Тип работы:
Предмет:
Язык работы:


Разработка тест-системы для оценки эффективности эффероцитоза

Работа №128118

Тип работы

Дипломные работы, ВКР

Предмет

биология

Объем работы47
Год сдачи2021
Стоимость4320 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
17
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


Введение
Цели и задачи 4
Обзор литературы 5
Липопротеины и транспорт липидов 5
Механизмы атерогенеза 7
Роль макрофагов в атерогенезе 11
Факторы эффективности эффероцитоза 14
Стратегии изучения и доступные модели исследования эффероцитоза 16
Материалы и методы 17
Работа с клеточной линией ТНР-1 17
Выделение мононуклеаров из периферической крови 18
Работа с клеточной линией Jurkat 19
Оценка эффективности эффероцитоза 20
Проточная цитометрия 22
Использование перфузионных камер и конфокальная микроскопия 23
Расчеты и статистическая обработка 25
Выравнивание нуклеотидных последовательностей 26
Результаты 26
Опыт для подбора оптимальных условий индукции апоптоза клеток линии Jurkat 26
Детекция эффероцитоза с помощью метода проточной цитометрии 27
Опыт по оценке зависимости эффективности эффероцитоза от времени 29
Серия опытов на ТНР-1 и РВМС с положительным и отрицательным контролем 31
Сравнение промоторных областей генов mertk человека и мыши 33
Обсуждение 34
Выводы 37
Список литературы 38

Постиндустриальное общество, помимо технического прогресса, озабочено также вопросами долголетия и улучшения качества жизни. Некоторые заболевания удалось победить с помощью инновационных мер профилактики и терапии, тогда как другие вышли на авансцену угроз мирового здравоохранения. На протяжении нескольких десятилетий заболевания сердечно-сосудистой системы лидируют в списке причин смерти людей по всему миру, и один из основных факторов риска их возникновения — это атеросклероз (Mozaffarian и др., 2014; www.who.int; Frostegard, 2013). Это заболевание характеризуется хроническим воспалительным процессом, затрагивающим преимущественно внутреннюю оболочку, или интиму, крупных и средних артерий, в которой образуются т.н. атеросклеротические бляшки. При разрастании они могут затруднять кровоток, а при разрушении — вызвать тромбообразование, закупорку сосуда и смерть. На начальных стадиях в интиму сосуда проникают богатые холестерином липопротеины низкой плотности (LDL). Их накопление вызывает активацию провоспалительных сигнальных путей эндотелиоцитов и экспрессию ими факторов адгезии моноцитов (Linton и др., 2019). Последние мигрируют в интиму и дифференцируются в макрофаги для захвата LDL с помощью фагоцитоза или рецептор-опосредованного эндоцитоза (Woollard и др., 2010). Кроме того, под действием воспалительных факторов и макрофаги, и эндотелиоциты вырабатывают активные формы кислорода, которые окисляют или иным образом модифицируют LDL (mLDL). Такие липопротеины сами по себе становятся мощным провоспалительным фактором, что и знаменует «порочный круг» патогенеза атеросклероза (Linton и др., 2019).
Несмотря на то, что почти любая клетка животного организма может синтезировать холестерин, ни одна из них не может полностью его катаболизировать, поэтому для клеток существует опасность избытка холестерина. Перенасыщение цистерн ЭПР макрофага эфирами холестерина блокирует работу рецептора нативных LDL (LDLR), однако такая отрицательная обратная связь не действует в случае рецепторов mLDL, что приводит к неконтролируемому поглощению последних и гибели макрофага в результате стресса ЭПР и нарушения фолдинга белков (Rogacev и др., 2012; Tabas и Ron., 2011). В норме макрофаги захватывают
погибшие клетки животного организма в ходе процесса, называемого эффероцитозом. При атеросклерозе эффективность эффероцитоза критически важна: погибшие апоптозом макрофаги, составляющие ядро атеросклеротической бляшки, могут претерпеть вторичный некроз, который определяет нестабильность бляшки и риск осложнений заболевания вплоть до летального исхода (Shao и др., 2012). Но данные, полученные при изучении более поздних атеросклеротических поражений, свидетельствуют о неэффективности в них эффероцитоза (Schrijvers и др., 2005).
Цели и задачи
Перечисленные факты определили цель настоящего исследования — разработку физиологически релевантной тест-системы, позволяющей исследовать эффективность эффероцитоза и его механизмы.
Для достижения этой цели необходимо было выполнить следующие задачи:
1. Подобрать оптимальные условия для индукции апоптоза клеток Т-лимфобластного лейкоза человека (Jurkat) с помощью камптотецина;
2. Подобрать оптимальное время контакта фагоцитов, полученных из клеток моноцитарного лейкоза человека (ТНР-1) и моноцитов периферической крови, и апоптотических клеток;
3. Детектировать эффероцитоз с помощью метода проточной цитометрии;
4. Выбрать метод культивирования для наблюдения за живыми клетками и визуализации эффероцитоза с помощью конфокальной микроскопии;
5. Провести количественный анализ эффективности эффероцитоза.


Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!


1. Суточная инкубация в среде с конечной концентрацией камптотецина 10 мкМ позволяет получать стабильную фракцию апоптотических Jurkat;
2. Контакт фагоцитов и клеток-мишеней в течение 90 минут оптимален для исследования эффероцитоза в условиях длительной пробоподготовки;
3. Тест-система может быть использована для детекции эффероцитоза с помощью проточной цитометрии;
4. Использование перфузионной камеры позволяет осуществлять прижизненную визуализацию эффероцитоза;
5. Количественный анализ эффективности эффероцитоза выявил различия в регуляции экспрессии человеческой и мышиной Mer тирозин-киназы, участвующей в эффероцитозе;



Adachi, H., &Tsujimoto, M. (2006). Endothelial scavenger receptors. Progress in lipid research, 45(5), 379-404.
A-Gonzalez, N., Bensinger, S. J., Hong, C., Beceiro, S., Bradley, M. N., Zelcer, N., Deniz, J., Ramirez, C., Diaz, M., Gallardo, G., de Galarreta, C. R., Salazar, J., Lopez, F., Edwards, P., Parks, J., Andujar, M., Tontonoz, P., & Castrillo, A. (2009). Apoptotic cells promote their own clearance and immune tolerance through activation of the nuclear receptor LXR. Immunity, 31(2), 245-258.
Anitchkow N. N., Chalatow S. S. (1913). Uber experimentelle Cholesterinsteatose und ihre Bedeutung fur die Entstiehung einiger pathologischer Prozesse. Zentralblatt fur allgemeine Pathologie und pathologische Anatomie, 24(1), 1-9.
Armstrong, S. M., Sugiyama, M. G., Fung, K. Y., Gao, Y., Wang, C., Levy, A. S., Azizi, P., Roufaiel, M., Zhu, S. N., Neculai, D., Yin, C., Bolz, S. S., Seidah, N. G., Cybulsky, M. I., Heit, B., & Lee, W. L. (2015). A novel assay uncovers an unexpected role for SR-BI in LDL transcytosis. Cardiovascular research, 108(2), 268-277.
Benedetti, S., Palma, F., Fraternale, A., & luliano, L. (2020). LDL receptors, caveolae and cholesterol in endothelial dysfunction: oxLDLs accomplices or victims?. British journal of pharmacology, 10.1111/bph.15272. Advance online publication.
Bennett, S. and Breit, S. N. (1994). Variables in the isolation and culture of human monocytes that are of particular relevance to studies of HIV. Journal of Leukocyte Biology, 56(3), 236-240
Bobryshev, Y. V., Ivanova, E. A., Chistiakov, D. A., Nikiforov, N. G., & Orekhov, A. N. (2016). Macrophages and Their Role in Atherosclerosis: Pathophysiology and Transcriptome Analysis. BioMed research international, 2016, 9582430.
Bohlson, S. S., O'Conner, S. D., Hulsebus, H. J., Ho, M. M., & Fraser, D. A. (2014).
Complement, c1q, and c1q-related molecules regulate macrophage polarization. Frontiers in immunology, 5, 402.
Calvo, D., Gomez-Coronado, D., Suarez, Y., Lasuncion, M. A., & Vega, M. A. (1998). Human CD36 is a high affinity receptor for the native lipoproteins HDL, LDL, and VLDL. Journal of lipid research, 39(4), 777-788.
Cancel, L. M., & Tarbell, J. M. (2011). The role of mitosis in LDL transport through cultured endothelial cell monolayers. American journal ofphysiology. Heart and circulatory physiology, 300(3), H769-H776.
Cifarelli, A., Pepe, G., Paradisi, F., & Piccolo, D. (1979). The influence of some metabolic inhibitors on phagocytic activity of mouse macrophages in vitro. Research in experimental medicine. Zeitschrift fur die gesamte experimentelle Medizin einschliesslich experimenteller Chirurgie, 174(2) 197-204.
Civelek, M., Manduchi, E., Riley, R. J., Stoeckert, C. J., Jr, & Davies, P F. (2009). Chronic endoplasmic reticulum stress activates unfolded protein response in arterial endothelium in regions of susceptibility to atherosclerosis. Circulation research, 105(5), 453-461.
Cominacini, L., Pasini, A. F., Garbin, U., Davoli, A., Tosetti, M. L., Campagnola, M., Rigoni, A., Pastorino, A. M., Lo Cascio, V., & Sawamura, T. (2000). Oxidized low density lipoprotein (ox-LDL) binding to ox-LDL receptor-1 in endothelial cells induces the activation of NF-kappaB through an increased production of intracellular reactive oxygen species. The Journal of biological chemistry, 275(17), 12633-12638.
da Rocha, R. F., De Bastiani, M. A., & Klamt, F. (2014). Bioinformatics approach to evaluate differential gene expression of M1/M2 macrophage phenotypes and antioxidant genes in atherosclerosis. Cell biochemistry and biophysics, 70(2), 831-839.
Davies PF. Flow-mediated endothelial mechanotransduction. Physiological reviews. 1995;75:519-560 Davies P F. (1995). Flow-mediated endothelial mechanotransduction. Physiological reviews, 75(3), 519-560.
Ehara, S., Ueda, M., Naruko, T., Haze, K., Itoh, A., Otsuka, M., Komatsu, R., Matsuo, T., Itabe, H., Takano, T., Tsukamoto, Y., Yoshiyama, M., Takeuchi, K., Yoshikawa, J., & Becker, A. E. (2001). Elevated levels of oxidized low density lipoprotein show a positive relationship with the severity of acute coronary syndromes. Circulation, 103(15), 1955-1960.
Evans, A. L., Blackburn, J. W., Yin, C., & Heit, B. (2017). Quantitative Efferocytosis Assays. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 1519, 25-41.
Fielding, C. J., & Fielding, P E. (2008). Dynamics of lipoprotein transport in the circulatory system. Biochemistry of Lipids, Lipoproteins and Membranes, 533-553.
Frostegard, J. (2013). Immunity, atherosclerosis and cardiovascular disease. BMC Medicine, 11(1).
Gillotte-Taylor, K., Boullier, A., Witztum, J. L., Steinberg, D., & Quehenberger, O. (2001). Scavenger receptor class B type I as a receptor for oxidized low density lipoprotein. Journal of lipid research, 42(9), 1474-1482.
Gimbrone, M. A., Jr, & Garcia-Cardena, G. (2013). Vascular endothelium, hemodynamics, and the pathobiology of atherosclerosis. Cardiovascular pathology : the official journal of the Society for Cardiovascular Pathology, 22(1), 9-15.
Gimbrone, M. A., Jr, Topper, J. N., Nagel, T., Anderson, K. R., & Garcia-Cardena, G. (2000). Endothelial dysfunction, hemodynamic forces, and atherogenesis. Annals of the New York Academy of Sciences, 902, 230-240.
Jahreis, G., & Dawczynski, C. (2020). Trans and conjugated fatty acids in dairy products: Cause for concern? Milk and Dairy Foods, 87-120.
Jang, E., Robert, J., Rohrer, L., von Eckardstein, A., & Lee, W. L. (2020). Transendothelial transport of lipoproteins. Atherosclerosis,315, 111-125.
Jiang, R., Cai, J., Zhu, Z., Chen, D., Wang, J., Wang, Q., Teng, Y., Huang. Y, Tao. M, Xia, A., Xue, M, Zhou, S. and Chen, A.F. (2014) Hypoxic Trophoblast HMGB1 Induces Endothelial Cell Hyperpermeability via the TRL-4/Caveolin-1 Pathway. Journal of Immunollogy, published online.
Kondo, T., & Watanabe, Y. (1975). A heritable hyperlipemic rabbit. Jikken dobutsu. Experimental animals, 24(3), 89-94.
Kunitomo, M., Yamaguchi, Y., Kagota, S., Yoshikawa, N., Nakamura, K., & Shinozuka, K. (2009). Biochemical Evidence of Atherosclerosis Progression Mediated by Increased Oxidative Stress in Apolipoprotein E-Deficient Spontaneously Hyperlipidemic Mice Exposed to Chronic Cigarette Smoke. Journal of Pharmacological Sciences, 110(3),354-361.
Lee, Y. T., Lin, H. Y., Chan, Y. W., Li, K. H., To, O. T., Yan, B. P., Liu, T., Li, G., Wong, W. T., Keung, W., & Tse, G. (2017). Mouse models of atherosclerosis: a historical perspective and recent advances. Lipids in health and disease, 16(1), 12.
Li, D., & Mehta, J. L. (2000). Antisense to LOX-1 inhibits oxidized LDL-mediated upregulation of monocyte chemoattractant protein-1 and monocyte adhesion to human coronary artery endothelial cells. Circulation, 101(25), 2889-2895.
Linton, M. F., Babaev, V. R., Huang, J., Linton, E. F., Tao, H., & Yancey, P G. (2016). Macrophage Apoptosis and Efferocytosis in the Pathogenesis of Atherosclerosis.
Circulation journal: official journal of the Japanese Circulation Society, 80(11), 2259-2268.
Miller, Y. I., Viriyakosol, S., Binder, C. J., Feramisco, J. R., Kirkland, T. N., & Witztum, J. L. (2003). Minimally modified LDL binds to CD14, induces macrophage spreading via TLR4/MD-2, and inhibits phagocytosis of apoptotic cells. The Journal of biological chemistry, 278(3), 1561-1568.
Morris, E. J., & Geller, H. M. (1996). Induction of neuronal apoptosis by camptothecin, an inhibitor of DNA topoisomerase-I: evidence for cell cycle-independent toxicity. The Journal of cell biology, 134(3), 757-770.
Morrow, J. D., Frei, B., Longmire, A. W., Gaziano, J. M., Lynch, S. M., Shyr, Y., ... Roberts, L. J. (1995). Increase in Circulating Products of Lipid Peroxidation (F2-Isoprostanes) in Smokers — Smoking as a Cause of Oxidative Damage. New England Journal of Medicine, 332(18), 1198-1203.
Mozaffarian, D., Benjamin, E. J., Go, A. S., Arnett, D. K., Blaha, M. J., Cushman, M., ... Turner, M. B. (2014). Heart Disease and Stroke Statistics—2015 Update. Circulation, 131(4), e29-e322.
Murray, P J., Allen, J. E., Biswas, S. K., Fisher, E. A., Gilroy, D. W., Goerdt, S., Gordon, S., Hamilton, J. A., Ivashkiv, L. B., Lawrence, T., Locati, M., Mantovani, A., Martinez, F. O., Mege, J. L., Mosser, D. M., Natoli, G., Saeij, J. P., Schultze, J. L., Shirey, K. A., Sica,
A. , ... Wynn, T. A. (2014). Macrophage activation and polarization: nomenclature and experimental guidelines. Immunity, 41(1), 14-20.
Nuutila, J., & Lilius, E. M. (2005). Flow cytometric quantitative determination of ingestion by phagocytes needs the distinguishing of overlapping populations of binding and ingesting cells. Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology, 65(2), 93-102.
Oram, J. F., Wolfbauer, G., Vaughan, A. M., Tang, C., & Albers, J. J. (2003).
Phospholipid transfer protein interacts with and stabilizes ATP-binding cassette transporter A1 and enhances cholesterol efflux from cells. The Journal of biological chemistry, 278(52), 52379-52385.
Orecchioni, M., Ghosheh, Y., Pramod, A. B., & Ley, K. (2019). Macrophage Polarization: Different Gene Signatures in M1(LPS+) vs. Classically and M2(LPS-) vs. Alternatively Activated Macrophages. Frontiers in immunology, 10, 1084.
Ravichandran K. S. (2010). Find-me and eat-me signals in apoptotic cell clearance: progress and conundrums. The Journal of experimental medicine, 207(9), 1807-1817.
Rogacev, K. S., Cremers, B., Zawada, A. M., Seiler, S., Binder, N., Ege, P., Grobe-Dunker, G., Heisel, I., Hornof, F., Jeken, J., Rebling, N. M., Ulrich, C., Scheller,
B. , Bohm, M., Fliser, D., & Heine, G. H. (2012). CD14++CD16+ monocytes independently predict cardiovascular events: a cohort study of 951 patients referred for elective coronary angiography. Journal of the American College of Cardiology, 60(16), 1512-1520.
Rohrer, L., Ohnsorg, P M., Lehner, M., Landolt, F., Rinninger, F., & von Eckardstein, A. (2009). High-density lipoprotein transport through aortic endothelial cells involves scavenger receptor BI and ATP-binding cassette transporter G1. Circulation research, 104(10), 1142-1150.
Sawamura, T., Kume, N., Aoyama, T., Moriwaki, H., Hoshikawa, H., Aiba, Y., Tanaka, T., Miwa, S., Katsura, Y., Kita, T., & Masaki, T. (1997). An endothelial receptor for oxidized low-density lipoprotein. Nature, 386(6620), 73-77.
Schrijvers, D. M., De Meyer, G. R., Kockx, M. M., Herman, A. G., & Martinet, W. (2005). Phagocytosis of apoptotic cells by macrophages is impaired in atherosclerosis. Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology, 25(6), 1256-1261.
Schwende, H., Fitzke, E., Ambs, P., & Dieter, P (1996). Differences in the state of differentiation of THP-1 cells induced by phorbol ester and 1,25-dihydroxyvitamin D3. Journal of leukocyte biology, 59(4), 555-561.
Shao, B., Pennathur, S., & Heinecke, J. W. (2012). Myeloperoxidase targets apolipoprotein A-I, the major high density lipoprotein protein, for site-specific oxidation in human atherosclerotic lesions. The Journal of biological chemistry, 287(9), 6375-6386.
Shaul, P.W. (2003). Endothelial nitric oxide synthase, caveolae and the development of atherosclerosis. The Journal of physiology, 547( 1), 21-33.
Sihombing, M., Safitri, M., Zhou, T., Wang, L., McGinty, S., Zhang, H. J., Yin, Y., Peng, Q., Qiu, J., & Wang, G. (2021). Unexpected Role of Nonimmune Cells: Amateur Phagocytes. DNA and cell biology, 40(2), 157-171.
Tabas, I., & Ron, D. (2011). Integrating the mechanisms of apoptosis induced by endoplasmic reticulum stress. Nature cell biology, 13(3), 184-190.
Tabas I. (2010). Macrophage death and defective inflammation resolution in atherosclerosis. Nature reviews. Immunology, 10(1), 36-46.
Taruc, K., Yin, C., Wootton, D. G., & Heit, B. (2018). Quantification of Efferocytosis by Single-cell Fluorescence Microscopy. Journal of visualized experiments : JoVE, (138), 58149.
Traganos, F., Seiter, K., Feldman, E., Halicka, H. D., & Darzynkiewicz, Z. (1996).
Induction of apoptosis by camptothecin and topotecan. Annals of the New York Academy of Sciences, 803, 101-110.
Ungvari Z, Wolin MS, Csiszar A. Mechanosensitive production of reactive oxygen species in endothelial and smooth muscle cells: role in microvascular remodeling? Antioxidants & redox signaling 2006; 8:1121-1129.
Watanabe Y. (1980). Serial inbreeding of rabbits with hereditary hyperlipidemia (WHHL-rabbit). Atherosclerosis, 36(2), 261-268.
Williams, K. J., & Tabas, I. (1995). The response-to-retention hypothesis of early atherogenesis. Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology, 15(5), 551-561.
Williams, T. M., & Lisanti, M. P (2004). The caveolin proteins. Genome biology, 5(3), 214.
Woollard, K. J., & Geissmann, F. (2010). Monocytes in atherosclerosis: subsets and functions. Nature reviews. Cardiology, 7(2), 77-86.
Wu, Y., Tibrewal, N., & Birge, R. B. (2006). Phosphatidylserine recognition by phagocytes: a view to a kill. Trends in cell biology, 16(4), 189-197.
Ye, D., Lammers, B., Zhao, Y., Meurs, I., Van Berkel, T. J., & Van Eck, M. (2011). ATP-binding cassette transporters A1 and G1, HDL metabolism, cholesterol efflux, and inflammation: important targets for the treatment of atherosclerosis. Current drug targets, 12(5), 647-660.
Zeng, L., Zampetaki, A., Margariti, A., Pepe, A. E., Alam, S., Martin, D., Xiao, Q., Wang, W., Jin, Z. G., Cockerill, G., Mori, K., Li, Y. S., Hu, Y., Chien, S., & Xu, Q. (2009). Sustained activation of XBP1 splicing leads to endothelial apoptosis and atherosclerosis development in response to disturbed flow. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 106(20), 8326-8331.
Zizzo, G., Hilliard, B. A., Monestier, M., & Cohen, P L. (2012). Efficient clearance of early apoptotic cells by human macrophages requires M2c polarization and MerTK induction. Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950), 189(7), 3508-3520.
Климов, А.Н., Никульчева, Н.Г. (1999). Обмен липидов и липопротеидов и его нарушения. СПб.: Питер, 512 с.
Парфенова, Н. С., Голиков, Ю. П., Климов, А. Н. (2016). К истории развития холестериновой модели атеросклероза. Медицинский Академический журнал, 16(2), 7-14.
http s://www.collecteurs .com/artists/heather-dewey-hagborg/artworks/jurkat-cells-brightfi eld-100x-magnification


Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.




©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ