РЕФЕРАТ 2
Введение 5
Глава 1.Обзор литературы 8
1.1 Общая характеристика полигидроксиалканоатов 8
1.2 Классификация и структура ПГА 9
1.3 Синтез ПГА 12
1.4 Продуценты ПГА 13
1.5 Характеристика липидов бактерий 15
1.6 Взаимосвязь между синтезом ПГА и жирнокислотным составом клетки 17
Глава 2. Материалы и методы 18
2.1 Бактериальный штамм 18
2.2 Культивирование, ход эксперимента и условия роста бактерий 19
2.3 Подготовка инокулята 20
2.4 Методы измерения параметров культивирования 20
2.4.1 Определение оптической плотности бактериальной культуры 20
2.4.2 Определение концентрации фруктозы в среде 20
2.4.3 Определение концентрации биомассы бактерий 21
2.4.4 Определение концентрации мочевины в среде 21
2.5 Определение содержания полимера 22
2.6 Экстракция липидов цитоплазматической мембраны и полимера 22
2.7 Омыление липополисахаридов 23
2.8 Метанолиз жирных кислот 24
2.9 Определение содержания белка в клетке 24
2.10 Анализ молекулярно-массовых характеристик полимера 25
Глава 3. Результаты 26
ЗаКЛЮЧЕНИЕ 39
Список сокращений 41
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ 42
Полимеры, полученные из нефтехимического сырья, очень популярны и востребованы благодаря своим разнообразным свойствам, таким как прочность, устойчивость к деградации, легкость, гибкость [1]. За счет своей практичности, разнообразию и всестороннему применению в домашнем, фармацевтическом и коммерческом секторах синтетические полимеры стали незаменимым товаром в современном обществе [2]. Сообщается, что ежегодный синтез пластмасс, полученных из нефти, составляет более 300 миллионов тонн, и ежегодно во всем мире потребляется около 150 миллионов тонн синтетических пластмасс и материалов на их основе [3, 4]. По оценкам, ежегодно в океан вымывается 10 миллионов тонн пластика, что оказывает пагубное воздействие на океаническую экосистему [5]. Спрос на пластмассы и изделия из них постоянно растет в связи с модернизацией и ростом населения [6], что в конечном итоге может привести к серьезным экологическим проблемам [7, 8]. Из-за медленной скорости разложения и образования токсичных побочных продуктов переработка пластика является наиболее подходящим способом обращения с данными отходами, но этот процесс чрезвычайно медленный и затруднен из-за разнообразных свойств различных пластиков. Пластиковые материалы имеют широкий спектр применения, поэтому сортировка выбрасываемых остатков весьма проблематична. Кроме того, наличие разнородных материалов и добавок, таких как покрытия, наполнители и красящие материалы, ограничивает их переработку [4]. В России объем полимерных отходов составляет около 750 тыс. т в год, при этом лишь 310 % из них используется вторично [9].
Поэтому переход на новые типы материалов, которые разрушаются в природной среде естественным путем до безвредных продуктов, становится насущной проблемой. Полимеры, получаемые из природного сырья или синтезируемые микроорганизмами (так называемые биополимеры, или биопластики), в отличие от нефтепродуктов, практически не вносят вклад в пополнение парниковых газов и глобальное потепление. Одно из преимуществ использования биоразлагаемых полимеров на биологической основе - возможность помочь обновить «углеродный цикл», или «реинкарнацию углерода» [10].
Среди различных групп биополимеров (полилактиды, полигликолиды, полиэтиленгликоль, поликапролактан, полиуретаны и др.) наиболее известны полигидроксиалканоаты (ПГА). Это сложные полиэфиры, синтезируемые множеством бактерий в виде соединения углерода и энергии. Они накапливаются в виде внутриклеточных гранул при избытке субстрата (источников углерода) в условиях ограниченного содержания кислорода, азота, фосфора (питательных веществ) или даже при колебаниях рН питательной среды. Полимеры на основе ПГА являются полностью биоразлагаемыми, а их скорость разложения в природных условиях намного выше, чем у химического сырья. Оставшиеся отходы биополимера запросто могут быть выброшены или компостированы для использования в качестве углеродного сырья, таким образом, реализуя концепцию «от колыбели до колыбели» (Cradle-to-Cradle) [11,12,13, 15].
Наиболее перспективными продуцентами для биотехнологического производства биоразрушаемых пластиков являются водородокисляющие бактерии Cupriavidus necator (ранее Ralstonia eutropha, Hydrogenomonas, Alcaligenes, Wautersia), группа грамотрицательных факультативных хемолитоавтотрофных аэробных бактерий, способных накапливать полимер до 80-90% на сухое вещество. Прежде всего, перспективность водородокисляющих бактерий определяется их высоким органотрофным потенциалом.
Возможность замены пластмасс на полигидроксиалканоаты имеет большой промышленный потенциал в будущем, так как ПГА обладает многими уникальными характеристиками, такими как: высокая устойчивость к ультрафиолетовому излучению, антиоксидантные, газобарьерные свойства, оптическая проводимость, нетоксичность, а также термоэлектрические свойства, которые обычно применяются в медицине, тканевой инженерии и упаковочных материалах [14]. Тем не менее, высокая стоимость производства является одним из основных факторов, которые затрудняют реализацию ПГА на глобальном уровне. Кроме того, многие аспекты физиологии накопления и разрушения ПГА остаются всё ещё не изученными. В связи с этим, широкопрофильное исследование штамма способного поставлять ПГА и характеристика накапливаемого им полимера, до сих пор являются актуальной научной работой для получения промышленно значимых продуктов.
Целью выпускной квалификационной работы являлось исследование динамики накопления биомассы клеток, ПГА и липидов бактериями Cupriavidus necator B-10646.
Для этого необходимо было решить следующие задачи:
1. Исследовать динамику накопления биомассы, полимера и липидов у бактерий Cupriavidus necator B-10646, выращиваемых на фруктозе;
2. Изучить изменения в жирнокислотном составе липидов на разных стадиях культивирования исследуемого штамма.
1. В ходе периодической культуры (0-72 ч) происходило постепенное накопление концентрации биомассы и содержания полимера с максимальными значениями на 72 ч, соответственно 7,83 г/л и 77%. Процесс внутриклеточной деградации полимера (72-144 ч) сопровождался как снижением содержания полимера до 40%, так и концентрацией биомассы до 5,6%. При ресинтезе полимера (144-165 ч), инициированном добавлением углеродного субстрата, произошло увеличение содержания полимера и биомассы соответственно до 61,5% и 6,4%.
2. Показано, что накопление полимера происходило на фоне снижения содержания белка и липидов. Внутриклеточная деградация полимера сопровождалась увеличением содержания белка, которое не снижалось при ресинтезе полимера. Содержание липидов практически не менялось в ходе деградации и ресинтеза полимера.
3. Липиды цитоплазматической мембраны Cupriavidus necator в своём составе содержат циклопропановые, насыщенные и моноеновые жирные кислоты. В ходе накопления полимера увеличивается насыщенность липидов цитоплазматической мембраны за счет увеличения содержания насыщенных жирных кислот, включая циклопропановые, на фоне снижения моноеновых кислот. Высокая насыщенность липидов сохраняется и в фазу внутриклеточной деградации и ресинтеза полимера.
Основными жирными кислотами липополисахаридов являются насыщенные жирные кислоты, включая 0- и а-гидроксикислоты. В процессе накопления полимера изменения в жирнокислотном составе связаны главным образом со снижением содержания 16:1ш7 и 0-ОН 14:0 на фоне увеличения содержания 16:0. В фазу внутриклеточной деградации и ресинтеза значительных изменений в содержании жирных кислот не выявлено.
4. Среднечисловая (Мч) и средневесовая (Мв) молекулярные массы полимера на 20 час культивирования имели максимальные значения: 281кДа и 744 кДа соответственно. По ходу накопления полимера эти показатели снижались до 120 кДа и 407 кДа (72 ч) соответственно. В фазу деградации полимера данные показатели практически не менялись. В фазу ресинтеза полимера отмечено снижение Мч и Мв до 84 кДа и 375 кДа соответственно.
1. Alavi, S., Thomas, S., Sandeep, K.P., Kalarikkal, N., Varghese, J., Yaragalla, S. (Eds.), 2014. Polymers for Packaging Applications. CRC Press.
2. Yadav, A., Mangaraj, S., Singh, R., Kumar, N., Simran, A., 2018. Biopolymers as packaging material in food and allied industry. Int. J. Chem. Stud. 6, 24112418.
3. Marichelvam, M.K., Jawaid, M., Asim, M., 2019. Corn and rice starch-based bioplastics as alternative packaging materials. Fibers 7, 32.
4. Anjum, A., Zuber, M., Zia, K.M., Noreen, A., Anjum, M.N., Tabasum, S., 2016. Microbial production of polyhydroxyalkanoates (PHAs) and its copolymers: a review of recent advancements. Int. J. Biol. Macromol. 89, 161-174.
5. Boucher, J., Billard, G., 2019. The challenges of measuring plastic pollution. Field Actions Sci. Rep. 19, 68-75.
6. Kumar, M., Gupta, J., Thakur, I.S., 2016b. Production and optimization of polyhydroxyalkanoate from oleaginous bacteria Bacillus sp. ISTC1. Res. Rev. J. Microbiol. Biotechnol. 5, 80-89.
7. Amaro, M.M., Miguel, T., Rosa, F., Comi, G., Iacumin, L., 2019. Prospects for the use of whey for polyhydroxyalkanoate (PHA) production. Front. Microbiol. 10, 992.
8. Kishna, M., Niesten, E., Negro, S., Hekkert, M.P., 2017. The role of alliances in creating legitimacy of sustainable technologies: a study on the field of bioplastics. J. Clean. Prod. 155, 7-16.
9. Тасекеев М. С., Еремеева Л. М. Производство биополимеров как один из путей решения проблем экологии и АПК: Аналит. обзор.- Алматы: НЦ НТИ, 2009.- С.7.
10. Kijchavengkul T., Auras R. (2008) Perspective compostability of polymers. Polymer International 57: 793-804.
11. Park, D.H. Production of poly(3-hydroxybutyrate) andpoly(3- hydroxybutyrate-co4-hydroxybutyrate) by Ralstonia eutropha fromsoybean oil/ D.H. Park, B.S. Kim //N. Biotechnol. - 2011. - р.719-724.
12. Kessler, B. Factors involved in the regulatory network of polyhydroxyalkanoate metabolism / B. Kessler, B. Witholt, // Biotechnol. - 2001. - V. 86. - P. 97-104.
13. Steinbuchel, A. Bacterial and other biological systems for polyester production / A. Steinbuchel, B. Fuchstenbusch // Trends Biotechnol. - 1998. - Vol. 16. - р. 419- 427.
14. Singh, A.K.; Srivastava, J.K.; Chandel, A.K.; Sharma, L.; Mallick, N.; Singh, S.P. Biomedical applications of microbially engineered polyhydroxyalkanoates: An insight into recent advances, bottlenecks, and solutions. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2019, 103, 2007-2032.
15. Mozejko-Ciesielska, J., Kiewisz, R. Bacterial polyhydroxyalkanoates: Still fabulous? / J.Mozejko-Ciesielska, R.Kiewisz //Microbiological research. - 2016. - Т. 192. - С. 271-282....61