Тип работы:
Предмет:
Язык работы:


Выявление хромосомных аббераций и эпигенетических мутаций у детей при острых лейкозах

Работа №18866

Тип работы

Бакалаврская работа

Предмет

биология

Объем работы43
Год сдачи2017
Стоимость4900 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
824
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


ВВЕДЕНИЕ 4
ОСНОВНАЯ ЧАСТЬ 7
1. Обзор литературы 7
1.1 Классификация лейкозов 7
1.2 Генетичекая основа развития Острых Лейкозов 9
1.3 Транслокация t (12;21) (p13;q22), TEL - AML1 10
1.4 Транслокация t(8;21)(q22;q22), AML1 - ETO 12
1.5 Транслокация t(1;19) (q23; p13) E2A (TCF3) 13
1.6 Минимальная остаточная болезнь (МОБ) 14
1.7 Экспрессия гена WT1 для определения МОБ 16
1.8 JAK2-STAT Сигнальный путь 18
2. Материалы и методы 21
2.1 Объект исследования 21
2.2 Выделение лейкоцитов из костного мозга 21
2.3 Выделения РНК из лейкоцитов костного мозга с помощью комплекта
реагентов «РИБО-золь-О»(ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии») 22
2. 4 Измерение концентрации РНК 23
2.5 Проведение Обратной транскрипции 25
2.6 Проведение первого этапа ПЦР 26
2.7 Проведение второго этапа ПЦР 29
2.8 Проведение гибридизации на биологическом микрочипе «ЛК-
БИОЧИП» 30
2.9 Определение уровня экспрессии WT1 и JAK с использованием метода
ПЦР - РВ 32
2.10 Статистическая обработка полученных результатов 36
3. Результаты и обсуждения

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ 44
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ 45

К числу распространенных онкологических заболеваний относятся лейкозы, которые занимают ведущее место в структуре онкологических заболеваний среди детей в возрасте до 15 лет и составляют 30 - 35% всех злокачественных опухолей.
Лейкоз - это клональное злокачественное (неопластическое) заболевание кроветворной системы, к которому относится обширная группа заболеваний, различных по своей этиологии, и характеризующихся повышенным содержанием морфологически незрелых - бластных - клеток крови, которые с одной стороны, не выполняют нормальные функции зрелых клеток, а с другой - за счет активной пролиферации вытесняют нормальные клетки- предшественники. Характерной особенностью лейкозов является быстрое распространение опухолевых клеток крови по кровеносному руслу во внутренние органы и селезенку. В норме в костном мозге располагаются стволовые клетки крови, которые обладают способностью к дифференцировке и выполнению специализированных функций в организме. Из этих стволовых клеток развиваются все разновидности форменных элементов крови. При лейкозах, кровяные клетки способны размножаться на более поздних стадиях гемопоэза, чем в норме. Опухолевые клетки начинают неуемно размножаться и замещают нормальные клетки костного мозга и крови.
Весь комплекс кроветворения можно разделить на два направления (ростка): лимфопоэз (образование лимфоцитов) и миелопоэз (образование остальных типов клеток крови). В зависимости от того какой росток кроветворения поражен, лейкозы делятся на лимфоидныеные (лимфобластные) и миелоидные (миелобластные). По клиническому течению лейкозы делятся на: острые и хронические.
Заболеваемость острыми лейкозами детей в России стабильна и составляет 3,17 ± 0,39, показатель смертности от них составляет 1,67 ± 0,28 случая на 100 тыс. Так на острый лимфобластный лейкоз приходится 80%
случаев заболевания, прежде всего среди детей в возрасте 1 - 4 лет, на острый миелоидный лейкоз - 17% случаев.
Острые лейкозы по своей природе являются клональным заболеванием, то есть возникают из одной мутировавшей кроветворной клетки, которая может относиться как к уже дифференцированным (коммитированным) в строну различных линий кроветворения клеткам - предшественницам, так и к очень ранним клеткам. Развитие Острых Лейкозов ассоциировано с хромосомными абберациями. Хромосомные абберации характерны для опухолевых клеток: они обнаружены во всех основных типах злокачественных опухолей. На сегодняшний день насчитывается 57709 видов хромосомных аберраций. С развитием острых лейкозов связана такая хромосомная аберрация, как транслокация, при которой происходит перенос участка хромосомы на негомологичную хромосому, что в результате приводит к образованию химерного транскрипта и продуцированию химерного белка. Наличие определенных химерных транскриптов, образующихся в результате хромомсомных аберраций, могут быть использованы в качестве оценки эффективности терапии и прогнозирования гематологического рецидива.
Одним из важных методов, помогающих оценивать уменьшение уровня опухолевых клеток в костном мозге, является МОБ , под которым понимают популяцию опухолевых клеток, оставшуюся в организме после достижения клинико - гематологической ремиссии (когда количество бластных клеток в миелограмме менее 5% т.е. количество клеток не распознаваемых стандартными цитологическими методами). Мониторинг МОБ одновременно может служить нескольким целям: оценке эффективности терапии, сравнению различных лечебных протоколов, контролю за сохранением ремиссии и максимально раннему обнаружению рецидивов для своевременной коррекции тактики лечения. Количественная диагностика МОБ важна практически на всех стадиях лечения ОЛ. Для определения МОБ при ОЛ в последние годы стали применять экспрессию гена WT1, занимающего важное место в гемопоэзе, которое связано с регуляцией пролиферацией и дифференцировкой клеток.
В норме многие гены не экспрессируются, а степень экспрессии имеет высокую индивидуальную вариабельность. Экспрессия гена JAK2 приводит к образованию белка JAK2, участвующего в пролиферации и дифференцировки бластных клеток - предшественниц. В литературе описаны случаи повышения экспрессии не мутантного (дикого типа) JAK2 у взрослых с ОМЛ. У детей с ОМЛ и ОЛЛ оценка экспрессии JAK2 не проводилась.
Исходя из вышесказанного, целью данной работы явилось выявление химерных транскриптов и определение уровня экспрессии генов WT1 и JAK2 у детей с диагнозом острым лейкозом.
Для достижения поставленной цели были сформулированы следующие задачи:
1. Проанализировать хромосомные транслокации в лейкоцитах аспирата костного мозга пациентов - детей с диагнозом Острый лейкоз.
2. Оценить уровень экспрессии генов WT1 и JAK2 в лейкоцитах аспирата костного мозга пациентов - детей с ОМЛ по сравнению с ОЛЛ.
3. Провести анализ зависимости уровня экспрессии от наличия исследуемых транслокаций.
Работа выполнялась в Красноярском филиале ФГБУ Гематологического научного центра Минздрава России и КГБУЗ Красноярского краевого клинического центра охраны материнства и детства.

Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь студентам в написании работ!


1. Морозова, В. Т. Хронические лейкозы / В. Т. Морозова // Клиническая лабораторная диагностика. - 2000. - Т. 12 -С. 25 - 32.
2. Коцкая, Н. Н. Медико-статистические характеристики и комплексная оценка результатов лечения острых лимфоблостных лейкозов у детей / Н. Н. Коцкая // Сибирское медицинское обозрение. - 2011. - Т. 72. - С. 9-13.
3. Рулина, А. В. Активированные лейкозные онкогены AML1-ETO и C-KIT: роль в развитии острого миелоидного лейкоза и современные подходы к их ингибированию / А. В. Рулина, П. В. Спирин, В.С. Прасолов // Успехи биологической химии. - 2010. - Т. 50. - С. 349-386.
4. James, W. The 2008 revision of theWorld Health Organization (WHO) classification of myeloid neoplasms and acute leukemia: rationale and important
changes / W. James, A. Daniel. BLOOD. - 2009. -V.114. - 45 p.
5. Цаур, Г. А. Мониторинг химерных транскриптов с участием гена MLL для оценки прогностического значения минимальной остаточной болезни при остром лимфобластном лейкозе у детей первого года жизни, получающих терапию по протоколу mll-baby / Г. А. Цаур, А. М. Попов, Т. В. Наседкина // Издательство "Медицина". - 2012. - T. 57. - С. 27.
6. .Цаур, Г. А. Время достижения молекулярной ремиссии как фактор прогноза у детей первого года жизни с острым лимфобластным лейкозом / Г. А. Цаур,Т. В. Наседкина, А. М. Попов // Онкогематология. - 2010. - T. 2. - С. 46¬54.
7. Мамаев, Н.Н. Гиперэкспрессия гена WT1 при злокачественных опухолях системы крови: теоретические и клинические аспекты (обзор
литературы.). / Н. Н. Мамаев, Я. В. Гудожникова, А. В. Горбунова // Онкошематологи. - 2016. - T. 9. - C. 257 - 259.
8. O'Sullivan, J. M.. JAK-STAT signaling in the therapeutic landscape of myeloproliferative neoplasms / J. M. O'Sullivan , C. N. Harrison // Molecular and cellular endocrinology. - 2017. - V. 71 - 79 p.
9. . Carter - Su, C. Role of the tyrosine kinase JAK2 in signal transduction by growth hormone / С. Carter - Su, L. Rui, J. Herrington. // Pediatr Nephrol. - 2000. - V. 14. - 550 p.
10. James, W. Vardiman. The 2008 revision of the World Health Organization (WHO) classification of myeloid neoplasms and acute leukemia:
rationale and important changes / Vardiman W. James, Т. Ju'ergen // BLOOD. - 2009. - T. 114. - 937 р.
11. Маколкин, В. И. Внутренние болезни. / В. И. Маколкин, С. И. Овчаренко, В. А. Сулимов // Учебник.. - 2012. - T. 6. - С. 768.
12. Мухина, Н. А. Внутренние болезни / Н.А. Мухина, В.С. Моисеева, А.И. Мартынова //Учебник. - 2010. -Т. 2. - С. 1256.
13. Четвертина, Е. В. Наноколонии и диагностика онкологических заболеваний, ассоциированных с хромосомными транслокациями / Е. В. Четвертина, А. Б. Четвертин // Успехи биологической химии. - 2010. - Т. 50. - С. 387-446.
14. Воробьев, А. И. Руководство по гематологии. / А.И Воробьев, Ю. Н. Андреев, З. С. Баркаган //Издательство "Ньюдиамед". - 2005. - Т. 5. - С. 413
15. Krzysztof, M. Cytogenetics and Molecular Genetics of Acute Lymphoblastic Leukemia / M. Krzysztof, David P. Harper // Hematol Oncol Clin North Am. - 2009. - T. 23. - 991 p.
16. Dombret, Н. Gene mutation and AML pathogenesis/ H. Dombret // Blood. - 2016. - V. 127. - 29-41 p.
17. Reikvam, H. Acute Myeloid Leukemia with the t (8;21) Translocation: Clinical Consequences and Biological Implications / H. Reikvam, Kimberley J. H. , Astrid O. K. // Journal of Biomedicine and Biotechnology. - 2011. - V. 2011. - 23 p.
18. Калинина, И. И. Клинические и генетические особенности острого миелоидного лейкоза с t(8;21) у детей и результаты терапии по протоколу ОМЛ-ММ-2000 / И. И. Калинина, М. М. Шнейдер, Н. П. Кирсанова, // Онкогематология. - 2011. - T. 1. - С. 11 - 18.
19. Tirado, Carlos. A (1;19) translocation involving TCF3-PBX1 fusion within the context of a hyperdiploid karyotype in adult B-ALL: a case report and review of the literature / Carlos Tirado, David Shabsovich // Biomarker Research. -
2015. - 269-278 p.
20. Цаур, Г. А. Исследование минимальной остаточной болезни при острых лейкозах у дете й первого года жизни. / Г. А. Цаур, А. М. Попов, Л. Г. Фетчина // Методические рекоминдации. - 2014. - С. 47.
21. . Цаур, Г. А. Методические основы диагностики и мониторинга минимальной остаточной болезни при острых лейкозах у детей первого года жизни / Г. А. Цаур, А. М. Попов, Л. Г. Фечина // Онкогематология. - 2016. - Т. 11. - С. 16.
22. Цаур, Г. А. Сравнение результатов определения минимальной остаточной болезни в периферической крови и костном мозге у детей 1-го года жизни с острым лимфобластным лейкозом. Клиническая лабораторная диагностика / Г. А. Цаур, Т. О. Ригер, А. М. Попов // Клиническая лабораторная диагностика. - Т. 60. - С. 15.
23. Дагбашян, С. С. Мониторинг минимальной остаточной болезни в гематологической клинике. / С. С. Дагбашян, Л. С. Саакян, А. Г. Захарян // Научно - практический журнал Кровь . - 2013. - С. 44 - 52.
24. Campana, D. Role of minimal residual disease monitoring in adult and pediatric acute lymphoblastic leukemia / D. Campana // Hematol. Oncol. Clin.
North. Am. - 2001. - T. 23. - 1083-1098 p.
25. Szczepanski, T. Why and how to quantify minimal residual disease in acute lymphoblastic leukemia? / T. Szczepanski // Leukemia. - 2007. - V. 21. - 622¬626 p.
26. Morrison, Avril A. New insights into the function of the Wilms tumor suppressor gene WT1 in podocytes / A. Avril. Morrison, R. Rebecca Viney, Moin A. Saleem// American Journal of Physiology. - 2008. - V. 295. - 681- 692 p.
27. Smith, Shirley I. Expression of the Wilms' Tumor Suppressor Gene, WT1, Is Upregulated by Leukemia Inhibitory Factor and Induces Monocytic Differentiation in M1 Leukemic Cells / Shirley I. Smith, Dominique Weil, Gregory R. Johnson // BLOOD. - 1998. - V. 91. - 764-773 p.
28. Rampal, Raajit. Wilms tumor 1 mutations in the pathogenesis of acute myeloid leukemia. / Raajit Rampal, Maria E. Figueroa // Haematologica. - 2017. - 672-679 p.
29. Бодиенкова, Г. М. Роль полиморфизма и экспрессии отдельных
генов цитокинов в формировании патологии.
Успехисовременногоестествознания / Г. М. Бодиенкова, Ж. В. Титова // Успехи современного естествознания. - 2015. - T. 1. - С. 617.
30. Rawlings, Jason S. The JAK/STAT signaling pathway / Jason S. Rawlings, Kristin M. Rosler, Douglas A. Harrison // Journal of Cell Science - 2004. - 1281-1283 p.
31. Bench, Anthony J. Molecular diagnosis of the myeloproliferative neoplasms: UK guidelines for the detection of JAK2 V617F and other relevant mutations / Anthony J. Bench, Helen E. White, Letizia Foroni // British Journal of Haematology. - 2013. - V. 160. - 25 - 34 р.
32. Соколова, Н. А. Изменения в представлении о патогенезе Ph- негативных миелопролиферативных заболеваний / Н. А. Соколова, М. И. Савина // Молодой ученый. - 2011. - Т. 2. - С. 216 - 219.
33. Tamotsu, Irino. JAK2 V617F-Dependent Upregulation of PU.1 Expression in the Peripheral Blood of Myeloproliferative Neoplasm Patients / Irino Tamotsu, Uemura Munehiro, Yamane Humitsugu // PLoS One. - 2011. - V. 7. - 148 p.
34. Ребриков, Д. В. ПЦР «в реальном времени» / Д. В. Ребриков, Г. А. Саматов, Д. Ю. Трофимов // Бином. Лаборатория знаний. - 2009. - Т. 2. - С. - 226.
35. Полимеразная цепная реакция. Biomir. [В Интернете] [Цитировано: 23 Сентябрь 2014 г.] http://biomir.blogspot.ru/2012/02/blog-post_5633.html.
36. Higuchi, R. Kinetic. PCR Analysis: Real-time monitoring of DNA amplification reactions / Kinetic R. Higuchi // Biotechnology. - 1993. - Т. 11. - 1026-1030 p.
37. Руководство по рименению. ООО БИОЧИП-ИМБ "ЛК-БИОЧИП". [В Интернете] [Цитировано: 23 Сентябрь 2015 г.] http: //www.biochip- imb.ru/attachments/article/
38. Грядунов, Д. А. Технология гидрогелевых биочипов и ее применение в медицинской лабораторной диагностике / Д. А. Грядунов, Д. В. Зименков, Т. В. Наседкина // Лаборатория. - 2009. - Т. 3. - С. 10 - 14.
39. Чечеткин, В. Р. Биочипы для медицинской диагностики / В. Р. Чечеткин, Д. В. Прокопенко, А. А. Макаров // Российские нанотехнологии. - 2006. - Т. 1. - С. 13 - 27.
40. Organista-Nava, Jorge. Survival of Patients With Acute Lymphoblastic Leukemia / Jorge Organista-Nava, Yazmrn Gomez-Gomez , Berenice Illades-Aguiar // Published: April 17. - 2013.
41. Reikvam, Hakon. Acute Myeloid Leukemia with the t(8;21) Translocation: Clinical Consequences and Biological Implications / Hakon Reikvam, Kimberley Joanne Hatfield, Astrid OlsnesKittang // Journal of Biomedicine and Biotechnology. - 2011. - V. 20. - 23 p.
42. Ilencikova, Denisa. MLL Gene Alterations in Acute Myeloid Leukaemia (11q23/MLL+ AML. / Denisa Ilencikova, Alexandra Kolenova // Oncogene and Cancer - From Bench to Clinic". - 2013.
43. Воробьев, А.И. Руководство по гематологии. / А.И Воробьев, Ю.Н.Андреев, З.С Баркаган // Издательство "Ньюдиамед". - 2005. - Т. 3. - С. 413.
44. Grimwade, D. Refinement of cytogenetic classification in acute myeloid leukemia: determination of prognostic significance of rare recurring chromosomal abnormalities among 5876 younger adult patients treated in the United Kingdom Medical Research Council trials/ D. Grimwade , Hills RK, Moorman AV, Walker H // Blood. - 2010. - 354 p.


Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.




©2024 Cервис помощи студентам в выполнении работ