Тип работы:
Предмет:
Язык работы:


Разработка компьютерного приложения для анализа данных UPVD-масс спектров

Работа №126280

Тип работы

Бакалаврская работа

Предмет

программирование

Объем работы13
Год сдачи2022
Стоимость4750 руб.
ПУБЛИКУЕТСЯ ВПЕРВЫЕ
Просмотрено
42
Не подходит работа?

Узнай цену на написание


Введение 3
Постановка задачи 6
Основные результаты 7
Итоги 10
Репозиторий проекта 10
Список литературы 11
Приложение 12


Необходимость в исследовании белков и пептидов возникает при решении самых разных задач современной биологии, химии и медицины. Наиболее широко используемым методом их анализа является массспектрометрия.
На вход прибора, называемого масс-спектрометром, поступают ионизированные молекулы исследуемого белка или пептида. Далее они разделяются по отношению m/z массы к заряду, для определенного значения
m/z обладающие им ионы изолируются и фрагментируются. Информация о фрагментных ионах и их интенсивности записывается в так называемый тандемный, или МС/МС, масс-спектр.

Возникли сложности?

Нужна помощь преподавателя?

Помощь в написании работ!


В ходе проделанной работы был разработан прототип программной системы, позволяющей находить подтверждения гипотезам о типах
фрагментных ионов и наглядно визуализировать используемые ими пики. Далее планируется усовершенствовать предложенные методы и, тем
самым, расширить возможности системы и обеспечить удобство ее применения при решении практических задач.


[1] К. В. Вяткина. De novo секвенирование белков и пептидов: алгоритмы, приложения, перспективы.
[2] Kira Vyatkina, Si Wu, Lennard J. M. Dekker, Martijn M. VanDuijn, Xiaowen Liu, Nikola Tolic, Mikhail Dvorkin, Sonya Alexandrova,Theo M. Luider, Ljiljana Pasa-Tolic and Pavel A. Pevzner. De Novo Sequencing of Peptides from Top-Down Tandem Mass Spectra
[3] Xiaowen Liu, Yuval Inbar, Pieter C. Dorrestein, Colin Wynne, Nathan Edwards, Puneet Souda, Julian P. Whitelegge, Vineet Bafna and Pavel A. Pevzner Deconvolution and Database Search of Complex Tandem Mass Spectra of Intact Proteins
[4] Huseyin Guner, Patrick L. Close, Wenxuan Cai, Han Zhang, Ying Peng, Zachery R. Gregorich and Ying Ge MASH Suite: A User-Friendly and Versatile Software Interface for High-Resolution Mass Spectrometry Data Interpretation and Visualization.
[5] Chambers, M.C., MacLean, B., Burke, R., Amode, D., Ruderman, D.L., Neumann, S., Gatto, L., Fischer, B., Pratt, B., Egertson, J., Hoff, K., Kessner, D., Tasman, N., Shulman, N., Frewen, B., Baker, T.A., Brusniak, M.-Y., Paulse, C., Creasy, D., Flashner, L., Kani, K., Moulding, C., Seymour, S.L., Nuwaysir, L.M., Lefebvre, B., Kuhlmann, F., Roark, J., Rainer, P., Detlev, S., Hemenway, T., Huhmer, A., Langridge, J., Connolly, B., Chadick, T., Holly, K., Eckels, J., Deutsch, E.W., Moritz, R.L., Katz, J.E., Agus, D.B., MacCoss, M., Tabb, D.L. Mallick, P. Nature Biotechnology 30, 918-920 (2012).A cross-platform toolkit for mass spectrometry and proteomics.


Работу высылаем на протяжении 30 минут после оплаты.




©2025 Cервис помощи студентам в выполнении работ