Тип работы:
Предмет:
Язык работы:


История колонизации островов Курильской гряды красно-серой полевкой по данным анализа изменчивости цитохрома b

Работа №126448

Тип работы

Магистерская диссертация

Предмет

биология

Объем работы32
Год сдачи2022
Стоимость5400 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
34
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


1. Введение 3
2. Обзор литературы 4
2.2 Плейстоценовая история 7
2.3 Общая характеристика вида 11
3. Материалы и методы 13
3.1 Материал 13
3.2 Выделение ДНК и ПЦР 14
3.3 Филогенетический анализ 14
3.4 Филогеографический анализ 15
4. Результаты 16
4.1 Филогения 16
4.2 Демографические события 18
5. Обсуждение 20
Выводы 23
Список литературы 24
Приложение 29

Исследования в области филогеографии дают представление о миграциях фауны в плейстоценовую эпоху. В частности, были предложены гипотезы о возможных путях колонизации Японских островов, острова Сахалина и Кунашира красно-серой полевкой Craseomys rufocanus Sundevall, 1846. В этой работе мы изучаем историю заселения одного из островов Южной Курильской гряды - острова Итуруп. По меньшей мере было две волны колонизации Итурупа - в плиоцене и в позднем плейстоцене (Pietsch et al., 2003). Фауна могла перемещаться по сухопутному мосту, который соединял острова Кунашир, Хоккайдо, Сахалин и приморские территории Евразийского континента. В результате трансгрессии уровня моря сухопутные мосты исчезали и острова постепенно изолировались. Между Итурупом и Кунаширом сухопутный мост исчез 14-15 тысяч лет назад (Belousova M., Belousov A., Miller T. P., 2009).
Согласно предыдущим работам, красно-серые полевки мигрировали с материка на Сахалин, далее на Хоккайдо и Кунашир в позднем плейстоцене (Abramson et al., 2012; Dobson, 1994; Wakana S. et al., 1996). Есть данные о том, что ареал красно-серой полевки включает остров Итуруп (Frisman et al., 2002), однако во всех ранее опубликованных работах нет информации о путях, по которым происходила миграция на Итуруп.
Цель - Предположить миграционные пути и период появления красно-серой полевки Craseomys rufocanus на острове Итуруп.
Задачи:
1. Изучить изменчивость участка митохондриального гена цитохрома б в популяциях островов Итурупа, Сахалина и Кунашира.
2. Провести демографический анализ островных популяций на основе анализа молекулярной дисперсии (AMOVA) и Баесовского скайлайн-плота (Bayesian Skyline plot).
3. Протестировать возможные гипотезы заселения острова Итуруп.
А) Популяции красно-серой полевки мигрировали с материка на Сахалин, оттуда на Кунашир и Хоккайдо, а затем на Итуруп. Такая миграция была возможна более 15 тысяч лет назад во время существования сухопутного моста между Итурупом, Кунаширом, Хоккайдо и Сахалином.
Б) Популяции красно-серой полевки появились на Итурупе в результате недавнего антропогенного завоза.

Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!


На основании результатов филогеографического анализа был подтверждена гипотеза B о недавнем случайном заселении красно-серыми полевками Qraseomys rufocanus острова Итуруп.
1. Популяции красно-серой полевки на всем острове Итурупе генетически однородны и имеют один гаплотип, в отличие от популяций с Сахалина, Хоккайдо и Дальнего Востока.
2. Популяции красно-серой полевки были завезены на Итуруп с Сахалина или Кунашира. Данный завоз был недавним, единичным, с небольшим количеством особей основателей. В последствии полевки расселились по всей территории острова.
3. Между популяциями красно-серых полевок Сахалина и Хоккайдо эпизодично возникал поток генов, однако в целом популяции изолированы, что подтверждается анализом генетических дистанций. В популяциях Кунашира и Сахалина за недавний период (~ 40 тысяч лет назад) наблюдался экспансивный рост.


1. Abramson, N. I., Lebedev, V. S., Tesakov, A. S., & Bannikova, A. A. (2009). Supraspecies relationships in the subfamily Arvicolinae (Rodentia, Cricetidae): An unexpected result of nuclear gene analysis. Molecular Biology, 43(5), 834-846. https://doi.org/10.1134/S0026893309050148
2. Abramson, N. I., Petrova, T. V., Dokuchaev, N. E., Obolenskaya, E. V., & Lissovsky, A. A. (2012). Phylogeography of the gray red-backed vole Craseomys rufocanus (Rodentia: Cricetidae) across the distribution range inferred from nonrecombining molecular markers. Russian Journal of Theriology, 11(2), 137-156. https://doi.org/10.15298/rusjtheriol.11.2.04
3. Abramson, N. I., Rodchenkova, E. N., & Kostygov, A. Yu. (2009). Genetic variation and phylogeography of the bank vole (Clethrionomys glareolus, Arvicolinae, Rodentia) in Russia with special reference to the introgression of the mtDNA of a closely related species, red-backed vole (Cl. Rutilus). Russian Journal of Genetics, 45(5), 533-545. https://doi.org/10.1134/S1022795409050044
4. Anderson N. H., Wisseman R. W. (1987). Recovery of the Trichoptera fauna near Mt. St. Helens five years after the 1980 eruption. 367-373.
5. Avise, J. C. (2009). Phylogeography: Retrospect and prospect. Journal of Biogeography, 36(1), 3-15. https://doi.org/10.1111/j.1365-2699.2008.02032.x
6. Avise J. C. et al. (2000). Phylogeography: The history and formation of species (Harvard university press).
7. Belousova M., Belousov A., Miller T. P. (2009). Kurile Islands. 520-525.
8. Brent C. Emerson, Christophe Thdbaud, & Emmanuel Paradis. (December2001). Revealing the demographic histories of species using DNA sequences. 16(12).
9. Chaline J., Graf J.-D. (1988). Phylogeny of the Arvicolinae (Rodentia): Biochemical and paleontological evidence. 69, 22-33.
10. Cook, J. A., Runck, A. M., & Conroy, C. J. (2004). Historical biogeography at the crossroads of the northern continents: Molecular phylogenetics of red-backed voles (Rodentia: Arvicolinae). Molecular Phylogenetics and Evolution, 30(3), 767-777. https://doi.org/10.1016/S1055-7903(03)00248-3
11. Dammerman K. W. (1922). The fauna of Krakatau, Verlaten island and Sebesy.
12. Darriba D, Taboada GL, Doallo R, & Posada D. (2012). jModelTest 2: More models, new heuristics and parallel computing. 9(8), 772.
13. Dobson, M. (1994). Patterns of distribution in Japanese land mammals. Mammal Review, 24(3), 91-111. https://doi.org/10.1111/j.1365-2907.1994.tb00137.x
14. Drummond, A. J. (2005). Bayesian Coalescent Inference of Past Population Dynamics from Molecular Sequences. Molecular Biology and Evolution, 22(5), 1185-1192. https://doi.org/10.1093/molbev/msi103
15. Frisman, L. V., Kartavtseva, I. V., Pavlenko, M. V., Kostenko, V. A., Suzuki, H., Iwasa, M., Nakata, K., & Chernyavskii, F. B. (2002). Gene-Geographic Variation and Genetic Differentiation in Red-Backed Voles of the Genus Clethrionomys (Rodentia, Cricetidae) from the Region of the Sea of Okhotsk. 38(5), 10.
...


Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.



Подобные работы


©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ