Тип работы:
Предмет:
Язык работы:


МОДЕЛИРОВАНИЕ РАСПРОСТРАНЕНИЯ ВИЧ-ИНФЕКЦИИ В МЕГАПОЛИСЕ НА ПРИМЕРЕ САНКТ-ПЕТЕРБУРГА

Работа №135010

Тип работы

Дипломные работы, ВКР

Предмет

медицина

Объем работы65
Год сдачи2019
Стоимость4390 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
48
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


Список сокращений 3
Введение 4
Глава I. Обзор литературы 7
1.1. Ситуация с ВИЧ инфекцией 7
1.2 Эпидемический процесс ВИЧ инфекции 10
1.3. Моделирование ВИЧ инфекции 12
ГЛАВА II. Материалы и методы 18
2.1. Источники данных 18
2.2. Используемые данные 20
2.3. Свойства модели социальной дезадаптации 23
2.4. Методика определения класса региона 25
Глава III. Расчет результатов 27
3.1. Расчет исходных данных 27
3.2. Расчет коэффициентов модели 29
3.3. Результаты моделирования 30
Глава IV. Анализ полученных результатов 33
4.1. Анализ коэффициентов 33
4.2. Анализ данных моделирования 37
4.3. Определение класса региона 45
4.4 Сравнение данных различных регионов. 46
Заключение 49
Выводы 51
Практические рекомендации 52
Список литературы 53
Приложения 59


В Российской Федерации заболеваемость ВИЧ инфекцией достигла состояния эпидемии. Общее число инфицированных на конец 2018 года во всех регионах составляет 896 075 согласно данным Минздрава и 1 007 369 про данным Роспотребнадзора. Причиной различия данных является разный подход в составлении групп: Роспотребнадзор учитывает суммарное количество случаев, выявленных в ходе скрининга, Минздрав учитывает только тех, кто обратился с документами по факту обнаружения инфекции в ходе скрининга. Пораженность населения страны составляет 679,5 на 100 тыс. населения. Растет число регионов с высокой пораженностью (более 0.5% населения) с 22 в 2014 до 35 в 2018. Санкт-Петербург относится к группе наиболее пораженных ВИЧ инфекцией субъектов: 994,5 на 100 тыс. населения. [7] В Санкт-Петербурге суммарное количество заболевших составляет 57420, заболеваемость составляет 31,4 на 100 тысяч населения [6]. 25% и инфицированных не знают о наличии заболевания [5] При этом особое внимание необходимо обратить на растущую заболеваемость в стране, несмотря на проводимую профилактическую и лечебную работу. По данным ВОЗ, РФ является лидером по заболеваемость в Европе [11]. Для борьбы с распространением ВИЧ инфекции в мире был принят концепт "90-90-90", 90% людей, живущих с ВИЧ, знают свой статус, 90% из них должны принимать АРВТ, 90% из них должны иметь неопределяемую вирусную нагрузку. Однако, согласно последним исследованиям, этот принцип не оправдался [43], и перед мировым сообществом снова встал вопрос, как именно можно остановить распространение данной инфекции.
Поскольку на данный момент ВИЧ инфекция не излечима за исключением 3 известных пациентов[44], для борьбы с распространением инфекции необходимо проводить в первую очередь противоэпидемические мероприятия профилактического характера. Однако для полного понимания всех групп риска, источников инфицирования, миграции внутри этих групп необходимы данные об эпидемическом процессе, который можно описать в виде модели. Видов данных моделей представлено большое количество, эти модели различаются по точности, по структуре, по применимости. Но многие из этих моделей не применимы в условиях РФ и СНГ ввиду разной структуры групп риска и путей передачи [33, 34]
Цель исследования
Улучшить качество прогнозирования и учета распространения ВИЧ инфекции. Создать оптимальную модель эпидемического процесса распространения ВИЧ инфекции в городе Санкт-Петербург, а также выявить влияние различных факторов на процесс с целью формирования оптимального плана борьбы с данным заболеванием.
Задачи исследования
1. Проанализировать виды моделей и определить наиболее походящую.
2. Описать изменения статистических показателей в период эпидемического процесса (заболеваемость, пораженность) на территории Санкт-Петербурга.
3. Оценить влияние доступных для изменения факторов на распространение ВИЧ в городе Санкт - Петербург.
4. Определить качественную структуру эпидемического процесса по путям передачи.
5. Изучить прогноз распространения ВИЧ инфекции на интервале до 2020 года.
6. Дать рекомендации по дальнейшей работе с ВИЧ инфекцией.
Научная новизна
Впервые проведено математическое моделирование распространения ВИЧ инфекции в рамках города Санкт-Петербург. Выявлены скрытые динамические процессы в группе ВИЧ инфицированных. Проанализирована эффективность применения антиретровирусной терапии, определены основные факторы риска распространения ВИЧ инфекции,. Показана эффективность применения методов математического моделирования инфекционного процесса в мегаполисе.
Практическая значимость
Создана эффективная модель распространения ВИЧ инфекции, выявлены недостатки работы статистических служб по данному заболеванию, показана эффективность применения антиретровирусной терапии, определены социальные группы, с которыми необходима дополнительная работа по нераспространению ВИЧ инфекции.
Объем и структура работы.
Дипломная работа изложена на 65 страницах машинописного текста, состоит из введения, обзора литературы, описания материала и методов исследования, результатов собственных исследований, анализа полученных результатов, заключения, выводов и рекомендаций. Работа содержит 7 таблиц, 7 графиков, 4 рисунка, 1 схему, 10 приложений. Библиографический указатель включает 61 источник (18 отечественных и 43 зарубежных).


Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!


ВИЧ инфекция является социально значимым заболеванием. Россия входит в четверку лидеров по заболеваемости ВИЧ инфекцией. Инфекция перешла эпидемический порог, после которого происходит значительный рост заболеваемости в общей популяции. Несмотря на то, что основными группами риска заражения считались больные наркоманией, мужчины, практикующие гомосексуальными контактами и работники коммерческого секса, передача вируса половым путем ставит в группу риска всю популяцию.
Статистическая служба по данному заболеванию была налажена только в 2000, в связи с чем первый период распространения заболевания оказался недоступным для детального анализа. Применение моделей зарубежных авторов для описания всей динамики распространения оказалось безуспешным и не соответствовало имеющимся данным.
В данной работе произведено моделирование распространения ВИЧ инфекции на основании модели социальной дезадаптации населения, которая учитывает специфику структуры российской популяции и происходящих в ней процессов.
По результатам проведенного исследования удалось выявить, что основным фактором распространения ВИЧ инфекции в Санкт-Петербурге в начале процесса была наркомания и социально-дезадаптированные слои населения. В последующем процесс перешел к внутреннему перераспределению доли инфицированных различных групп, сначала перейдя в группу мост, а затем в основную популяцию. Важным моментом является отсутствие видимых статистических данных о данном процессе.
В данных модели процесс перехода эпидемического порога обладал более ранними, преддикторными показателями: начало превышения распространенности в основной популяции над распространенностью в группе-мост, а также переход роста численности инфицированных в основной группе из линейного в экспоненциальный.
Важным аспектом является возможность оценки эффективности АРВ терапии, с началом применения которой рост распространенности стал отличаться от модельных данных и стал уменьшаться, в то время как модельные данные продолжали расти. Этот факт позволяет говорить об успешности применения данного метода.
Также при оценке исходных данных для моделирования удалось выявить показатели, характеризующие популяцию, согласно имеющимся данным. При анализе этих данных были выявлены факторы, ускоряющие рост эпидемии (наркомания, промискуитет) и сдерживающие его (алкоголизм).
Выявлены аномалии в работе различных государственных статистических служб. В территориальном центре СПИД и статистических формах №61 Минздрава РФ выявлены аномалии численности, расходящиеся с данными Федерального центра СПИД. При этом модельные данные на основании данных Федерального центра СПИД близко кореллировали со всеми наборами данных до периода начала активного применения АРВТ.



1. Братусь А.С., Новожилов А.С., Платонов А.П., Динамические системы и модели биологии - М.: Физматлит, 2010, -400с.
2. David D Celentano, Moyses Szklo, Gordis Epidemiology - Elsevier, 2019, 420p.
3. Как ВИЧ попал в СССР, Газета.ru, URL:https://www.gazeta.ru/science/2016/10/31_a_10294289.shtml (дата обращения: 20.05.2019)
4. Michael Worobey, Thomas D. Watts, Richard A. McKay, Marc A. Suchard, Timothy Granade, Dirk E. Teuwen, Beryl A. Koblin, Walid Heneine, Philippe Lemey & Harold W. Jaffe, 1970s and ‘Patient 0’ HIV-1 genomes illuminate early HIV/AIDS history in North America, Nature volume539, pages 98–101
5. Роспотребнадзор, URL: https://www.rospotrebnadzor.ru (дата обращения 20.05.2019)
6. Информационные бюллетени, СПб ГБУЗ «Центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями» URL:http://www.hiv-spb.ru/lsn/informaczionnyie-byulleteni.html (дата обращения 20.05.2019)
7. Справка ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в 2018 г., - Минздрав РФ, 2019 - 2с.
8. Mastroberardino, Antonio & Cheng, Yuanji & Abdelrazec, Ahmed & , Liu. (2015). Mathematical modeling of the HIV/AIDS epidemic in Cuba. International Journal of Biomathematics. 8. 1550047. 10.1142/S1793524515500473.
9. Halperin DT et al. A surprising prevention success: Why did the HIV epidemic decline in Zimbabwe? PLoS Med. 2011. 8;8(2).
10. Alistar S., Owens D., Brandeau M. Effectiveness and cost-effectiveness of expanding drug treatment programs and HIV antiretroviral therapy in a mixed HIV epidemic: an analysis for Ukraine // Русский журнал «СПИД, рак и общественное здоровье», 2010, т.14, № 1(23), с.44.
11. HIV/AIDS surveillance in Europe - ECDC. 2019 - 134 p.
12. Клинические рекомендации. ВИЧ-инфекция у взрослых - Министерство здравоохранения РФ, 2017 - 55c.
13. Пантелеева О. В., Бембеева Н.А., Волкова Т.М., Кусниязова И.Е., Васильева В.А., Куприянова Т. С., Информационный бюллетень «ВИЧ инфекция в Санкт Петербурге по состоянию на 01.01.2019г.»,СПб ГБУЗ «Центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями» -СПб., 2019 .- 13с
14. Carey RF et al. Effectiveness of latex condoms as a barrier to human immunodeficiency virus-sized particles under conditions of simulated use. Sex Transm Dis 1992;19:230–4.
15. Holmes K et al. Effectiveness of condoms in preventing sexually transmitted infections. Bulletin of the World Health Organization, 2004, 82 (6).
16.Weller S et al. Condom effectiveness in reducing heterosexual HIV transmission. Cochrane Database Syst Rev. 2002;(1):CD003255.
17.Smith DK et al. Condom effectiveness for HIV prevention by consistency of use among men who have sex with men in the United States. J Acquir Immune Defic Syndr. 2015 Mar 1;68(3):337–44.
18. Johnson LF et al. 2012. The effect of changes in condom usage and antiretroviral treatment coverage on human immunodeficiency virus incidence in South Africa: a model-based analysis, Journal of the Royal Society Interface. 2012, 7;9(72):1544–54.
19. WHO. 2015. Technical update on Pre-exposure Prophylaxis (PrEP), February 2015. WHO/HIV/2015.4.
20. Jean-Michel Molina, M.D., Catherine Capitant, M.D., Bruno Spire, M.D., Ph.D., Gilles Pialoux, M.D., Laurent Cotte, M.D., Isabelle Charreau, M.D., Cecile Tremblay, M.D., Jean-Marie Le Gall, Ph.D., Eric Cua, M.D., Armelle Pasquet, M.D., François Raffi, M.D., Claire Pintado, M.D., et al., On-Demand Preexposure Prophylaxis in Men at High Risk for HIV-1 Infection - ANRS IPERGAY, 2013 Mar 3;65(3):347–44.
21.PrEPWatch https://www.prepwatch.org/country/norway/ (дата обращения: 20.05.2019)
22. WHO. 2007. New Data on Male Circumcision and HIV Prevention: Policy and Programme Implications. WHO/UNAIDS Technical Consultation on Male Circumcision and HIV Prevention: Research Implications for Policy and Programming Montreux, 6 – 8 March 2007.
23. Малый В.П. «ВИЧ. СПИД. Новейший медицинский справочник». - М.: Эксмо, 2009, 672 с.
24. Покровский В.В., Ладная Н.Н., Соколова Е.В., Буравцова Е.В. ВИЧ-инфекция / Информационный бюллетень № 33. – М.: ФНМЦ СПИД, 2009, 24 с.
25.Castillo-Chavez C. Mathematical and statistical approaches to AIDS epidemiology // Springer Verlag,1989, 405.
26. Longini M., Clark W.S., Byers R.H., Ward J.W., Darrow W.W., Lenp G.F., Hethcote H.W. Statisticalanalysis of the stages of HIV infection using a Markov model // Statistics in Medicine, 1989,№8, p.831-843.
27. Bacaer N., Pretorius C., Auvert B. An age-structured model for the Potential Impact of Generalized Access to Antiretrovirals on the South African HIV Epidemic // Bulletin of Mathematical Biology, 2010.
28. Sloot P.M.A., Ivanov S.V., Boukhanovsky A.V., Van De Vijver D., Boucher C. HIV Population Dynamics on Complex Networks // European Conference on Complex Systems, 2007, p.1-2.
29. Cooke K.L., Yorke J.A. Some equations modelling growth processes and gonorrhea epidemics //Math. Biosci., 1973, № 16, p.75-101.
30. Abbas U.L., Anderson R.M., Mellors J.W. JAIDS. 2006. № 41. P. 632–641
31. Перцев Н.В., Леоненко В.Н. Труды 5-ой Всероссийской научно-практической конференции «Имитационное моделирование. Теория и практика». 2011. Т.1. С. 234–238.
32. Романюха А.А., Носова Е.А. Модель распространения ВИЧ-инфекции в результате социальной дезадаптации. Управление большими системами. 2011.Вып. 34. С. 227–253.
33. Е. А. Носова, А. А. Романюха, Математическая модель распространения ВИЧ инфекции и динамики численности групп риска, Матем. моделирование, 2013, том 25, номер 1, 45–64
34. Форма № 61 «Сведения о контингентах больных ВИЧ-инфекцией» Федерального государственного статистического наблюдения.
35. Федеральный научно-методический Центр по профилактике и борьбе со СПИДом [электронный ресурс] URL: http://www.hivrussia.ru/stat/ (Дата обращения: 20.05.2019)
36. Никифоров О.Н., Л.В. Дмитриева, Л.М. Потахова, В.В. Скогорев, С.Л. Соловьева, Л.М. Федорова, А.И. Филиппова, А.И. Ходачек, Л.П. Яковлева. Санкт-Петербург в 2016 году./Петростат - СПб., 2017. - 206 с.
37. Покровский В.В., Ладная Н.Н., Соколова Е.В., Буравцова Е.В. ВИЧ-инфекция / Информационный бюллетень № 40. – М.: ФНМЦ СПИД, 2015, 57 с.
38. Nosova E.A., Romanyukha A.A. Regional index of HIV infection Risk based on factors of social disadaptation // RJNAMM, 2009, p.325-340.
41. Н.Н. Ладная. Мониторинг и оценка ситуации по ВИЧ-инфекции в России, - М.:ФНМЦ СПИД, 2018, 25 с.
42. Об утверждении Государственной стратегии противодействия распространению ВИЧ-инфекции в России на период до 2020 года и дальнейшую перспективу, Правительство России URL: http://government.ru/docs/24983/ (Дата обращения: 20.05.2019)
43. Jon - Cohen, Largest ever HIV prevention study delivers sobering message, - Science, 2019, - 2p.
44. A third person may have become HIV-free after a bone marrow transplant, Newscientist, URL: https://www.newscientist.com/article/2195780-a-third-person-may-have-become-hiv-free-after-a-bone-marrow-transplant/ (Дата обращения 20.05.2019)
45..Fatma Bozkurt, Fatma Peker, Mathematical modelling of HIV epidemic and stability analysis - Advances in Difference Equations 2014:95
46. Nsuami, M.U. & Witbooi, P.J. Adv Differ Equ (2018) 2018: 11. https://doi.org/10.1186/s13662-017-1458-x
47. Palella FJ, Jr., Delaney KM, Moorman AC, et al. Declining morbidity and mortality among patients with advanced human immunodeficiency virus infection? - N Engl J Med, 1998;338(13):853–86018. D
48. UNAIDS URL: https://www.unaids.org/ (дата обращения: 20.05.2019)
49. Андерсон Р.М., Мэй Р.М. Инфекционные болезни человека: динамика и контроль. – М.: Мир, «Научный мир», 2004, 784 с.
50. Купряшкина-МакГилл С.В. Влияние грантов глобального фонда на политику в области ВИЧ/ СПИДа в Украине // Русский журнал «СПИД, рак и общественное здоровье», 2010, т.14, №2(24), с.7-12. 34.
51. Министерство здравоохранения РФ. [Электронный ресурс]. URL: https://www.rosminzdrav.ru/ru (дата обращения: 20.05.2019).
51. ALMEDA J, CASABONA J, SIMON B, GERARD B, REY D, PURO V, Proposed recommendations for the management of HIV post-exposure prophylaxis after sexual, injecting drug or other exposures in Europe. // Eurosurveillance Monthly – 2004 – Vol. 9, Issue 6. – P. 5-6.
53. ANDERSON RM, GUPTA S, MAY RM. Potential of community wide chemotherapy or immunotherapy to control the spread of HIV-1.// Nature. – 1991 – 350 – P. 356-359.
54. ARAZOZA H, LOUNES R, HOANG T, INTERLAN Y. Modeling HIV epidemic under contact tracing--the Cuban case. // J Theor Med – 2000 – 2 – P. 267-274
Hyman, JM, Li, J, Stanley, EA: The differential infectivity and staged progression models for the transmission of HIV. Math. Biosci. 155, 77-109 (1999)
55. Hove-Musekwa, SD, Nyabadza, F: The dynamics of an HIV/AIDS model with screened disease carriers. Comput. Math. Methods Med. 10(4), 287-305 (2009)
56. Nyabadza, F, Mukandavire, Z: Modelling HIV/AIDS in the presence of an HIV testing and screening campaign. J. Theor. Biol. 280(1), 167-179 (2011)
57. Lajmanovich, A, Yorke, JA: A deterministic model for gonorrhea in a nonhomogeneous population. Math. Biosci. 28, 221-236 (1976)
58. Dietz, K, Heesterbeek, JAP: Daniel Bernoulli’s epidemiological model revisited. Math. Biosci. 180(1-2), 1-21 (2002)
59. Anderson, RM, Medley, GF, May, RM, Johnson, AM: A preliminary study of the transmission dynamics of the human immunodeficiency virus HIV, the causative agent of AIDS. IMA J. Math. Appl. Med. Biol. 3, 229-263 (1986)
60. Adams, BM, Banks, HT, Davidian, M, Kwon, HD, Tran, HT, Wynne, SN, Rosenberg, ES: HIV dynamics: modeling, data analysis, and optimal treatment protocols. J. Comput. Appl. Math. 184(1), 10-49 (2005)
61. Blythe, SP, Anderson, RM: Variable infectiousness in HIV transmission models. IMA J. Math. Appl. Med. Biol. 5, 181-200 (1988)


Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.




©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ