ВВЕДЕНИЕ 3
ГЛАВА I Обзор литературы 5
ГЛАВА II Материалы и методы 17
ГЛАВА III Результаты 27
ГЛАВА IV Обсуждение 35
ВЫВОДЫ 39
БЛАГОДАРНОСТИ 40
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 41
Морские изоляты, иначе называемые морскими озёрами - особые, малоизученные категории морских систем. Изоляты в узком смысле термина - это полуизолированные водоемы, сообщающиеся с морем поверхностно (Strom, 1936). Примерами таких водоёмов являются губа Ивановская (северо-восточное побережье Кольского полуострова), «тресковое» озеро Огак (остров Земля Баффина), «медузовые» озера острова Млет в Адриатическом море. Если морские изоляты, как правило, встречаются в полярных и приполярных областях, то для тропиков характерны анхиалиновые водоемы (Stock et al., 1986). Они сообщаются с морем не на поверхности, а под землей — через тоннели и трещины в карсте или за счет фильтрации воды через рыхлый грунт. Примерами таких водоёмов являются озеро Медуз в архипелаге Палау, озеро Какабан на острове Калимантан и озеро Могильное на острове Кильдин - единственное анхиалиновое озеро в Арктике. Озеро Могильное сочетает в себе самые характерные признаки морских озёр, как анхиалиновых тропических так и арктических озёр-изолятов (Strelkov et al, 2014).
Традиционно, разными исследователями независимо выдвигалась гипотеза о том, что морское озеро - это древняя, изолированная, стабильная система, эволюционирующая по собственным законам. Первым это сказал в начале XX века К.М. Дерюгин (1925) об озере Могильном. Однако, по результатам последующих исследований оказалось, что озеро Могильное гораздо моложе, чем думал Дерюгин - около 1 500 лет (Митяев и др, 2008) против 10 000. Стабильность Могильного является относительной. Только за XX век стратификация вод в озере изменилась, а биоразнообразие сократилось. Также, сравнение видовых списков разных лет показывает, что в озеро могут проникать животные извне (Strelkov et al, 2014). Постулированная «древность», «стабильность» и «изолированность» других морских озер требует уточнения.
Если географы понимают под островом участок суши, окружённый со всех сторон водой и постоянно возвышающийся над водой, то биогеографы - участок одной среды обитания организмов, окружённый со всех сторон другой средой обитания. С биогеографической точки зрения, морское озеро можно определить как остров океана. Уподобляя морские изоляты островам, мы должны обсудить гипотезу о биологической изоляции озёрных популяций от «материковых», то есть океанических. Одним из косвенных методов оценки изоляции популяций является генетический.
В литературе есть примеры генетических исследований обитателей морских озер, в первую очередь таких «титульных» видов как атлантической трески арктических изолятов и оз. Могильного (Zhivotovsky et al., 2015) и медуз родов Mastigiasи Aureliaтропических и средиземноморских озер (Dawson and Hamner, 2005; Schroth et al., 2002). Попыток обобщить весь объем опубликованных данных по генетике обитателей морских озер, на сегодняшний день, не предпринималось.
Гидробиологи СПбГУ - представители научной школы Константина Михайловича Дерюгина, участвующие в исследованиях оз. Могильного с конца XIX века (Дерюгин, 1925). В последние 10 лет одним из направлений работы было описание генофондов обитателей оз. Могильного (Strelkov et al. 2007; Andreev et al. 2015, Skazina et al. 2018). В последние два года в этих работах принимал участие автор настоящей работы. Интерпретация данных по генофондам озера затруднена дефицитом сравнительных данных по сопредельным морским популяциям. Российский сектор Баренцева моря, равно как и моря Русского Севера вообще, можно образно назвать «белым пятном» на филогеографической карте океана. В частности, в Генбанке NCBI мы не нашли ни одной нуклеотидной последовательности планктонных беспозвоночных из баренцевоморских вод Кольского полуострова.
Таким образом, для проверки гипотезы об изоляции гидробионтов в морских озёрах, нам нужно обобщить литературные данные по генетике обитателей морских озер, обобщить архивные данные Кафедры ихтиологии и гидробиологии СПбГУ, включая собственные данные, и предметно обсудить вопрос о структуре морских генофондов баренцевоморского региона.
Цель работы:
Проверить гипотезу об изоляции гидробионтов в морских озёрах.
Задачи работы:
> Обобщить литературные данные об особенностях генофондов обитателей морских озер
> Изучить митохондриальную изменчивость избранных видов планктонных беспозвоночных Cyanea capillata (Linnaeus,1758) и Pseudocalanus acuspes (Giesbrecht, 1881) Баренцевоморского региона, включая популяции морских изолятов оз. Могильное и губа Ивановская
> Обобщить неопубликованные данные коллектива Кафедры об особенностях генофондов обитателей озера Могильное
> Популяции обитателей морских озёр, как правило, демонстрируют признаки изолированных генофондов, которые подверглись генетическому дрейфу.
> По результатам комплексного исследования озера Могильного можно заключить, что всё макросообщество озера существует в условиях изоляции. Средняя потеря изменчивости в озерных популяциях составляет 60%.
> На фоне данных по другим морским озёрам, предварительные данные по Cyanea capillata и Pseudocalanus acuspesморского изолята губа Ивановская являются неожиданными: в этих популяциях наблюдается не пониженная, а повышенная изменчивость.
> Пример Cyanea capillataпоказывает, что планктонные виды могут иметь в баренцевоморском регионе сложную популяционную структуру. Пример Pseudocalanus acuspesпоказывает, что планктонные виды могут иметь в баренцевоморском регионе сложную биогеографическую историю.
> Известно, что для сухопутных животных океанические острова могут служить рефугиумами для древних эволюционных линий, центрами видообразования, вместилищами изолированных, уникальных, генофондов. Анализ собственных и литературных данных демонстрирует, что тем же самым морские озёра служат для морских обитателей.
1. Дерюгин, К. М. (1925). Реликтовое озеро Могильное (остров Кильдин в Баренцевом море). Тр. ПЕНИ, 2, 1-112.
2. Дрейпер, Д., Скотт, Р., Армитидж, Ф., Дьюри, Г., Джэкоб, Л., Уолден, Р., &
Джефферсон, Р. (1991). Генная инженерия растений. Лабораторное руководство. Учебное издание. Мир.
3. Митяев, М. В., Корсун, С. А., Стрелков, П. П., & Матишов, Г. Г. (2008). Древние береговые линии Восточного Кильдина. Доклады Академии наук 423(4), 546-550.
4. Харди, Д. С., Рено, К. Б., Пономаренко, В. П., Мухина, Н. В., Ярагина, Н. А., Шеросен, Й. Е., & Хатчингс, Д. А. (2008). Изоляция популяций атлантической трески Gadus morhua (Gadiformes) в северных меромиктических озёрах - повторяющийся в Арктике феномен. Вопросы ихтиологии, 48(2), 179-190.
5. Aarbakke, O. N. S., Bucklin, A., Halsband, C., & Norrbin, F. (2011). Discovery of Pseudocalanus moultoni in Northeast Atlantic waters based on mitochondrial COI sequence variation. Journal of Plankton Research, 33(10), 1487-1495.
6. Aarbakke, O. N. S., Bucklin, A., Halsband, C., & Norrbin, F. (2014). Comparative phylogeography and demographic history of five sibling species of Pseudocalanus (Copepoda: Calanoida) in the North Atlantic Ocean. Journal of experimental marine biology and ecology, 461, 479-488.
7. Abboud, S. S., Daglio, L. G., & Dawson, M. N. (2018). A global estimate of genetic and geographic differentiation in macromedusae implications for identifying the causes of jellyfish blooms. Marine Ecology Progress Series, 591, 199-216.
8. Andreev, V., Fokin, M., Mugue, N., & Strelkov, P. (2015). Long-term persistence and evolutionary divergence of a marine fish population with a very small effective population size (Kildin cod Gadus morhua kildinensis). Marine Biology, 162(5), 979-992.
9. Becking, L. E., de Leeuw, C. A., Knegt, B., Maas, D. L., De Voogd, N. J., Suyatna, I., & Peijnenburg, K. T. (2016). Highly divergent mussel lineages in isolated Indonesian marine lakes. PeerJ, 4, e2496.
10. Bromham, L. (2009). Why do species vary in their rate of molecular evolution? Biology letters, 5(3), 401-404.
11. Bucklin, A., Frost, B., Bradford-Grieve, J., Allen, L., & Copley, N. (2003). Molecular systematic and phylogenetic assessment of 34 calanoid copepod species of the Calanidae and Clausocalanidae. Marine Biology, 142(2), 333-343.
12. Castellani, C., & Edwards, M. (Eds.). (2017). Marine Plankton: A Practical Guide to Ecology, Methodology, and Taxonomy. Oxford University Press.
13. Clague, D. A., & Gillespie, R. G. (Eds.). (2009). Encyclopedia of islands. University of California Press.
14. Costa, F. O., DeWaard, J. R., Boutillier, J., Ratnasingham, S., Dooh, R. T., Hajibabaei, M., & Hebert, P. D. (2007). Biological identifications through DNA barcodes: the case of the Crustacea. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 64(2), 272-295.
15. Dawson, M. N. (2005). Five new subspecies of Mastigias (Scyphozoa: Rhizostomeae: Mastigiidae) from marine lakes, Palau, Micronesia. Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom, 85(3), 679-694.
16. Dawson, M. N. (2005). Incipient speciation of Catostylus mosaicus (Scyphozoa,
Rhizostomeae, Catostylidae), comparative phylogeography and biogeography in south-east Australia. Journal of Biogeography, 32(3), 515-533.
17. Dawson, M. N., & Hamner, W. M. (2005). Rapid evolutionary radiation of marine zooplankton in peripheral environments. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(26), 9235-9240.
18. Gotoh, R. O., Chiba, S. N., Goto, T. V., Tamate, H. B., & Hanzawa, N. (2011). Population genetic structure of the striped silverside, Atherinomorus endrachtensis (Atherinidae, Atheriniformes, Teleostei), inhabiting marine lakes and adjacent lagoons in Palau: marine lakes are “Islands” for marine species. Genes & genetic systems, 86(5), 325-337.
19. Gotoh, R. O., Sekimoto, H., Chiba, S. N., & Hanzawa, N. (2009). Peripatric differentiation among adjacent marine lake and lagoon populations of a coastal fish, Sphaeramia orbicularis (Apogonidae, Perciformes, Teleostei). Genes & genetic systems, 84(4), 287-295.
20. Hall, T. (1997). BioEdit: a biological sequence alignment editor for Windows 95/98/NT. V5. 0.9 Available from http://www.mbio.ncsu.edu/BioEdit/bioedit.html.
21. Hammer, 0., Harper, D. A., & Ryan, P. D. (2001). PAST: paleontological statistics software package for education and data analysis. Palaeontologia electronica, 4(1), 9.
22. Hamner, W. M. (1982). Strange world of Palau's salt lakes. National geographic, 161(2),264-282.
23. Hardie, D. C., Gillett, R. M., & Hutchings, J. A. (2006). The effects of isolation and colonization history on the genetic structure of marine-relict populations of Atlantic cod (Gadus morhua) in the Canadian Arctic. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 63(8), 1830-1839.
24. Kearse, M., Moir, R., Wilson, A., Stones-Havas, S., Cheung, M., Sturrock, S., ... & Thierer, T. (2012). Geneious Basic: an integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data. Bioinformatics, 28(12), 1647-1649.
25. Kumar, S., Stecher, G., Li, M., Knyaz, C., & Tamura, K. (2018). MEGA X: molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms. Molecular biology and evolution, 35(6), 1547-1549.
26. Lait, L. A., Marshall, H. D., & Carr, S. M. (2018). Phylogeographic mitogenomics of Atlantic cod Gadus morhua: Variation in and among trans-Atlantic, trans-Laurentian, Northern cod, and landlocked fjord populations. Ecology and evolution, 8(13), 6420-6437.
27. Leigh, J. W., & Bryant, D. (2015). Popart: full-feature software for haplotype network construction. Methods in Ecology and Evolution, 6(9), 1110-1116.
28. Librado, P., & Rozas, J. (2009). DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data. Bioinformatics, 25(11), 1451-1452.
29. Maas, D. L., Prost, S., Bi, K., Smith, L. L., Armstrong, E. E., Aji, L. P., ... & Becking, L. E. (2018). Rapid divergence of mussel populations despite incomplete barriers to dispersal. Molecular ecology, 27(7), 1556-1571.
30. Markhaseva, E. L., Abramova, A. A., & Mingazov, N. D. (2012). Pseudocalanus acuspes (Crustacea: Copepoda) from the White Sea. Proceedings ZIN, 316, 57-70.
31. Mayr, E. (1954). Change of genetic environment and evolution. In: Evolution as a Process, edited by J. Huxley, A. C. Hardy and E. B. Ford. Allen & Unwin, London.
32. McLaren, I. A. (1969). Population and production ecology of zooplankton in Ogac Lake, a landlocked fiord on Baffin Island. Journal of the Fisheries Board of Canada, 26(6),1485¬1559.
33. Meyer, C. P., Geller, J. B., & Paulay, G. (2005). Fine scale endemism on coral reefs: archipelagic differentiation in turbinid gastropods. Evolution, 59(1), 113-125.
34. Novikov, G. G., Afanas’ev, K. I., Rubtsova, G. A., & Stroganov, A. N. (2006). Some genetic parameters of Kildin cod Gadus morhua kildinensis (Gadidae, Gadiformes). Journal of Ichthyology, 46(8), 674-676.
35. Orsini, L., Vanoverbeke, J., Swillen, I., Mergeay, J., & De Meester, L. (2013). Drivers of population genetic differentiation in the wild: isolation by dispersal limitation, isolation by adaptation and isolation by colonization. Molecular ecology, 22(24), 5983-5999.
36. Nei, M., & Saitou, N. (1987). The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Molecular biology and evolution, 4(4), 406-425.
37. Schroth, W., Jarms, G., Streit, B., & Schierwater, B. (2002). Speciation and phylogeography in the cosmopolitan marine moon j elly, Aurelia sp. BMC Evolutionary Biology, 2(1), 1.
38. Skazina, M., Gagarina, A., Shunatova, N., Strelkov, P. C., Simon, A. C., & Bierne, N. (2018). Landlocked population of blue mussels Mytilus edulis L. with extraordinary operational sex ratio, 25%F:75%M. Marine Evolution 2018. A Marcus Wallenberg Symposium; Abstract Book. Stromstad, Sweden, May 15-17, 2018. University of Gothenburg.
39. Stock, J. H., Iliffe, T. M., & Williams, D. (1986). The concept ‘anchialine’ reconsidered. Stygologia, 2(1/2), 90-92.
40. Strelkov, P., Nikula, R., & Vainola, R. (2007). Macoma balthica in the White and Barents Seas: properties of a widespread marine hybrid swarm (Mollusca: Bivalvia). Molecular ecology, 16(19), 4110-4127.
41. Strelkov, P., Shunatova, N., Fokin, M., Usov, N., Fedyuk, M., Malavenda, S., ... & Korsun, S. (2014). Marine lake Mogilnoe (Kildin Island, the Barents Sea): one hundred years of solitude. Polar biology, 37(3), 297-310.
42. Stroganov, A. N., Afanasiev, K. I., Rubtsova, G. A., Rakitskaya, T. A., & Semenova, A. V. (2011). Data on variation of microsatellite loci in Kildin cod Gadus morhua kildinensis
(Gadidae). Journal of ichthyology, 51(7), 500.
43. Strom, K. M. (1936). Land-locked Waters: Hydrography and Bottom Deposits in Badly- ventilated Norwegian Fjords, with Remarks Upon Sedimentation Under Anaerobic Conditions (No. 7). Dybwad
44. Teterina, A. A., & Zhivotovsky, L. A. (2016). Genomic testing of landlocked Kildin cod (Gadus morhua kildinensis) for its ancestral state: stationary or migratory ecotype? (No. e2497v1). PeerJ Preprints.
45. Wilson, E. O., & MacArthur, R. H. (1967). The theory of island biogeography. Princeton, NJ.
46. Zhivotovsky, L. A., Teterina, A. A., Mukhina, N. V., Stroganov, A. N., Rubtsova, G. A., & Afanasiev, K. I. (2016). Effects of genetic drift in a small population of Atlantic cod (Gadus morhua kildinensis Derjugin) landlocked in a meromictic lake: genetic variation and conservation measures. Conservation genetics, 17(1), 229-238.