Тема: Роль посттрансляционных модификаций белков протеасомы в ее транспорте во внеклеточное пространство
Закажите новую по вашим требованиям
Представленный материал является образцом учебного исследования, примером структуры и содержания учебного исследования по заявленной теме. Размещён исключительно в информационных и ознакомительных целях.
Workspay.ru оказывает информационные услуги по сбору, обработке и структурированию материалов в соответствии с требованиями заказчика.
Размещение материала не означает публикацию произведения впервые и не предполагает передачу исключительных авторских прав третьим лицам.
Материал не предназначен для дословной сдачи в образовательные организации и требует самостоятельной переработки с соблюдением законодательства Российской Федерации об авторском праве и принципов академической добросовестности.
Авторские права на исходные материалы принадлежат их законным правообладателям. В случае возникновения вопросов, связанных с размещённым материалом, просим направить обращение через форму обратной связи.
📋 Содержание
ВВЕДЕНИЕ 4
ЦЕЛЬ И ЗАДАЧИ 5
1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 6
1.1. Структура протеасомы 6
1.2. Убиквитин-зависимый протеолиз 8
1.3. Внеклеточные протеасомы 10
1.4. Посттрансляционные модификации протеасомы 11
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 16
2.1. Клеточные линии и культивирование клеток 16
2.2. Аффинная очистка протеасом 16
2.3. Измерение пептидазной активности протеасом 17
2.4. Денатурирующий электрофорез в полиакриламидном геле и вестерн-блот анализ 17
2.5. Двумерный электрофорез 18
2.6. Масс-спектрометрический анализ 19
2.7. Ферментативные реакции и амплификация фрагментов ДНК методом ПИР 19
2.8. Сайт-направленный мутагенез 20
2.9. Трансформация 21
2.10. Выделение плазмидной ДНК 22
2.11. Получение вирусных частиц 22
2.12. Получение нокаут конструкций и нокаут по гену PSMB3 23
2.13. Получение доксициклин-регулируемой клеточной линии 24
3. РЕЗУЛЬТАТЫ 25
3.1. Аффинное очищение протеасом 25
3.2. МС/МС-анализ посттрансляционных модификаций клеточных протеасом 28
3.3. МС-анализ посттрансляционных модификаций протеасом 30
3.4. Нокаут гена протеасомы PSMB3 33
3.5. Получение доксициклин-регулируемой клеточной линии К562 36
4. ОБСУЖДЕНИЕ 39
ВЫВОДЫ 44
БЛАГОДАРНОСТИ 45
ЛИТЕРАТУРА 46
ПРИЛОЖЕНИЕ А 55
ПРИЛОЖЕНИЕ Б 57
ПРИЛОЖЕНИЕ В 58
ПРИЛОЖЕНИЕ Г 60
📖 Введение
Несмотря на большое количество данных, касающихся исследованию концентрации и активности внеклеточных протеасом у пациентов, страдающих тем или иным заболеванием, свойства секретируемых клетками протеасом или механизм их секреции на сегодняшний день не исследованы, что отдаляет перспективу использования внеклеточных протеасом в качестве маркеров онкологических и других заболеваний. Чтобы приблизиться к пониманию роли протеасом во внеклеточном пространстве, необходимо определить специфические особенности, в том числе посттрансляционные модификации белков внеклеточных протеасом в сравнении с внутриклеточными комплексами, и ответить на вопрос, какие механизмы задействованы в их транспорте во внеклеточное пространство.
✅ Заключение
1. С помощью масс-спектрометрического анализа идентифицированы 55 посттрансляционных модификаций у клеточных и 31 - у внеклеточных протеасом, аффинно-очищенных из клеток К562 и кондиционированной клетками среды. Из списка выявленных посттрансляционных модификаций клеточных и внеклеточных протеасом, соответственно, 36 и 21 идентифицированы нами впервые.
2. По результатам МС-анализа фосфорилирование по серину в 181-м положении в субъединице РЗ (PSMB3) нами обнаружено впервые и потенциально является специфичной посттрансляционной модификацией для внеклеточных протеасом.
3. Получены и апробированы плазмидные конструкции рХЗЗО системы CRISPR/Cas9, содержащие последовательности гид-РНК, нацеленные на второй и третий экзоны гена субъединицы РЗ (PSMB3) протеасомы с целью дальнейшего нокаута по гену PSMB3 доксициклин-регулируемых клеточный линий.
4. Получена линия клеток K562, стабильно экспрессирующая генетическую конструкцию, кодирующую субъединицу протеасом РЗ (PSMB3) слитую на N- конце с последовательностью T7, с целью дальнейшего получения линий клеток HeLa, стабильно экспрессирующих нормальную и, созданную нами, мутантную последовательности.





