Амилоиды представляют собой фибриллярные белковые агрегаты, которые формируются за счет образования упорядоченных межмолекулярных в-складчатых листов. Амилоидным агрегатам присуще несколько физико-химическим свойств, которые позволяют отличать их от остальных белковых агрегатов:
- связывание с амилоид-специфическими красителями, такими как Конго красный, а также Тиофлавин S и Тиофлавин T;
- высокий уровень устойчивости к воздействию ионных детергентов;
- способность протофибрилл к автокаталитическому росту за счет присоединения свободных мономеров;
Большинство известных амилоидов являются патогенными и связаны с целой группой заболеваний животных и человека, таких как болезнь Альцгеймера [Reitz et al., 2011], болезнь Хангтингтона [Lee et al., 2013], системный амилоидоз AA [Westermark and Westermark, 2009] и другие. Однако, наряду с патогенными, были выявлены и функциональные амилоиды, которые в норме присутствуют во многих живых организмах и выполняют жизненно важные функции. Наиболее известными среди них являются белки паутины Nephila edulis и шелка Bomhyx mori и некоторых других насекомых [Andersson et al, 2016] - спидроин и фиброин. Также выявлены функциональные
амилоиды бактерий, входящие в состав экстраклеточной биопленки (например, у Bacillus suhtillus амилоидный белок TasA [Romero, 2010]). У Saccharomyces cerevisiae выявлен функциональный белок Bgl2 [Gorkovskii, 2009], стабилизирующий клеточную стенку. У человека был обнаружен амилоидный белок Pmel17, который в норме связывает меланин [Fowler D.M., 2006].
В последние годы появляются данные, что амилоиды присутствуют в норме в ооцитах многих животных. Есть данные, что в оболочке яиц некоторых беспозвоночных, рыб, амфибий, птиц и млекопитающих есть белки, способные образовывать агрегаты, которые связываются с амилоид-специфичными красителями.
В нашей лаборатории был разработан метод протеомного скрининга амилоидов PSIA LC-MALDI, основанный на устойчивости амилоидных фибрилл к ионным детергентам [Nizhnikov et al., 2014]. Этот метод применим для работы с разными организмами и позволяет отделять белки, формирующие высокомолекулярные амилоидоподобные агрегаты, от прочих белков.
В данной работе проведён скрининг белков для выявления наиболее перспективных кандидатов на роль функциональных амилоидов в яичниках Drosophila melanogaster. Плодовая мушка дрозофила удобна в разведении в лабораторных условиях, всесторонне изучена, в том числе у нее хорошо исследован оогенез.
Таким образом, целью данной работы является выявление кандидатов на роль функциональных амилоидов в яичниках Drosophila melanogaster.
В соответствии с поставленной целью были сформулированы следующие задачи:
1. Окрашивание срезов яичников Drosophila melanogaster амилоидспецифичными красителями Тиофлавин S и Конго красный.
2. Проведение протеомного скрининга для выявления белков-кандидатов на роль функциональных амилоидов в ооцитах Drosophila melanogaster.
3. Анализ агрегации наиболее перспективного белка-кандидата в дрожжах Saccharomyces cerevisiae.
Мы показали, что белок хориона ооцитов дрозофилы s36 связывает амилоидспецифичные красители Тиофлавин S и Конго красный, формирует SDS-устойчивые агрегаты в яичниках дрозофилы, содержит амилоидогенные последовательности, предсказанные биоинформатическими алгоритмами и химерный белок CP36-YFP при сверхпродукции формирует агрегаты в клетках дрожжей Saccharomyces cerevisiae. Полученные результаты демонстрируют, что исследуемый белок обладает свойствами, характерными для амилоидов. Учитывая это, а также литературные данные о роли белка s36 в формировании хориона, в том числе микропиле, мы можем рассматривать этот белок в качестве кандидата на роль функционального амилоида в ооцитах Drosophila melanogaster.
1. Aagaard J.E., Yi X., MacCoss M.J., Swanson W.J. Rapidly evolving zona pellucida domain proteins are a major component of the vitelline envelope of abalone eggs. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2006. - Vol. 103, №46. - P. 17302-17307.
2. Ahmed A.B., Kajava A.V. Breaking the amyloidogenicity code: methods to predict amyloids from amino acid sequence. // FEBS Lett. - 2013. - Vol. 587. - №8. - P. 1089-1095.
3. Andersson M., Johansson J., Rising A. Silk spinning in silkworms and spiders. // International Journal of Molecular Sciences. - 2016. - Vol. 17 - P. 1290
4. Bastock R., Johnston D.St. Drosophila oogenesis. // Curr Biol. - 2008. - Vol. 18, №23. - R1082-R1087.
5. Berchowitz L.E., Kabachinski G., Walker M.R., Carlile T.M., Gilbert W.V., Schwartz T.U., Amon A. Regulated formation of an amyloid-like translational repressor governs gametogenesis. // Cell. - 2015. - Vol. 163, №2. - P. 406-418.
6. Berg C.A. Tube formation in Drosophila egg chambers. // Tissue Eng.: Part A. - 2008. - Vol. 14, №9. - P. 1479-88.
7. Berruti G. and Paiardi C. Acrosome biogenesis: Revisiting old questions to yield new insights. // Spermatogenesis. - 2011. - Vol. 1, №2. - P. 95-98.
8. Bleem A. and Daggett V. Structural and functional diversity among amyloid proteins: agents of disease, building blocks of biology, and implications for molecular engineering. // Biotechnol. Bioeng. - 2017. - Vol. 114, №1 - P. 7-20.
9. Boke E., Ruer M., Wuhr M., Coughlin M., Lemaitre R., Gygi S.P., Alberti S., Drechsel D., Hyman A.A. and Mitchison T.J. Amyloid-like Self-assembly of a Cellular Compartment. // Cell. - 2016. - Vol. 166, №3. - P. 637-650.
10. Bontems F., Stein A., Marlow F., Lyautey J., Gupta T., Mullins M.C. and Dosch R. Bucky Ball Organizes Germ Plasm Assembly in Zebrafish. // Current Biology. - 2009. - Current Biology. - Vol. 19, №5. - P. 414-22.
11. Carneiro K.M.M., Zhai H., Zhu L., Horst J.A., Sitlin M., Nguyen M., Wagner M., Simpliciano C., Milder M., Chen C.-L., Ashby P., Bonde J., Li W., Habelitz S. Amyloid-like ribbons of amelogenins in enamel mineralization. // Sci. Rep. -
2016. - Vol. 6. - P. 23105.
12. Coustou V., Deleu C., Saupe S., Begueret J. The protein product of the het-s heterokaryon incompatibility gene of the fungus Podospora anserina behaves as a prion analog. // Proc Natl Acad Sci U S A. - 1997. - Vol. 94, № 18. - P. 9773 - 9778.
13. Egge N., Muthusubramanian A., Cornwall G.A. Amyloid Properties of the Mouse Egg Zona Pellucida. // PLOS ONE. - 2015. - Vol.10, №6. - e0129907.
14. Ephrussi A., Dickinson L.K., Lehmann R. Oskar organizes the germ plasm and directs localization of the posterior determinant nanos. // Cell. - 1991. - Vol. 66, №1. - P. 37-50.
15. Fakhouri M., Elalayli M., Sherling D., Hall J.D., Miller E., Sun X., Wells L., LeMosy E.K.. Minor proteins and enzymes of the Drosophila eggshell matrix. // Dev Biol. - 2006. - Vol. 293, №1. - P. 127-41.
16. Fowler D.M., Koulov A.V., Alory-Jost C., Marks M.S., Balch W.E., Kelly J.W. Functional amyloid formation within mammalian tissue. // PLoS Biol. - 2006. - Vol. 4, № 1. - e6.
... Всего источников –61.