📄Работа №184478
Тема: СТРУКТУРА ГЕНОФОНДА ШОРЦЕВ И ХАКАСОВ ПО АУТОСОМНЫМ STR-МАРКЕРАМ И МАРКЕРАМ У-ХРОМОСОМЫ
Характеристики работы
Тип работы
Главы к дипломным работам
Предмет
Биология
Объем:
48 листов
Год:
2017
Просмотров:
79
3000
руб.
🛒 Купить работу
Не подходит эта работа?
Закажите новую по вашим требованиям
Узнать цену на написание
Закажите новую по вашим требованиям
Представленный материал является образцом учебного исследования, примером структуры и содержания учебного исследования по заявленной теме. Размещён исключительно в информационных и ознакомительных целях.
Workspay.ru оказывает информационные услуги по сбору, обработке и структурированию материалов в соответствии с требованиями заказчика.
Размещение материала не означает публикацию произведения впервые и не предполагает передачу исключительных авторских прав третьим лицам.
Материал не предназначен для дословной сдачи в образовательные организации и требует самостоятельной переработки с соблюдением законодательства Российской Федерации об авторском праве и принципов академической добросовестности.
Авторские права на исходные материалы принадлежат их законным правообладателям. В случае возникновения вопросов, связанных с размещённым материалом, просим направить обращение через форму обратной связи.
Настоящий учебно-методический информационный материал размещён в ознакомительных и исследовательских целях и представляет собой пример учебного исследования. Не является готовым научным трудом и требует самостоятельной переработки.
📋 Содержание
ВВЕДЕНИЕ 4
Глава 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 6
1.1 Строение Y-хромосомы и использование её маркеров в популяционной генетике 6
1.2 Микросателлиты 7
1.3 Этногенез шорцев 10
1.4 Шорские сеоки 11
1.5 Этногенез хакасов 14
1.6 Хакасские сеоки 16
Глава 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 21
2.1 Материал исследования 21
2.2 Методы исследования 22
2.2.1 Выделение ДНК 22
2.2.2 Спектрофотометрическое определение качества выделенной ДНК 22
2.2.3 Маркеры, использованные для характеристики генетического разнообразия 23
2.2.4 Генотипирование ДНК -маркеров 44
2.2.5 Статистическая обработка данных 45
Глава 3 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 47
3.1 Состав и структура генофонда шорцев по маркерам Y -хромосомы 47
3.2 Генетическое разнообразие шорцев 49
3.3 Генетическая дифференциация популяций 50
3.4 Генетические взаимоотношения между популяциями 53
3.5 Филогенетический анализ гаплогруппы N1 a1a2a 54
3.6 Филогенетический анализ гаплогруппы R1a1a1h-Z93 55
3.7 Генетическая структура шорских сеоков 56
ВЫВОДЫ 66
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 67
... отсутствует 3 раздел
Глава 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 6
1.1 Строение Y-хромосомы и использование её маркеров в популяционной генетике 6
1.2 Микросателлиты 7
1.3 Этногенез шорцев 10
1.4 Шорские сеоки 11
1.5 Этногенез хакасов 14
1.6 Хакасские сеоки 16
Глава 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 21
2.1 Материал исследования 21
2.2 Методы исследования 22
2.2.1 Выделение ДНК 22
2.2.2 Спектрофотометрическое определение качества выделенной ДНК 22
2.2.3 Маркеры, использованные для характеристики генетического разнообразия 23
2.2.4 Генотипирование ДНК -маркеров 44
2.2.5 Статистическая обработка данных 45
Глава 3 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 47
3.1 Состав и структура генофонда шорцев по маркерам Y -хромосомы 47
3.2 Генетическое разнообразие шорцев 49
3.3 Генетическая дифференциация популяций 50
3.4 Генетические взаимоотношения между популяциями 53
3.5 Филогенетический анализ гаплогруппы N1 a1a2a 54
3.6 Филогенетический анализ гаплогруппы R1a1a1h-Z93 55
3.7 Генетическая структура шорских сеоков 56
ВЫВОДЫ 66
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 67
... отсутствует 3 раздел
📖 Введение
Современный этнический состав коренного населения Южной Сибири является результатом длительных исторических и этногенетических процессов. Смешение народов различной расовой и языковой принадлежности, возрастание подразделённости популяций из-за географической изоляции, религиозных и культурных традиций стало причиной антропологического и генетического разнообразия современных народов Сибири (Лавряшина М.Б. и др., 2010).
С использованием полиморфных ДНК-маркеров анализируют геномное разнообразие современных популяций человека, генетические особенности этносов, а также изучают исторические взаимоотношения народов. Несмотря на то, что в настоящее время для изучения структуры и истории генофонда наиболее актуально полногеномное секвенирование, маркеры нерекомбинирующей части Y-хромосомы (NRY) всё ещё активно используются, так как они позволяют решать целый ряд вопросов популяционной генетики (описывать дифференциацию, разнообразие, филогенетические
взаимоотношения). Актуальными являются популяционные исследования, использующие высоко вариабельные маркеры STR для определения гаплотипов NRY. Один из наиболее результативных методов изучения популяционно -генетического разнообразия человека - иерархический анализ гаплогрупп, определяемых на основании генотипирования диаллельных маркерных систем и широкого набора микросателлитных маркеров Y - хромосомы.
Генофонд населения Сибири складывался за счёт многоэтапного смешения большого числа локальных генофондов различных племен европеоидного и монголоидного происхождения. Все коренные южносибирские народы на настоящем этапе этнической истории подвержены активным ассимиляционным процессам в результате межэтнических браков. Это может привести к необратимой трансформации (метисации) уникальных южносибирских генофондов (Лавряшина М.Б., 2012).
Генофонд коренных этносов Сибири - ценнейший ресурс генетических данных. Он специфичен и изучен довольно хорошо с участием современных ДНК -маркеров, однако генофонд шорцев изучен относительно слабо. За последние годы вышло несколько работ, затрагивающих эту тему, но полностью они её не раскрыли. Поэтому проведение данного исследования является актуальным. Интерес к проблеме генетического разнообразия южносибирских популяций связан со сложностью их этногенеза. Процессы слияния и ассимиляции с участием монголоидных и европеоидных групп сыграли основную роль в формировании тюркоязычных народов Южной Сибири, в том числе хакасов. Несмотря на значительное количество разнообразных работ, посвященных исследованию генофонда хакасов, он остается относительно слабо изученным по маркерам изменчивости Y- хромосомы.
Несмотря на высокий уровень изученности, проблематика, касающаяся родоплеменной структуры у тюркских народов, имеет ряд невыясненных вопросов. Современные методологические подходы генетики дают богатые возможности для исследования проблем, связанных с родовой системой, так как развитие современных методов анализа генофондов популяций позволяет вывести этногенетические исследования на новый уровень. В настоящее время существует возможность подробно охарактеризовать структуру, подразделённость, дифференцировку, популяционную и этническую историю различных родоплеменных общностей.
Цель: Охарактеризовать структуру генофонда шорцев по маркерам
нерекомбинирующей части Y -хромосомы и аутосомным STR-маркерам.
Задачи:
1. Провести анализ состава генофонда шорцев с использованием маркеров нерекомбинирующей части Y -хромосомы и оценить частоты встречаемости её гаплогрупп.
2. Провести анализ состава генофонда шорцев с использованием аутосомных STR-маркеров.
3. Охарактеризовать межэтнические и внутриэтнические различия шорцев и хакасов по уровню генетического разнообразия и генетической дифференциации и провести анализ генетических отношений шорцев с другими сибирскими этносами.
4. С помощью анализа филогенетических взаимоотношений YSTR-гаплотипов дать сравнительную характеристику составу и генетической структуре основных шорских и хакасских родов (сеоков).
Работа выполнена на базе "Научно-исследовательского института медицинской генетики" (НИИ медицинской генетики) Федерального государственного бюджетного научного учреждения “Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук”, в лаборатории эволюционной генетики, под руководством ведущего научного сотрудника, доктора биологических наук В.Н. Харькова.
С использованием полиморфных ДНК-маркеров анализируют геномное разнообразие современных популяций человека, генетические особенности этносов, а также изучают исторические взаимоотношения народов. Несмотря на то, что в настоящее время для изучения структуры и истории генофонда наиболее актуально полногеномное секвенирование, маркеры нерекомбинирующей части Y-хромосомы (NRY) всё ещё активно используются, так как они позволяют решать целый ряд вопросов популяционной генетики (описывать дифференциацию, разнообразие, филогенетические
взаимоотношения). Актуальными являются популяционные исследования, использующие высоко вариабельные маркеры STR для определения гаплотипов NRY. Один из наиболее результативных методов изучения популяционно -генетического разнообразия человека - иерархический анализ гаплогрупп, определяемых на основании генотипирования диаллельных маркерных систем и широкого набора микросателлитных маркеров Y - хромосомы.
Генофонд населения Сибири складывался за счёт многоэтапного смешения большого числа локальных генофондов различных племен европеоидного и монголоидного происхождения. Все коренные южносибирские народы на настоящем этапе этнической истории подвержены активным ассимиляционным процессам в результате межэтнических браков. Это может привести к необратимой трансформации (метисации) уникальных южносибирских генофондов (Лавряшина М.Б., 2012).
Генофонд коренных этносов Сибири - ценнейший ресурс генетических данных. Он специфичен и изучен довольно хорошо с участием современных ДНК -маркеров, однако генофонд шорцев изучен относительно слабо. За последние годы вышло несколько работ, затрагивающих эту тему, но полностью они её не раскрыли. Поэтому проведение данного исследования является актуальным. Интерес к проблеме генетического разнообразия южносибирских популяций связан со сложностью их этногенеза. Процессы слияния и ассимиляции с участием монголоидных и европеоидных групп сыграли основную роль в формировании тюркоязычных народов Южной Сибири, в том числе хакасов. Несмотря на значительное количество разнообразных работ, посвященных исследованию генофонда хакасов, он остается относительно слабо изученным по маркерам изменчивости Y- хромосомы.
Несмотря на высокий уровень изученности, проблематика, касающаяся родоплеменной структуры у тюркских народов, имеет ряд невыясненных вопросов. Современные методологические подходы генетики дают богатые возможности для исследования проблем, связанных с родовой системой, так как развитие современных методов анализа генофондов популяций позволяет вывести этногенетические исследования на новый уровень. В настоящее время существует возможность подробно охарактеризовать структуру, подразделённость, дифференцировку, популяционную и этническую историю различных родоплеменных общностей.
Цель: Охарактеризовать структуру генофонда шорцев по маркерам
нерекомбинирующей части Y -хромосомы и аутосомным STR-маркерам.
Задачи:
1. Провести анализ состава генофонда шорцев с использованием маркеров нерекомбинирующей части Y -хромосомы и оценить частоты встречаемости её гаплогрупп.
2. Провести анализ состава генофонда шорцев с использованием аутосомных STR-маркеров.
3. Охарактеризовать межэтнические и внутриэтнические различия шорцев и хакасов по уровню генетического разнообразия и генетической дифференциации и провести анализ генетических отношений шорцев с другими сибирскими этносами.
4. С помощью анализа филогенетических взаимоотношений YSTR-гаплотипов дать сравнительную характеристику составу и генетической структуре основных шорских и хакасских родов (сеоков).
Работа выполнена на базе "Научно-исследовательского института медицинской генетики" (НИИ медицинской генетики) Федерального государственного бюджетного научного учреждения “Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук”, в лаборатории эволюционной генетики, под руководством ведущего научного сотрудника, доктора биологических наук В.Н. Харькова.
✅ Заключение
1. Генофонд шорцев представлен тремя основными гаплогруппами Y- хромосомы (R1a1a1h-Z93, N1a1a2a-B499, N1a2b2a2a-VL63).
2. Субэтнические группы северных (лесостепных) и южных (горно -таежных) шорцев показывают значительную генетическую дифференциацию как по частотам гаплогрупп Y-хромосомы (Fst = 11%), так и по и аутосомным микросателлитам.
3. Уровень генетического разнообразия шорцев по маркерам Y-хромосомы (Н = 0,467) ниже, чем у других популяций Южной Сибири. При этом северная группа шорцев (Н = 0,373) отличается значительно более низким уровнем разнообразия по сравнению с южной (Н = 0,566). Результаты подтверждены сравнительным анализом по аутосомным микросателлитам: генетическое разнообразие северных шорцев (Н = 0,734) также ниже, чем южных (Н = 0,765).
4. По частотам гаплогрупп Y-хромосомы, структуре YSTR-гаплотипов и по аутосомным микросателлитам, из представленных этнических групп Южной Сибири, шорцы наиболее близки к алтайцам и хакасам.
5. Генофонд шорцев, а точнее его часть, маркируемая гаплогруппами Y- хромосомы, структурирована, прежде всего, по родовому принципу. Для подавляющего большинства образцов показана тесная генетическая близость представителей одного сеока.
2. Субэтнические группы северных (лесостепных) и южных (горно -таежных) шорцев показывают значительную генетическую дифференциацию как по частотам гаплогрупп Y-хромосомы (Fst = 11%), так и по и аутосомным микросателлитам.
3. Уровень генетического разнообразия шорцев по маркерам Y-хромосомы (Н = 0,467) ниже, чем у других популяций Южной Сибири. При этом северная группа шорцев (Н = 0,373) отличается значительно более низким уровнем разнообразия по сравнению с южной (Н = 0,566). Результаты подтверждены сравнительным анализом по аутосомным микросателлитам: генетическое разнообразие северных шорцев (Н = 0,734) также ниже, чем южных (Н = 0,765).
4. По частотам гаплогрупп Y-хромосомы, структуре YSTR-гаплотипов и по аутосомным микросателлитам, из представленных этнических групп Южной Сибири, шорцы наиболее близки к алтайцам и хакасам.
5. Генофонд шорцев, а точнее его часть, маркируемая гаплогруппами Y- хромосомы, структурирована, прежде всего, по родовому принципу. Для подавляющего большинства образцов показана тесная генетическая близость представителей одного сеока.
ИЛИ
Поиск аналога
📕 Список литературы
🖼 Скриншоты
🛒 Оформить заказ
⚡ Работу высылаем в течении 5 минут после оплаты.