Разработка и исследование полуавтоматических и автоматического алгоритмов оконтуривания левого желудочка сердца на эхокардиографических изображениях сердца
Актуальность темы исследования и степень ее разработанности. Болезни сердца являются причинами большого числа скоропостижных смертей, в том числе людей не пожилого возраста. В этой связи врачам кардиологам требуется максимально точная и своевременная информация о состоянии сердечной мышцы пациента, которая во многих случаях позволяет диагностировать ее заболевания и назначить необходимое лечение.
Сегодня одним из наиболее распространенных методов диагностики являются ультразвуковые исследования (УЗИ) сердечно-сосудистой системы (эхокардиография - ЭхоКГ), предоставляющие кардиологам визуальные изображения сердечной мышцы в различных проекциях. Следует отметить, что в задачах кардиологии наиболее часто используется апикальная проекция сердца, которая с точки зрения врачей-кардиологов является наиболее информативной, потому что они имеют возможность провести анализ УЗИ-изображений сердца и построить эндокардиальный (внутренний) контур левого желудочка (ЛЖ). Далее оказывается возможным вычислить количественные показатели, характеризующие состояние сердечной мышцы.
Для проведения ЭхоКГ-исследований сегодня применяют УЗИ-сканеры различных производителей (Philips, Aloka Hitachi, Toshiba, Siemens, General Electric и др.), которые оснащены тем или иным инструментарием для построения контура ЛЖ вручную. Используя данный инструментарий, врачи-кардиологи на основе собственных представлений о форме ЛЖ, зачастую субъективных, строят на УЗИ-изображении контур ЛЖ. (Например, они достраивают границы областей сердца с низкой контрастностью (рис. 1), а также в ряде случаев сглаживают контур ЛЖ, отбрасывая на изображении те или иные области повышенной плотности.) При этом, несмотря на имеющиеся рекомендации американской кардиологической ассоциации, обобщить опыт оконтуривания ЛЖ сердца на УЗИ-изображениях в виде некоторого набора правил врачам-кардиологам не удается.
Известно большое число работ, авторы которых предпринимали попытки реализации алгоритмов оконтуривания ЛЖ на УЗИ-изображениях сердца с использованием:
• геометрических моделей (M. Mignotte, A. Mishra, O. Gerard, L. Jacobs);
• методов уровневых множеств (N. Lin, J. Yan, F. Galluzzo, C. Fabbri,
C. Corsi);
• алгоритмов, основанных на вычислении оптического потока пикселей изображения (J. Pedrosa, J. Nascimento);
• статистических моделей контуров ЛЖ (А. Ятченко, А. Крылов, F. Orderud, M. Stralen, J. Hansegard, D. Barbosa, L. Maes,
D. Boukerroui);
• методов морфологической обработки УЗИ-изображений (J. Klinger, M. Choy);
• искусственных нейронных сетях (E. Alcevska, O. Oktay, S. Leclerc, O. Bernard, J. Pedrosa, N. Azarmehr, G. Coppini, A. Ostvik).
Также отметим работы (J. Noble, K. Leung), в которых приведены обзоры наиболее значимых результов в области разработки алгоритмов оконтуривания ЛЖ на момент написания обзоров. Однако универсальных алгоритмов, пригодных к различным наборам УЗИ-изображений, не существовало. В этой ситуации разработка полуавтоматических и автоматических алгоритмов для построения контуров ЛЖ является актуальной...
1. Проведен анализ инструментария, поставляемого совместно с УЗИ-сканерами, производителей Philips, General Electric, Canon, Mindray, Siemens, которые не имеет инструментов автоматического оконтуривания ЛЖ на УЗИ-изображениях.
2. Проведено исследование наборов данных с УЗИ-изображениями сердечной мышцы: USEKB, CAMUS и CETUS и обоснованно возможность их использования для разработки алгоритмов оконтуривания ЛЖ на УЗИ-изображениях.
3. Разработаны полуавтоматические алгоритмы оконтуривания ЛЖ на УЗИ-кадрах аппикальной проекции, и их программная реализации, основанные на использовании:
— морфологических операций;
• уровневых множеств;
• геодезических активных контуров;
• оптического потока Лукаса-Канаде.
и автоматический алгоритм оконтуривания ЛЖ, основанный на использовании СНС с модифицированной архитектурой U-Net.
4. Проведен сравнительный анализ точности нахождения контура ЛЖ предложенных алгоритмов на основе использования коэффициента Dice, результаты которого показали, что наилучшим по выбранному коэффициенту оказывается алгоритм автоматического оконтуривания основанный на СНС с модифицированной архитектурой U-Net.
Перспективы дальнейшей разработки темы исследования заключаются в:
1. разработке 3D акустической модели сердца;
2. разработке методов синтеза УЗИ-изображений на основе использования 3D акустической модели сердца;
3. использовании синтезированных УЗИ-изображений для анализа и дальнейшей модификации автоматических и полуавтоматических алгоритмов оконтуривания ЛЖ.
Разработка и исследование полуавтоматических и автоматического алгоритмов оконтуривания левого желудочка сердца на эхокардиографических изображениях сердца