📄Работа №136941

Тема: Генотипические и фенотипические характеристики штаммов Streptococcus agalactiae,выделенных у беременных женщин и новорожденных детей

📝
Тип работы Бакалаврская работа
📚
Предмет биология
📄
Объем: 44 листов
📅
Год: 2019
👁️
Просмотров: 54
Не подходит эта работа?
Закажите новую по вашим требованиям
Узнать цену на написание
ℹ️ Настоящий учебно-методический информационный материал размещён в ознакомительных и исследовательских целях и представляет собой пример учебного исследования. Не является готовым научным трудом и требует самостоятельной переработки.

📋 Содержание

Список сокращений 3
Введение 4
Глава 1. Обзор литературы 5
1.1. Систематическое положение и биологические свойства Streptococcus agalactiae. 5
1.2. Факторы вирулентности СГВ 8
1.3. Серотипы, сиквенс-типы и клональные комплексы СГВ 11
1.4. Клиническая значимость СГВ-инфекций 13
1.5. Профилактика СГВ-инфекции 15
Глава 2. Материалы и методы 18
2.1. Штаммы S. agalactiaeи условия их культивирования 18
2.2. Подготовка культуры для определения чувствительности к антибиотикам 20
2.3. Определение чувствительности к антибиотикам 20
2.4. Выделение ДНК 21
2.5. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) 22
2.6. Линейный электрофорез в агарозном геле 25
2.7. Статистическая обработка данных 25
Глава 3. Результаты и обсуждение 26
3.1. Резистентность к антибиотикам 26
3.2. Распределение генных локусов, кодирующих фимбрии СГВ 30
3.3. Распределение типов капсульных полисахаридов 34
3.4. Комбинации факторов вирулентности 36
Выводы 38
Список литературы 39

📖 Введение

Streptococcus agalactiae(стрептококки группы В, СГВ) являются основной причиной неонатального сепсиса и менингита, а также вызывают инфекции у беременных женщин, новорожденных детей, пожилых людей и людей с ослабленным иммунитетом [1, 2]. В качестве профилактики неонатальной инфекции, вызванной стрептококками группы B, с 1990-х годов и по сегодняшний день используют интранатальное внутривенное введение антибиотиков инфицированным женщинам [3]. Несмотря на то, что этот метод профилактики показал свою эффективность, со временем его использование перестало приводить к снижению заболеваемости [4]. Кроме того, если СГВ остается полностью чувствительным к пенициллину и ампициллину (препараты первой линии для антибиотикопрофилактики), то антибиотикорезистентность к некоторым альтернативным препаратам, используемым при аллергии на пенициллин (макролидам и клиндамицину), неуклонно растет. Для получения более эффективного метода профилактики начались разработки профилактических вакцин на основе капсульного полисахарида (capsular polysaccharide, CPS), белков фимбрий и других факторов вирулентности СГВ [5]. Эту задачу осложняет широкое разнообразие каждого типа мишени для вакцины, а также то, что распределение разных типов факторов вирулентности СГВ отличается в разных странах и может изменяться со временем.
Трудности разработки эффективных мер профилактики СГВ-инфекций связаны как с гетерогенностью и динамичностью генетического состава популяций СГВ, так и с отсутствием актуальных эпидемиологических данных для многих стран/регионов мира, включая Российскую Федерацию. Целью данного исследования стало изучение клинически значимых характеристик штаммов S. agalactiae,выделенных от беременных женщин и новорожденных детей в Санкт-Петербурге. Для достижения этой цели были поставлены задачи:
1) Выявление резистентности к антибиотикам, применяемым при СГВ-инфекциях (пенициллин, клиндамицин, эритромицин и ванкомицин);
2) Оценка распределения генов факторов вирулентности (фимбрий и капсульного полисахарида) среди клинических изолятов S. agalactiae;
3) Оценка изменчивости этих показателей в течение последних 8 лет посредством сравнения штаммов СГВ, выделенных в периоды 2010-2011 и 2017-2018 гг.

Возникли сложности?

Нужна качественная помощь преподавателя?

👨‍🎓 Помощь в написании

✅ Заключение

1) Чувствительность всех изученных штаммов S. agalactiaeк пенициллину и ванкомицину позволяет применять европейские рекомендации антибиотикопрофилактики СГВ-инфекций в Санкт-Петербурге.
2) Увеличение доли резистентных к клиндамицину штаммов среди стрептококков, изолированных в 2017-2018 годах, требует проверки клинических изолятов на устойчивость к этому антибиотику перед его применением.
3) Отсутствие смены доминирующих PI-генотипов S. agalactiaeсвидетельствует о перспективности белков фимбрий как мишени для создания вакцин.
4) Подавляющее большинство изученных штаммов S. agalactiaeотносились к пяти вакцинным CPS-генотипам.

Нужна своя уникальная работа?
Срочная разработка под ваши требования
Рассчитать стоимость
ИЛИ

📕 Список литературы

1. Baker C.J. The spectrum of perinatal group B streptococcal disease // Vaccine. Elsevier Ltd, 2013. Vol. 31, № S4. P. D3-D6.
2. Phares C.R. et al. Epidemiology of invasive group B streptococcal disease in the United States, 1999-2005. // J. Am. Med. Assoc. 2008. Vol. 299, № 17. P. 2056-2065.
3. Renzo G.C. Di et al. Intrapartum GBS screening and antibiotic prophylaxis : a European consensus conference // J Matern Fetal Neonatal Med. 2014. Vol. 27. P. 1-17.
4. Edmond K.M. et al. Group B streptococcal disease in infants aged younger than 3 months: Systematic review and meta-analysis // Lancet. Elsevier Ltd, 2012. Vol. 379, № 9815. P. 547-556.
5. Chen V.L., Avci F.Y., Kasper D.L. A Maternal Vaccine against Group B Streptococcus: Past, Present, ans Future. 2013. Vol. 28, № 31(04).
6. Whiley R.A. et al. Rosenbach 1884, 22. 2015.
7. Shottmuller H. Die Artunterscheidung der fur den menschen Pathogen Streptokokken durch Blutagar. // Munch. Med. Wochenschr. 1903. № 50. P. 849-853.
8. Brown J.H. The use of blood agar for the study of streptococci. Monograph 9. The Rockefeller Institute for Medical Research. New York, N.Y., 1919.
9. Lancefield B.R.C. A SEROLOGICAL D I F F E R E N T I A T I O N OF HUMAN AND ( From the Hospital of The Rockefeller Institute for Medical Research ). 1932. Vol. 1919, № 1. P. 571-595.
10. Sherman J.M. The streptococci // Bacteriol. Rev. 1937. Vol. 1, № 1. P. 3-97.
11. Elliott J.A., Facklam R.R., Richter C.B. Nonhemolytic Group B,. 1990. Vol. 28, № 3. P. 628-630.
12. Christie R., Atkins N.E., Munch-Peterson E. A note on a lytic phenomenon shown by group B streptococci // Aust. J. Exp. Biol. Med. Sci. 1944. Vol. 22. P. 197-200.
13. Smith, JP Durfee, KK Marymont J.J. A review of laboratory methods for identification of group B streptococci (Streptococcus agalactiae). // Am. J. Med. Technol. 1979. Vol. 45, № 3. P. 199-204.
14. Тотолян А.А., Суворов А.Н., Дмитриев А.В. Стрептококки группы В в патологии человека. “Человек,” 2009.
15. Fischetti V.A., Pancholi V., Schneewind O. Conservation of a hexapeptide sequence in the anchor region of surface proteins from Gram-positive cocci // Mol. Microbiol. 1990. Vol. 4, № 9. P. 1603-1605.
16. Glaser P. et al. Genome sequence of Streptococcus agalactiae , a pathogen causing invasive neonatal disease. 2002. Vol. 45. P. 1499-1513.
17. Tettelin H. et al. Complete Genome Sequence of a Virulent Isolate of Streptococcus
pneumoniae. 2014. Vol. 498, № 2001.
18. Shabayek S., Spellerberg B. Group B streptococcal colonization, molecular characteristics, and epidemiology // Front. Microbiol. 2018. Vol. 9, № MAR. P. 1-14.
19. Nizet V., Rubens C.E. Pathogenic mechanisms and virulence fac- tors of group B streptococci // Gram-Positive Pathog. 2006. P. 152-168.
20. Slotved H.C. et al. Serotype IX, a proposed new Streptococcus agalactiae serotype // J. Clin. Microbiol. 2007. Vol. 45, № 9. P. 2929-2936.
21. Cieslewicz M.J. et al. Structural and Genetic Diversity of Group B Streptococcus Capsular Polysaccharides. 2005. Vol. 73, № 5. P. 3096-3103.
22. Jiang S. et al. Regulation and Function of Pilus Island 1 in Group B Streptococcus. 2012. P. 2479-2490.
23. Lauer P. et al. Genome analysis reveals pili in Group B Streptococcus. 2005. № July. P. 95420.
24. Rosini R. et al. Identification of novel genomic islands coding for antigenic pilus-like structures in Streptococcus agalactiae // Mol. Microbiol. 2006. Vol. 61, № 1. P. 126-141.
25. Teatero S. et al. Genetic evidence for a novel variant of the pilus Island 1 backbone protein in group B Streptococcus // J. Med. Microbiol. 2017. Vol. 66, № 10. P. 1409-1415.
26. Dramsi S. et al. Assembly and role of pili in group B streptococci // Mol. Microbiol. 2006. Vol. 60, № 6. P. 1401-1413.
27. Pansegrau W., Bagnoli F. Pilus Assembly in Gram-Positive Bacteria. 2015.
28. Martins E.R. et al. Distribution of pilus islands in Streptococcus agalactiae that cause human infections: Insights into evolution and implication for vaccine development // Clin. Vaccine Immunol. 2013. Vol. 20, № 2. P. 313-316.
29. Meehan M., Cunney R., Cafferkey M. Molecular epidemiology of group B streptococci in Ireland reveals a diverse population with evidence of capsular switching // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2014. Vol. 33, № 7. P. 1155-1162.
30. Lu B. et al. Distribution of pilus islands and alpha-like protein genes of group B Streptococcus colonized in pregnant women in Beijing, China // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2015. Vol. 34, № 6. P. 1173-1179.
31. Madzivhandila M. et al. Distribution of pilus islands of group B streptococcus associated with maternal colonization and invasive disease in South Africa // J. Med. Microbiol. 2013. Vol. 62, № PART 2. P. 249-253.
32. Russell N.J. et al. Maternal Colonization With Group B Streptococcus and Serotype Distribution Worldwide : Systematic Review and. 2017. Vol. 65, № Suppl 2.
33. Martins E.R. et al. Analysis of group B streptococcal isolates from infants and pregnant women in Portugal revealing two lineages with enhanced invasiveness // J.
Clin. Microbiol. 2007. Vol. 45, № 10. P. 3224-3229.
34. Alhhazmi A., Hurteau D., Tyrrell G.J. Epidemiology of invasive group b streptococcal disease in Alberta, Canada, from 2003 to 2013 // J. Clin. Microbiol. 2016. Vol. 54, № 7. P. 1774-1781.
35. Jones N. et al. Multilocus Sequence Typing System for Group B Streptococcus // J. Clin. Microbiol. 2003. Vol. 41, № 6. P. 2530-2536.
36. Davies H.D. et al. Multilocus Sequence Typing of Serotype III Group B Streptococcus and Correlation with Pathogenic Potential // J. Infect. Dis. 2004. Vol. 189, № 6. P. 1097-1102.
37. Bohnsack J.F. et al. Population structure of invasive and colonizing strains of Streptococcus agalactiae from neonates of six U.S. academic centers from 1995 to 1999 // J. Clin. Microbiol. 2008. Vol. 46, № 4. P. 1285-1291.
38. Luan S. et al. Multilocus Sequence Typing of Swedish Invasive Group B Streptococcus Isolates Indicates a Neonatally Associated Genetic Lineage and Capsule Switching Multilocus Sequence Typing of Swedish Invasive Group B Streptococcus Isolates Indicates a Neonatally Asso. 2005. Vol. 43, № 8. P. 3727-3733.
39. Skov Sorensen U.B. et al. Emergence and global dissemination of host-specific Streptococcus agalactiae clones // MBio. 2010. Vol. 1, № 3. P. 1-9.
40. Da Cunha V. et al. Streptococcus agalactiae clones infecting humans were selected and fixed through the extensive use of tetracycline // Nat. Commun. 2014. Vol. 5. P. 1-12.
41. Brochet M. et al. Shaping a bacterial genome by large chromosomal replacements, the evolutionary history of Streptococcus agalactiae // Proc. Natl. Acad. Sci. 2008. Vol. 105, № 41. P. 15961-15966.
42. Bellais S. et al. Capsular switching in group B streptococcus CC17 hypervirulent clone: A future challenge for polysaccharide vaccine development // J. Infect. Dis. 2012. Vol. 206, № 11. P. 1745-1752.
43. Teatero S. et al. Characterization of invasive group B Streptococcus strains from the greater Toronto area, Canada // J. Clin. Microbiol. 2014. Vol. 52, № 5. P. 1441-1447.
44. Chaffin D.O. et al. The Serotype of Type Ia and III Group B Streptococci Is Determined by the Polymerase Gene within the Polycistronic Capsule Operon The Serotype of Type Ia and III Group B Streptococci Is Determined by the Polymerase Gene within the Polycistronic Capsule Op // J. Bacteriol. 2000. Vol. 182, № 16. P. 4466-4477.
45. Teatero S. et al. Serotype distribution, population structure, and antimicrobial resistance of group b streptococcus strains recovered from colonized pregnant women // J. Clin. Microbiol. 2017. Vol. 55, № 2. P. 412-422.
46. Lancefield B.Y.R.C., Hare R. THE SEROLOGICAL DIFFERENTIATION OF PATHOGENIC AND NON-PATHOGENIC STRAINS OF HEMOLYTIC STREPTOCOCCI FROM PARTURIENT WOMEN * ( From the Hospital of The Rockefeller Institute for Medical Research , New York , and the Bernhard Baron Memorial Research Laborato. 1934.
47. Fry R.M. Fatal Infections by Haemolytic Streptococcus Group B. // Lancet. 1938. Vol.
1. P. 199-201.
48. Schuchat a. Epidemiology of group B streptococcal disease in the United States: shifting paradigms. // Clin. Microbiol. Rev. 1998. Vol. 11, № 3. P. 497-513.
49. Schuchat a. Group B streptococcus. // Lancet. 1999. Vol. 353, № 9146. P. 51-56.
50. Schrag S.J. et al. Group B Streptococcal Disease in the Era of Intrapartum Antibiotic Prophylaxis // N. Engl. J. Med. 2000. Vol. 342, № 1. P. 15-20.
51. Centers for Disease Control and Prevention. Prevention of Perinatal Group B Streptococcal Disease // Mmwr. 2010. Vol. 59, № No. RR-10. P. 1-32.
52. Russell N.J. et al. Risk of Early-Onset Neonatal Group B Streptococcal Disease with Maternal Colonization Worldwide: Systematic Review and Meta-analyses // Clin. Infect. Dis. 2017. Vol. 65, № Suppl 2. P. S152-S159.
53. Boyer K.M., Gotoff S.P. Strategies for chemoprophylaxis of GBS early-onset infections // Antibiot Chemother. 1985. Vol. 35. P. 267-280.
54. Boyer K.M., Gotoff S.P. Prevention of early-onest neonatal group B streptococcal disease with selective intrapartum chemoprophylaxis // N Engl J Med. 1986. Vol. 314. P.1665-1669.
55. Bloom S.L. et al. Ampicillin for neonatal group B streptococcal prophylaxis: how rapidly can bactericidal concentrations be achieved? // Am J Obs. Gynecol. 1996. Vol. 175. P. 974-976.
56. Weisblum B. Erythromycin Resistance by Ribosome Modification. 1995. Vol. 39, № 3. P. 577-585.
57. Zhong P. et al. Methylation in MLS-Resistant Streptococcus pneumoniae by Macrolides and Ketolides Induction of Ribosome. 1999. Vol. 5, № 3.
58. Giersing B.K. et al. Report from the World Health Organization’s Product Development for Vaccines Advisory Committee (PDVAC) meeting, Geneva, 7-9th Sep 2015 // Vaccine. 2016. Vol. 34, № 26. P. 2865-2869.
59. Madhi S.A. et al. Antibody Kinetics and Response to Routine Vaccinations in Infants Born to Women Who Received an Investigational Trivalent Group B Streptococcus Polysaccharide CRM197-Conjugate Vaccine during Pregnancy // Clin. Infect. Dis. 2017. Vol. 65, № 11. P. 1897-1904.
60. Kobayashi M. et al. Group B Streptococcus vaccine development: present status and future considerations , with emphasis on perspectives for low and middle income countries [ version 1; referees : 2 approved ] Referee Status : 2016. № 0.
61. Kobayashi M. et al. WHO consultation on group B Streptococcus vaccine development: Report from a meeting held on 27 - 28 April 2016 // Vaccine. The Author(s), 2016. № April.
62. Fabbrini M. et al. The Protective Value of Maternal Group B Streptococcus Antibodies: Quantitative and Functional Analysis of Naturally Acquired Responses to Capsular Polysaccharides and Pilus Proteins in European Maternal Sera // Clin. Infect. Dis. 2016. Vol. 63, № 6. P. 746-753.
63. Margarit I. et al. Preventing Bacterial Infections with Pilus-Based Vaccines: the Group B Streptococcus Paradigm // J. Infect. Dis. 2009. Vol. 199, № 1. P. 108-115.
64. Nuccitelli A. et al. Structure-based approach to rationally design a chimeric protein for an effective vaccine against Group B Streptococcus infections. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011. Vol. 108, № 25. P. 10278-10283.
65. Lin S.M. et al. Vaccination with a latch peptide provides serotypeindependent protection against group B streptococcus infection in mice // J. Infect. Dis. 2018. Vol. 217, № 1. P. 93-102.
66. Santillan D.A., Andracki M.E., Hunter S.K. Protective immunization in mice against group B streptococci using encapsulated C5a peptidase // Am. J. Obstet. Gynecol. 2008. Vol. 198, № 1. P. 1-6.
67. Суворов, А. Н. Грабовская, К. Б. Леонтьева, Г. Ф. Мерингова, Л. Ф. Королева, И. Н. Дуплик, Н. В. Тотолян А.А. Рекомбинантные фрагменты консервативных белков стрептококков группы В как основа специфической вакцины // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2010. № 2. P. 44-50.
68. Santillan D.A. et al. Efficacy of polymeric encapsulated C5a peptidasebased group B streptococcus vaccines in a murine model // Am. J. Obstet. Gynecol. Elsevier Inc., 2011. Vol. 205, № 3. P. 249.e1-249.e8.
69. Lamy M.C. et al. Rapid detection of the “highly virulent” group B streptococcus ST-17 clone // Microbes Infect. 2006. Vol. 8, № 7. P. 1714-1722.
70. Margues, M. B. Kasper, D. L. Shroff A. et al. Functional activity of antibodies to the group B polysaccharide of group B streptococci elicited by a polysaccharide-protein conjugate vaccine . Functional Activity of Antibodies to the Group B Polysaccharide of Group B Streptococci Elicited by Polysaccha. 1994. Vol. 62, № 5. P. 1593-1599.
71. Kim S. et al. Cost-effectiveness of a potential group B streptococcal vaccine for pregnant women in the United States // Vaccine. Elsevier Ltd, 2017. P. 1-10.
72. Martins E.R., Melo-Cristino J., Ramirez M. Evidence for rare capsular switching in Streptococcus agalactiae // J. Bacteriol. 2010. Vol. 192, № 5. P. 1361-1369.
73. Brochet M., Couve E., Glaser P. Integrative Conjugative Elements and Related Elements Are Major Contributors to the Genome Diversity of Streptococcus agalactiae □ §. 2008. Vol. 190, № 20. P. 6913-6917.
74. Teatero S. et al. Clonal Complex 17 Group B Streptococcus strains causing invasive disease in neonates and adults originate from the same genetic pool. 2016. № December 2015. P. 1-9.
75. Springman A.C. et al. Pilus distribution among lineages of Group B Streptococcus: An evolutionary and clinical perspective // BMC Microbiol. 2014. Vol. 14, № 1. P. 1-11.
76. Yao K. et al. Capsular gene typing of streptococcus agalactiae compared to serotyping by latex agglutination // J. Clin. Microbiol. 2013. Vol. 51, № 2. P. 503-507.
77. Poyart C. et al. Multiplex PCR assay for rapid and accurate capsular typing of group B streptococci // J. Clin. Microbiol. 2007. Vol. 45, № 6. P. 1985-1988.
78. Imperi M. et al. A multiplex PCR assay for the direct identification of the capsular type (Ia to IX) of Streptococcus agalactiae // J. Microbiol. Methods. 2010. Vol. 80, №
2. P. 212-214.

🛒 Оформить заказ

Работу высылаем в течении 5 минут после оплаты.

©2026 Cервис помощи студентам в выполнении работ