СТРУКТУРА ГЕНОФОНДА ШОРЦЕВ И ХАКАСОВ ПО АУТОСОМНЫМ STR-МАРКЕРАМ И МАРКЕРАМ У-ХРОМОСОМЫ

ВВЕДЕНИЕ 4
Глава 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 6
1.1 Строение Y-хромосомы и использование её маркеров в популяционной генетике 6
1.2 Микросателлиты 7
1.3 Этногенез шорцев 10
1.4 Шорские сеоки 11
1.5 Этногенез хакасов 14
1.6 Хакасские сеоки 16
Глава 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 21
2.1 Материал исследования 21
2.2 Методы исследования 22
2.2.1 Выделение ДНК 22
2.2.2 Спектрофотометрическое определение качества выделенной ДНК 22
2.2.3 Маркеры, использованные для характеристики генетического разнообразия 23
2.2.4 Генотипирование ДНК -маркеров 44
2.2.5 Статистическая обработка данных 45
Глава 3 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 47
3.1 Состав и структура генофонда шорцев по маркерам Y -хромосомы 47
3.2 Генетическое разнообразие шорцев 49
3.3 Генетическая дифференциация популяций 50
3.4 Генетические взаимоотношения между популяциями 53
3.5 Филогенетический анализ гаплогруппы N1 a1a2a 54
3.6 Филогенетический анализ гаплогруппы R1a1a1h-Z93 55
3.7 Генетическая структура шорских сеоков 56
ВЫВОДЫ 66
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 67
... отсутствует 3 раздел
Купить

Современный этнический состав коренного населения Южной Сибири является результатом длительных исторических и этногенетических процессов. Смешение народов различной расовой и языковой принадлежности, возрастание подразделённости популяций из-за географической изоляции, религиозных и культурных традиций стало причиной антропологического и генетического разнообразия современных народов Сибири (Лавряшина М.Б. и др., 2010).
С использованием полиморфных ДНК-маркеров анализируют геномное разнообразие современных популяций человека, генетические особенности этносов, а также изучают исторические взаимоотношения народов. Несмотря на то, что в настоящее время для изучения структуры и истории генофонда наиболее актуально полногеномное секвенирование, маркеры нерекомбинирующей части Y-хромосомы (NRY) всё ещё активно используются, так как они позволяют решать целый ряд вопросов популяционной генетики (описывать дифференциацию, разнообразие, филогенетические
взаимоотношения). Актуальными являются популяционные исследования, использующие высоко вариабельные маркеры STR для определения гаплотипов NRY. Один из наиболее результативных методов изучения популяционно -генетического разнообразия человека - иерархический анализ гаплогрупп, определяемых на основании генотипирования диаллельных маркерных систем и широкого набора микросателлитных маркеров Y - хромосомы.
Генофонд населения Сибири складывался за счёт многоэтапного смешения большого числа локальных генофондов различных племен европеоидного и монголоидного происхождения. Все коренные южносибирские народы на настоящем этапе этнической истории подвержены активным ассимиляционным процессам в результате межэтнических браков. Это может привести к необратимой трансформации (метисации) уникальных южносибирских генофондов (Лавряшина М.Б., 2012).
Генофонд коренных этносов Сибири - ценнейший ресурс генетических данных. Он специфичен и изучен довольно хорошо с участием современных ДНК -маркеров, однако генофонд шорцев изучен относительно слабо. За последние годы вышло несколько работ, затрагивающих эту тему, но полностью они её не раскрыли. Поэтому проведение данного исследования является актуальным. Интерес к проблеме генетического разнообразия южносибирских популяций связан со сложностью их этногенеза. Процессы слияния и ассимиляции с участием монголоидных и европеоидных групп сыграли основную роль в формировании тюркоязычных народов Южной Сибири, в том числе хакасов. Несмотря на значительное количество разнообразных работ, посвященных исследованию генофонда хакасов, он остается относительно слабо изученным по маркерам изменчивости Y- хромосомы.
Несмотря на высокий уровень изученности, проблематика, касающаяся родоплеменной структуры у тюркских народов, имеет ряд невыясненных вопросов. Современные методологические подходы генетики дают богатые возможности для исследования проблем, связанных с родовой системой, так как развитие современных методов анализа генофондов популяций позволяет вывести этногенетические исследования на новый уровень. В настоящее время существует возможность подробно охарактеризовать структуру, подразделённость, дифференцировку, популяционную и этническую историю различных родоплеменных общностей.
Цель: Охарактеризовать структуру генофонда шорцев по маркерам
нерекомбинирующей части Y -хромосомы и аутосомным STR-маркерам.
Задачи:
1. Провести анализ состава генофонда шорцев с использованием маркеров нерекомбинирующей части Y -хромосомы и оценить частоты встречаемости её гаплогрупп.
2. Провести анализ состава генофонда шорцев с использованием аутосомных STR-маркеров.
3. Охарактеризовать межэтнические и внутриэтнические различия шорцев и хакасов по уровню генетического разнообразия и генетической дифференциации и провести анализ генетических отношений шорцев с другими сибирскими этносами.
4. С помощью анализа филогенетических взаимоотношений YSTR-гаплотипов дать сравнительную характеристику составу и генетической структуре основных шорских и хакасских родов (сеоков).
Работа выполнена на базе "Научно-исследовательского института медицинской генетики" (НИИ медицинской генетики) Федерального государственного бюджетного научного учреждения “Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук”, в лаборатории эволюционной генетики, под руководством ведущего научного сотрудника, доктора биологических наук В.Н. Харькова.
Купить