Список сокращений
Введение
1 Литературный обзор
1.1 Общие сведения о Грамицидине С
1.1.1 Биосинтез Грамицидина С
1.1.2 Модифицированные аналоги Грамицидина С
1.2 Лабораторные методы синтеза пептидов
1.2.1 Методы конденсации аминокислот
1.2.2 Защитные группы
1.2.2.1 Временные защитные группы…………………………………………………14
1.2.2.2 Постоянные защитные группы………………………………………………...16
1.2.3 Синтез пептидов в растворе……………………………………………………...17
1.2.4 Метод твердофазного синтеза пептидов………………………………………..17
1.3 Тетразолы…………………………………………………………………………...18
1.3.1 Основные направления модификации аминокислот…………………………...19
1.3.1.1 Тетразолильная группа, как изостер α-карбоксильной группы……………..19
1.3.1.2 Тетразолильная группа, как изостер α-аминогруппы………………………..20
1.3.1.3 Тетразолильная группа в боковой цепи аминокислот……………………….20
Цели и задачи работы
2 Обсуждение результатов……………………………………………………………..24
2.1 Выбор рационального метода синтеза…………………………………………….25
2.2 Выбор стратегии твердовазного синтеза
2.2.1 Удаление защитных групп
2.3 Выбор смолы для синтеза
2.4 Синтез линейных предшественников Грамицидина С и его тетразолильных аналогов
2.5 Циклизация линейных предшественников Грамицидина С и его тетразолильных аналогов
3 Экспериментальная часть
3.1 Приборы и оборудование
3.2 Реагенты и растворители
3.3 Методики синтеза
3.3.1 9-Флуоренилметилоксикарбонил ε-трет-бутилоксикарбонил-орнитин………37
3.3.2 Общие методы синтеза пептидов 1 -8
3.3.2.1 H-Pro-Val-Orn(Boc)-Leu-DPhe-Pro-Val-Orn(Boc)-Leu-DPhe-OH…..………….39
3.3.2.2 H-Pro-Val-Lys(tetrazol)-Leu-DPhe-Pro-Val-Lys(tetrazol)-Leu-DPhe-OH…….. 40
3.3.2.3 H-Pro-Val-Orn(Boc)-Leu-DPhe(tetrazol)-Pro-Val-Orn(Boc)- Leu-DPhe(tetrazol)-OH
3.3.2.4 H-Pro-Val-Lys(tetrazol)-Leu-DPhe(tetrazol)-Pro-Val-Lys(tetrazol)-Leu-DPhe(tetrazol)-OH
3.3.2.5 cyclo(Pro-Val-Orn-Leu-DPhe)2
3.3.2.6 cyclo(Pro-Val-Lys(tetrazol)-Leu-DPhe)2
3.3.2.7 cyclo(Pro-Val-Orn-Leu-DPhe(tetrazol)2
3.3.2.8 cyclo(Pro-Val-Lys(tetrazol)-Leu-DPhe(tetrazol)2
Выводы
Список использованной литературы
Приложения
Многие виды организмов используют антимикробные пептиды, как первую линию защиты от бактериальных инфекций. Такие катионные пептиды способны быстро уничтожать широкий диапазон бактерий, воздействуя на их мембрану. Одним из таких антимикробных пептидов является Грамицидин С.
Грамицидин С был впервые выделен в 1942 году Г. Ф. Гаузе и М. Г. Бражниковой из одного из штаммов Bacillus Brevis, обитающей в садовых почвах. Данное соединение вызвало большой интерес ученых, как эффективный антибактериальный препарат широкого спектра действия. Он обладает бактериостатическим в отношении менингококков, гонококков, возбудителей анаэробной инфекции, а также в высоких концентрациях бактерицидным действием на стрептококки и стафилококки. В настоящее время Грамицидин С используется для лечения воспалений и гнойных инфекций кожи и мягких тканей (язвы, пролежни), воспалительных заболеваниях полости рта (стоматит), ожогах кожи и как местное противозачаточное средство.
Актуальность темы: На данный момент нет информации о том, что появились штаммы бактерий, устойчивых к антимикробным пептидом. Это связано с тем, что механизм их действия связан с разрушением клеточной мембраны, в частности механизм работы Грамицидина С основан на увеличении проницаемости мембраны микробной клетки для неорганических катионов за счет формирования сети каналов в билипидном слое мембраны, что обусловливает осмотическую неустойчивость клетки. А это значит, что для образования резистентности бактериальной клетке нужно значительно изменить структуру своей клеточной стенки. Однако большим недостатком Грамицидина С является то, что помимо разрушения бактериальных мембран он вызывает лизис клеточной стенки и эукариотических клеток, таких, как эритроциты.
Все это делает актуальными исследования, связанные с модифицированием структуры Грамицидина С, направленные на снижение его гемолитической активности и улучшение терапевтического индекса.
Научная новизна: Впервые были получены и исследованы аналоги Грамицидина С, модифицированные путем ввода в его структуру тетразолильных производных таких аминокислот, как D-фенилаланин и L-лизин.
Цель работы: синтез аналогов Грамицидина С, содержащих остатки аминокислот, модифицированных тетразол-1-ильными циклами для дальнейшего изучения их биологической активности.
1. Показана возможность синтеза линейных предшественников аналогов Грамицидина С, содержащих модифицированные аминокислоты с включенным в них тетразолильным фрагментом.
2. Показано, что наличие модифицированных аминокислот, содержащих тетразолильный фрагмент не препятствует циклизации линейных предшественников аналогов Грамицидина С.