Тип работы:
 Предмет:
 Язык работы:


Локализация рецепторов PXY, CRN и CLV2 в корне редиса (Raphanus sativus L.)

Работа №134922

Тип работы

Бакалаврская работа

Предмет

биология

Объем работы74
Год сдачи2018
Стоимость4275 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
14
Не подходит работа?

Узнай цену на написание



Введение
1. Обзор литературы
1.1. CLE пептиды и их участие в регуляции функционирования меристем высших
растений
1.1.1. Общая характеристика пептидных гормонов растений
1.1.2. Пептиды CLE: структура и классификация
1.1.3. Функции пептидов CLE
1.2. Рецепторы пептидов CLE
1.2.1. Общая характеристика рецепторов пептидов CLE
1.2.2. Рецептор TDIF RECEPTOR/PHLOEM INTERCALATED WITH XYLEM
(TDR/PXY)
1.2.3. Мембранные белки CORYNE (CRN) и CLAVATA2 (CLV2)
1.3. Развитие корнеплода и естественных опухолей у редиса
1.3.1. Развитие корнеплода редиса
1.3.2. Опухолеобразование у растений и естественные опухоли редиса
2. Материалы и методы
2.1. Растительный материал
2.2 Подбор праймеров для ПЦР и ОТ-ПЦР в реальном времени
2.3. Выделение РНК из опухолевого материала и проверка наличия транскриптов при
помощи ОТ-ПЦР в реальном времени
2.4. Выделение геномной ДНК редиса и арабидопсис
2.5. Амплификация фрагментов геномной ДНК и трансляционное слияние фрагментов
2.6. Гель-электрофорез и выделение ДНК из агарозного геля
2.7. Клонирование фрагментов в векторы экспрессии методом GateWayTM
2.8. Трансформация бактерий Escherichia coli и Agrobacteruim rhizogenes
2.9. Выделение плазмид из бактериальных трансформантов
2.10. Проверка вставки в вектор при помощи ПЦР, рестрикции и секвенирования по3
Сэнгеру
2.11. Условия выращивания растений и трансформация при помощи Agrobacterium
rhizogenes
2.12. Приготовление микропрепаратов и конфокальная микроскопия
2.13. Приготовление препаратов для GUS-окрашивания
3. Результаты
3.1. Результаты ОТ-ПЦР и ОТ-ПЦР в реальном времени
3.2. Амплификация фрагментов ДНК и оптимизация протоколов ПЦР
3.3. Конструирование векторов экспрессии
3.4. Получение трансформантов A. rhizogenes
3.5. Получение растительного материала и растений-трансформантов
3.5. Проверка успешности трансформации растений при помощи конфокальной
микроскопии
4.6. Анализ трансгенных корнеплодов при помощи флуоресцентной микроскопии........50
4.7. GUS-окрашивание
4. Обсуждения
4.1. Результаты ОТ-ПЦР в реальном времени
4.2. Амплификация последовательностей интереса
4.3. Создание векторов
4.4. Трансформация растений
4.5. Выращивание растений в почве и получение опухолей и корнеплодов
4.6. Гистологический анализ препаратов при помощи флуоресцентной микроскопии....53
Выводы
Список литературы
Приложение 1: Использованные праймеры
Приложение 2: Протоколы ПЦР
Приложение 3: Полученные векторы

Морфогенетические процессы в организме растений опосредованы активностью особых
тканей, или меристем, состоящих из недифференцированных мультипотентных клеток,
способных к пролиферации и последующей дифференциации в клетки любых других
тканей организма [Steeves, Sussex, 1989]⁠. Несмотря на то, что подобная организация
пролиферирующих тканей значительно отличается от организации пула тканеспецифичных
стволовых клеток у животных, регуляция активности и идентичности стволовых клеток у
всех многоклеточных организмов демонстрирует ряд общих черт [Doonan, Sablowski, 2010].
Одной из таких черт является участие межклеточного сигналинга, опосредованного как
непосредственным контактом экспонированных на поверхности клеток молекул, так и
секрецией растворимых агентов в межклеточное пространство. У растений основным
механизмом подобных межклеточных взаимодействий является секреция в апопласт или в
проводящие ткани специфических сигнальных молекул, или фитогормонов. Сравнительно
недавно среди фитогормонов стали выделять отдельную группу низкомолекулярных
пептидов, обладающих разнообразными функциями. Данный класс сигнальных молекул
подразделяется на две группы: цистеин-богатые пептиды (CRPs) и пептиды, несущие
посттрансляционные модификации (PTM peptides) [Czyzewicz et al, 2013]. К последней
группе относятся пептиды семейства CLE, участвующие в регуляции активности и
поддержания всех имеющихся у растений типов меристем [Kucukoglu, Nilsson, 2015].
Латеральные меристемы (прокамбий и камбий) участвуют в процессах роста аксиальных
органов растения в ширину. В онтогенезе подобные процессы подразделяются на первичное
и вторичное утолщение, приводящие к появлению первичных и вторичных проводящих
тканей, соответственно. У некоторых растений подземные органы в ходе вторичного роста
существенно увеличиваются в поперечных размерах и приобретают запасающую функцию.
В частности, редис (Raphanus sativus L. var. radicola) из семейства Brassicaceae формирует
корнеплоды, являющиеся продуктом совместной деятельности камбия в главном корне и
нижней части гипокотиля. За счет накопления в корнеплоде ряда веществ, включая
углеводы, глюкозинолаты, фолат, аскорбат и различные вторичные метаболиты, редис
является важной сельскохозяйственной культурой [Chaturvedi, 2008; Curtis, 2003; Gutiérrez, Perez, 2004].
Помимо конститутивных меристем, таких как апикальные меристемы побега (Shoot Apical
Meristem, SAM) и корня (Root Apical Meristem, RAM) и камбий, растения формируют также
так называемые нерегулярные меристемы [Dodueva, Frolova, Lutova, 2007]. К результатам5
активности данного класса меристем относится широкий круг способных к росту и
ограниченной дифференциации объектов, таких как раневые каллусы, продукты
деятельности фитопатогенов и естественные опухоли некоторых растительных мутантов и
гибридов [Ahuja, 1998; Persinger, Christopher, 1991].
Одним из примеров образования естественных опухолей являются инбредные линии редиса
(Raphanus sativus L. var. radicola), формирующие опухоли на нижней половине корнеплода
при переходе к цветению [Il’ina et al, 2006]. Данные опухоли способны к росту на среде без гормонов, демонстрируют тканевую дифференциацию и слабый вторичный рост. Для
опухолей редиса показано наличие собственных очагов меристематической активности,
эквивалентных апикальным меристемам и отмеченных экспрессий ряда генов,
участвующих в сигнальной системе пептидов CLE [Lebedeva Osipova et al, 2015]. В связи с
этим представляется интересным проследить паттерн экспрессии ряда генов, относящихся
к пептидному сигналингу, в частности, генов рецепторов пептидов CLE, в опухолевых
меристемах.
Целью данной работой является выявление локализации рецепторов к пептидам CLE, а
именно PXY, CLV2 и CRN, в корнеплоде редиса, а также в спонтанных опухолях у
опухолеобразующих линий. Данные рецепторы были выбраны исходя из имеющихся
данных об их участии в регуляции работы камбия, за счет активности которого и происходит
утолщение корнеплода в ходе его развития.
Объектом работы послужил редис инбредных линий 19 и 28 из коллекции кафедры
генетики и биотехнологии Санкт-Петербургского государственного университета. Данные
линии различаются по признаку опухолеобразования.
В рамках выдвинутой гипотезы мы ожидаем обнаружить в корнеплоде паттерн экспрессии
генов интереса в камбии, а также в очагах спонтанной меристематеческой активности, в то
время как в опухолях предполагается увидеть менее упорядоченный паттерн из-за слабой
гистологической дифференцированности опухолевого материала.
Для успешного достижения сформулированной цели были поставлены следующие задачи:
1. Проанализировать литературу по заявленной теме.
2. Убедиться в наличии транскриптов генов интереса в опухолях при помощи ОТ-ПЦР.6
3. Амплифицировать необходимые фрагменты генома редиса.
4. Создать репортерные конструкции с использованием GUS и eGFP методом Gateway
и клонировать их в векторы экспрессии.
5. Трансформировать бактерии A. rhizogenes с использованием полученных векторов.
6. Трансформировать растения редиса двух линий, различающихся по признаку
опухолеобразования, с использованием A. rhizogenes.
7. Получить трансгенные корнеплоды для обеих исследуемых линий растений и
трансгенные опухоли для опухолеобразующей линии
8. Проанализировать паттерн экспрессии репортерных конструкций в трансгенных
корнеплодах и опухолях с использованием методов флуоресцентной микроскопии и
гистохимии.
9. Сравнить результаты, полученные для корнеплодов и спонтанных опухолей
трансгенных растений.

Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!
ДИПЛОМНЫЕ МАГИСТЕРСКИЕ ДИССЕРТАЦИИ
КУРСОВЫЕ СТАТЬИ ВКР

В ходе данной работы были получены следующие выводы:
1. В опухолях редиса наблюдается экспрессия генов RsPXY, RsCRN и RsCLV2, при этом
уровень экспрессии не отличается от уровня экспрессии в главном корне растения.
2. Получены последовательности промоторов, кодирующих последовательностей и
терминаторов для генов RsPXY, RsCRN и RsCLV2, причем промоторы RsCRN и RsCLV2
успешно амплифицированы с использованием праймеров для соответствующих
последовательностей арабидопсис.
3. С использованием полученных последовательностей были получены репортерные
конструкции с GUS и eGFP, а также соответствующие трансформанты для E. coli и A.
rhizogenes.
4. Для ряда полученных конструкций получены трансгенные растения. Для растений,
трансформированных AtCRN::AtCRN-eGFP и AtCLV2-eGFP, экспрессия трансгена
продемонстрирована при помощи флуоресцентной микроскопии.
5. Оптимизация условий выращивания в закрытом грунте позволяет получать цветущие и
образующие корнеплод растения вне привязки к естественному вегетационному периоду


1. Etchells J.P. et al A brief history of the TDIF-PXY signalling module: Balancing meristem
identity and differentiation during vascular development // New Phytol. 2016. Т. 209. № 2. С.
474–484.
2. Somssich M. et al CLAVATA-WUSCHEL signaling in the shoot meristem // Development.
2016. Т. 143. № 18. С. 3238–3248.
3. Dodueva I.E. et al Plant stem cells: unity and diversity // Vavilov J. Genet. Breed. 2016. Т. 20.
№ 4. С. 441–458.
4. Coninck B. De, Smet I. De. Plant peptides - Taking them to the next level // J. Exp. Bot. 2016.
Т. 67. № 16. С. 4791–4795.
5. Cho H. et al A secreted peptide acts on BIN2-mediated phosphorylation of ARFs to potentiate
auxin response during lateral root development // Nat. Cell Biol. 2013. Т. 16. № 1. С. 66–76.
6. Etchells J.P., Turner S.R. The PXY-CLE41 receptor ligand pair defines a multifunctional
pathway that controls the rate and orientation of vascular cell division // Development. 2010. Т.
137. № 5. С. 767–774.
7. Song S.-K., Lee M.M., Clark S.E. POL and PLL1 phosphatases are CLAVATA1 signaling
intermediates required for Arabidopsis shoot and floral stem cells // Development. 2006. Т. 133.
№ 23. С. 4691–4698.
8. Hirakawa Y., Kondo Y., Fukuda H. TDIF Peptide Signaling Regulates Vascular Stem Cell
Proliferation via the WOX4 Homeobox Gene in Arabidopsis // Plant Cell. 2010. Т. 22. № 8. С.
2618–2629.
9. Fisher K., Turner S. PXY, a Receptor-like Kinase Essential for Maintaining Polarity during
Plant Vascular-Tissue Development // Curr. Biol. 2007. Т. 17. № 12. С. 1061–1066.
10. Etchells J.P., Provost C.M., Turner S.R. Plant Vascular Cell Division Is Maintained by an
Interaction between PXY and Ethylene Signalling // PLoS Genet. 2012. Т. 8. № 11.
11. Додуева И.Е. et al CLE ПЕПТИДЫ – УНИВЕРСАЛЬНЫЕ РЕГУЛЯТОРЫ РАЗВИТИЯ
МЕРИСТЕМ // Физиология растений. 2012. Т. 59. № 1. С. 17–31.
12. Xu C. et al A cascade of arabinosyltransferases controls shoot meristem size in tomato // Nat.
Genet. 2015. Т. 47. № 7. С. 784–792.
13. Shinohara H., Matsubayashi Y. Chemical synthesis of arabidopsis CLV3 glycopeptide reveals
the impact of hydroxyproline arabinosylation on peptide conformation and activity // Plant Cell
Physiol. 2013. Т. 54. № 3. С. 369–374.
14. Somssich M. et al Real-time dynamics of peptide ligand-dependent receptor complex56
formation in planta // Sci. Signal. 2015. Т. 8. № 388. С. ra76-ra76.
15. Goad D.M., Zhu C., Kellogg E.A. Comprehensive identification and clustering of
CLV3/ESR-related (CLE) genes in plants finds groups with potentially shared function // New
Phytol. 2016. Т. 2.
16. Smakowska-Luzan E. et al An extracellular network of Arabidopsis leucine-rich repeat
receptor kinases // Nature. 2018. Т. 553. № 7688. С. 342–346.
17. Ishida T. et al Heterotrimeric G proteins control stem cell proliferation through CLAVATA
signaling in Arabidopsis. // EMBO Rep. 2014. Т. 15. № 11. С. 1202–9.
18. Kayes J.M., Clark S.E. CLAVATA2, a regulator of meristem and organ development in
Arabidopsis. // Development. 1998. Т. 125. № 19. С. 3843–3851.
19. Shinohara H., Matsubayashi Y. Reevaluation of the CLV3-receptor interaction in the shoot
apical meristem: Dissection of the CLV3 signaling pathway from a direct ligand-binding point of
view // Plant J. 2015. Т. 82. № 2. С. 328–336.
20. Somssich M., Bleckmann A., Simon R. Shared and distinct functions of the pseudokinase
CORYNE (CRN) in shoot and root stem cell maintenance of Arabidopsis // J. Exp. Bot. 2016. Т.
67. № 16. С. 4901–4915.
21. Shiu S.-H., Bleecker A.B. Receptor-like kinases from Arabidopsis form a monophyletic gene
family related to animal receptor kinases // Proc. Natl. Acad. Sci. 2001. Т. 98. № 19. С. 10763–
10768.
22. Whitford R. et al Plant CLE peptides from two distinct functional classes synergistically
induce division of vascular cells // Proc. Natl. Acad. Sci. 2008. Т. 105. № 47. С. 18625–18630.
23. Gancheva M.S. et al Identification, expression, and functional analysis of CLE genes in
radish (Raphanus sativus L.) storage root // BMC Plant Biol. 2016. Т. 16. № S1. С. 7.
24. Il’ina E.L. et al The effect of cytokinins on in vitro cultured inbred lines of Raphanus sativus
var. radicula Pers. with genetically determined tumorigenesis // Russ. J. Plant Physiol. 2006. Т.
53. № 4. С. 514–522.
25. Doonan J.H., Sablowski R. Walls around tumours -why plants do not develop cancer // Nat.
Rev. Cancer. 2010. Т. 10. № 11. С. 794–802.
26. Pan L. et al The Multifunction of CLAVATA2 in Plant Development and Immunity // Front.
Plant Sci. 2016. Т. 7. № October. С. 1573.
27. Peláez P. et al Small RNAs Derived from the T-DNA of Agrobacterium rhizogenes in Hairy
Roots of Phaseolus vulgaris // Front. Plant Sci. 2017. Т. 8. № February. С. 1–13.
28. Gaillochet C., Daum G., Lohmann J.U. O Cell, Where Art Thou? The mechanisms of shoot
meristem patterning // Curr. Opin. Plant Biol. 2015. Т. 23. С. 91–97.
29. Sugimoto K., Jiao Y., Meyerowitz E.M. Arabidopsis regeneration from multiple tissues57
occurs via a root development pathway. // Dev. Cell. 2010. Т. 18. № 3. С. 463–471.
30. Muller R., Bleckmann A., Simon R. The Receptor Kinase CORYNE of Arabidopsis
Transmits the Stem Cell-Limiting Signal CLAVATA3 Independently of CLAVATA1 // Plant Cell
Online. 2008. Т. 20. № 4. С. 934–946.
31. Wei Z. et al Identification and expression analysis of the LRR-RLK gene family in tomato
(Solanum lycopersicum) Heinz 1706. // Genome. 2015. Т. 58. № 4. С. 121–34.
32. Nimchuk Z.L., Tarr P.T., Meyerowitz E.M. An Evolutionarily Conserved Pseudokinase
Mediates Stem Cell Production in Plants // Plant Cell. 2011. Т. 23. № 3. С. 851–854.
33. Kucukoglu M., Nilsson O. CLE peptide signaling in plants - the power of moving around //
Physiol. Plant. 2015. Т. 155. № 1. С. 74–87.
34. Iwase A. et al Report The AP2 / ERF Transcription Factor WIND1 Controls Cell
Dedifferentiation in Arabidopsis // Curr. Biol. 2011. Т. 21. № 6. С. 508–514.
35. Ikeuchi M., Sugimoto K., Iwase A. Plant Callus: Mechanisms of Induction and Repression //
Plant Cell. 2013. Т. 25. № 9. С. 3159–3173.
36. Dodueva I., Frolova N., Lutova L. Plant tumorigenesis: different ways for shifting systemic
control of plant cell division and differentiation // Transgen. Plant J. 2007. Т. 1. С. 17–38.
37. Sun J. et al Genome-wide characterization, evolution, and expression analysis of the leucinerich repeat receptor-like protein kinase (LRR-RLK) gene family in Rosaceae genomes // BMC
Genomics. 2017. Т. 18. № 1.
38. Etchells J.P. et al WOX4 and WOX14 act downstream of the PXY receptor kinase to regulate
plant vascular proliferation independently of any role in vascular organisation // Development.
2013. Т. 140. № 10. С. 2224–2234.
39. Suer S. et al WOX4 Imparts Auxin Responsiveness to Cambium Cells in Arabidopsis // Plant
Cell Online. 2011. Т. 23. № 9. С. 3247–3259.
40. Ahmed M., Kim D.R. pcr: an R package for quality assessment, analysis and testing of qPCR
data // PeerJ. 2018. Т. 6. С. e4473.
41. Ahuja M.R. Genetic tumors in Nicotiana and other plants // Q. Rev. Biol. 1998. Т. 73. № 4.
С. 439–462.
42. Al-Shehbaz I.A., Beilstein M.A., Kellogg E.A. Systematics and phylogeny of the
Brassicaceae (Cruciferae): An overview // Plant Systematics and Evolution. , 2006. С. 89–120.
43. Ali M.A. et al Smart Parasitic Nematodes Use Multifaceted Strategies to Parasitize Plants //
Front. Plant Sci. 2017. Т. 8.
44. Altschul S.F. et al Basic local alignment search tool. // J. Mol. Biol. 1990. Т. 215. № 3. С.
403–10.
45. Andrews S.J., Rothnagel J.A. Emerging evidence for functional peptides encoded by short58
open reading frames // Nat. Rev. Genet. 2014. Т. 15. № 3. С. 193–204.
46. Arnim A.G. Von, Jia Q., Vaughn J.N. Regulation of plant translation by upstream open
reading frames // Plant Sci. 2014. Т. 214. С. 1–12.
47. Ascencio-Ibanez J.T. et al Global Analysis of Arabidopsis Gene Expression Uncovers a
Complex Array of Changes Impacting Pathogen Response and Cell Cycle during Geminivirus
Infection // PLANT Physiol. 2008. Т. 148. № 1. С. 436–454.
48. Berardini T.Z. et al The arabidopsis information resource: Making and mining the «gold
standard» annotated reference plant genome // Genesis. 2015. Т. 53. № 8. С. 474–485.
49. Berckmans B. et al Auxin-Dependent Cell Cycle Reactivation through Transcriptional
Regulation of Arabidopsis E2Fa by Lateral Organ Boundary Proteins // Plant Cell. 2011. Т. 23.
№ 10. С. 3671–3683.
50. Betsuyaku S. et al Mitogen-activated protein kinase regulated by the CLAVATA receptors
contributes to shoot apical meristem homeostasis // Plant Cell Physiol. 2011. Т. 52. № 1. С. 14–
29.
51. Bhattacharjee S. et al IMPa-4, an Arabidopsis Importin Isoform, Is Preferentially Involved
in Agrobacterium-Mediated Plant Transformation // PLANT CELL ONLINE. 2008. Т. 20. № 10.
С. 2661–2680.
52. Bielach A., Hrtyan M., Tognetti V.B. Plants under stress: Involvement of auxin and cytokinin
// Int. J. Mol. Sci. 2017. Т. 18. № 7.
53. Bircheneder S., Dresselhaus T. Why cellular communication during plant reproduction is
particularly mediated by CRP signalling // J. Exp. Bot. 2016. Т. 67. № 16. С. 4849–4861.
54. Bird D.M., Koltai H. Plant Parasitic Nematodes: Habitats, Hormones, and HorizontallyAcquired Genes. // J. Plant Growth Regul. 2000. Т. 19. № 2. С. 183–194.
55. Brencic A., Eberhard A., Winans S.C. Signal quenching, detoxification and mineralization of
vir gene-inducing phenolics by the VirH2 protein of Agrobacterium tumefaciens // Mol.
Microbiol. 2004. Т. 51. № 4. С. 1103–1115.
56. Buzovkina I.S., Lutova L.A. The genetic collection of radish inbred lines: history and
prospects // Genetika. 2007. Т. 43. № 10. С. 1411–1423.
57. Cai X.T. et al Arabidopsis ERF109 mediates cross-talk between jasmonic acid and auxin
biosynthesis during lateral root formation // Nat. Commun. 2014. Т. 5.
58. Cangelosi G.A., Ankenbauer R.G., Nester E.W. Sugars induce the Agrobacterium virulence
genes through a periplasmic binding protein and a transmembrane signal protein. // Proc. Natl.
Acad. Sci. 1990. Т. 87. № 17. С. 6708–6712.
59. Casamitjana-Martínez E. et al Root-specific CLE19 overexpression and the so1l/2
suppressors implicate a CLV-like pathway in the control of Arabidopsis root meristem59
maintenance // Curr. Biol. 2003. Т. 13. № 16. С. 1435–1441.
60. Chaturvedi P. Inhibitory response of Raphanus sativus on lipid peroxidation in albino rats //
Evidence-based Complement. Altern. Med. 2008. Т. 5. № 1. С. 55–59.
61. Chen M.-K. et al ERECTA Family Genes Regulate Auxin Transport in the Shoot Apical
Meristem and Forming Leaf Primordia // PLANT Physiol. 2013. Т. 162. № 4. С. 1978–1991.
62. Chinchilla D. et al A flagellin-induced complex of the receptor FLS2 and BAK1 initiates
plant defence // Nature. 2007. Т. 448. № 7152. С. 497–500.
63. Chung K.R., Tzeng D.D. Biosynthesis of Indole-3-Acetic Acid by the Gall-inducing Fungus
Ustilago esculenta // J. Biol. Sci. 2004. Т. 4. № 6. С. 744–750.
64. Cissé O.H. et al Genome sequencing of the plant pathogen Taphrina deformans, the causal
agent of peach leaf curl // MBio. 2013. Т. 4. № 3.
65. Clark S., Running M., Meyerowitz E. CLAVATA3 is a specific regulator of shoot and floral
meristem development affecting the same processes as CLAVATA1 // Development. 1995. Т. 121.
С. 2057–2067.
66. Clark S.E., Running M.P., Meyerowitz E.M. CLAVATA1, a regulator of meristem and flower
development in Arabidopsis. // Development. 1993. Т. 119. № 2. С. 397–418.
67. Cock J.M., McCormick S. A Large Family of Genes That Share Homology withCLAVATA3
// Plant Physiol. 2001. Т. 126. № 3. С. 939–942.
68. Curtis I.S. The noble radish: Past, present and future // Trends Plant Sci. 2003. Т. 8. № 7. С.
305–307.
69. Czyzewicz N. et al Message in a bottle: Small signalling peptide outputs during growth and
development // J. Exp. Bot. 2013. Т. 64. № 17. С. 5281–5296.
70. Daum G. et al A mechanistic framework for noncell autonomous stem cell induction in
Arabidopsis // Proc. Natl. Acad. Sci. 2014. Т. 111. № 40. С. 14619–14624.
71. Desvoyes B. et al Cell Type-Specific Role of the Retinoblastoma / E2F Pathway during
Arabidopsis Leaf Development 1 // Plant Physiol. 2005. Т. 140. № January. С. 1–14.
72. Devos S. et al Infection of Chinese cabbage by Plasmodiophora brassicae leads to a
stimulation of plant growth: Impacts on cell wall metabolism and hormone balance // New
Phytol. 2005. Т. 166. № 1. С. 241–250.
73. Doss R.P. et al Bruchins: Insect-derived plant regulators that stimulate neoplasm formation //
Proc. Natl. Acad. Sci. 2000. Т. 97. № 11. С. 6218–6223.
74. Duan M. et al Identification of Optimal Reference Genes for Expression Analysis in Radish
(Raphanus sativus L.) and Its Relatives Based on Expression Stability // Front. Plant Sci. 2017.
Т. 8.
75. Durbak A.R., Tax F.E. CLAVATA signaling pathway receptors of arabidopsis regulate cell60
proliferation in fruit organ formation as well as in meristems // Genetics. 2011. Т. 189. № 1. С.
177–194.
76. Faure J.D. et al The PASTICCINO genes of Arabidopsis thaliana are involved in the control
of cell division and differentiation // DEVELOPMENT. 1998. Т. 125. № 5. С. 909–918.
77. Fernando W.G.D. et al Molecular and morphological characteristics of Apiosporina morbosa,
the causal agent of black knot in Prunus spp. // Can. J. Plant Pathol. 2005. Т. 27. № 3. С. 364–
375.
78. Fiers M. et al Mis-expression of the CLV3/ESR-like gene CLE19 in Arabidopsis leads to a
consumption of root meristem // Gene. 2004. Т. 327. № 1. С. 37–49.
79. Frank M. et al Hormone autotrophic growth and differentiation identifies mutant lines of
Arabidopsis with altered cytokinin and auxin content or signaling. // Plant Physiol. 2000. Т. 122.
№ 3. С. 721–9.
80. Frank M. et al Tumorous shoot development (tsd) genes are required for co-ordinated plant
shoot development // Plant J. 2002. Т. 29. № 1. С. 73–85.
81. Gifford M.L. The Arabidopsis ACR4 gene plays a role in cell layer organisation during ovule
integument and sepal margin development // Development. 2003. Т. 130. № 18. С. 4249–4258.
82. Goldraij A. et al Compartmentalization of S-RNase and HT-B degradation in selfincompatible Nicotiana // Nature. 2006. Т. 439. № 7078. С. 805–810.
83. Gordon J.E., Christie P.J. The Agrobacterium Ti Plasmids // Microbiol. Spectr. 2014. Т. 2. №
6.
84. Gorres K.L., Raines R.T. Prolyl 4-Hydroxylase. , 2010. 106-124 с.
85. Gou X. et al Genome-wide cloning and sequence analysis of leucine-rich repeat receptor-like
protein kinase genes in Arabidopsis thaliana // BMC Genomics. 2010. Т. 11. № 1. С. 19.
86. Gou X. et al Genetic evidence for an indispensable role of somatic embryogenesis receptor
kinases in brassinosteroid signaling // PLoS Genet. 2012. Т. 8. № 1.
87. Guo Y. et al CLAVATA2 forms a distinct CLE-binding receptor complex regulating
Arabidopsis stem cell specification // Plant J. 2010. Т. 63. № 6. С. 889–900.
88. Gutierrez C. DNA replication and cell cycle in plants: Learning from geminiviruses // EMBO
J. 2000. Т. 19. № 5. С. 792–799.
89. Gutiérrez R.M.P., Perez R.L. Raphanus sativus (Radish): Their Chemistry and Biology // Sci.
World J. 2004. Т. 4. С. 811–837.
90. Hanemian M. et al Arabidopsis CLAVATA1 and CLAVATA2 receptors contribute
to Ralstonia solanacearum pathogenicity through a miR169-dependent pathway // New Phytol.
2016. Т. 211. № 2. С. 502–515.
91. Hara K. et al The secretory peptide gene EPF1 enforces the stomatal one-cell-spacing rule //61
Genes Dev. 2007. Т. 21. № 14. С. 1720–1725.
92. Hastwell A.H., Gresshoff P.M., Ferguson B.J. Genome-wide annotation and characterization
of CLAVATA/ESR (CLE) peptide hormones of soybean (Glycine max) and common bean
(Phaseolus vulgaris), and their orthologues of Arabidopsis thaliana // J. Exp. Bot. 2015. Т. 66. №
17. С. 5271–5287.
93. Hazak O. et al Perception of root‐active CLE peptides requires CORYNE function in the
phloem vasculature // EMBO Rep. 2017. Т. 18. № 8. С. 1367–1381.
94. Herrera-Estrella A. et al VirD proteins of Agrobacterium tumefaciens are required for the
formation of a covalent DNA--protein complex at the 5’ terminus of T-strand molecules //
EMBO J. 1988. Т. 7. № 13. С. 4055–4062.
95. Hirakawa Y. et al Non-cell-autonomous control of vascular stem cell fate by a CLE
peptide/receptor system // Proc. Natl. Acad. Sci. 2008. Т. 105. № 39. С. 15208–15213.
96. Hirakawa Y., Bowman J.L. A Role of TDIF Peptide Signaling in Vascular Cell Differentiation
is Conserved Among Euphyllophytes // Front. Plant Sci. 2015. Т. 6.
97. Huang C.H. et al Resolution of brassicaceae phylogeny using nuclear genes uncovers nested
radiations and supports convergent morphological evolution // Mol. Biol. Evol. 2016. Т. 33. № 2.
С. 394–412.
98. Ilina E.L. et al. Lateral root initiation and formation within the parental root meristem of
Cucurbita pepo : is auxin a key player ? // Ann. Bot. 2018. № April. С. 1–16.
99. Initiative T.A.G. Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis
thaliana // Nature. 2000. Т. 408. № 6814. С. 796–815.
100. Intrieri M.C., Buiatti M. The horizontal transfer of Agrobacterium rhizogenes genes and the
evolution of the genus Nicotiana // Mol. Phylogenet. Evol. 2001. Т. 20. № 1. С. 100–110.
101. Ito Y. et al Dodeca-CLE as peptides as suppressors of plant stem cell differentiation //
Science (80-. ). 2006. Т. 313. № 5788. С. 842–845.
102. Jang G. et al Cytokinin-dependent secondary growth determines root biomass in radish
(Raphanus sativus L.). // J. Exp. Bot. 2015. Т. 66. № 15. С. 4607–19.
103. Jiang F. et al Involvement of Plant Stem Cells or Stem Cell-Like Cells in Dedifferentiation
// Front. Plant Sci. 2015. Т. 6.
104. Johnson R. et al Detection and quantitation of octopine in normal plant tissue and in crown
gall tumors // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1974. Т. 71. № 2. С. 536–539.
105. Katzen F. Gateway ® recombinational cloning: a biological operating system // Expert Opin.
Drug Discov. 2007. Т. 2. № 4. С. 571–589.
106. Kerr A. Transfer of virulence between isolates of agrobacterium // Nature. 1969. Т. 223. №
5211. С. 1175–1176.62
107. Kiba T. et al The type-A response regulator, ARR15, acts as a negative regulator in the
cytokinin-mediated signal transduction in Arabidopsis thaliana // Plant Cell Physiol. 2003. Т. 44.
№ 8. С. 868–874.
108. Kim Y.S. et al CHRK1, a chitinase-related receptor-like kinase in tobacco. // Plant Physiol.
2000. Т. 123. № 3. С. 905–915.
109. Kondo T. et al Dual assay for MCLV3 activity reveals structure-activity relationship of CLE
peptides // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2008. Т. 377. № 1. С. 312–316.
110. Kondo Y. et al CLE peptides can negatively regulate protoxylem vessel formation via
cytokinin signaling // Plant Cell Physiol. 2011. Т. 52. № 1. С. 37–48.
111. Kondo Y. et al Plant GSK3 proteins regulate xylem cell differentiation downstream of
TDIF-TDR signalling. // Nat. Commun. 2014. Т. 5. С. 3504.
112. Kondo Y. et al A novel system for xylem cell differentiation in arabidopsis thaliana // Mol.
Plant. 2015. Т. 8. № 4. С. 612–621.
113. Kong Y. et al Tissue-specific expression of SMALL AUXIN UP RNA41 differentially
regulates cell expansion and root meristem patterning in arabidopsis // Plant Cell Physiol. 2013.
Т. 54. № 4. С. 609–621.
114. Kosugi S., Ohashi Y. Constitutive E2F expression in tobacco plants exhibits altered cell
cycle control and morphological change in a cell type-specific manner // Plant Physiol. 2003. Т.
132. № 4. С. 2012–2022.
115. Krupková E. et al The Tumorous Shoot Development2 gene of Arabidopsis encoding a
putative methyltransferase is required for cell adhesion and co-ordinated plant development //
Plant J. 2007. Т. 50. № 4. С. 735–750.
116. Krupková E., Schmülling T. Developmental consequences of the tumorous shoot
development1 mutation, a novel allele of the cellulose-synthesizing KORRIGAN1 gene // Plant
Mol. Biol. 2009. Т. 71. № 6. С. 641–655.
117. Ku A.T. et al IbMADS1 (Ipomoea batatas MADS-box 1 gene) is involved in tuberous root
initiation in sweet potato (Ipomoea batatas) // Ann. Bot. 2008. Т. 102. № 1. С. 57–67.
118. Lammens T. et al Atypical E2Fs: new players in the E2F transcription factor family //
Trends Cell Biol. 2009. Т. 19. № 3. С. 111–118.
119. Latham J.R. et al Induction of plant cell division by beet curly top virus gene C4 // Plant J.
1997. Т. 11. № 6. С. 1273–1283.
120. Lauressergues D. et al Primary transcripts of microRNAs encode regulatory peptides //
Nature. 2015. Т. 520. № 7545. С. 90–93.

Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.




©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ
.