Тип работы:
 Предмет:
 Язык работы:


АНАЛИЗ МОРФОЛОГИИ МУТАНТОВ ПРИОННОГО БЕЛКА SUP 35

Работа №130114

Тип работы

Магистерская диссертация

Предмет

физика

Объем работы51
Год сдачи2017
Стоимость4900 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
29
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


Введение
2. Обзор литературы
2.1. Прионы, общие сведения
2.2. Болезни, вызываемые прионами
2.3. Белок Sup35 дрожжей Saccharomyces cerevisiae,фактор [PSI+]
2.4. Мутации в гене SUP35
3. Методы исследования и материалы
3.1. Атомная силовая микроскопия
3.2. Сканирующий электронный микроскоп
3.3. Приготовление образцов для АСМ и СЭМ
3.4. Обработка изображений с помощью NanoScope Analysis, FibrilJ
3.5. Материалы
4. Экспериментальные результаты и их обсуждение
4.1. Анализ изображений, полученных методом АСМ
4.1.1. Анализ фибрилл прионного белка Sup35NMp wT
4.1.2. Анализ фибрилл прионного белка Sup35NMp-M0
4.1.3. Анализ фибрилл прионного белка Sup35NMp-M1
4.1.4. Анализ фибрилл прионного белка Sup35NMp-M2
4.1.5. Анализ фибрилл прионного белка Sup35NMp-M3
4.1.6. Анализ фибрилл прионного белка Sup35NMp-M4
4.1.7. Анализ фибрилл прионного белка Sup35NMp-M5
4.1.8. Сводная таблица линейных характеристик для дикого типа белка Sup35NMp и егомутантных форм.
4.2. Анализ изображений, полученные методом СЭМ
4.2.1. Анализ фибрилл прионного белка Sup35NMp-wT
4.2.2. Анализ фибрилл прионного белка Sup35NMp-M0
4.2.3. Анализ фибрилл прионного белка Sup35NMp-M1
4.2.4. Анализ фибрилл прионного белка Sup35NMp-M2
4.2.5. Анализ фибрилл прионного белка Sup35NMp-M4
4.2.6. Анализ фибрилл прионного белка Sup35NMp- M5
Сводная таблица линейных характеристик для дикого типа прионного белка
«Шубы» дикого типа и мутантов прионного белка Sup35NMp.
Результаты
Благодарности
Список литературы

На сегодняшний день известно, что причиной большого количества заболеваний является
аномальное формирование пространственной структуры белков. В том случае, если по каким-то причинам белок перешел в неправильное состояние, это может привести к формированию амилоидов - фибриллярных структур. Длинные и жесткие нити могут образовывать бляшки в мозгу, почках и других органах, вызывая такие болезни как: Амилоидоз, болезнь Альцгеймера и т.д.
Прионы — это инфекционные агенты, механизм действия которых основан на изменении конформационной структуры белков. Белки, способные прионизоваться, найдены как у высших, так и у низших эукариот. Одним из самых изученных является фактор [PSI+] — прионная форма белка Sup35 дрожжей Saccharomyces cerevisiae. На биологическом факультете СанктПетербургского государственного университета был получен набор из шести мутаций этого белка.
Задачей данной работы, было исследовать линейные характеристики образовавшихся агрегатов для каждой мутации. Эти данные могут помочь в дальнейшем определить факторы, обеспечивающие стабильность таких структур и на основе этого создать лекарственные средства, блокирующие их образование.

Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!
ДИПЛОМНЫЕ МАГИСТЕРСКИЕ ДИССЕРТАЦИИ
КУРСОВЫЕ СТАТЬИ ВКР

 Получили линейные характеристики фибрилл прионного белка Sup35NMp дикого типа и его мутантов с использованием двух методов АСМ и СЭМ. Значения диаметров, полученные методом СЭМ оказались несколько завышенными, по сравнению с СЭМ. Это связано с принципом построения изображений в СЭМ.
 Установили, что возникает конкуренция за связывание с гидрофильной подложкой слюды между фибриллярными структурами и мономерным белком.
 Фибриллы, полученные из прионного белка Sup35NMp мутаций М0, М1, М4, М5,
склонны к слипанию и образованию длинных, вытянутых структур.
 Фибриллы окружены «шубами», состоящими из мономерного белка, который предположительно, стабилизирует сгруппированные фибриллы.
 Наличие мутаций влияет как на диаметры, так и на «шубы» фибрилл


1. Citron M. Alzheimer’s disease: strategies for disease modification // Nat. Rev. Drug Discov.
2010. Т. 9. No 5. С. 387–98.
2. Castro C. E., J. Dong, M.C. Boyce, S. Lindquist, M.J. Lang, Physical properties of polymorphic
yeast prion amyloid fibers, Biophys. J. 101 (2011) 439–448.
3. Cox B.S. [PSI+], a cytoplasmic supresor of super-supressor in yeast // Genetics. 1964. С. 505–
521.
4. Decker C.J., Parker R. P-bodies and stress granules: possible roles in the control of translation
and mRNA degradation // Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 2012. Т. 4. No 9. С. a012286.
5. DePace A.H., Santoso A., Hillner P., Weissman J.S. A critical role for aminoterminal glutamine/asparagine repeats in the formation and propagation of a yeast prion // Cell.
1998. Т. 93. No 7. С. 1241–52.
6. Doel S.M., Mccready S.J., Nierras C.R., Cox B.S. The dominant PNM2 mutation
which eliminates the PSI factor of Saccharomyces cerevisiae is the result of missense
mutation in the SUP35 gene // Genetics. 1994. Т. 137. С. 659–670.
7. Eaglestone S.S., Cox B.S., Tuite M.F. Translation termination efficiency can be regulated in
Saccharomyces cerevisiae by environmental stress through a prion-mediated mechanism //
EMBO J. 1999. Т. 18. No 7. С. 1974–81.
8. Fitzpatrick D.A., O’Brien J., Moran C., Hasin N., Kenny E., Cormican P., Gates A., Morris
D.W., Jones G.W. Assessment of inactivating stop codon mutations in forty
Saccharomyces cerevisiae strains: implications for [PSI] prion-mediated phenotypes // PLoS
One. 2011. Т. 6. No 12.С. e28684.
9. Fowler D.M., Koulov A. V, Alory-Jost C., Marks M.S., Balch W.E., Kelly J.W. Functional
amyloid formation within mammalian tissue // PLoS Biol. 2006. Т. 4. No 1. С. e6.
10. Gilks N., Kedersha N., Ayodele M., Shen L., Stoecklin G., Dember L.M., Anderson P. Stress
granule assembly is mediated by prion-like aggregation of TIA-1 // Mol. Biol. Cell. 2004. Т. 15.
С. 5383–5398.
11. Halfmann R., Jarosz D.F., Jones S.K., Chang A., Lancaster A.K., Lindquist S. Prions are
acommon mechanism for phenotypic inheritance in wild yeasts // Nature. 2012b. Т. 482. No
7385. С. 363–368.
12. Hou F, Sun L Zheng H, Skaug B, Jiang Q, Chen Z, MAVS forms functional prion-like
aggregates to activate and proragate antiviral innate immune response Cell 2001.
13. Kajava A. V., Baxa U., Wickner R.B., Steven A.C. A model for Ure2p prion filaments and other
amyloids: the parallel superpleated beta-structure // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004. Т. 101.
No21. С. 7885–7890.50
14. King C.Y. Supporting the structural basis of prion strains: induction and identification of [PSI]
variants // J. Mol. Biol. 2001. Т. 307. No 5. С. 1247–60.
15. Liebman S.W., Sherman F. Extrachromosomal psi + determinant suppresses nonsense
mutations in yeast // J. Bacteriol. 1979. Т. 139. No 3. С. 1068–71.
16. Maji S.K., Perrin M.H., Sawaya M.R., Jessberger S., Vadodaria K., Rissman R. A., Singru P.S.,
Nilsson K.P.R., Simon R., Schubert D., Eisenberg D., Rivier J., Sawchenko P., Vale W., Riek
R. Functional amyloids as natural storage of peptide hormones in pituitary secretory granules //
Science. 2009. Т. 325. No 5938. С. 328–32.
17. Nakayashiki T., Kurtzman C.P., Edskes H.K., Wickner R.B. Yeast prions [URE3] and [PSI+]
are diseases // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005. Т. 102. No 30. С. 10575–80.
18. Nover L., Scharf K.D., Neumann D. Formation of cytoplasmic heat shock granules in tomato
cell cultures and leaves // Mol. Cell. Biol. 1983. Т. 3. No 9. С. 1648–1655.
19. Palmer E., Wilhelm J.M., Sherman F. Variation of phenotypic suppression due to the psi + and
psi - extrachromosomal determinants in yeast // J. Mol. Biol. 1979. Т. 128. No 1. С. 107–10.
20. Rogoza T., Goginashvili A., Rodionova S., Ivanov M., Viktorovskaya O., Rubel A., Volkov K.,
Mironova L. Non-Mendelian determinant [ISP+] in yeast is a nuclear-residing prion form of the
global transcriptional regulator Sfp1 // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010. Т. 107. No 23. С.
10573–7.
21. Saifitdinova A.F., Nizhnikov A. A., Lada A.G., Rubel A. A., Magomedova Z.M., Ignatova V.
V, Inge-Vechtomov S.G., Galkin A.P. [NSI (+)]: a novel non-Mendelian nonsense
suppressor determinant in Saccharomyces cerevisiae // Curr. Genet. 2010. Т. 56. No 5. С. 467–
78.
22. Shewmaker F., McGlinchey R.P., Wickner R.B. Structural insights into functional
and pathological amyloid // J. Biol. Chem. 2011. Т. 286. No 19. С. 16533–40.
23. Shkundina I.S., Kushnirov V. V., Tuite M.F., Ter-Avanesyan M.D. The role of the N-terminal
oligopeptide repeats of the yeast Sup35 prion protein in propagation and transmission of prion
variants // Genetics. 2006. Т. 172. No 2. С. 827–835.
24. Sokolov P. A., Belousov M. V., Bondarev S. A., Zhouravleva G. A. , Kasyanenko N.A. FibrilJ:
ImageJ Plugin for Fibrils' Diameter and Persistence Length Determination// Computer Physics
Communications, 2017.
25. stress // PLoS Biol. 2008. Т. 6. No 11. С. e294.
26. Ter-Avanesyan M.D., Dagkesamanskaya A.R., Kushnirov V. V., Smirnov V.N. The SUP35
omnipotent suppressor gene is involved in the maintenance of the non-mendelian determinant
[psi+] in Yeast Saccharomyces cerevisiae // Genetics. 1994. Т. 137. С. 671–676.
27. Tyedmers J., Madariaga M.L., Lindquist S. Prion switching in response to environmental51
28. Wang C., Liu X., Wei B. Mitochondrion: an emerging platform critical for host antiviral
signaling // Expert Opin. Ther. Targets. 2011. Т. 15. No 5. С. 647–665.
29. Wickner R.B. [URE3] as an altered URE2 protein: evidence for a prion analog in
Saccharomyces cerevisiae // Science. 1994. Т. 264. No 5158. С. 566–9.
30. Wickner R.B., Masison D.C., Edskes H.K. [PSI] and [URE3] as yeast prions // Yeast. 1995. Т.
11. No 16. С. 1671–85.
31. Wilczynska A., Aigueperse C., Kress M., Dautry F., Weil D. The translational regulator CPEB1
provides a link between dcp1 bodies and stress granules // J. Cell Sci. 2005. Т. 118. No Pt 5. С.
981–92.
32. Бондарев С. А., Влияние мутация в прионизирующем домене белка Sup35 на свойства
приона [PSI+] дрожжей Saccharomyces cerevisiae, 2014.
33. Шкундина И. С., Тер-Авесян М. Д., Успехи биологической химии, 2006

Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.



Подобные работы


©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ
.