Прионами называют самораспространяющиеся и трансформируемые белковые изоформы. Они представляют собой белки с аномальной третичной структурой, способные индуцировать конформационное превращение гомологичных им нормальных клеточных белков в прионную форму. Белок в прионной форме меняет укладку нормального белка «по своему образу и подобию», изменяя его третичную структуру и таким образом увеличивая количество прионных белков. Такие неправильно уложенные белки, в свою очередь, образуют амилоиды — фибриллярные отложения, содержащие большое количество Р- структур, размером от небольших олигомеров до больших нерастворимых агрегатов.
Накопление белковых амилоидов в организме человека или млекопитающих, а конкретно, в их нервных клетках, является причиной развития различных нейродегенаративных заболеваний, таких как болезнь Альцгеймера, болезнь Паркинсона, Хантингтона, Крейтцфельда-Якоба и других. На данный момент не существует ни действенных методов лечения подобных болезней, ни точного описания механизма их развития, чем и объясняется актуальность исследований механизма образования амилоидов и распространения прионов.
Белок дрожжей Saccharomyces cerevisiae - Sup35 используется в качестве удобной модельной системы для изучения механизмов образования и распространения амилоидов. Механизм его прионизации достаточно хорошо изучен и описан в большом количестве различных научных работ. Хотя он и не гомологичен прионному белку млекопитающих PrP, ответственному за заболевания человека, однако механизм его укладки и агрегации весьма схож с механизмами для PrP, поэтому понимание переходных процессов для белка Sup35 может проложить путь для разработки эффективной диагностики и лечения заболеваний.
Количество полученной информации о механизмах агрегации и о структурных и морфологических свойствах агрегатов в последнее время значительно увеличилось, однако детальный механизм перехода белков в амилоидную форму, а также влияние амилоидных агрегатов на цитотоксичность на данный момент остаются неизвестными. Для исследования амилоидообразования применяют ряд различных методик, таких как микроскопия, метод кругового дихроизма, флуоресценция в присутствии тиофлавина Т, инфракрасная спектроскопия и метод динамического рассеяния света.
В данной работе изучалась кинетика агрегации и морфология полученных фибрилл белка Sup35 с помощью динамического рассеяния света, сканирующей электронной микроскопии и атомной силовой микроскопии.
1. Метод динамического рассеяния света позволяет определять зависимость распределения фибрилл прионного белка Sup35NM по длинам от времени его агарегации.
2. Замены M0 (QQ33 — KK34) и M5 (QQ89-90KK) затрудняют агрегацию белка Sup35NM.
3. Отсутствие M-домена в белке Sup35NM упрощает его агрегацию.
Результаты были ранее представлены на VI Молодежной конференции по молекулярной и клеточной биологии Института цитологии РАН.
1. Baxa, U.; Keller, P. W.; Cheng, N.; Wall, J. S.; Steven, A. C. In Sup35p Filaments (the [PSI+] Prion), the Globular C-Terminal Domains Are Widely Offset from the Amyloid Fibril Backbone. Mol. Microbiol. 2011, 79 (2), 523-532.
2. Бондарев Станислав Александрович. Влияние мутаций в прионизирующем домене белка Sup35 на свойства приона [PSI+] дрожжей Saccharomyces cerevisiae. Диссертация. 2014
3. Balbirnie, M.; Grothe, R.; Eisenberg, D. S. An Amyloid-Forming Peptide from the Yeast Prion Sup35 Reveals a Dehydrated Beta-Sheet Structure for Amyloid. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001, 98 (5), 2375-2380.
4. Shewmaker, F.; Wickner, R. B. B.; Tycko, R. Amyloid of the Prion Domain of Sup35p Has an in-Register Parallel Beta-Sheet Structure. PNAS 2006, 103 (52), 4000-4007.
5. Liebman, S. W.; Chernoff, Y. O. Prions in Yeast. Genetics 2012, 191 (4), 1041-1072.
6. Bondarev, S. A.; Zhouravleva, G. A.; Belousov, M. V; Kajava, A. V. Structure-Based View on [PSI ] Prion Properties. Prion 2015, 9 (190), 199.
7. Wickner, R. B.; Edskes, H. K.; Bateman, D. A.; Kelly, A. C.; Gorkovskiy, A.; Dayani, Y.; Zhou, A. Amyloids and Yeast Prion Biology.
8. Kishimoto, A.; Hasegawa, K.; Suzuki, H.; Taguchi, H.; Namba, K.; Yoshida, M. Р-Helix Is a Likely Core Structure of Yeast Prion Sup35 Amyloid Fibers. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004, 315 (3), 739-745.
9. Chen, B.; Thurber, K. R.; Shewmaker, F.; Wickner, R. B.; Tycko, R. Measurement of Amyloid Fibril Mass-per-Length by Tilted-Beam Transmission Electron Microscopy. PNAS 2009, 106 (34), 14339-14344.
10. Kinoshita, M., Lin, Y., Nakatsuji, M., Inui, T., Lee, Y.-H. Kinetics and polymorphs of yeast prion Sup35NM amyloidogenesis. International Journal of Biological Macromolecules 2017, 102, 1241-1249
11. Streets AM, Sourigues Y, Kopito RR, Melki R, Quake SR (2013) Simultaneous Measurement of Amyloid Fibril Formation by Dynamic Light Scattering and Fluorescence Reveals Complex Aggregation Kinetics. PLoS ONE 8(1): e54541.
12. A. Gladytz, E. Lugovoy, A. Charvat, T. Haupl, K. R. Siefermann, B. Abel. Intermediates caught in the act: tracing insulin amyloid fibril formation in time by combined optical spectroscopy, light scattering, mass spectrometry and microscopy. Phys. Chem. Chem. Phys., 2015, 17, 918
13. Kim, J.R., Muresan, A., Lee, K.Y.C., Murphy, R.M.. Urea modulation of P-amyloid fibril growth: Experimental studies and kinetic models. Protein Science. 2004. 13(11), 2888-2898
14. В. Л. Миронов. Основы сканирующей зондовой микроскопии. Учебное пособие для студентов старших курсов высших учебных заведений. Российская академия наук, Институт физики микроструктур.г. Нижний Новгород, 2004 г. - 110 с.
15. Введение в физику поверхности. Оура К., Лифшиц В.Г., Саранин А.А., Зотов А.В., Катаяма М..М.: Наука, 2006. — 490 с.
16. Bruce J. Berne, Robert Pecora. Dynamic Light Scattering: With Applications to Chemistry, Biology, and Physics.
... Всего источников – 22.