Тема: Анализ роли генетического варианта c.1320+1G>A гена CDH1 в развитии рака желудка (Башкирский Государственный Университет)
Закажите новую по вашим требованиям
Представленный материал является образцом учебного исследования, примером структуры и содержания учебного исследования по заявленной теме. Размещён исключительно в информационных и ознакомительных целях.
Workspay.ru оказывает информационные услуги по сбору, обработке и структурированию материалов в соответствии с требованиями заказчика.
Размещение материала не означает публикацию произведения впервые и не предполагает передачу исключительных авторских прав третьим лицам.
Материал не предназначен для дословной сдачи в образовательные организации и требует самостоятельной переработки с соблюдением законодательства Российской Федерации об авторском праве и принципов академической добросовестности.
Авторские права на исходные материалы принадлежат их законным правообладателям. В случае возникновения вопросов, связанных с размещённым материалом, просим направить обращение через форму обратной связи.
📋 Содержание
1. Обзор литературы 6
1.1. Классификация рака желудка 6
1.2. Эпидемиология рака желудка 9
1.3. Механизмы патогенеза рака желудка 13
1.3.1. Факторы риска развития рака желудка 13
1.3.2. Генетические факторы риска развития рака желудка 16
1.4 Роль гена CDH1 в развитии рака желудка 20
1.4.1 Строение и функции гена CDH1 21
1.4.2. Генетические изменения гена CDH1, ассоциированные с раком желудка 24
2. Материалы и методы исследования 32
2.1. Материалы исследования 32
2.2. Методы исследования 34
2.2.1. Выделение геномной ДНК 34
2.2.2. Полимеразная цепная реакция синтеза ДНК 35
2.2.3. Анализ кривых плавления с высокой разрешающей способностью (HRM) 37
2.2.4. Определение нуклеотидной последовательности методом дидезоксисеквенирования по Сенгеру 37
2.2.6. Электрофорез фрагментов ДНК в полиакриламидном геле (ПААГ) 38
2.2.7. Статистическая обработка полученных результатов 39
3. Результаты исследований и их обсуждение 42
3.1. Ресеквенирование участка экзома, содержащего выявленный в результате экзомного секвенирования генетический вариант c.1320+1G>A гена CDH1 43
3.2. Поиск изменений нуклеотидной последовательности участка, содержащего вариант c.1320+1G>A гена CDH1, в образцах ДНК, выделенных из крови больных раком желудка и здоровых индивидов, а также из опухолевой и здоровой ткани больных раком желудка из Республики Башкортостан 45
3.3. Верифицирование выявленных изменений с помощью секвенирования методом Сэнгера46
ЗАКЛЮЧЕНИЕ 48
ВЫВОДЫ: 49
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ И ЛИТЕРАТУРЫ 50
📖 Введение
Несмотря на значительные улучшения в выживаемости пациентов с РЖ за последние несколько десятилетий, РЖ часто диагностируется на поздней стадии, и прогнозы все еще неудовлетворительные из-за высокой частоты рецидивов. Поскольку РЖ в основном протекает бессимптомно до прогрессирования стадии, раннее выявление с использованием эффективных методов скрининга важно для снижения смертности от РЖ [7].
Подавляющее большинство (примерно 90%) рака желудка - это аденокарциномы, которые возникают из желез самого поверхностного слоя или слизистой оболочки желудка. Однако существуют и другие типы рака, возникающие из желудка, включая лимфомы и лейомиосаркомы, которые возникают из мышц, окружающих слизистую оболочку. Существует большое классификации РЖ. Популярная классификация Lauren делит аденокарциномы РЖ на два основных гистологических типа: диффузные и кишечные. Эти два типа не только выглядят по-разному под микроскопом, но и различаются соотношением полов, возрастом на момент постановки диагноза и другими эпидемиологическими особенностями [8].
Мутации гена CDH1, кодирующий E-кадгерин, являются наиболее распространенными мутациями зародышевой линии, обнаруживаемыми при раке желудка, и лежат в основе синдрома наследственного диффузного рака желудка. Все зарегистрированные НДРЖ относятся к диффузному типу по классификации Lauren и связаны с мрачным прогнозом, как только опухоль проникает в подслизистую оболочку. Наследование является аутосомно-доминантным, но пенетрантность для возникновения рака желудка составляет 70% у мужчин и 56% у женщин [10].
В лаборатории молекулярной генетики и фундаментальной медицины проведено секвенирование экзома и у одного пациента из девяти обнаружена мутация в гене CDH1, который является патогенной по результатам анализа большинства баз данных.
В связи с вышеизложенным, целью данной работы является анализ роли генетического варианта c.1320+1G>A гена CDH1.
В соответствии с целью поставлены следующие задачи:
1) Провести ресеквенирование участка экзома, содержащего выявленный в результате экзомного секвенирования генетический вариант c.1320+1G>A гена CDH1.
2) Провести поиск изменений нуклеотидной последовательности участка, содержащего вариант c.1320+1G>A гена CDH1, в образцах ДНК, выделенных из крови больных раком желудка из Республики Башкортостан;
3) Провести поиск изменений нуклеотидной последовательности участка, содержащего вариант c.1320+1G>A гена CDH1, в образцах ДНК, выделенных из опухолевых и здоровых тканей больных раком желудка из Республики Башкортостан;
4) Провести поиск изменений нуклеотидной последовательности участка, содержащего вариант c.1320+1G>A гена CDH1, в образцах ДНК, выделенных из крови здоровых доноров из Республики Башкортостан;
5) Верифицировать выявленные изменения с помощью секвенирования методом Сэнгера.
✅ Заключение
Гистологически РЖ делится на три основных подтипа: кишечный, диффузный и смешанный, которые имеют различные эпидемиологические и прогностические особенности. Спорадические опухоли желудка составляют 90%, а семейная кластеризация встречается редко и составляет около 10%. Только от 1 до 3% являются наследственными, включая несколько синдромальных форм, таких как семейный кишечный рак желудка и наследственная диффузная рак желудка. НДРЖ - аутосомно-доминантное наследственное заболевание, вызванное мутациями зародышевой линии гена CDH1 с риском развития диффузного типа, начиная с 45 лет. Носители мутации CDH1 имеют пожизненный риск развития РЖ 70-80%. На сегодняшний день, по данным Базы данных мутаций генов человека, во всем мире зарегистрировано более 155 мутаций, приводящих к потере функции гена CDH1.
E-Cadherin как продукт гена CDH1 является гомофильной молекулой, которая играет роль в клеточной адгезии. Этот трансмембранный гликопротеин имеет пять внеклеточных доменов и цитоплазматический домен, который действует в комплексе из трех молекул, включая α-, β- и γ-катенины. Дефекты Е-кадгерина приводят к потере ингибирования контакта, что является критической начальной стадией в канцерогенезе. Кроме того, дисфункция E-кадгерина способствует метастазированию.
В рамках нашего исследования был проведен анализ роли генетического варианта c.1320+1G>A гена CDH1 в развитии предрасположенности к «раку желудку» среди больных и здоровых доноров.
ВЫВОДЫ:
1. У пациента с низкодифференцированной аденокарциномой желудка тяжелого течения в ДНК, выделенной из опухолевой ткани, подтверждено наличие патогенного генетического варианта c.1320+1G>A в гетерозиготном состоянии в положении +1 донорного сайта сплайсинга экзона 9 гена CDH1;
2. При скрининге в расширенных выборках из Республики Башкортостан генетический вариант c.1320+1G>A гена CDH1 в образцах ДНК, выделенных из крови больных раком желудка (N=300), опухолевых и здоровых тканей больных раком желудка (N=70), крови здоровых доноров (N=285), не выявлен;
3. Выявлен герминальный генетический вариант c.1300G>C (p.Gly434Arg) в экзоне 9 гена CDH1 у одной пациентки с высокодифференцированной аденокарциномой желудка.



