Тип работы:
Предмет:
Язык работы:


Изучение взаимодействия ДНК с ионами металлов и металлоорганическими комплексами

Работа №143167

Тип работы

Бакалаврская работа

Предмет

физика

Объем работы49
Год сдачи2018
Стоимость4220 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
28
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


Введение 3
Глава 1. Структура и свойства ДНК. Ее взаимодействие с металлами и металлокомплексами 5
1.1 Структура молекулы ДНК 5
1.2 ДНК как мишень для противоопухолевых препаратов 10
1.3 Взаимодействие ДНК с ионами металлов 13
1.4 Координационные соединения 14
1.4.1 Связывание молекулы ДНК с координационными соединениями платины 15
1.4.2 Взаимодействие ДНК с соединениями рутения 17
Глава 2. Методы и материалы 20
2.1 Электронная спектроскопия поглощения 20
2.2. Определение константы связывания соединений с ДНК методом Вульфа-Шиммера 20
2.3 Изучение ДНК методом плавления 24
2.4. Метод флуоресцентной спектроскопии 25
2.4.1 Конкурентное связывание DAPI и комплекса рутения c ДНК 26
2.4.2 Конкурентное связывание соединения рутения и EtBr с ДНК. 27
2.5 Материалы 28
Глава 3. Результаты и их обсуждение 28
3.1.Изучение взаимодействия молекулы ДНК с соединением рутения 28
3.2.Изучение конкурентного связывания RuNalNa с ДНК с использованием люминесцирующих красителей DAPI и EtBr 36
3.3. Изучение связывания ДНК с координационными соединениями платины и двухвалентными ионами металлов 39
Выводы 44
Список литературы


Злокачественная опухоль – новообразование, возникшее в результате трансформации здоровых клеток в злокачественные, которые начинают бесконтрольно размножаться, нанося вред всему организму. В результате трансформации они могут потерять способность к апоптозу, старению и могут образовывать метастазы в других органах. Злокачественнее опухоли появились, по-видимому, вместе с многоклеточными организмами, поскольку они описаны даже у таких простых организмов как гидры. [1]В последнее время увеличение продолжительности жизни и ухудшение экологии привело к увеличению заболеваемости. [2]
В настоящее время разработано множество эффективных средств борьбы с опухолями, таких как радиотерапия, хирургическое удаление, фото и иммунотерапия. Но наиболее эффективным методом для лечения большинства видов опухолей остается химиотерапия, то есть применение лекарств, подавляющих развитие опухолей. Такие лекарственные средства могут воздействовать на иммунную систему человека, на некоторые белки, но основной мишенью лекарств является молекула ДНК. Лекарства, связываясь с молекулой ДНК, могут блокировать деление злокачественной клетки и вызывать ее апоптоз. Они влияют на весь организм, но наибольшему действию подвержены быстро делящиеся клетки, такие как клетки злокачественных опухолей, некоторые клетки кишечника и кожи. Не последнее место среди таких лекарств занимают координационные комплексы металлов, первый из которых, цисплатин (цис-диамминдихлороплатина(II)), был открыт случайно в результате электролиза платиновых электродов. Соединение оказалось способно эффективно убивать бактерии, а затем была продемонстрирована его высокая противоопухолевая активность. При некоторых видах рака применение цисплатина в составе комбинированной терапии позволяет добиться почти гарантированного выздоровления. [3] Однако, при всех своих достоинствах, цисплатин обладает очень высокой токсичностью для здоровых клеток, что спровоцировало большое количество исследований, стремящихся найти комплексы металлов, способных показывать аналогичную цисплатину эффективность в лечении злокачественных опухолей, но обладающих меньшей токсичностью. Этот поиск не прекращается и сейчас. Одним из направлений этого поиска является синтез и исследование препаратов других металлов платиновой группы, других металлов и их ионов.
Изучение взаимодействие ДНК с новыми соединениями в растворе является широко используемым подходом. Поскольку действие противоопухолевых препаратов чаще всего связано с взаимодействием с ДНК путем образования прочных связей, изучение взаимодействия ДНК с соединениями-претендентами на роль новых противоопухолевых лекарств является удобным методом отбора перспективных соединений из тысяч кандидатов.
Сказанное выше свидетельствует об актуальности выполненных исследований. Побочные эффекты используемых сейчас в медицине соединений платины вынуждают исследователей как можно быстрее найти более безопасные и эффективные заменители. Практическая ценность работы заключается в том, что исследуемые соединения являются либо противоопухолевыми препаратами (цисплатин), либо потенциальными лекарственными средствами (препарат рутения). Для сравнения рассмотрено взаимодействие молекулы ДНК с ионами двухвалентных металлов (медью, марганца, магния).
Научная новизна проведенной работы заключается в том, что исследуемое соединение рутения является новым препаратом.
Основной целью данной работы являлось выяснение способа связывания металлов и их комплексов с ДНКinvitro, выявление перспективности синтезированного соединения для дальнейших более тщательных и сложных исследований, тестирования на бактериях, клеточных линиях и животных в качестве противоопухолевого средства.


Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!


В работе изучены спектры поглощения комплексов ДНК с координационными соединениями рутения и платины, а также с двухвалентными ионами металлов.
2. Показано, что соединение рутения взаимодействует с молекулой ДНК в условиях эксперимента, при этом, по-видимому, лиганд – остаток налидиксовой кислоты уходит в раствор при формировании связи рутения с ДНК.
3. При взаимодействии реализуется более одного типа связывания соединения с ДНК, о чем свидетельствует отсутствие изобестической точки при проведении спектрофотометрического титрования.
4. При концентрациях компонентов (ДНК и соединения рутения), соответствующих значению r<0.6 соединение находится в связанном состоянии с ДНК.
5. Сравнение спектров поглощения ДНК с соединениями цис-ДДП, транс-ДДП, СuCl2, MnCl2 показало, что комплексы образуются с одной и той же позицией на молекуле –N7 гуанина.
6. Изучение плавления ДНК в комплексах указывает, что все эти соединения дестабилизируют двойную спираль ДНК, тогда как ионы Mg2+,напротив, приводят к стабилизации вторичной структуры ДНК.
7. Спектры поглощения растворов ДНК с соединениями после их медленного нагревания до 98 градусов показывают, что плавление не нарушает комплексообразования ДНК с используемыми соединениями.
8. Связывание соединения рутения с ДНК влияет как на связывание красителя DAPIпо малой бороздке, так и на его связывание с фосфатами, а также наблюдалось вытеснение интеркалированного этидиума после введения соединения рутения, что свидетельствует о более сильном связывании последнего с ДНК. Можно полагать, что формируется координационная связь.



1. Naturally occurring tumours in the basal metazoan Hydra. Nature Communications volume 5 Article number: 4222 (2014)
2. Aging Dis. 2017 Oct; 8(5): 611–627. Cancer and Aging - the Inflammatory Connection Adar Zinger,1 William C Cho,2 and Arie Ben-YehudaTesticular cancer before and after cisplatin: a 30-year view.
Wendy Ansell and Jonathan Shamash.
3. On the deoxyribonucleic acid content of sea urchin gametes Experientia8 (4): 143–145
4. Franklin R. E and Gosling R. G 1953 The structure of sodium thymonucleatefibres. I. the influence of water content //ActaCrystallographica6.№. 8-9. 673-677.
5. Watson J.D., Crick F.H.C. A structure for deoxyribose nucleic acid // Nature, 1953, 171, 737-738.
6. Hoogsteen K 1963 The crystal and molecular structure of a hydrogenbonded complex between 1-methylthymine and 9-methyladenine ActaCrystallographica 16 907-16
7. Devoe H and Tinoco I 1962 J. Mol. Biol. 4 500
8. Зенгер В 1987 Принципы структурной организации нуклеиновых кислот (Москва: «Мир») № 5719 гл.9 240-259
9. Ivanov V.I., Minchenkova L.E., Minyat E.E. et al. B to A transition of DNA in solution // J. Mol. Biol., 1974, 87, 817-833.
10. Wang AHJ, Quigley GJ, Kolpak FJ, Crawford JL, van Boom JH, Van der Marel G, Rich A. Molecular structure of a left-handed double helical DNA fragment at atomic resolution // Nature (London). 1979, 282: 680–686
11. Wang AHJ, Quigley GJ, Kolpak FJ, Crawford JL, van Boom JH, Van der Marel G, Rich A. Molecular structure of a left-handed double helical DNA fragment at atomic resolution // Nature (London). 1979, 282: 680–686
12. Hoogsteen K. The crystal and molecular structure of a hydrogen-bonded complex between 1-methylthymine and 9-methyladenine // ActaCrystallogr., 1963, 16, 907-916
13. Кантор Ч и Шиммел П 1984 Биофизическая химия (Москва: «Мир»)
14. Биохимия: Учеб. для вузов / В. П. Комов, В. Н. Шведова. — М.: Дрофа, 2004. 183-184/
15. Curr Med Chem. 2017;24(15):1488-1503. DNA-Damaging Anticancer Drugs - A Perspective for DNA Repair- Oriented Therapy.
16. Lerman L.S 1961 Structural considerations in the interaction of DNA and acridines J. Mol. Biol. 3 18-30
17. Zipper H, Brunner H, Bernhagen J and Vitzthum F 2004 Investigations onDNA intercalation and surface binding by SYBR Green I, its structuredetermination and methodological implications Nucleic Acids Res. 32103
18. Haq I and Ladbury J 2000 Drug–DNA recognition: energetics and implications for design J. Mol. Rec. 13 188-197
19. Zimmer C, Reinert K. E and Luck G 1971 Interaction of the oligopeptide В62 antibiotics netropsin and distamycin A with nucleic acids J. Mol. Biol. 58 329-48
20. Андроникашвили Э.Л. Малигнизация и изменение некоторых физико-химических свойств биомакромолекул и надмолекулярных структур // Биофизика. 1987. ╧ 5. С. 782-799.
21. Касьяненко Н. А., Дьяконова Н. Е., Фрисман Э. В. Исследование молекулярного механизма взаимодействия ДНК с двухвалентными ионами металлов // Молекулярная биология. 1989. Т. 23. № 4. С. 975–982
22. Касьяненко Н. А., Сельман-Хусейн Соса Г., Уверский В. Н., Фрисман Э. В. Исследование влияния ионов Mn2+ и Mg2+ на конформацию молекулы ДНК // Молекулярная биология. 1987. Т. 23. № 1. С. 140–146.
23. Rosenberg B., Van Camp L., Krigas T. Inhibition of cell division in escherichia coli by electrolysis products from a platinum electrode // Nature, 1965, 205, 698-699,
24. Rosenberg B., Van Camp L., Trosko J.E., Mansour V.N. Platinum compounds: a new class of potent antitumour agents // Nature, 1969, 222, 385-386.
25. Akaboshi M., Kawai K., Maki H., Akuta K., Ujeno Y., Miyahara T. The number of platinum atoms binding to DNA, RNA and protein molecules of HeLa cells treated with cisplatin at its mean lethal concentration // Jpn. J. Cancer Res. 1992, 83(5), 522-526.
26. Eastman A., The formation, isolation and characterization of DNA adducts produced by anticancer platinum complexes // Pharmacol. Ther., 1987, 34(2), 155-166.
27. Fichtinger-Schepman A.M., van der Veer J.L., den Hartog J.H., Lohman P.H.M., Reedijk J. Adducts of the antitumor drug cis- diamminedichloroplatinum(II) with DNA: formation, identification and quantitation // Biochemistry, 1985, 24(3), 707-713.
28. Eastman A. Reevaluation of interaction of cis- dichloro(ethylenediamine) platinum(II) with DNA // Biochemistry, 1986, 25(13), 3912-3915.
29. Roberts J.J., Pascoe J.M., Cross-linking of complementary strands of DNA in mammalian cells by antitumour platinum compounds // Nature, 1972, 235(5336), 282-284.
30. Jamieson E.R., Lippard S.J., Structure, Recognition and Processing of Cisplatin-DNA Adducts // Chem. Rev. 1999, 99(9), 2467-2498
31. Eastman A., Barry M.A., Interaction of trans-diamminedichloroplatinum(II) with DNA: formation of monofunctional adducts and their reaction with glutathione // Biochemistry, 1987, 26(12), 3303-3307.
32. Kasyanenko N.A., Prokhorova S.A., Haya E.E.F., Suadakova S.S, Frisman E.V, Dyachenko S.A., Smorygo N.A., Ivin B.F. Interaction of protonated DNA with trans-dichlorodiamminepolatinum (II) // Colloids and Surfaces, A: Physicochemical and Engineering Aspects, 1999, 148, 121-128.
33. Herman F., Kozelka J., Stoven V., Guittet E., Girault J.P., Huynh-Dinh T., Igolen J., Lallemand J.Y., Chottard J.C., A d(GpG)-platinateddecanucleotide duplex is kinked. An extended NMR and molecular mechanics study // Eur. J. Biochem. 1990, 194(1), 119-133
34. Bergamo, Alberta; Sava, Gianni (2011). "Ruthenium anticancer compounds: Myths and realities of the emerging metal-based drugs". Dalton Transactions. 40 (31): 7817–23
35. A.D. Kelman, M.J. Clarke, S.D. Edmonds, H.J. Peresie, J ClinHematolOncol 7 (1977) 274–288.
36. Ruthenium Complexes as Protein Kinase Inhibitors Lilu Zhang, Patrick Carroll, and Eric Meggers* Org. Lett., 2004, 6 (4), pp 521–523
37. Org. Lett., 2004, 6 (4), pp 521–523] [Y.K. Yan, M. Melchart, A. Habtemariam, P.J. Sadler, Chem. Commun (2005) 4764−4776
38. G. Mestroni, E. Alessio, G. Sava, S. Pacor, M. Coluccia, A. Bocarelli, Metal-based Drugs 1 (1993) 41–63.
39. M.J. Clarke, Coord. Chem. Rev. 236 (2003) 209–233.
40. Appraisal of the redox behaviour of the antimetastatic ruthenium(III) complex [ImH][RuCl4(DMSO)(Im)], NAMI-A M. Ravera, S. Baracco, C. Cassino, P. Zanello, D. Osella, Dalton Trans. 7 (2004) 2347–2351
41. J Bacteriol. 1965 Apr; 89(4): 1068–1074. Mechanism of Action of Nalidixic Acid on Escherichia coli II. Inhibition of Deoxyribonucleic Acid SynthesisWilliam A. Goss, William H. Deitz, and Thomas M. Cook
42. Inorg Chem. 2013 Aug 5;52(15):9039-52. New uses for old drugs: attempts to convert quinolone antibacterials into potential anticancer agents containing ruthenium. Kljun J1, Bratsos I, Alessio E, Psomas G, Repnik U, Butinar M, Turk B, Turel I.
43. Л.С. Якимова метод уф-спектроскопии и его применение в органической и физической ХИМИИ Учебно-методическое пособие Казань-2015
44. Lifson S and Zimm B 1963 Biopolymers 1 15
45. Me W, Wei X, Liu Y and Wang B 2008 Transition Met. Chem. 33 907
46. A. Biancardi, T. Biver, F. Secco and B. Mennucci 2013 An investigation of the photophysical properties of minor groove bound and intercalated DAPI through quantum-mechanical and spectroscopic tools Phys. Chem. Phys. 15 4596
47. Бакулев В.М, Ревегук З. В, ЧжанЦюши и Касьяненко Н. А. 2014 Люминесценция комплексов DAPI-ДНК при разных ионных силах В64 раствора Вестник СпбГУ 59 491-497
48. Sabnis, R. W. (Ram Wasudeo) (2010). Handbook of biological dyes and stains: synthesis and industrial application. Hoboken, N.J.: Wiley. ISBN 978-0-470-40753-0.
49. FazleAlamMd, Varshney S, Kham M. A, Laskar A.A and Younus H 2018 Int. J. Biol. Macromol. 113 300-308
50. C.S. Allardyce et al. Journal of Organometallic Chemistry 668 (2003) 35-42.
51. ЧжанЦюшиКонформационные изменения молекулы ДНК при взаимодействии с координационными соединениями платины и серебра. Диссертация на соискание ученой степени кандидата ф-м наук СПБГУ 2015


Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.




©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ