Представленный материал является образцом учебного исследования, примером структуры и содержания учебного исследования по заявленной теме. Размещён исключительно в информационных и ознакомительных целях.
Workspay.ru оказывает информационные услуги по сбору, обработке и структурированию материалов в соответствии с требованиями заказчика.
Размещение материала не означает публикацию произведения впервые и не предполагает передачу исключительных авторских прав третьим лицам.
Материал не предназначен для дословной сдачи в образовательные организации и требует самостоятельной переработки с соблюдением законодательства Российской Федерации об авторском праве и принципов академической добросовестности.
Авторские права на исходные материалы принадлежат их законным правообладателям. В случае возникновения вопросов, связанных с размещённым материалом, просим направить обращение через форму обратной связи.
ℹ️Настоящий учебно-методический информационный материал размещён в ознакомительных и исследовательских целях и представляет собой пример учебного исследования. Не является готовым научным трудом и требует самостоятельной переработки.
Перечень сокращений 4
ВВЕДЕНИЕ 5
1. Литературный обзор 7
1.1 Микроорганизмы микробиома животных, особенности изучения 7
1.1.1 Молекулярные методы как инструмент для исследования микробного
разнообразия 8
1.1.2 Современные подходы для культивирования и описания
микроорганизмов 9
1.2 Представители класса Limnochordia 13
1.2.1 Класс Limnochordia,распространение 17
2. Материалы и методы 19
2.1 Объекты исследования 19
2.2. Методы культивирования анаэробных микроорганизмов 19
2.3 Аналитические методы исследования и статистическая обработка данных
22
Список использованной литературы 34
📖 Введение
Высокопроизводительное секвенирование, метагеномика и биоинформатический анализ широко используют в микробиологических исследованиях (Shi et al., 2022). Количество и разнообразие микроорганизмов (м/о), описанных с помощью молекулярных методов неуклонно растет, однако большинство из них не имеют культивируемых представителей и не поддается культивированию in vitroс использованием стандартных методов. Несмотря на это, анализ молекулярных баз данных помимо представления о структуре генома позволяет получить информацию о метаболических возможностях и особенностях, а также об активности и структуре сложных микробных сообществ (Gutleben et al., 2017) Метагеномные данные и профилирование по гену 16S рРНК часто служат ключом к поиску целевого организма, а геномная информация позволяет облегчить подбор условий культивирования. Наличие чистых культур необходимо для подтверждения данных полученных из генома о физиологии и клеточной биологии. Также культивируемые микроорганизмы нужны для понимания их экологической роли, патогенности. Кроме того, межвидовые взаимодействия, эволюционные принципы, динамика популяций могут быть экспериментально подтверждены только при наличии изолятов. Наконец, стабильные культуры прокладывают путь к применению в биотехнологии, например, в поисках новых биоактивных соединений и их производства, биоремедиации и экосистемной инженерии (Gutleben et al., 2017).
Отходы сельского хозяйства содержат микроорганизмы, обладающие значительным потенциалом для использования в биотехнологии. Большинство микробиологических исследований сельского хозяйства, сосредоточены на оценке биоразнообразия, а данные о нем получены с использованием метогеномного анализа, биоинформатических методов и секвенирования. Однако молекулярный и биоинформатический подходы не позволяют полностью оценить функциональную и метаболическую активность, для этого необходимо наличие in vitroчистых культур или ко-культур микроорганизмов.
Представители класса Limnochordiaзарегистрированы в различных поверхностных биотопах, в том числе в термофильном компосте, навозе крупного рогатого скота (Karnachuk et al., 2024). Limnochordiaявляется основным бактериальным компонентам для разложения лигноцеллюлозной биомассы, благодаря наличию гидролаз.
Цель исследования: выделение и изучение новых представителей Geochorda,ассоциированных с микробиомом редких сельскохозяйственных животных.
Для достижения цели были поставлены следующие задачи:
1. Получить накопительные культуры представителей Geochordaиз проб компоста и фекалий маралов (Cervus elaphus).
2. Выделить чистые культуры представителей Geochorda.
3. Определить оптимальные и предельные значения физико-химических факторов для штаммов Geochorda sp. 1819, Geochorda sp. 1850, Geochorda sp. 1853, Geochorda sp. 1864.
4. Изучить спектр доноров и акцепторов используемых штаммами Geochorda sp. 1819, Geochorda sp. 1850, Geochorda sp. 1853, Geochorda sp. 1864.
Работа проведена в Лаборатории биохимии и молекулярной биологии при кафедре Физиологии растений, биотехнологии и биоинформатики Национального Исследовательского Томского государственного университета (НИТГУ).
Автор выражает благодарность научному руководителю кандидату биологических наук, Анастасии Петровне Лукиной за научное руководство, помощь в постановке экспериментов и обсуждение результатов.