Тип работы:
Предмет:
Язык работы:


История колонизации островов Курильской гряды красно-серой полевкой по данным анализа изменчивости цитохрома b

Работа №142826

Тип работы

Дипломные работы, ВКР

Предмет

биология

Объем работы32
Год сдачи2022
Стоимость4600 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
12
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


1. Введение 3
2. Обзор литературы 4
2.2 Плейстоценовая история 7
2.3 Общая характеристика вида 11
3. Материалы и методы 13
2.1 Материал 13
2.2 Выделение ДНК и ПЦР 14
2.2 Филогенетический анализ 14
2.3 Филогеографический анализ 15
3. Результаты 16
3.1 Филогения 16
3.2 Демографические события 18
4. Обсуждение 20
Выводы 23

Исследования в области филогеографии дают представление о миграциях фауны в плейстоценовую эпоху. В частности, были предложены гипотезы о возможных путях колонизации Японских островов, острова Сахалина и Кунашира красно-серой полевкой Craseomys rufocanus Sundevall, 1846. В этой работе мы изучаем историю заселения одного из островов Южной Курильской гряды - острова Итуруп. По меньшей мере было две волны колонизации Итурупа - в плиоцене и в позднем плейстоцене (Pietsch et al., 2003). Фауна могла перемещаться по сухопутному мосту, который соединял острова Кунашир, Хоккайдо, Сахалин и приморские территории Евразийского континента. В результате трансгрессии уровня моря сухопутные мосты исчезали и острова постепенно изолировались. Между Итурупом и Кунаширом сухопутный мост исчез 14-15 тысяч лет назад (Belousova M., Belousov A., Miller T. P., 2009).
Согласно предыдущим работам, красно-серые полевки мигрировали с материка на Сахалин, далее на Хоккайдо и Кунашир в позднем плейстоцене (Abramson et al., 2012; Dobson, 1994; Wakana S. et al., 1996). Есть данные о том, что ареал красно-серой полевки включает остров Итуруп (Frisman et al., 2002), однако во всех ранее опубликованных работах нет информации о путях, по которым происходила миграция на Итуруп.
Цель - Предположить миграционные пути и период появления красно-серой полевки Craseomys rufocanus на острове Итуруп.
Задачи:
1. Изучить изменчивость участка митохондриального гена цитохрома б в популяциях островов Итурупа, Сахалина и Кунашира.
2. Провести демографический анализ островных популяций на основе анализа молекулярной дисперсии (AMOVA) и Баесовского скайлайн-плота (Bayesian Skyline plot).
3. Протестировать возможные гипотезы заселения острова Итуруп.
А) Популяции красно-серой полевки мигрировали с материка на Сахалин, оттуда на Кунашир и Хоккайдо, а затем на Итуруп. Такая миграция была возможна более 15 тысяч лет назад во время существования сухопутного моста между Итурупом, Кунаширом, Хоккайдо и Сахалином.
Б) Популяции красно-серой полевки появились на Итурупе в результате недавнего антропогенного завоза.

Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!


На основании результатов филогеографического анализа был подтверждена гипотеза B о недавнем случайном заселении красно-серыми полевками Qraseomys rufocanus острова Итуруп.
1. Популяции красно-серой полевки на всем острове Итурупе генетически однородны и имеют один гаплотип, в отличие от популяций с Сахалина, Хоккайдо и Дальнего Востока.
2. Популяции красно-серой полевки были завезены на Итуруп с Сахалина или Кунашира. Данный завоз был недавним, единичным, с небольшим количеством особей основателей. В последствии полевки расселились по всей территории острова.
3. Между популяциями красно-серых полевок Сахалина и Хоккайдо эпизодично возникал поток генов, однако в целом популяции изолированы, что подтверждается анализом генетических дистанций. В популяциях Кунашира и Сахалина за недавний период (~ 40 тысяч лет назад) наблюдался экспансивный рост.


1. Abramson, N. I., Lebedev, V. S., Tesakov, A. S., & Bannikova, A. A. (2009). Supraspecies relationships in the subfamily Arvicolinae (Rodentia, Cricetidae): An unexpected result of nuclear gene analysis. Molecular Biology, 43(5), 834-846. https://doi.org/10.1134/S0026893309050148
2. Abramson, N. I., Petrova, T. V., Dokuchaev, N. E., Obolenskaya, E. V., & Lissovsky, A. A. (2012). Phylogeography of the gray red-backed vole Craseomys rufocanus (Rodentia: Cricetidae) across the distribution range inferred from nonrecombining molecular markers. Russian Journal of Theriology, 11(2), 137-156. https://doi.org/10.15298/rusjtheriol.11.2.04
3. Abramson, N. I., Rodchenkova, E. N., & Kostygov, A. Yu. (2009). Genetic variation and phylogeography of the bank vole (Clethrionomys glareolus, Arvicolinae, Rodentia) in Russia with special reference to the introgression of the mtDNA of a closely related species, red-backed vole (Cl. Rutilus). Russian Journal of Genetics, 45(5), 533-545. https://doi.org/10.1134/S1022795409050044
4. Anderson N. H., Wisseman R. W. (1987). Recovery of the Trichoptera fauna near Mt. St. Helens five years after the 1980 eruption. 367-373.
5. Avise, J. C. (2009). Phylogeography: Retrospect and prospect. Journal of Biogeography, 36(1), 3-15. https://doi.org/10.1111/j.1365-2699.2008.02032.x
6. Avise J. C. et al. (2000). Phylogeography: The history and formation of species (Harvard university press).
7. Belousova M., Belousov A., Miller T. P. (2009). Kurile Islands. 520-525.
8. Brent C. Emerson, Christophe Thdbaud, & Emmanuel Paradis. (December2001). Revealing the demographic histories of species using DNA sequences. 16(12).
9. Chaline J., Graf J.-D. (1988). Phylogeny of the Arvicolinae (Rodentia): Biochemical and paleontological evidence. 69, 22-33.
10. Cook, J. A., Runck, A. M., & Conroy, C. J. (2004). Historical biogeography at the crossroads of the northern continents: Molecular phylogenetics of red-backed voles (Rodentia: Arvicolinae). Molecular Phylogenetics and Evolution, 30(3), 767-777. https://doi.org/10.1016/S1055-7903(03)00248-3
11. Dammerman K. W. (1922). The fauna of Krakatau, Verlaten island and Sebesy.
12. Darriba D, Taboada GL, Doallo R, & Posada D. (2012). jModelTest 2: More models, new heuristics and parallel computing. 9(8), 772.
13. Dobson, M. (1994). Patterns of distribution in Japanese land mammals. Mammal Review, 24(3), 91-111. https://doi.org/10.1111/j.1365-2907.1994.tb00137.x
14. Drummond, A. J. (2005). Bayesian Coalescent Inference of Past Population Dynamics from Molecular Sequences. Molecular Biology and Evolution, 22(5), 1185-1192. https://doi.org/10.1093/molbev/msi103
15. Frisman, L. V., Kartavtseva, I. V., Pavlenko, M. V., Kostenko, V. A., Suzuki, H., Iwasa, M., Nakata, K., & Chernyavskii, F. B. (2002). Gene-Geographic Variation and Genetic Differentiation in Red-Backed Voles of the Genus Clethrionomys (Rodentia, Cricetidae) from the Region of the Sea of Okhotsk. 38(5), 10....55


Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.



Подобные работы


©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ