Список сокращений 3
Введение 4
Глава 1. Обзор литературы 5
1.1. Систематическое положение и биологические свойства Streptococcus agalactiae. 5
1.2. Факторы вирулентности СГВ 8
1.3. Серотипы, сиквенс-типы и клональные комплексы СГВ 11
1.4. Клиническая значимость СГВ-инфекций 13
1.5. Профилактика СГВ-инфекции 15
Глава 2. Материалы и методы 18
2.1. Штаммы S. agalactiaeи условия их культивирования 18
2.2. Подготовка культуры для определения чувствительности к антибиотикам 20
2.3. Определение чувствительности к антибиотикам 20
2.4. Выделение ДНК 21
2.5. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) 22
2.6. Линейный электрофорез в агарозном геле 25
2.7. Статистическая обработка данных 25
Глава 3. Результаты и обсуждение 26
3.1. Резистентность к антибиотикам 26
3.2. Распределение генных локусов, кодирующих фимбрии СГВ 30
3.3. Распределение типов капсульных полисахаридов 34
3.4. Комбинации факторов вирулентности 36
Выводы 38
Список литературы 39
Streptococcus agalactiae(стрептококки группы В, СГВ) являются основной причиной неонатального сепсиса и менингита, а также вызывают инфекции у беременных женщин, новорожденных детей, пожилых людей и людей с ослабленным иммунитетом [1, 2]. В качестве профилактики неонатальной инфекции, вызванной стрептококками группы B, с 1990-х годов и по сегодняшний день используют интранатальное внутривенное введение антибиотиков инфицированным женщинам [3]. Несмотря на то, что этот метод профилактики показал свою эффективность, со временем его использование перестало приводить к снижению заболеваемости [4]. Кроме того, если СГВ остается полностью чувствительным к пенициллину и ампициллину (препараты первой линии для антибиотикопрофилактики), то антибиотикорезистентность к некоторым альтернативным препаратам, используемым при аллергии на пенициллин (макролидам и клиндамицину), неуклонно растет. Для получения более эффективного метода профилактики начались разработки профилактических вакцин на основе капсульного полисахарида (capsular polysaccharide, CPS), белков фимбрий и других факторов вирулентности СГВ [5]. Эту задачу осложняет широкое разнообразие каждого типа мишени для вакцины, а также то, что распределение разных типов факторов вирулентности СГВ отличается в разных странах и может изменяться со временем.
Трудности разработки эффективных мер профилактики СГВ-инфекций связаны как с гетерогенностью и динамичностью генетического состава популяций СГВ, так и с отсутствием актуальных эпидемиологических данных для многих стран/регионов мира, включая Российскую Федерацию. Целью данного исследования стало изучение клинически значимых характеристик штаммов S. agalactiae,выделенных от беременных женщин и новорожденных детей в Санкт-Петербурге. Для достижения этой цели были поставлены задачи:
1) Выявление резистентности к антибиотикам, применяемым при СГВ-инфекциях (пенициллин, клиндамицин, эритромицин и ванкомицин);
2) Оценка распределения генов факторов вирулентности (фимбрий и капсульного полисахарида) среди клинических изолятов S. agalactiae;
3) Оценка изменчивости этих показателей в течение последних 8 лет посредством сравнения штаммов СГВ, выделенных в периоды 2010-2011 и 2017-2018 гг.
1) Чувствительность всех изученных штаммов S. agalactiaeк пенициллину и ванкомицину позволяет применять европейские рекомендации антибиотикопрофилактики СГВ-инфекций в Санкт-Петербурге.
2) Увеличение доли резистентных к клиндамицину штаммов среди стрептококков, изолированных в 2017-2018 годах, требует проверки клинических изолятов на устойчивость к этому антибиотику перед его применением.
3) Отсутствие смены доминирующих PI-генотипов S. agalactiaeсвидетельствует о перспективности белков фимбрий как мишени для создания вакцин.
4) Подавляющее большинство изученных штаммов S. agalactiaeотносились к пяти вакцинным CPS-генотипам.
