциацию между характером предопухолевых изменений в эпителии мелких бронхов и прогрессией НМРЛ. Так, подавляющее число рецидивов наблюдалось у пациентов в тех случаях, когда в отдаленных от опухоли мелких бронхах определялось сочетание БКГ и ПМ в бронхолегочном эпителии - 46,7% случаев (21/45). При других вариантах морфологических изменений бронхиального эпителия рецидив НМРЛ был найден только в 0,8% (1/126) случаев (Панкова О. В., 2018). У больных НМРЛ без морфологических изменений в слизистой оболочке бронхов рецидивы не выявлялись. Таким образом, наличие сочетания БКГ и ПМ в бронхолегочном эпителии указывает на высокий, а отсутствие респираторных изменений - на низкий риск рецидивирования НМРЛ.
В настоящей работе мы акцентировали внимание на анализе конститутивных генотипических особенностей, предрасполагающих к развитию рецидивирования. Генотипирование пациентов с наличием БКГ, сочетанной с ПМ и, соответственно, высоким риском рецидивирования позволит идентифицировать геномные регионы, полиморфные варианты и вариации числа копий ДНК, которые предопределяют риск развития данного вида опухолевой прогрессии при НМРЛ.
Целью исследования является идентификация полиморфных вариантов, ассоциированных с рецидивированием немелкоклеточного рака легкого
Задачи:
1. Провести сравнительный анализ частоты полиморфных вариантов у больных немелкоклеточным раком легкого с высоким и низким риском рецидивирования.
2. Выявить полиморфные варианты и гены, ассоциированные с высоким риском рецидивирования немелкоклеточного рака легкого.
3. Дать функциональную характеристику полиморфным вариантам и генам, ассоциированным с высоким риском рецидивирования немелкоклеточного рака легкого.
Работа была выполнена на базе НИИ онкологии Томского НИМЦ под руководством научного сотрудника лаборатории биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Томского НИМЦ, кандидата медицинских наук Геращенко Татьяны Сергеевны.

Купить