ВВЕДЕНИЕ 2
1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 4
1.1 Общие сведения о программе ImageJ 4
1.3 Применение ImageJ в современных направлениях науки 7
1.4 Imagej в геологии и почвоведении 8
1.5 ImageJ в биологии 10
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ 14
2.1 Объекты исследования
2.2 Проращивание семян пшеницы Ошибка! Закладка не определена.
2.3 Компьютерная морфометрия корней проростков пшеницы в программе ImageJ
2.4 Статистическая обработка данных
3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 15
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 17
В настоящее время в связи с увеличением потребности населения в продуктах питания активно развивается сельское хозяйство. В связи с развитием сельского хозяйства появляются новые и совершенствуются старые методы научных исследований. В научных исследованиях в том числе проводятся измерения таких параметров биологических и небиологических объектов, как длина, ширина, периметр и площадь. Объекты измерения часто имеют неправильную форму, что затрудняет измерение при помощи ручных приборов. В таких случаях бывает целесообразным фотографирование объектов с последующим измерением их размеров на фотографиях. Для приведения результатов исследования к общему виду, который может быть обработан максимальным количеством существующих программ, необходимо адаптировать сами данные или, если это возможно адаптировать само программное обеспечение, например, с помощью подпрограмм или макросов. В качестве средства обработки полученных в эксперименте данных может выступать свободно распространяемое программное обеспечение. ImageJ.
Программа создана на языке программирования Java и распространяется без ограничений как коллективная собственность. Открытый программный интерфейс приложения позволяет гибко наращивать функциональность за счёт подключаемых модулей, а встроенный макроязык — автоматизировать сложные повторяющиеся действия. ImageJ широко применяется в биомедицинских и биотехнологических исследованиях, астрономии, географии и других дисциплинах, связанных с анализом изображений, в качестве альтернативы коммерческому программному обеспечению.
Программа ImageJ прекрасно подходит для компьютерной морфометрии длинны корней и оценки корнеобразования при проращивании семян. Даже при исходных настройках, без подключения дополнительных
модулей, можно получить высокоточные результаты, в том числе при наличии у корней изгибов разнообразной формы.
Цель работы - создание методики компьютерной морфометрии корнеобразования проростков пшеницы, для достижения поставленной цели были поставили следующие задачи
В связи с поставленной целью решались следующие задачи:
1. Отработка методики проращивания семян пшеницы в чашках Петри в термостатируемых условиях и дальнейшего фотографирования пророщенных семян с целью получения снимков как исходного материала для морфометрии.
2. Оценка неопределенности измерения длинны корней проростков пшеницы посредствам компьютерного анализа фотографий в свободно распространяемом программном обеспечении ImageJ.
3. Исследование показателей вариации длины корней проростков пшеницы после проращивания в течении 48 часов при температуре 25°С в термостате.
4. Тестирование разработанной методики компьютерной морфометрии как способа регистрации отклика проростков пшеницы на стрессирующее воздействие в модельных экспериментах с засолением.
Работа выполнена на кафедре экологии, природопользования и экологической инженерии под руководством кандидата биологических наук, доцента А.В. Куровского
Раздел «Выводы» содержит результаты интеллектуальной деятельности в научной сфере, изъят из выпускной квалификационной работы в соответствии с и. 3.2. Регламента размещения текстов выпускных квалификационных работ в электронной библиотеке Научной библиотеки НИ ТГУ (Приказ ректора ТГУ № 413/ОД от 24.05.2016).
